Periprotetická osteolýza (PPOL) a aseptické uvolnění (AU), nejčastější pozdní komplikace totálních endoprotéz (TEP) kyčlí a kolen, a také infekce kloubní náhrady (IKN) jsou spojovány s individuální genovou predispozicí. Identifikace imunogenetických faktorů společně s dalšími klinicky významnými parametry asociovanými s PPOL/AU/IKN jsou nezbytné k předoperačnímu určení rizika vzniku zmíněných komplikací. V našem projektu se zaměříme na vyšetření panelu funkčních polymorfismů v genech asociovaných se zánětlivou odpovědí a oxidačním stresem u pacientů s TEP kyčlí a kolen s cílem identifikovat rizikové haplotypy asociované s PPOL/AU/IKN. Dalším cílem je vývoj elektronického kalkulátoru, který by měl umožnit stanovit riziko předčasného selhání TEP a reoperace na základě moderních metod informatiky a biostatistiky. Tyto metody dovolují současné zpracování velkých dat z imunogenetického profilu a dalších klinických, implantátových a laboratorních parametrů. U pacientů se zvýšeným rizikem selhání TEP je možné aplikovat preventivní opatření (implantát, perioperační, pooperační intervence).; Periprosthetic osteolysis (PPOL) and aseptic loosening (AL), the major long-term complications of total joint arthroplasties (TJAs), as well as prosthetic joint infection (PJI) are associated with individual susceptibility to these complications. The identification of imunogenetic risk factors together with other clinical and laboratory markers associated with susceptibility to PPOL/AL/PJI are critically needed for the prediction of failure of TJAs. We will therefore investigate a comprehensive set of functional polymorphisms in genes related to inflammation and oxidative stress in TJAs patients in order to identify the risk haplotypes associated with TJAs complications. Moreover, we will develop a tool for estimating a risk for failure of TJAs (“electronic risk calculator”) integrating individual “imunogenetic” susceptibility to PPOL/AL/PJI and other patient-, implant-, and surgeon-related data. This electronic tool should enable more precise preoperative identification of patients at risk for failure of THA/TKA in routine clinical practice with applying a preventative measures.

• MeSH
• genetické testování MeSH
• imunogenetické jevy MeSH
• infekce spojené s protézou prevence a kontrola   MeSH
• lidé MeSH
• náhrada kyčelního kloubu škodlivé účinky   MeSH
• reoperace MeSH
• rizikové faktory MeSH
• sekundární prevence MeSH
• totální endoprotéza kolene škodlivé účinky   MeSH
• výpočetní biologie MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• genetika, lékařská genetika
• preventivní medicína
• chirurgie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Chronická lymfocytární leukémie (CLL) je nejčastější leukémií v západních zemích. Časný relaps nebo rezistence na iniciální léčbu jsou spojeny s nepříznivou prognózou a významně zkracují přežití nemocných. Identifikace pacientů s vysokým rizikem relabující/refrakterní nemoci by umožnila nabídnout těmto pacientům včasnou personalizovanou léčbu novými léky na bázi inhibitorů BCR signální dráhy a BCL2 antagonistů. S cílem identifikovat rizikové haplotypy, které jsou spojeny s relabující/refrakterní CLL, budeme studovat panel funkčních polymorfismů v genech asociovaných se zánětlivou odpovědí a oxidačním stresem. Dalším cílem je vývoj elektronické aplikace, která umožní identifikovat rizikové CLL pacienty na základě zpracování velkých imunogenetických dat, rizikových haplotypů, analýz somatické genetické variability, klonální heterogenity a dalších prognostických faktorů. Identifikace pacientů s vyšším rizikem časného relapsu a rezistence na léčbu by měla vést k návrhu individuální léčebné strategie, a tím zlepšení prognózy, prodloužení přežití a snížení nákladů na léčbu těchto pacien...; Chronic lymphocytic leukemia (CLL) is the most common form of leukemia in western countries. Early relaps and refractoriness to initial therapy are associated with poor prognosis and low life-expectancy. Identification of patients with high risk of relapsed/refractory disease may stratify them for on-time personalised treatment using novel BCR-signaling inhibitors and BCL2 antagonists. We aim therefore to study a comprehensive panel of functional polymorphisms influencing the extent/burden of inflammatory reaction and oxidative stress in order to identify risk haplotypes associated with relaps/refractoriness. Moreover, we will develop an electronic tool for estimation of a relapse/refractoriness risk by integrating big data from individual “imunogenetic” signature, somatic genetic variability, clonal heterogeneity and other prognostic markers. Identification of patients with high risk of early relaps/refractoriness may contribute to selection of personalised treatment strategy, thus to improve the prognosis, life-expectancy and lower the treatment costs for these patients.

