Triple-negative breast cancer (TNBC) accounts for 15% to 20% of breast cancer cases and is characterized by the absence of estrogen, progesterone, and human epidermal growth factor 2 receptors. Though TNBC is a highly heterogenic and aggressive disease, TNBC patients have better response to neoadjuvant therapy compared to other breast cancer subtypes. Nevertheless, patients with residual disease have a very poor prognosis, with higher probability of relapse and lower overall survival in the first years after diagnosis. TNBC has 6 subtypes with distinct molecular signatures with different prognoses and probably different responses to therapy. The precise stratification of TNBC is therefore crucial for the development of potent standardized and targeted therapies. In spite of intensive research into finding new molecular biomarkers and designing personalized therapeutic approaches, BRCA mutational status is the only clinically validated biomarker for personalized therapy in TNBC. Recent studies have reported several promising biomarkers that are currently being validated through clinical trials. The objective of this review was to summarize the clinically relevant genetic markers for TNBC that could serve as diagnostic, prognostic, or predictive or could improve personalized therapeutic strategies.
- MeSH
- cílená molekulární terapie MeSH
- geny nádorové genetika MeSH
- lidé MeSH
- lokální recidiva nádoru genetika terapie MeSH
- mutace MeSH
- nádorové biomarkery genetika MeSH
- prognóza MeSH
- regulace genové exprese u nádorů genetika MeSH
- triple-negativní karcinom prsu klasifikace genetika terapie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- přehledy MeSH
BACKGROUND: Epigenetic modifications have been recognized as an important mechanism underlying carcinoma progression. DNA methylation plays an important role in cancer biology and represents potentially heritable changes in gene expression that do not involve DNA sequence. The aim of this study was to investigate promoter methylation of selected genes in sinonasal carcinoma by comparison with noncancerous sinonasal tissue. METHODS: To search for epigenetic events (methylation in 25 tumor suppressor genes) we used MS-MLPA (Methylation-specific multiplex ligation-dependent probe amplification) to compare methylation status of 59 formalin fixed, paraffin embedded tissue samples of sinonasal carcinomas with 18 control samples. The most important changes in methylation were confirmed using MSP (Methylation specific PCR). Detected alterations in methylation were compared with clinicopathological characteristics. RESULTS: Using a 20% cut-off for methylation (MS-MLPA), we found significantly higher methylation in GATA5 (P=0.0005), THSB1 (P=0.0002) and PAX5 (P=0.03) genes in the sinonasal cancer group compared to the control group. Methylation in five or more genes was associated with impaired overall survival (P=0.017). CONCLUSION: These findings provide evidence that alterations in methylation profile may be one of the major mechanisms in sinonasal carcinogenesis. In addition, changes in methylation could potentially be used as prognostic factors of sinonasal carcinoma and may have implications for future individualized therapy based on epigenetic changes.
- MeSH
- dospělí MeSH
- epigeneze genetická genetika MeSH
- geny nádorové genetika MeSH
- Kaplanův-Meierův odhad MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- metylace DNA fyziologie MeSH
- mladý dospělý MeSH
- nádorové biomarkery fyziologie MeSH
- nádory vedlejších dutin nosních diagnóza genetika mortalita MeSH
- prognóza MeSH
- promotorové oblasti (genetika) genetika MeSH
- retrospektivní studie MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mladý dospělý MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
Karcinom prsu je v současné době nejčastějším zhoubným nádorem u žen a incidence onemocnění stále narůstá. Ročně je v České republice zjištěno téměř 6.500 nových případů onemocnění a přibližně 2.000 žen ročně tomuto onemocnění podlehne. Karcinom prsu zaujímá prvenství mezi příčinami úmrtí u žen ve věkové kategorii 20-54 let. Cílem tohoto příspěvku je poukázat na preventivní programy a tím na včasné odhalení karcinomu prsu u žen.
Breast cancer is currently the most common type of cancer between women and the incidence of this type of cancer is growing. Annually, nearly 6,500 new cases of this disease are detected in the Czech Republic, and approximately 2,000 women per year pass away because of this illness. Breast cancer is leading cause of death among young women from the age 20 to the age 54. The aim of this article is to point out preventative programs and thus the early detection of breast cancer.
- MeSH
- analýza nákladů a výnosů MeSH
- exprese genu MeSH
- geny nádorové genetika MeSH
- kvalita života MeSH
- lidé MeSH
- mutace MeSH
- nádory prsu * genetika metabolismus patologie MeSH
- náklady na léky MeSH
- prediktivní hodnota testů MeSH
- sekvenční analýza hybridizací s uspořádaným souborem oligonukleotidů ekonomika metody MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- novinové články MeSH
- MeSH
- exprese genu MeSH
- geny nádorové genetika MeSH
- hodnocení rizik MeSH
- lidé MeSH
- lokální recidiva nádoru genetika metabolismus patologie MeSH
- mutace MeSH
- nádory prsu * genetika metabolismus patologie MeSH
- prediktivní hodnota testů MeSH
- recidiva MeSH
- sekvenční analýza hybridizací s uspořádaným souborem oligonukleotidů metody MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- novinové články MeSH
BACKGROUND: Multiple myeloma (MM) is characterized by malignant proliferation of plasma cells (PC) which accumulate in the bone marrow (BM). The advent of new drugs has changed the course of the disease from incurable to treatable, but most patients eventually relapse. One group of MM patients (10-15%) is considered high-risk because they relapse within 24 months. Recently, extramedullary relapse of MM (EM) has been observed more frequently. Due to its aggressivity and shorter survival, EM is also considered high-risk. AIMS: The goal of this study was to determine if the so-called high-risk genes published by the University of Arkansas group (UAMS) are even more deregulated in EM patients than in high-risk MM patients and if these patients may be considered high-risk. METHODS: Nine samples of bone marrow plasma cells from MM patients as well as 9 tumors and 9 bone marrow plasma cells from EM patients were used. Quantitative real-time PCR was used for evaluation of expression of 15 genes connected to the high-risk signature of MM patients. RESULTS: Comparison of high-risk plasma cells vs extramedullary plasma cells revealed 4 significantly deregulated genes (CKS1B, CTBS, NADK, YWHAZ); moreover, comparison of extramedullary plasma cells vs extramedullary tumors revealed significant differences in 9 out of 15 genes. Of these, 6 showed significant changes as described by the UAMS group (ASPM, SLC19A1, NADK, TBRG4, TMPO and LARS2). CONCLUSIONS: Our data suggest that increasing genetic abnormalities as described by the gene expression data are associated with increased risk for EM relapse.
