Alzheimerova choroba (AD) je progresivní mozkové onemocnění, které poškozuje a nakonec ničí mozkové buňky, což vede ke ztrátě paměti, myšlení a poškození dalších mozkových funkcí. V současné době je AD jednou z hlavních příčin úmrtí ve vyspělých zemích a jediná z první desítky nemocí, u které nemáme k dispozici prostředky na léčbu, prevenci nebo alespoň k významnému zpomalení progrese. Z těchto důvodů se intenzivně hledají nové terapeutické postupy pro zlepšení přežití a kvality života pacientů s AD a jejich rodin. Náš předchozí výzkum vedl k identifikaci nových selektivních nukleosidových inhibitorů MARK4 kinázy, která je zapojená v rozvoji patologie u AD. V předkládaném projektu navrhujeme komplexní translační výzkum vedoucí k syntéze a ověřování biologické aktivity syntetických inhibitorů MARK4 kinázy v in vitro anebo in vivo podmínkách s využitím zvířecích i lidských modelů AD a identifikaci preklinických kandidátů léčiv proti Alzheimerově chorobě.; Alzheimer disease (AD) is a progressive brain disorder that damages and eventually destroys brain cells, leading to a loss of memory, thinking and other brain functions. Currently, AD is one of the major cause of death in developed countries and the only one of the top ten without a means to prevent, cure or significantly slow its progression. Therefore, the new therapeutic concepts are urgently needed to improve survival and quality of life for AD patients and families. Our previous work resulted in identification of novel selective nucleoside based inhibitors of MARK4 kinase, which has been implicated in development of AD pathology. Here we propose complex translational research leading to synthesis and validation of biological activities of MARK4 inhibitors under both in vitro and in vivo conditions using animal and human models of AD and identification of preclinical candidates for anti-Alzheimer drugs.

• MeSH
• Alzheimerova nemoc farmakoterapie   MeSH
• inhibitory proteinkinas terapeutické užití   MeSH
• lidé MeSH
• modely nemocí na zvířatech MeSH
• myši MeSH
• nukleosidy terapeutické užití   MeSH
• nukleotidy terapeutické užití   MeSH
• translační biomedicínský výzkum MeSH
• zvířata MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• myši MeSH
• zvířata MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• neurologie
• farmacie a farmakologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Amyloidóza zahrnuje skupinu onemocnění, pro než jsou typická depozita chybně složeného proteinového materiálu v různých tkáních. Stanovení diagnózy není snadné, a to navzdory zlepšení diagnostiky, terapie i zvýšeného zájmu vědců v posledních dekádách. Kromě klinického vyšetření je nezbytná biopsie tkáně s průkazem amyloidu. Přesné určení typu amyloidu je stěžejní pro volbu vhodné strategie péče o pacienta, která se mezi jednotlivými typy nemoci podstatně liší. V současnosti dominují metody založené na reakci antigen-protilátka, avšak nové postupy využívající hmotnostní spektrometrii odstranily rizika spojená s imunologickou detekcí proteinu a jsou vysoce specifické a sensitivní při přímém průkazu proteinu z malého množství tkáně. V tomto kontextu jsme se rozhodli zlepšit možnosti diagnostiky amyloidózy a identifikovat nové potencionální proteomické biomarkery a specifická fluorescenční barviva. Zapojením center při fakultních nemocnicích vznikla pracovní skupina, jejímž cílem je maximalizace počtu vyšetřených vzorků a usnadnění vzájemné spolupráce s výrazným benefitem pro pacienta.; Amyloidosis is a group of diseases resulting from misfolded protein deposits. Despite better diagnostics and therapy and also covering up in research activities in last decades, examination of patients with suspected disease is not yet straight-forward process. Apart from clinical check-up, a biopsy with proof of deposits is crucial. The subsequent correct amyloid typing is obligate due to disease-bound different attitude to patients and is mainly aimed to antigen-antibody based methods. To avoid frequent non-specific immuno-protein detection, the new methodology based on mass spectrometry seems to be highly specific and sensitive with direct protein recognition in a small amount of tissue. Therefore and in the frame of the proposed project we have decided to improve amyloidosis diagnostics opportunities, to identify new potential proteomic biomarkers and specific fluorescent labels. To facilitate mutual collaboration for the patient benefit and maximise number of analysed samples we have established consortium where four Czech University hospital centres are involved.