• MeSH
• chronická lymfatická leukemie etiologie   terapie   MeSH
• haplotypy MeSH
• imunogenetické jevy MeSH
• individualizovaná medicína MeSH
• lidé MeSH
• nádorové biomarkery MeSH
• oxidační stres MeSH
• polymorfismus genetický MeSH
• recidiva MeSH
• rizikové faktory MeSH
• zánět MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• onkologie
• genetika, lékařská genetika
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Imunitně zprostředkované komplikace, zejména nemoc štěpu proti hostiteli (GVHD), limitují úspěšnost alogenní transplantace krvetvorných kmenových buněk (dále HSCT). Navrhovaný projekt se zaměří na 1) vztah systémové exprese (a její dynamiky) vybraných imunitních a regulačních molekul k rozvoji GVHD a celkovým výsledkům HSCT, 2) testování funkčních dopadů nejvýznamnějších genových nonHLA variant dříve spojených s výskytem GVHD, 3) identifikaci nových polymorfismů imunitních genů významných pro úspěšnost HSCT. Získané výsledky budou hodnoceny ve vztahu k výskytu a závažnosti GVHD, relapsů základního onemocnění a úmrtnosti po transplantaci. Cílem projektu je identifikovat prediktivní a časně diagnostické markery GVHD a úspěšnosti HSCT a rozšířit tak možnosti individualizace léčebných přístupů u tohoto typu transplantace. Současně projekt přinese nové poznatky o mechanismech aloreaktivity po HSCT a může tak napomoci k identifikaci nových molekulárních cílů pro léčbu jejích komplikací.; Immune-mediated complications, namely graft versus host disease (GVHD), limit markedly the results of allogeneic haematopoietic stem cell transplantation (HSCT). The proposed project will focus on 1) the relationship of systemic expression (and its dynamics) of immune and regulatory molecules with GVHD and overall outcome of HSCT, 2) assessment of functional impact of the most important gene variants formerly associated with GVHD, 3) identification of new immune gene polymorphisms relevant for the HSCT outcome. The results will be analysed against the occurrence and severity of GVHD, relapses of leukaemia and mortality. The crucial aim of this project is to identify novel predictive/diagnostic markers of GVHD and HSCT outcome and, by this way, to enlarge possibilities for individualization of therapeutical approaches in HSCT. The project will further clarify the mechanisms of alloreactivity after HSCT and may, therefore, propose new molecular targets for the treatment of the HSCT complications.

