DNA mutation
Dotaz
Zobrazit nápovědu
sv.
V současné době prudce narůstá množství identifikovaných genů, které jsou-li poškozeny nebo je-li změněna jejich funkce či regulační vztahy způsobují dědičnou predispozici k určitému onemocnění. Molekulárně genetická diagnostika je nyní dostupnou součástí vyšetření u řady geneticky podmíněných chorob. Laboratorní metody umožňují detekci široké škály mutací, které lze obecně definovat jako odchylky od specifické DNA sekvence ve srovnání s referenční sekvencí zveřejněnou v genové databázi. V některých případech je však obtížné rozlišit, zda je detekovaná sekvenční varianta hledanou onemocnění způsobující mutací nebo zda se jedná o neutrální (polymorfní) variantu nemající vztah k onemocnění jedince. Dědičné formy komplexních onemocnění, jako jsou například hereditární formy nádorových onemocnění, jsou z hlediska interpretace závažnosti mutace velmi problematickou skupinou. Další analýzy na DNA a na proteinové úrovni s využitím bioinformatiky však mohou míru patogenity sekvenčních variant nejasného významu odhalit. Určení konkrétní příčiny genetické predispozice k onemocnění a míra patogenity za onemocnění odpovědné mutace má význam pro včasný záchyt jedinců ve velkém riziku onemocnění, pro cílená preventivní a léčebná opatření a umožňuje v závažných případech prenatální nebo případně také preimplantační diagnostiku.
Molecular genetic diagnostics is available for increasing number of genetically determined diseases. Awide spectrum of mutations can be detected by laboratory methods. A mutation can be defined as a change in a specific DNA sequence when compared with the reference sequence published in the gene database. However, in some cases it is difficult to distinguish if the detected sequence variant is a causal mutation or a neutral (polymorphic) variation without any effect on phenotype. The interpretation of rare sequence variants of unknown significance detected in disease-causing genes becomes an increasingly important problem. Further analysis on DNA and on protein levels with the use of bioinformatics are needed to reveal the effect of rare sequence variants. Inherited complex disorders, for example rare hereditary forms of cancer diseases, represent a challenge tomolecular geneticists. The identification of exact causal mutation directly responsible for the development of the disease and for the assessment of disease risk resulting from this genetic variation has further implications. Predictive genetic diagnostics allows identify relatives at high risk of genetically determined disease and use of targeted preventive and therapeutic approaches. In severe cases it allows also prenatal or pre-implantation diagnostics.
Mutation research, ISSN 0027-5107 vol. 482, suppl. 1, October 2001
S157 s. ; 28 cm
- MeSH
- molekulární biologie MeSH
- mutace MeSH
- mutageneze MeSH
- mutageny MeSH
- oprava DNA MeSH
- toxikologie MeSH
- Publikační typ
- rejstříky MeSH
- Konspekt
- Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
- NLK Obory
- biologie
xiv, 364 s. : il.
Východisko. Friedreichova ataxie je autozomálně recesivní neurodegenerativní onemocnění s incidencí 1 - 2 : 100 000. V 95 % případů je příčinou Friedreichovy ataxie expanze GAA tripletu uvnitř prvního intronu genu X25 lokalizovaného na 9q. Cílem práce bylo zavést jednoduchou a spolehlivou DNA diagnostickou metodu, která by pomohla při specifikaci spinocerebelárních ataxií. Metody a výsledky. Naše diagnostika je založena na rozlišení normální a mutované alely genu X25 pomocí PCR a následné elektroforézy v agarózovém gelu. U normální alely dosahuje velikost PCR produktu v našem případě 521 - 614 bp, což odpovídá 7 - 38 GAA tripletům v alele. Naproti tomu v případě mutantních alel s 200 až 1200 GAA triplety je délka produktu až 4100 bp. Po zavedení metody bylo analyzováno 12 vyšetřovaných, z nichž 4 byli diagnostikováni jako pozitivní pro Friedreichovu ataxii. Závěry. Podařilo se zavést rychlou, neradioaktivní, spolehlivou DNA diagnostickou metodu. Jejím přínosem je možnost rozpoznání přenašečů, což dovoluje provádět skríningová vyšetření rizikových rodin.
Background. Friedreich's ataxia is an autosomal recessive, neurodegenerative disease with a prevalence of 1 - 2 : 100 000. Ninety five % of cases are caused by Friedreich's ataxia expansion of GAA triplet repeat in the first intron of the X25 gene. The gene is mapped on chromosome 9q. The objective of the investigation was to introduce simple and reliable DNA diagnosis helping to specify of spinocerebellare ataxias. Methods and Results. Our diagnosis is based on the differentiation of normal and mutant alleles of gene X25 with PCR and electrophoresis on agarose gel. Size of PCR product of normal allele is in our case 521 - 614 bp. It is responding to 7 - 38 GAA triplets. Size of mutant alleles with 200 - 1200 GAA triplets is as 4100 bp. After the method was introduced, we analysed 12 probands. Four of them suffered from Friedreich's ataxia. Conclusions. We introduced a fast, non-radioactive, reliable DNA diagnostic method. The contribution of this method is defection of carriers and we can screen of families with the risk of Friedreich's ataxia.
Tistena podoba seznamy pracovisf DNA-diagnostiky rozsiruje prvni seznam, ktery vysel v Praktickem lekari v roce 1994, o dalsf pracoviste a nabidku dalsich vysetrem. Dues jiz jsou seznamy dostupne na internetu.
The printed list of departments of DNA diagnosis extends the version published in 1994 in Prakticky lekar by further departments and extends also the offer of further examinations. Nowadays the lists are available on the internet.
[1st ed.] xiv, 330 s. : il.
Metylace DNA je vedle acetylace histonových proteinů jedním ze dvou globálních mechanizmů, kterým je řízena genová exprese. Profily metylace DNA se během vývoje organizmu i v průběhu nádorového onemocnění mění. V nádorových buňkách jsou pozorovány tři změny profilů metylace DNA: hypometylace, hypermetylace a ztráta imprintingu. Metylaci DNA lze považovat vedle intragenové mutace a ztráty heterozygozity za třetí cestu inaktivace tumor-supresorových genů v genezi nádorového onemocnění. V předkládaném přehledném článku popisujeme nedávné poznatky a hypotézy o úloze metylace DNA při vzniku nádorového onemocnění a uvádíme možné aplikace v diagnostice a terapii nádorových onemocnění.
DNA methylation and acetylation of histone proteins represent two global mechanisms controlling the gene expression. DNA methylation profiles alter during the development of the organism and during progression of neoplasia. Three types of alterations of the DNA methylation profiles were observed in the tumor cells: hypo- methylation, hypermethylation and the loss of imprinting. Beside the intra-gene mutation and the heterozygosity absence, DNA methylation can be understood as the third mechanism of tumor-suppressor gene inactivation in the genesis of neoplasia. Our review article brings recent findings and hypotheses on the role of DNA methylation in the carcinogenesis and its possible application in the diagnostics and therapy of the malignant proliferation.