• MeSH
• amyloid chemie   MeSH
• amyloidóza diagnostické zobrazování   MeSH
• biologické markery chemie   MeSH
• fluorescenční barviva analýza   MeSH
• imunohistochemie metody   MeSH
• lidé MeSH
• optické zobrazování metody   MeSH
• proteomika metody   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• vnitřní lékařství
• experimentální medicína
• biochemie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Kondenzát vydechovaného vzduchu (EBC) představuje bohatý zdroj biomarkerů, které mohou poskytnout cenné informace o respiračních stejně jako o systémových onemocněních. Nalezení neinvazivních metod pro včasnou detekci poškození plic, zánětu a infekčních komplikací u chronických onemocnění, jako je cystická fibróza (CF) nebo astma bronchiale (AB) by bylo velmi přínosné. Navrhujeme proměřit proteinové "dechové otisky" z EBC, tvořící molekulární podpisy plicního zánětu a specifických respiračních bakteriálních infekcí u pacientů s CF a AB. Předpokládáme, že analýza EBC může odhalit biomarkery specifické pro tíži zánětu a identifikovat infekce způsobené oportunními patogeny, jako je např. P. aeruginosa (PA). Tyto dechové profily plánujeme korelovat s nálezy plicní mikroflóry pomocí tradičních metod a s tíží onemocnění cystickou fibrózou. Předpokládáme, že naše studie urychlí využití analýzy EBC jako nového nástroje pro stanovení správné diagnózy AB a umožní neinvazivní sledování aktivity onemocnění CF, účinnosti léčby a zpřesní diagnostiku oportunních infekcí.; Exhaled breath condensate (EBC) represents a rich source for countless biomarkers that can provide valuable information about respiratory as well as systemic diseases. Finding non-invasive methods for early detection of lung injury, inflamation and infectious complications in chronic diseases like Cystic fibrosis (CF) or bronchial asthma (AB) would be highly beneficial. We propose to establish EBC “breath-prints” revealing molecular signatures of pulmonary inflammation and specific respiratory bacterial infections of CF patients and AB. We hypothesize that the analysis of EBC can reveal biomarkers specific for severity of the inflammation and infection caused by opportunistic pathogens such as P. aeruginosa. With these breath-prints, we also propose to establish correlations between respiratory microbiota using traditional methods and CF lung disease severity. Together, our studies will advance the development and validation of EBC as a novel tool for the proper diagnosis of AB and monitoring of CF disease activity, treatment efficacy and diagnosis of opportunistic infections.

• MeSH
• biologické markery MeSH
• bronchiální astma diagnóza   genetika   MeSH
• cystická fibróza diagnóza   genetika   MeSH
• dechové testy metody   MeSH
• lidé MeSH
• proteomika metody   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• pneumologie a ftizeologie
• genetika, lékařská genetika
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Identifikace buněčných cílů aktivních látek má zásadní význam pro optimalizaci léčiv a minimalizaci jejich nežádoucích vedlejších účinků. Komplexní povaha biologických systémů ztěžuje tuto identifikaci, ale mikroskopické metody, zejména fenotypové testování, reprezentované metodou „Cell Painting“, představují cenný nástroj pro pochopení vlivu látek na úrovni buněk a organel. Tyto metody umožňují rychlé testování rozsáhlých knihoven látek a nabízejí unikátní pohled na mechanismus jejich účinku pozorováním chování buněk, pomocí hodnocení jejich morfologie, pohyblivosti, dělení a migrace. Mikroskopie živých buněk čelí výzvám, jako je fototoxicita, což vyžaduje pečlivý výběr fluorescenčních značek a optimalizaci podmínek. Mezi syntetickými fluorescenčními sondami pro mikroskopii živých buněk vynikají BODIPY barviva se svou syntetickou univerzálností a fotofyzikálními vlastnostmi, které zajišťují minimální poškození vzorku během biozobrazování.

