Nově zavedenými molekulárními metodami na přímý průkaz infekcí S. aureus, MRSA, small colny variants (SCV) S. aureus a SCV-MRSA a speciálními kultivačními metodami opakovaně vyšetříme klinický materiál pacientů s CF (ročně zhruba 300 kmenů). Nově zavedené molekulárně diagnostické a typizační metody umožní přímý průkaz a klonální charakterizaci patogena, ale i analýzu rezistence (determinanty rezistence, hypermutatorový typ rezistence) a virulence (superantigeny, gen pvl). Aplikace těchto progresivních metod a interpretace jejich výsledků poslouží k přímé racionalizaci léčby konkrétních pacientů s CF. Analýza intracelulární perzistence a citlivosti kmenů k bakteriofágům, s důrazem na SCV a SCV-MRSA, in vitro vytvoří předpoklady pro další studium specifické fagoterapie u pacientů s CF.; The newly developed molecular methods for direct detection of S. aureus, MRSA, small colony variants (SCV) of S. aureus and SCV-MRSA and special culture methods will be used for repeat analyses of clinical specimens from CF patients (about 300 strains per year). The molecular diagnostic and typing methods will be helpful not only in direct detection and clonal characterization of the pathogen but also in the analysis of resistance (resistance determinants, hypermutator phenotype) and virulence (superantigens, the pvl gene). The obtained results and their interpretation will be vital for tailored treatment of CF patients. The analysis of intracellular persistence of strains and their in vitro susceptibility to bacteriophages, with emphasis on SCV and SCV-MRSA strains, will be a point of departure for the development of candidate phage therapy in CF patients.

• MeSH
• cystická fibróza komplikace   mikrobiologie   MeSH
• diagnostické techniky molekulární MeSH
• methicilin rezistentní Staphylococcus aureus MeSH
• molekulární biologie MeSH
• polymerázová řetězová reakce MeSH
• stafylokokové infekce MeSH
• Staphylococcus aureus patogenita   MeSH

• Konspekt
• Mikrobiologie
• NLK Obory
• bakteriologie
• genetika, lékařská genetika
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Rostoucí výskyt rezistencí u původců nozokomiálních infekcí je jedním z hlavních problémů současné medicíny. Úspěšnou léčbu dále komplikuje schopnost těchto bakterií růst ve formě biofilmu. Mezi perspektivní alternativy léčby takových infekcí patří využití bakteriofágů. V rámci projektu budou izolovány nové fágy či jejich subtypy účinné vůči nozokomiálním kmenům stafylokoků a pseudomonád. Fágy budou podrobně charakterizovány z hlediska jejich biologických a genetických vlastností, včetně kompletní sekvence genomu. Pomocí metod kapilární elektroforézy bude ověřena možnost jejich kvantifikace ve vzorku pro účely kontroly kvality fágové kultury. Účinky těchto fágů či jejich synergické kombinace s antimikrobiálními látkami budou ověřovány na nozokomiálních izolátech, zejm. na multirezistentních kmenech. Na základě analýzy schopnosti testovaných fágů infikovat bakterie perzistující uvnitř makrofágů a bakterie rostoucí ve formě biofilmu bude navržena optimální terapeutická strategie pro léčbu chronických infekcí spojených s intracelulárním přežíváním bakterií či s tvorbou biofilmu.; The increasing resistance in agents of nosocomial infections is one of the main problems of current medicine. The efficient treatment is also complicated by their ability to form biofilm. One of perspective alternatives to the treatment of these infections is the use of bacteriophages. The project is focused on the isolation of new phages and their subtypes effective against multiresistant strains of staphylococci and pseudomonades. Phages will be biologically and genetically characterized, including complete genome sequence. Capillary electrophoresis methods will be employed for the detection of phages in cultures. The lytic effect of the virulent phages as well as the synergistic effect of bacteriophages with antimicrobials will be assessed on nosocomial isolates. Within the analysis of tested phages and their ability to induce infections in bacteria persisting intracellulary in macrophages and bacteria growing in biofilm, the optimal therapeutic strategy for the treatment of chronic infections caused by intracellular-living and/or biofilm-forming bacteria will be proposed.

• MeSH
• antiinfekční látky terapeutické užití   MeSH
• biofilmy účinky léků   MeSH
• elektroforéza MeSH
• fágová terapie metody   MeSH
• infekce spojené se zdravotní péčí terapie   MeSH
• lidé MeSH
• mnohočetná bakteriální léková rezistence účinky léků   MeSH
• Pseudomonas aeruginosa izolace a purifikace   MeSH
• Staphylococcus aureus izolace a purifikace   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• infekční lékařství
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Analýza výskytu vankomycin-rezistentních enterokolů humánní a animální provenience v olomouckém regionu, analýza jejich chromozomální i plazmidové DNA. Vliv selekčního tlaku antimikrobních preparátů na výskyt vankomycin-rezistentních enterokoků a možnosti jejich prevence v rámci racionální antobiotické politiky. Zavedení metodiky, umožňující rychlou a spolehlivou detekci determinant rezistence typu VanA a VanB pomocí PCR.amplifikace specifických genů kódujících rezistenci k vankomycinu.; Analysis of occurrence of vancomycin-resistant enterococci of human and animal origin in the region of Olomouc, analysis of their chromosomal and plasmide DNA. Effect of selection pressure of antimicrobial agents on the occurrence of vancomycin-resistantenterococci and possibilites of their prevention in the frame of rational antibiotic policy. Implementation of method enabling fast and reliable detection of determining factors of VanA and VanB resistance using PCR - amplification of specific genes coding resistance against vancomycin.

