The aim of this study was to experimentally test chromogenic media and reagents for a rapid diagnosis of toxigenic microfungi Aspergillus flavus, A. carbonarius, A. ochraceus, Penicillium expansum, P. verrucosum, and P. citrinum isolated from foodstuffs. Toxigenic microfungi of Aspergillus and Penicillium species are considered to be of major relevance for human and animal health. The presence of these toxigenic microfungi in foodstuffs and feedstuffs raises a potential risk of mycotoxins (for example presence of aflatoxins, cyclopiazonic acid, ochratoxin A, patulin or citrinin). In order to reduce the risks for consumers’ health, it is necessary to set rapid methods for toxigenic microfungi isolated from foodstuffs and also feedstuffs. Application of chromogenic media and reagents presents one of the possibilities. The selected strains of toxigenic microfungi, producing mycotoxins, were tested on chromogenic media. The chromogenic media and reagents in our study are suitable for a microbiological and mycological laboratory. The benefits of chromogenic media and reagents include a rapid diagnosis within 48–72 h, simple preparation, easy availability and relatively low prices.
- MeSH
- analýza potravin MeSH
- Aspergillus izolace a purifikace klasifikace patogenita MeSH
- bezpečnost potravin MeSH
- chromogenní sloučeniny MeSH
- indikátory a reagencie MeSH
- krmivo pro zvířata MeSH
- kultivační média * klasifikace MeSH
- mikrobiologické techniky * metody MeSH
- mitosporické houby * izolace a purifikace klasifikace metabolismus patogenita MeSH
- mykotoxiny biosyntéza izolace a purifikace klasifikace škodlivé účinky MeSH
- Penicillium izolace a purifikace klasifikace patogenita MeSH
- potravinářská mikrobiologie MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
Taxonomie dermatofytů prošla v minulosti řadou výrazných změn a nikdy nebyla příliš stabilní. Poslední rozsáhlejší změny proběhly v souvislosti s revizí skupiny molekulárně genetickými metodami. Hlavním cílem této práce je seznámit čtenáře s pokroky v taxonomii dermatofytů a prostřednictvím seznamu doporučených jmen sjednotit pojmenovávání druhů napříč českými pracovišti. To by mělo nejen usnadnit komunikaci, ale také porovnávání výsledků se zahraniční literaturou. Jedním z doporučení je například ukončení používání jména Trichophyton mentagrophytes v klinické praxi. V úvodu textu se diskutuje o problematickém konceptu druhu u dermatofytů, jehož rozdílná aplikace může mít velký vliv na počet uznávaných druhů. Závěrečná část je věnována budoucím změnám souvisejícím s novým vydáním Mezinárodního kódu nomenklatury řas, hub a rostlin. Jedná se především o ukončení duální nomenklatury hub a vybrání jediného správného jména pro každý druh. Obecně se dá říci, že je vhodné preferovat jméno nepohlavního stadia (Trichophyton, Microsporum, Epidermophyton), s výjimkou případů, kde toto jméno není k dispozici (např. Arthroderma benhamiae). Klíčová slova: Arthroderma – druhový koncept – fylogeneze – Mezinárodní nomenklatorický kód – jedna houba, jedno jméno – polyfázický přístup – Trichophyton interdigitale – Trichophyton mentagrophytes
Taxonomy of dermatophytes has changed significantly in the past and it has never been stable. Last extensive changes appeared after revision of the group by molecular genetic methods. This paper introduces the advances in taxonomy of dermatophytes and helps to unify the species names in use among the Czech laboratories to simplify their communication and comparison of the results with foreign literature. The complicated species concept of dermatophytes that might be applied differently and might influence the number of accepted species is discussed in the beginning. The last part is dedicated to future changes related to a new edition of the International Code of Nomenclature for algae, fungi, and plants namely to termination of a dual nomenclature of fungi and choosing the one correct name for each species. Key words: Atrhroderma – species concept – phylogeny – the International Code of Nomenclature – one fungus one name – polyphasic approach – Trichophyton interdigitale – Trichophyton mentagrophytes