• MeSH
• autologní transplantace MeSH
• biologické markery MeSH
• genotypizační techniky MeSH
• HLA-C antigeny MeSH
• individualizovaná medicína MeSH
• messenger RNA analýza   MeSH
• nemoc štěpu proti hostiteli MeSH
• polymorfismus genetický MeSH
• transplantace hematopoetických kmenových buněk MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• alergologie a imunologie
• transplantologie
• genetika, lékařská genetika
• angiologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Projekt je zaměřen na analýzu expresních profilů (RNA, protein) vybraných molekul účastnících se profibrotizačních procesů u pacientů s difúzními plicními onemocněními (DPO). Budeme sledovat EP chemokinů/cytokinů a dalších molekul podílejících se na aktivaci fibroblastů, tvorbě proteinů extracelulární matrix a regulaci zánětu. Znalost EP přispěje k objasnění patogenetických mechanizmů fibrotizace, přispěje k rozšíření klasifikačního schématu fibróz charakteristických velmi špatnou prognózou, umožní stratifikovat pacienty s rizikem fibrotizace a sledovat léčebnou odpověď. Projekt dále umožní určit kandidátní molekuly pro následnou analýzu genetických mechanizmů a navrhnout cíle pro budoucí terapii.; 1.The project will investigate mRNA & protein expression profile (EP) of selected molecules, related to pro-fibrotic processes in diffuse lung diseases (DLDs). 2. The EP of chemokines, cytokines and other regulatory molecules contributing to activation of fibroblasts, extracellular matrix protein deposition and regulation of inflammation will be investigated. 3. Beside contribution to knowledge on pathomechanisms, the knowledge of EP associated with DLDs may contribute to earlier and more precise assessment of diagnosis, prediction of disease outcome, control of therapeutic response and staging of patients. 4. This project will also suggest new candidates for genetic studies in DLDs and for its therapy.

• MeSH
• bronchoalveolární lavážní tekutina MeSH
• chemokiny analýza   MeSH
• cytokiny analýza   MeSH
• exprese genu MeSH
• individualizovaná medicína MeSH
• intersticiální plicní nemoci MeSH
• mikro RNA analýza   MeSH
• plicní fibróza MeSH
• plicní sarkoidóza MeSH
• polymorfismus genetický MeSH
• progrese nemoci MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• biologie
• genetika, lékařská genetika
• pneumologie a ftizeologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

1. Osteolýza (OL) je považována za největší problém endoprotetiky kyčle/kolena. Pro indukci OL jsou nejdůležitější DAMP receptory makrofágů a fibroblastů, které reagují na protetické částice. 2. O rozsahu OL rozhodují amplifikační prozánětlivé/protizánětlivé dráhy a zejména stupeň osteoklastogeneze. Pokud se rozvine adaptace na částice, nerozvine se ani výrazný zánět, ani osteoklastogeneze, tj. nevzniknou rozsáhlé kostní defekty. 3. Projekt je zaměřen na analýzu expresních profilů (mRNA, proteiny) vybraných kandidátních molekul (KM) v periprotetických tkáních v různých časových obdobích po implantaci endoprotézy. Analýza expresních profilů bude doplněna imunohistochemickou detekcí, resp. vyšetřením vybraných genových polymorfismů regulujících expresi KM. 4. Srovnání expresního profilu u pacientů v různých obdobích po operaci/s různým rozsahem OL umožní identifikovat molekuly/dráhy, které jsou sdruženy s nevýznamnou/významnou OL/předčasným selháním. Projekt umožní určit KM pro diagnostiku/léčbu OL.; 1.Osteolysis(OL) is considered a major cause of hip/knee arthroplasty failure. DAMP receptors on macrophages, fibroblasts stimulated by particles induce increased inflammatory chemokine/cytokine synthesis. 2.The extent of OL depends on regulatory molecules (RM) of pro-inflammatory pathways and increased osteoclastogenesis. If the tissues do not adapt to particles then OL develops and vice versa. 3.Project is focused on analysis of expression profiles (EP) - mRNA, proteins - of selected RM in periprosthetic tissues obtained from patients with different extent of OL/time to surgery. EP will be supplemented with immunohistochemical/joint fluid analysis/ investigation of candidate gene polymorphism. 4. Comparing EPs and further data between cases with different extent of OL/time to reoperation we will be able to identify molecules/pathways connected with insignificant/ significant OL/early prosthetic failure. Project can identify candidate molecules for diagnostics/treatment of OL.

