The main intention of the project is to search for the differences in expression of genes of metabolism and transport, DNA repair and cell cycle genes between tumour tissues of patients and tissues of patients with bad response to the standard CLM chemotherapy. The partial aim will be to indentify prospectively, in patients with CLM, the pharmacogenomic profile of good response to the chemotherapy. Another aim of the project is to validate retrospectively the pharmacogenomic profile as it was identifiedin the prospective part, which is in connection with good response to the administered chemotherapy in group of patients with unresectable CLM. In case, that significant differences between patients are found, i.e. genes responsible for the different sensitivity to the therapy are identified, mechanism of sensitivity will be studied.

Celkové přežití nemocných s neoperabilními nebo paliativně ošetřenými metastázami kolorektálního karcinomu (CLM) je i přes následnou chemoterapii stále neuspokojivé. Hlavním záměrem předkládaného projektu je hledat rozdíly v expresi genů metabolismu, transportu, opravy DNA a buněčného cyklu mezi nádorovými tkáněmi pacientů dobře odpovídajících a tkáněmi pacientů špatně odpovídajících na standardní chemoterapii. Naším cílem je také prospektivně identifikovat, u nemocných s CLM, farmakogenomický profil dobré odpovědi na chemoterapii. Tyto předpokládané výsledky mají vést k racionalizaci a úpravě onkologické léčby s cílem maximální možné odpovědi, která by umožnila zvýšení počtu nemocných s úspěšným onkologickým downstagingem onemocnění.

• MeSH
• cytostatické látky aplikace a dávkování   terapeutické užití   MeSH
• exprese genu účinky léků   MeSH
• farmakogenetika MeSH
• katetrizační ablace MeSH
• kolorektální nádory MeSH
• metastázy nádorů MeSH
• nádory jater chirurgie   sekundární   MeSH
• neoadjuvantní terapie metody   využití   MeSH
• senzitivita a specificita MeSH
• staging nádorů metody   využití   MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• onkologie
• biologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

OBJECTIVES: Classical and proliferative tumour markers and matrix metalloproteinases and their tissue inhibitors reflect the features of malignancy and are useful in prediction of prognosis in patients with colorectal liver metastases. There is very limited information about their physiological functions during regeneration and healing of liver parenchyma after any type of liver surgery for malignancy. METHODS: The presented study included the patients, who underwent following surgical procedures for CLM, benign liver lesions and inguinal hernias: Group A: 22 patients with inguinal hernias, Group B: 26 patients with benign liver lesions, Group C: 30 patients with colorectal liver metastases (CLM) who were treated by radiofrequency ablation, Group D: 41 patients with CLM who underwent a radical surgical therapy - resection, and Group E: 22 patients with inoperable CLM who underwent an explorative laparotomy without any surgical procedure. RESULTS: The preoperative and postoperative serum levels of CEA, CA 19-9, TK, TPA, TPS, MMP-2, MMP-9, TIMP-1, and TIMP-2 were statistically analyzed and compared within the groups to estimate the influence of a surgical procedure type. These results reflect the influence of surgical procedure on the serum levels of studied tumour markers during operation. CONCLUSIONS: It was the first description using these types of comparison to all metalloproteinases, their inhibitors, and proliferative and classical tumour markers. It could help us to estimate the critical relations of these tumour markers in prognoses of disease free survival or overall survival in patients after a surgical procedure for CLM (Tab. 5, Ref. 26).

• MeSH
• dospělí MeSH
• kolorektální nádory patologie   MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• matrixové metaloproteinasy krev   MeSH
• mladiství MeSH
• mladý dospělý MeSH
• nádorové biomarkery krev   MeSH
• nádory jater diagnóza   sekundární   chirurgie   MeSH
• prognóza MeSH
• senioři nad 80 let MeSH
• senioři MeSH
• tkáňové inhibitory metaloproteinas krev   MeSH
• Check Tag
• dospělí MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mladiství MeSH
• mladý dospělý MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• senioři nad 80 let MeSH
• senioři MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH
• srovnávací studie MeSH