• MeSH
• antibiotická profylaxe MeSH
• bakteriální chromozomy MeSH
• bakteriální léková rezistence MeSH
• DNA bakterií analýza   MeSH
• Enterococcus faecalis MeSH
• rezistence na vankomycin MeSH

• Konspekt
• Mikrobiologie
• NLK Obory
• farmacie a farmakologie
• infekční lékařství
• biologie
• mikrobiologie, lékařská mikrobiologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Určení patogenního stafylokoka S. aureus pomocí mutant jeho polyvalentního fága XXX XXX XXX

• MeSH
• stafylokokové bakteriofágy analýza   MeSH
• stafylokokové infekce genetika   diagnóza   MeSH

• Konspekt
• Obecná genetika. Obecná cytogenetika. Evoluce
• NLK Obory
• radiologie, nukleární medicína a zobrazovací metody
• mikrobiologie, lékařská mikrobiologie
• embryologie a teratologie
• genetika, lékařská genetika
• chemie, klinická chemie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

• Klíčová slova
• Staphylococcus pseudintermedius, MLSB rezistence,
• MeSH
• bakteriální léková rezistence * MeSH
• faktory virulence * genetika   klasifikace   MeSH
• genotyp MeSH
• methicilin MeSH
• mikrobiální testy citlivosti metody   MeSH
• mnohočetná bakteriální léková rezistence MeSH
• multiplexová polymerázová řetězová reakce metody   MeSH
• psi MeSH
• stafylokokové infekce kůže * mikrobiologie   MeSH
• stafylokokové infekce mikrobiologie   MeSH
• Staphylococcus * genetika   klasifikace   patogenita   MeSH
• virulence genetika   MeSH
• zvířata MeSH
• Check Tag
• psi MeSH
• zvířata MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

Staphylococcus aureus is one of the most frequent pathogens infecting the respiratory tract of patients with cystic fibrosis (CF). This study was the first to examine S. aureus isolates from CF patients in the Czech Republic. Among 100 S. aureus isolates from 92 of 107 observed patients, we found a high prevalence of resistance to macrolide-lincosamide-streptogramin B (MLS(B)) antibiotics (56%). More than half of the resistant strains (29 of 56) carried a mutation in the MLS(B) target site. The emergence of MLS(B) resistance and mutations conferring resistance to MLS(B) antibiotics was associated with azithromycin treatment (p=0.000000184 and p=0.000681, respectively). Methicillin resistance was only detected in 3% of isolates and the rate of resistance to other antibiotics did not exceed 12%. The prevalence of small-colony variant (SCV) strains was relatively low (9%) and eight of nine isolates with the SCV phenotype were thymidine dependent. The study population of S. aureus was heterogeneous in structure and both the most prevalent community-associated and hospital-acquired clonal lineages were represented. Of the virulence genes, enterotoxin genes seg (n=52), sei (n=49), and sec (n=16) were the most frequently detected among the isolates. The PVL genes (lukS-PV and lukF-PV) have not been revealed in any of the isolates.

• MeSH
• antibakteriální látky farmakologie   terapeutické užití   MeSH
• azithromycin terapeutické užití   MeSH
• bakteriální léková rezistence genetika   MeSH
• cystická fibróza mikrobiologie   MeSH
• dlouhodobá péče MeSH
• infekce spojené se zdravotní péčí mikrobiologie   MeSH
• lidé MeSH
• methicilin rezistentní Staphylococcus aureus účinky léků   MeSH
• mikrobiální testy citlivosti MeSH
• mutace genetika   MeSH
• ribozomy genetika   MeSH
• stafylokokové infekce farmakoterapie   mikrobiologie   MeSH
• Staphylococcus aureus účinky léků   genetika   MeSH
• thymidin genetika   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

V letošním roce byl popsán nový druh stafylokoka, Staphylococcus petrasii. Kmeny tohoto druhu se vyskytují v humánním klinickém materiálu a hrají zřejmě roli podmíněného patogena podobně jako řada dalších koagulázanegativních stafylokoků. Dosud byly nejspíše identifikovány jako atypické Staphylococcus warneri, s kterými jsou fenotypově nejbližší. Fylogeneticky jsou nejblíže k druhům Staphylococcus haemolyticus, Staphylococcus hominis, Staphylococccus devriesei a Staphylococccus lugdunensis.

A novel staphylococcal species, Staphylococcus petrasii, has recently been described. Strains of this species were isolated from human clinical specimens and are likely to be opportunistic pathogens, similarly to other coagulase- negative staphylococci. Previously, they may have been identified as atypical Staphylococcus werneri, to which they are phenotypically closest. Phylogenetically, they are closest to the species Staphylococcus haemolyticus, Staphylococcus hominis, Staphylococccus devriesei, and Staphylococccus lugdunensis.

• Klíčová slova
• koagulázanegativní stafylokoky, S. petrasii, taxonomie rodu Staphylococcus,
• MeSH
• fenotyp MeSH
• fylogeneze MeSH
• genotyp MeSH
• lidé MeSH
• Staphylococcus * izolace a purifikace   klasifikace   patogenita   růst a vývoj   účinky léků   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

• Publikační typ
• abstrakt z konference MeSH

• Publikační typ
• abstrakt z konference MeSH