Target identification of active substances is critical in optimizing drugs and minimizing side effects. The complex nature of biological systems presents challenges; to meet them, however, microscopic methods, particularly phenotypic screening, represented by "Cell Painting" method and fluorescent probes, can be used as valuable tools for understanding the impact of various substances at the cellular and organelle levels. These methods enable rapid testing of large libraries of compounds and offer unique insights into their mechanism of action by observing cell behavior, assessing cell morphology, motility, division, and migration. However, live cell microscopy faces challenges like phototoxicity, requiring a careful selection of fluorescent labels and optimized conditions. Among synthetic probes for live cell microscopy, BODIPY dyes stand out for their synthetic versatility and photophysical properties, providing minimal sample damage during bioimaging.

• MeSH
• farmakologické účinky - molekulární mechanismy * MeSH
• fluorescenční barviva chemie   MeSH
• lidé MeSH
• mikroskopie metody   MeSH
• rychlé screeningové testy metody   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

Waldenströmova makroglobulinémie (WM) patří k low-grade B-lymfomům. Je definována přítomností lymfoplazmocytárního lymfomu v kostní dřeni a monoklonálního imunoglobulinu typu IgM (M-IgM) v séru. Příznaky nemoci, anémie a trombocytopenie, mohou souviset s masou patologických buněk, stejně jako systémové zánětlivé projevy (B-symptomy). Velké spektrum symptomů však způsobuje M-IgM. Koncentrace M-IgM u WM nekoreluje s masou patologických buněk. Spektrum poruch způsobených M-IgM je vzhledem k diverzitě patofyziologických mechanizmů a lokalizaci poškození značně široké. Poškození může vzniknout depozicí kompletní molekuly nebo její části ve formě agregátů, amorfních, krystalických, mikrotubulárních či fibrilárních struktur. M-IgM může také pacienta poškozovat autoprotilátkovou aktivitou namířenou proti antigenům vlastních tkání. Dále může M-IgM tvořit imunitní komplexy a aktivovat komplement. Výjimečně může B buněčný klon indukovat tvorbu cytokinů. Proto je velmi obtížené včas rozpoznat symptomatickou formu WM. V této publikaci popisujeme pacientku poškozenou depozity M-IgM a řetězců lambda. Diskuze je zaměřena na přehled všech forem poškození člověka depozity M-IgM, mezi něž patří i popsaný případ.

Waldenström’s macroglobulinaemia (WM) is a low-grade B-cell lymphoproliferative disorder characterised by an immunoglobulin IgM monoclonal gammopathy and bone marrow infiltration by lymphoplasmacytic lymphoma. Clinical features may be related to the overall disease burden, such as anaemia, thrombocytopenia, and constitutional inflammatory symptoms, or may be directly attributable to the IgM paraprotein. The concentration of monoclonal IgM can vary widely in WM. There is no direct relationship between the concentration of monoclonal immunoglobulin IgM and bone marrow infiltration. The spectrum of monoclonal immunoglobulin IgM-related disorders is large because of the diversity of involved organs and pathogenic mechanisms. Lesions commonly result from the deposition of all or part of the M-IgM as aggregates, amorphous, crystalline, microtubular, or fibrillar forms. Other mechanisms include autoantibody activity against a tissue antigen, formation of immune complexes, and complement activation. In addition, even a small B-cell clone may absorb biologically active molecules or induce cytokine secretion. In our case report, we describe a female patient with monoclonal IgM and lambda liver deposition and we discuss the frequency and variety of disorders caused by deposition of monoclonal IgM and free light chain.