Alteration of DNA integrity is a potential cause of cancer and it is assumed that reduced DNA repair capacity and accumulation of DNA damage may represent intermediate markers in carcinogenesis. In this case-control study, DNA damage and nucleotide excision repair capacity (NER-DRC) were assessed in association with sporadic colorectal cancer (CRC). Both parameters were quantified by comet assay in blood cells of 70 untreated incident patients and 70 age-matched healthy controls. mRNA expression and polymorphisms in relevant NER genes were concurrently analyzed. The aim of this study was to characterize incident CRC patients for NER-DRC and to clarify possible relations between investigated variables. Comet assay and mRNA expression analysis showed that CRC patients differ in repair capacity as compared to controls. Patients had a lower NER-DRC and simultaneously they exhibited higher endogenous DNA damage (for both P < 0.001). Accumulation of DNA damage and decreasing NER-DRC behaved as independent modulating parameters strongly associated with CRC. Expression levels of 6 out of 9 studied genes differed between groups (P ≤ 0.001), but none of them was related to DRC or to any of the studied NER polymorphisms. However, in patients only, XPC Ala499Val modulated expression levels of XPC, XPB and XPD gene, whereas XPC Lys939Gln was associated with XPA expression level in controls (for all P < 0.05). This study provides evidence on altered DRC and DNA damage levels in sporadic CRC and proposes the relevance of the NER pathway in this malignancy. Further, alterations in a complex multigene process like DNA repair may be better characterized by functional quantification of repair capacity than by quantification of individual genes transcripts or gene variants alone.

• MeSH
• celogenomová asociační studie MeSH
• DNA vazebné proteiny genetika   MeSH
• dospělí MeSH
• genotyp MeSH
• kolorektální nádory diagnóza   genetika   MeSH
• kometový test MeSH
• kvantitativní polymerázová řetězová reakce MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• messenger RNA genetika   MeSH
• oprava DNA genetika   MeSH
• polymorfismus genetický genetika   MeSH
• poškození DNA genetika   MeSH
• prognóza MeSH
• senioři nad 80 let MeSH
• senioři MeSH
• studie případů a kontrol MeSH
• Check Tag
• dospělí MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• senioři nad 80 let MeSH
• senioři MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH
• srovnávací studie MeSH

Worldwide, colorectal cancer (CRC) is the third most common cancer, with the highest mortality rates occurring in Central Europe. The use of chemotherapy to treat CRC is limited by the inter-individual variability in drug response and the development of cancer cell resistance. ATP-binding cassette (ABC) transporters play a crucial role in the development of resistance by the efflux of anticancer agents outside of cancer cells. The aim of this study was to explore transcript levels of all human ABCs in tumours and non-neoplastic control tissues from CRC patients collected before the first line of treatment by 5-fluorouracil (5-FU)-containing regimen. The prognostic potential of ABCs was evaluated by the correlation of transcript levels with clinical factors. Relations between transcript levels of ABCs in tumours and chemotherapy efficacy were also addressed. The transcript profile of all known human ABCs was assessed using real-time polymerase chain reaction with a relative standard curve. The majority of the studied ABCs were down-regulated or unchanged between tumours and control tissues. ABCA12, ABCA13, ABCB6, ABCC1, ABCC2 and ABCE1 were up-regulated in tumours versus control tissues. Transcript levels of ABCA12, ABCC7 and ABCC8 increased in direction from colon to rectum. Additionally, transcript levels of ABCB9, ABCB11, ABCG5 and ABCG8 followed the reverse significant trend, i.e. a decrease in direction from colon to rectum. The transcript level of ABCC10 in tumours correlated with the grade (P = 0.01). Transcript levels of ABCC6, ABCC11, ABCF1 and ABCF2 were significantly lower in non-responders to palliative chemotherapy in comparison with responders. The disease-free interval of patients treated by adjuvant chemotherapy was significantly shorter in patients with low transcript levels of ABCA7, ABCA13, ABCB4, ABCC11 and ABCD4. In conclusion, ABCC11 may be a promising candidate marker for a validation study on 5-FU therapy outcome.