• MeSH
• amplifikace genu MeSH
• chirurgie operační MeSH
• exprese genu MeSH
• genetické testování MeSH
• imunohistochemie MeSH
• kloubní pouzdro imunologie   MeSH
• messenger RNA MeSH
• náhrada kyčelního kloubu MeSH
• osteolýza diagnóza   etiologie   imunologie   terapie   MeSH
• polymorfismus genetický MeSH
• totální endoprotéza kolene MeSH
• zánět genetika   imunologie   MeSH

• Konspekt
• Ortopedie. Chirurgie. Oftalmologie
• NLK Obory
• ortopedie
• biochemie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

1.Projekt zaměřen na analýzu expresních profilů (mRNA, protein) vybraných molekul s cílem navrhnout molekulární biomarkery charakterizující stabilní stádium CHOPN a odlišující infekční a neinfekční AECHOPN (AE=acute exacerbation). Srovnání expresního profilu (EP) ve stabilní fázi CHOPN s četnosti AECHOPN v průběhu 1-2 let umožní určit biomarkery pro krátkodobou prognózu. Časná identifikace pacientů se sklonem k opakovaným AECHOPN poskytne možnost zahájení profylaktické léčby. 2. EP vybraných molekul sevztahem k zánětlivé imunitní reakci bude nejprve studován v bronchoalveolární tekutině (BAT), což umožní přesnější popis molekulárních dějů plicního zánětu ve srovnáni se sputem nebo periferní krví. Biomarkery následně potvrdíme v periferní krvi, dostupnější pro klinická vyšetření. 3.EP BAT bude popsán pomocí 2 metod (RT-PCR a ELISA), což zajistí reprodukovatelnost výsledků. Projekt dále umožní určit kandidátní molekuly pro následnou analýzu genetických mechanismů a navrhnout cíle pro budoucí terapii.; 1.The project will investigate mRNA & protein expression profile (EP) of selected molecules, related to inflammatory reactions, to assess biomarkers characterising stable stage of COPD and distinguishing infectious and non-infectious AECOPD (AE=acute exacerbation). Comparison of EP associated with stable stage of COPD with the frequency of AECOPD over 1-2 years will implicate further biomarkers for a short-time prognosis. Early identification of the patients prone to repeated AECOPD will allow start ofprophylactic therapy. 2.The EP will be primarily measured in bronchoalveolar lavage (BAL) allowing more precious description of molecular events concerning pulmonary inflammation compared to sputum/peripheral blood. Biomarkers will be then confirmed in circulation-blood, available for clinical investigation. 3. BAL EP will be explored by two methods (ELISA, RT-PCR) to increase reproducibility of our results. This project will also suggest new candidates for genetic studies in COPD and for its therapy.

• MeSH
• akutní nemoc MeSH
• bakteriální infekce MeSH
• biologické markery MeSH
• bronchoalveolární lavážní tekutina MeSH
• chemokiny MeSH
• chronická obstrukční plicní nemoc diagnóza   genetika   terapie   MeSH
• cytokiny MeSH
• ELISA MeSH
• genetická predispozice k nemoci MeSH
• metaloproteasy MeSH
• polymerázová řetězová reakce s reverzní transkripcí MeSH
• prognóza MeSH
• progrese nemoci MeSH
• výsledek terapie MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• pneumologie a ftizeologie
• biologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Navrhovaný projekt stanoví na podkladě asociační studie na souboru pacientů, jejich dárců a vzorku kontrolní populace vztah vybraných polymorfismů imunitních genů k výskytu závažných komplikací po transplantaci kmenových buněk krvetvorby. Data získaná genotypizací vybraných polymorfismů imunitních genů budou analyzována ve vztahu k výskytu reakce štěpu proti hostiteli, relapsů základního onemocnění po transplantaci, celkovému přežívání a dalším klinickým charakteristikám. Výsledky studie lze využít k určování rizika komplikací a nastavení individuální profylaxe a léčby po transplantaci kmenových buněk krvetvorby.; Proposed project will determine the relevance of selected immune gene polymorphisms for development of severe complications after AHSCT through an association study on the groups of patients, their donors and control population. Data obtained from the genotyping of selected polymorphisms of immune genes will be analysed in relation to the graft versus host disease (GvHD), relapses of malignancies after AHSCT, overall survival and other clinical characteristics. The results of the study may be utilised to determine the risk of complications and to individualise prophylaxis and therapy after AHSCT.