• Klíčová slova
• imunokomplexy,
• MeSH
• amyloid imunologie   klasifikace   MeSH
• amyloidóza diagnóza   imunologie   klasifikace   patologie   MeSH
• hepatomegalie etiologie   imunologie   MeSH
• imunoglobulin M imunologie   krev   škodlivé účinky   MeSH
• krevní nemoci diagnóza   etiologie   krev   MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• Waldenströmova makroglobulinemie * diagnostické zobrazování   diagnóza   imunologie   patologie   MeSH
• Check Tag
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• kazuistiky MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

Advancements in small-molecule research have created the need for sensitive techniques to accurately study biological processes in living systems. Fluorescent-labeled probes have become indispensable tools, particularly those that use boron-dipyrromethene (BODIPY) dyes. Terpenes and terpenoids are organic compounds found in nature that offer diverse biological activities, and BODIPY-based probes play a crucial role in studying these compounds. Monoterpene-BODIPY conjugates have exhibited potential for staining bacterial and fungal cells. Sesquiterpene-BODIPY derivatives have been used to study sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase (SERCA), indicating their potential for drug development. Owing to their unique properties, diterpenes have been investigated using BODIPY conjugates to evaluate their mechanisms of action. Triterpene-BODIPY conjugates have been synthesized for biological studies, with different spacers affecting their cytotoxicity. Fluorescent probes, inspired by terpenoid-containing vitamins, have also been developed. Derivatives of tocopherol, coenzyme Q10, and vitamin K1 can provide insights into their oxidation-reduction abilities. All these probes have diverse applications, including the study of cell membranes to investigate immune responses and antioxidant properties. Further research in this field can help better understand and use terpenes and terpenoids in various biological contexts.

• MeSH
• fluorescenční barviva chemie   MeSH
• lidé MeSH
• molekulární struktura MeSH
• sloučeniny boru * chemie   farmakologie   MeSH
• terpeny * chemie   farmakologie   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH
• přehledy MeSH

Bruton's tyrosine kinase (BTK) is a non-RTK cytoplasmic kinase predominantly expressed by hemopoietic lineages, particularly B-cells. A new oxindole-based focused library was designed to identify potent compounds targeting the BTK protein as anticancer agents. This study used rational approaches like structure-based pharmacophore modeling, docking, and ADME properties to select compounds. Molecular dynamics simulations carried out at 20 ns supported the stability of compound 9g within the binding pocket. All the compounds were synthesized and subjected to biological screening on two BTK-expressing cancer cell lines, RAMOS and K562; six non-BTK cancer cell lines, A549, HCT116 (parental and p53-/-), U2OS, JURKAT, and CCRF-CEM; and two non-malignant fibroblast lines, BJ and MRC-5. This study resulted in the identification of four new compounds, 9b, 9f, 9g, and 9h, possessing free binding energies of -10.8, -11.1, -11.3, and -10.8 kcal/mol, respectively, and displaying selective cytotoxicity against BTK-high RAMOS cells. Further analysis demonstrated the antiproliferative activity of 9h in RAMOS cells through selective inhibition of pBTK (Tyr223) without affecting Lyn and Syk, upstream proteins in the BCR signaling pathway. In conclusion, we identified a promising oxindole derivative (9h) that shows specificity in modulating BTK signaling pathways.