• MeSH
• ABC transportéry genetika   MeSH
• adjuvantní chemoterapie MeSH
• kolon metabolismus   MeSH
• kolorektální nádory farmakoterapie   genetika   mortalita   MeSH
• kvantitativní polymerázová řetězová reakce MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• messenger RNA genetika   MeSH
• metastázy nádorů MeSH
• míra přežití MeSH
• pilotní projekty MeSH
• polymerázová řetězová reakce s reverzní transkripcí MeSH
• prognóza MeSH
• progrese nemoci MeSH
• protinádorové látky terapeutické užití   MeSH
• regulace genové exprese u nádorů MeSH
• rektum metabolismus   MeSH
• senioři MeSH
• studie případů a kontrol MeSH
• Check Tag
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• senioři MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

Úvod: Proliferativní nádorové markery a matrixové metaloproteinázy a jejich tkáňové inhibitory odráží vlastnosti malignity a mohou být užitečné při hodnocení prognózy jaterních metastáz kolorektálního karcinomu (CLM). Přesto není mnoho známo o jejich fyziologických funkcích a chování během regenerace a hojení jaterního parenchymu po jaterním výkonu pro malignitu. Metody: Do studie byli zahrnuti pacienti, kteří byli operováni v našem zařízení v období od 11/2002–12/2004 a podstoupili následující výkony: skupina (kontrolní) A: 22 pacientů s tříselnou kýlou; skupina B: 26 pacientů s benigní ložiskovou jaterní lézí; skupina C: 30 pacientů s CLM léčenou radiofrekvenční ablací; skupina D: 41 pacientů s CLM léčených radikální chirurgickou léčbou a skupina E: 22 pacientů s inoperabilním CLM, kteří podstoupili explorativní laparotomii. U všech pacientů byly stanoveny předoperační a pooperační sérové hladiny CEA, CA19-9, TK, TPA, TPS, MMP-2, MMP-9, TIMP-1 a TIMP-2. Výsledky: Srovnání kontrolní skupiny A se skupinou B ukázalo významné rozdíly v předoperačních sérových hladinách MMP-2 a -9 a TIMP-2 a pooperačních sérových hladinách TPS, TK, MMP-2 a TIMP-2. Srovnání kontrolní skupiny A se skupinou C vykazovalo statisticky významné rozdíly v předoperačních sérových hladinách TPA, TPS, MMP- 2, TIMP-2, CEA a CA19-9 a pooperačních sérových hladinách TK, TPA, TPS, TIMP-1 a -2, CEA a CA19-9. Srovnání kontrolní skupiny A se skupinou D demonstrovalo rozdíly v předoperačních sérových hladinách TPA, TPS, MMP-2 a -9, TIMP-1 a -2, CEA a CA19-9 a pooperačních sérových hladinách TK, TPA, TPS, MMP-9, TIMP-1 a -2, CEA a CA19-9. Srovnání kontrolní skupiny A se skupinou E vykazovalo významné rozdíly v předoperačních sérových hladinách TK, TPA, TPS, MMP-2 a -9, TIMP-1 a -2, CEA a CA19-9 a pooperačních sérových hladinách TK, TPA, TPS, MMP-2, TIMP-1 a -2, CEA a CA19-9. Závěr: Retrospektivní analýza sérových hodnot různých nádorových markerů, metaloproteináz a jejich tkáňových inhibitorů před chirurgickými výkony a po nich ukázala, že sérové koncentrace těchto ukazatelů jsou významně ovlivňovány remodelací tkáně a procesem hojení. Výsledky této studie ukazují, že uvedené markery nejsou spolehlivé pro stanovení prognózy nemocných po chirurgické léčbě CLM.