- MeSH
- buněčné klony MeSH
- exprese genu MeSH
- geny nádorové genetika MeSH
- kvantitativní polymerázová řetězová reakce MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mnohočetný myelom genetika MeSH
- plazmatické buňky fyziologie MeSH
- recidiva MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- Check Tag
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- MeSH
- biopsie metody normy využití MeSH
- buňky stromatu imunologie patologie MeSH
- cévy imunologie metabolismus růst a vývoj MeSH
- cílená molekulární terapie * metody využití MeSH
- fibroblasty cytologie imunologie účinky léků MeSH
- geny nádorové genetika MeSH
- ischemie metabolismus MeSH
- karcinom MeSH
- lidé MeSH
- metastázy nádorů MeSH
- mnohočetná léková rezistence imunologie účinky léků MeSH
- mutace MeSH
- nádorové biomarkery MeSH
- nádory * diagnóza etiologie imunologie MeSH
- progrese nemoci MeSH
- proliferace buněk MeSH
- recidiva MeSH
- signální transdukce účinky léků MeSH
- tumor infiltrující lymfocyty imunologie účinky léků MeSH
- výzkum MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
Epigenetic changes are considered to be a frequent event during tumour development. Hypermethylation of promoter CpG islands represents an alternative mechanism for inactivation of tumour suppressor genes, DNA repair genes, cell cycle regulators and transcription factors. The aim of this study was to investigate promoter methylation of specific genes in ovarian cancer by comparison with normal ovarian tissue. To search for epigenetic events we used methylation-specific multiplex ligation-dependent probe amplification (MS-MLPA) to compare the methylation status of 69 tissue samples of ovarian cancer with 40 control samples. Using a 15% cut-off for methylation, we observed significantly higher methylation in genes MGMT, PAX5, CDH13, WT1, THBS1, GATA5 in the ovarian cancer group, while in the ESR1 gene we observed significantly higher methylation in the control group compared with the ovarian cancer group. These findings could potentially be used in screening of ovarian cancer and may have implications for future chemotherapy based on epigenetic changes.
- MeSH
- dospělí MeSH
- geny nádorové genetika MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- metylace DNA genetika MeSH
- multiplexová polymerázová řetězová reakce metody MeSH
- nádory vaječníků genetika patologie MeSH
- promotorové oblasti (genetika) MeSH
- studie případů a kontrol MeSH
- tumor supresorové geny * MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
Nádory jsou onemocnění charakterizovaná genomovou instabilitou. Změny v počtu kopií DNA jsou jednou z mnoha abnormit, kterými může být ovlivněna exprese a funkce genů. Proto určení nebalancovaných změn, které představují především amplifikace a delece chromosomových oblastí a genů v nich lokalizovaných, dovoluje určit kritické geny a signální dráhy zahrnuté do vzniku a vývoje onemocnění. Určení takových nebalancovaných změn dovoluje molekulárně cytogenetická metoda komparativní genomová hybridizace (CGH). CGH se stala základem nedávno vyvinuté technologie, metody array komparativní genomové hybridizace (array CGH), která dovoluje detailní analýzu chromosomových oblastí, ve kterých došlo ke změně počtu kopií sekvencí DNA. V současnosti můžeme využít řady array CGH technologií, které významným způsobem zvyšují rozlišovací schopnost metody CGH a umožňují definovat v genomu oblasti, které mají vztah ke vzniku nádoru a dovolují rychle odhalit geny ležící v těchto oblastech. Tato práce informuje o principu, významu a využití metody array CGH při určování nebalancovaných změn v nádorovém genomu.
Cancer is a disease characterized by genomic instability. One of the mechanisms that changes gene expression and gene function is DNA copy number changes. These changes mostly include gains and losses of chromosomal regions, which can be detected by molecular cytogenetic method: comparative genomic hybridization (CGH). On the basis of CGH a new method has been recently developed called array comparative genomic hybridization (array CGH). Array CGH improves the resolution of CGH and enables detailed analysis of chromosomal regions, detecting DNA sequence copy number changes. Modern array CGH technologies posses increased sensitivity and are able to define genomic regions related to cancer, and to identify genes lying within these regions. Such genes may be involved in critical signaling pathways and may play role in cancer development and progression. This work informs about the principle, significance and usage of array CGH method in detection of imbalanced aberrations of cancer genome.
- MeSH
- financování organizované MeSH
- geny nádorové genetika imunologie MeSH
- hybridizace genetická MeSH
- lékařská onkologie metody trendy MeSH
- lidé MeSH
- nestabilita genomu genetika MeSH
- onkogeny genetika imunologie MeSH
- sekvenční analýza hybridizací s uspořádaným souborem oligonukleotidů metody trendy MeSH
- srovnávací genomová hybridizace MeSH
- statistika jako téma MeSH
- tumor supresorové geny MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
Current topics in microbiology and immunology ; Vol. 220
X, 166 s. : obr., tab., grafy ; 24 cm