• Publikační typ
• časopisecké články MeSH

A series of heterocyclic chloroquine hybrids, containing a chain of two carbon atoms at position four of the quinolinic chain and acting as a link between quinoline and several benzoyl groups, is synthesized and screened in vitro as an inhibitor of β-hematin formation and in vivo for its antimalarial activity against chloroquine-sensitive strains of Plasmodium berghei ANKA in this study. The compounds significantly reduced haeme crystallization, with IC50 values < 10 μM. The values were comparable to chloroquine's, with an IC50 of 1.50 ± 0.01 μM. The compounds 4c and 4e prolonged the average survival time of the infected mice to 16.7 ± 2.16 and 14.4 ± 1.20 days, respectively. We also studied the effect of the compounds 4b, 4c, and 4e on another important human parasite, Leishmania mexicana, which is responsible for cutaneous leishmaniasis, demonstrating a potential leishmanicidal effect against promasigotes, with an IC50 < 10 μM. Concerning the possible mechanism of action of these compounds on Lesihmania mexicana, we performed experiments demonstrating that these three compounds could induce the collapse of the parasite mitochondrial electrochemical membrane potential (Δφ). The in vitro cytotoxicity assays against mammalian cancerous and noncancerous human cell lines showed that the studied compounds exhibit low cytotoxic effects. The ADME/Tox analysis predicted moderate lipophilicity values, low unbound fraction values, and a poor distribution for these compounds. Therefore, moderate bioavailability was expected. We calculated other molecular descriptors, such as the topological polar surface area, according to Veber's rules, and except for 2 and 4i, the rest of the compounds violated this descriptor, demonstrating the low antimalarial activity of our compounds in vivo.

• Publikační typ
• časopisecké články MeSH

Cervikální hlen je viskózní kapalina fungující jako zátka děložního čípku. V cervikálním hlenu můžeme detekovat produkty endometriálních a cervikálních žláz. Cervikální hlen je dále obohacen transudátem pocházejícím z vejcovodů a proteiny pocházející z vaječníků, peritonea a vzdálených tkání. Se zvyšující se hladinou ovariálních estrogenů se vlastnosti cervikálního hlenu mění tak, že umožňují snadnější odběr a zpracování. Z tohoto důvodu jsme vybrali skupinu deseti pacientek léčených kontrolovanou ovariální hyperstimulací pro in vitro fertilizaci v centru asistované reprodukce. Tato studie se zaměřuje na proteomickou charakterizaci cervikálního hlenu a na buněčnou a tkáňovou lokalizaci identifikovaných proteinů. Nejvíce intenzivními proteiny identifikovanými v cervikálním hlenu jsou muciny, ale bylo nalezeno také mnoho méně abundantních proteinů vnitrobuněčného původu. Analýza tkáňových expresí odhalila mnoho proteinů, které jsou kromě tkání ženských reprodukčních orgánů exprimovány také v jiných tkáních a mimo jiné také proteiny specifické pro varlata, játra, placentu, oční sítnici a mozeček. Tato studie dále potvrzuje vhodnost cervikálního hlenu jako zdroje proteomických biomarkerů nejen pro diagnostiku ženského reprodukčního traktu.

Cervical mucus is a viscous fluid functioning as a cervix plug. Products of the endometrial and cervical glands can be detected in the cervical mucus. Cervical mucus is further enriched with transudate originating from the fallopian tubes and proteins originating from the ovaries, peritoneum and distant tissues. With increasing levels of ovarian estrogens, the properties of cervical mucus for possible collection and processing change appropriately. For these reasons, we chose a group of 10 patients treated in the center of assisted reproduction by controlled ovarian stimulation for in vitro fertilization. This study focuses on the proteomic characterization of cervical mucus and localizes the possible sources of the identified proteins. The most abundant proteins were extracellular proteins, mainly mucins; however, most of the identified proteins, present usually in lower quantities, were of intracellular origin. The tissue analysis revealed that proteins from female reproductive organs are also expressed in other tissues in addition to female reproductive organs, but also proteins specific to the testis, liver, placenta, retina, and cerebellum. This study confirms the suitability and high potential of cervical mucus as a source of proteomic biomarkers not only for the diagnosis of the female reproductive tract.

• Klíčová slova
• tkáňové exprese,
• MeSH
• cervikální hlen * chemie   MeSH
• klinická studie jako téma MeSH
• lidé MeSH
• proteomika MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• ženské pohlaví MeSH

• Publikační typ
• abstrakt z konference MeSH