• MeSH
• genetická predispozice k nemoci MeSH
• genomika MeSH
• homologní transplantace MeSH
• polymorfismus genetický MeSH
• reakce štěpu proti hostiteli MeSH
• rizikové faktory MeSH
• transplantace hematopoetických kmenových buněk MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• biologie
• onkologie
• transplantologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Osteolýza (OL) je považována za největší problém endoprotetiky kyčelního kloubu. Jde o multifaktoriální proces související s opotřebováním kloubních povrchů implantátu (nejčastěji polyetylénu, dále PE). V patogenezi OL sehrávají klíčovou úlohu makrofágy,osteoblasty, osteoklasty a plejáda cytokinů, z nichž nejdůležitější jsou TNF?, IL-1ß, IL-6. Závažná osteolýza se ale nerozvíjí u všech případů vystavených srovnatelnému počtu PE částic. Předpokládá se proto existence endogenních faktorů, které o dispozici k této komplikaci rozhodují. Jedním z nich je rozdílná aktivita cytokinů daná variabilitou genů, které je kódují (genový polymorfismus =GP). Cílem projektu je testování hypotézy, že existuje významná asociace mezi vybranými typy GP cytokinů a rozsahemOL. Zaměření projektu odpovídá trendům v ortopedii i imunologii.; Osteolysis(OL) is considered a major cause of hip arthroplasty failure. The exact underlying pathogenetic mechanisms are yet to be elucidated despite the relationships with wearing of PE prosthetic surfaces are generally accepted. PE wear particles activate an inflammatory cascade in which several cytokines play a pivotal role resulting in OL. However, severe OL does not develop in every case under similar conditions (i.e. number and size of PE particles). This suggests existence of important endogenousfactors influencing the OL onset/development. Concept of implication of cytokine gene polymorphisms seems to be one of the most attractive because of the key role of cytokines in regulation pathways. The aim of the project is to test hypothesis that there exists association between cytokine polymorphisms and extension of bone defects. Scope of the project is in line with the up to date trends in both orthopaedics and immunology.

• MeSH
• cytokiny MeSH
• diagnostické techniky molekulární MeSH
• náhrada kyčelního kloubu MeSH
• polyethyleny škodlivé účinky   MeSH
• polymorfismus genetický MeSH
• rizikové faktory MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• ortopedie
• biologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Projekt zaměřen na charakterizaci molekulárních dějů u difúzních plicních onemocnění s cílem identifikovat geny podílející se na zánětlivých a fibrotizačních procesech. Pomocí citlivé techniky "real time RT-PCR" budeme sledovat expresní profil genů cytokino-chemokinových sítí, což umožní detekovat zánět v raném stádiu, stratifikovat pacienty s rizikem fibrotizace a sledovat léčebnou odpověď. Sledování expresního profilu umožní definovat nové kandidátní geny pro následnou analýzu genetických mechanismů anavrhnout cíle pro budoucí vývoj nových, diagnostických markerů. Fenotypy, získané na základě expresního profilování genů u pacientů s IPF přispějí k rozšíření klasifikačního schématu stádií IPF-onemocnění s velmi špatnou prognózou.; Proposal focuses on characterisation of molecular events in diffuse lung diseases, with main interest to the genes involved in inflammatory and fibrotic processes. Study of expression profiles of cytokine gene networks using sensitive real time RT-PCR method can help to detect inflammation in its early phase, stratify patients according to the risk of fibrosis and follow up the treatment response. Analysis of mRNA expression profiles can delineate new candidates for analyses of genetic mechanisms of IPF& S and nominate targets for future development of novel, biological therapies. Phenotypes based on the expression profiling of immune-related genes in IPF patients, can contribute to more precise classification of IPF-disease with very poor prognosis.

• MeSH
• chemokiny MeSH
• cytokiny MeSH
• exprese genu MeSH
• genomika MeSH
• idiopatická plicní fibróza imunologie   patologie   MeSH
• imunoterapie MeSH
• plicní sarkoidóza imunologie   patologie   MeSH
• polymerázová řetězová reakce s reverzní transkripcí MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• pneumologie a ftizeologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

• Publikační typ
• abstrakt z konference MeSH