Introduction: A proliferative tumour markers and matrix metalloproteinases and their tissue inhibitors reflect the features of malignancy and they have a role in prognosis prediction in patients with colorectal metastases (CLM) in the liver. Their physiological functions during liver regeneration is not comptelety known. Methods: Only patients those had been operated in our department between 11/2002 and 12/2004 were included. They underwent the following surgical procedures: Group (control) A: 22 patients with groin hernias, Group B: 26 patients with benign liver lesions, Group C: 30 CLM patients were treated by radiofrequency ablation, Group D: 41 patients with CLM those underwent radical liver surgery and Group E: 22 patients with inoperable CLM those underwent explorative laparotomy only. The preoperative and postoperative serum levels of CEA, CA19-9, K, TPA, TPS, MMP-2, MMP-9, TIMP-1 and TIMP-2 were measured. Results: We proved a asignificat differences of serum levels MMP-2, -9; TIMP-2 and TPS, TK, MMP-2, TIMP-2 in a preoperative and postoperative settings respectively between control Group A and Group B. The comparison of control Group A and Group C displayed a significant differences in the preoperative serum levels of TPA, TPS, MMP-2, TIMP-2, CEA and CA19-9 and postoperative serum levels of TK, TPA, TPS, TIMP-1, -2, CEA, CA19-9 respectively. The comparison of control Group A and Group D demonstrated a significant diferences in the preoperative serum levels of TPA, TPS, MMP-2 and -9, TIMP-1, -2, CEA, CA19-9 and postoperative serum levels of TK, TPA,TPS, MMP-9, TIMP-1, -2, CEA, CA19-9 respectively. The comparison of control Group A with Group E proved a significant differences in the preoperative serum levels of TK, TPA, TPS, MMP-2 and -9, TIMP-1, -2, CEA, CA19-9 and postoperative serum levels of TK, TPA, TPS, MMP-2, TIMP-1, -2, CEA, CA19-9 respectively. Conclusion: The retrospective analysis of serum matrix metalloproteinases and their tissues inhibitors in differenet group of patients has shown that serum levels of tumour markers are influenced significantly due to the regeneration and remodelling of healing tissues. The study findings support a critical view how to use these tumour markers for disease prognosis prediction in patients after surgical procedure for CLM.

• Klíčová slova
• nádorové markery, jaterní chirurgie, průběh nádorových markerů, jaterní resekce, prognostické faktory, jaterní metastázy, kolorektální karcinom, časná recidiva, benigní jaterní choroby,
• MeSH
• antigeny sacharidové asociované s nádorem krev   MeSH
• chirurgie trávicího traktu metody   MeSH
• dospělí MeSH
• financování organizované MeSH
• hepatektomie MeSH
• inguinální hernie chirurgie   MeSH
• karcinoembryonální antigen krev   MeSH
• katetrizační ablace MeSH
• keratiny krev   MeSH
• kolorektální nádory komplikace   MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• metaloproteasy krev   MeSH
• metastázy nádorů patologie   MeSH
• mladiství MeSH
• mladý dospělý MeSH
• nádorové biomarkery krev   MeSH
• nádory jater chirurgie   patologie   sekundární   MeSH
• prediktivní hodnota testů MeSH
• prognóza MeSH
• radiofrekvenční ablace MeSH
• retrospektivní studie MeSH
• senioři nad 80 let MeSH
• senioři MeSH
• statistika jako téma MeSH
• tkáňové inhibitory metaloproteinas krev   MeSH
• Check Tag
• dospělí MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mladiství MeSH
• mladý dospělý MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• senioři nad 80 let MeSH
• senioři MeSH
• ženské pohlaví MeSH

• Klíčová slova
• molekulárně biologické metody, prognostické faktory, prediktivní faktory,
• MeSH
• diagnostické techniky molekulární MeSH
• DNA nádorová analýza   MeSH
• kolorektální nádory diagnóza   genetika   terapie   MeSH
• lidé MeSH
• molekulární biologie MeSH
• nádorové biomarkery analýza   MeSH
• prognóza MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• přehledy MeSH

• Publikační typ
• abstrakty MeSH

• Publikační typ
• abstrakty MeSH

• Publikační typ
• abstrakty MeSH

• Publikační typ
• abstrakty MeSH