- Klíčová slova
- druhový koncept, Trichophyton mentagrophytes, Trichophyton interdigitale, polyfázický přístup, Mezinárodní nomenklatorický kód, zoofilní druhy, geofilní druhy,
- MeSH
- Arthrodermataceae klasifikace MeSH
- dermatomykózy mikrobiologie MeSH
- Epidermophyton klasifikace MeSH
- fylogeneze * MeSH
- houby klasifikace MeSH
- lidé MeSH
- Microsporum klasifikace MeSH
- mitosporické houby * izolace a purifikace klasifikace MeSH
- mykologické určovací techniky MeSH
- terminologie jako téma * MeSH
- Trichophyton klasifikace MeSH
- zoonózy MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
- přehledy MeSH
- Klíčová slova
- mykotické infekce, laboratorní postupy, diagnostika mykóz, interpretace výsledků,
- MeSH
- algoritmy MeSH
- kvasinky izolace a purifikace MeSH
- lidé MeSH
- mikroskopie metody MeSH
- mitosporické houby izolace a purifikace MeSH
- mykologické určovací techniky metody přístrojové vybavení MeSH
- mykózy diagnóza MeSH
- reagenční diagnostické soupravy MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
Microorganisms were isolated from lignite freshly excavated in the Záhorie coal mine (southwestern Slovakia) under conditions excluding contamination with either soil or air-borne microorganisms. The isolates represented both Prokarya and Eukarya (fungi). All were able to grow on standard media, although some microorganisms were unstable and became extinct during storage of coal samples. Bacteria belonged to the genera Bacillus, Staphylococcus, and Rhodococcus, according to both morphological criteria and ITS sequences. Several bacterial isolates were resistant to antibiotics. The presence of anaerobic bacteria was also documented, although they have not yet been identified. Fungal isolates were typified by using their ITS sequences. They belonged to the genera Trichoderma (Hypocrea), Penicillium, Epicoccum, Metarhizium (Cordyceps), and Cladosporium. Several fungi produced compounds with antibiotic action against standard bacterial strains. The evidence for the presence of microorganisms in native lignite was obtained by means of fluorescence microscopy, scanning electron microscopy, and electron microprobe analysis. Results demonstrated that microorganisms were able to survive in the low-rank coal over a long time period.
- MeSH
- anaerobní bakterie izolace a purifikace MeSH
- antibakteriální látky biosyntéza farmakologie MeSH
- antibiotická rezistence MeSH
- antibióza MeSH
- Bacillus izolace a purifikace klasifikace MeSH
- Bacteria izolace a purifikace klasifikace MeSH
- DNA bakterií genetika chemie MeSH
- financování organizované MeSH
- fluorescenční mikroskopie MeSH
- hornictví MeSH
- mezerníky ribozomální DNA genetika chemie MeSH
- mikroanalýza elektronovou sondou MeSH
- mikroskopie elektronová rastrovací MeSH
- mitosporické houby izolace a purifikace klasifikace MeSH
- molekulární sekvence - údaje MeSH
- Rhodococcus izolace a purifikace klasifikace MeSH
- ribozomální DNA genetika chemie MeSH
- sekvenční analýza DNA MeSH
- Staphylococcus izolace a purifikace klasifikace MeSH
- uhlí mikrobiologie MeSH
- Geografické názvy
- Slovenská republika MeSH
- MeSH
- dermatomykózy epidemiologie mikrobiologie MeSH
- incidence MeSH
- lidé MeSH
- mitosporické houby izolace a purifikace MeSH
- zdraví ve městech MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
- MeSH
- akutní lymfatická leukemie komplikace MeSH
- amfotericin B aplikace a dávkování terapeutické užití MeSH
- dospělí MeSH
- fungální meningitida farmakoterapie komplikace mikrobiologie MeSH
- lidé MeSH
- mitosporické houby izolace a purifikace MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
