interaction structure
Dotaz
Zobrazit nápovědu
3rd ed. 456 s. ; 23 cm
- MeSH
- osobnost MeSH
- psychoanalytická teorie MeSH
- psychoanalytická terapie MeSH
- psychoanalýza MeSH
- sociální psychologie MeSH
- Publikační typ
- monografie MeSH
- Konspekt
- Zvláštní duševní stavy a procesy
- NLK Obory
- psychologie, klinická psychologie
- psychoterapie
... Hradec Králové, CZ) -- 10:00- 10:30am Coffee break - Congress foyer -- 10:30- 11.10am Rýchlik Ivan - Structure ... ... Králové, CZ) -- 12:30-2:00pm Lunch - A RKADA hotel -- 2:00-2.40pm Joshi Lokesh - Host-Microbial interaction ... ... 5.55pm KRD obchodní spolecnost s.r.o. - OpenSPR: New approach to determination ofthe biomolecular interactions ...
54 nečíslovaných stran : barevné ilustrace ; 22 cm
- MeSH
- interakce hostitele a parazita MeSH
- Publikační typ
- abstrakty MeSH
- kongresy MeSH
- programy MeSH
- sborníky MeSH
- zprávy MeSH
- Konspekt
- Patologie. Klinická medicína
- NLK Obory
- infekční lékařství
... Bio-Safety survey for practicians - the current ECMUS policy (Christian Kallmann) 1 -- 1.1 Ultrasound interactions ... ... 1 -- 1.1.1 Mechanical interactions 2 -- 1.1.2 Thermal interactions 7 -- 1.2 Epidemiological investigations ...
1st ed. 173 s. : il., tab. ; 21 cm
- MeSH
- bezpečnost vybavení MeSH
- intervenční ultrasonografie metody přístrojové vybavení využití MeSH
- ultrasonografie metody přístrojové vybavení trendy MeSH
- Publikační typ
- monografie MeSH
- Konspekt
- Patologie. Klinická medicína
- NLK Obory
- radiologie, nukleární medicína a zobrazovací metody
- NLK Publikační typ
- kolektivní monografie
The mechanical stability of epithelial cells, which protect organisms from harmful external factors, is maintained by hemidesmosomes via the interaction between plectin 1a (P1a) and integrin α6β4. Binding of calcium-calmodulin (Ca(2+)-CaM) to P1a together with phosphorylation of integrin β4 disrupts this complex, resulting in disassembly of hemidesmosomes. We present structures of the P1a actin binding domain either in complex with the N-ter lobe of Ca(2+)-CaM or with the first pair of integrin β4 fibronectin domains. Ca(2+)-CaM binds to the N-ter isoform-specific tail of P1a in a unique manner, via its N-ter lobe in an extended conformation. Structural, cell biology, and biochemical studies suggest the following model: binding of Ca(2+)-CaM to an intrinsically disordered N-ter segment of plectin converts it to an α helix, which repositions calmodulin to displace integrin β4 by steric repulsion. This model could serve as a blueprint for studies aimed at understanding how Ca(2+)-CaM or EF-hand motifs regulate F-actin-based cytoskeleton.
- MeSH
- hemidesmozomy chemie MeSH
- hydrofobní a hydrofilní interakce MeSH
- integrin beta4 chemie MeSH
- interakční proteinové domény a motivy MeSH
- kalmodulin chemie MeSH
- krysa rodu rattus MeSH
- krystalografie rentgenová MeSH
- lidé MeSH
- molekulární modely MeSH
- molekulární sekvence - údaje MeSH
- myši MeSH
- nádorové buněčné linie MeSH
- plektin chemie MeSH
- sekvence aminokyselin MeSH
- terciární struktura proteinů MeSH
- vazba proteinů MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- krysa rodu rattus MeSH
- lidé MeSH
- myši MeSH
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- MeSH
- aceton diagnostické užití MeSH
- buňky cytologie enzymologie ultrastruktura MeSH
- fluorescenční barviva diagnostické užití MeSH
- fosfolipasy A diagnostické užití MeSH
- hydrofobní a hydrofilní interakce * MeSH
- kyselina jantarová diagnostické užití MeSH
- lipoproteiny metabolismus ultrastruktura MeSH
- multiproteinové komplexy MeSH
- proteiny přenášející fosfolipidy MeSH
- proteiny * metabolismus ultrastruktura MeSH
- sérový albumin hovězí MeSH
- statistika jako téma MeSH
- struktury buněčné membrány * enzymologie genetika MeSH
- ubichinon diagnostické užití MeSH
- umbeliferony diagnostické užití metabolismus MeSH
In order to predict interaction interface for proteins, it is crucial to identify their characteristic features controlling the interaction process. We present analysis of 69 crystal structures of dimer protein complexes that provides a basis for reasonable description of the phenomenon. Interaction interfaces of two proteins at amino acids level were localized and described in terms of their chemical composition, binding preferences, and residue interaction energies utilizing Amber empirical force field. The characteristic properties of the interaction interface were compared against set of corresponding intramolecular binding parameters for amino acids in proteins. It has been found that geometrically distinct clusters of large hydrophobic amino acids (leucine, valine, isoleucine, and phenylalanine) as well as polar tyrosines and charged arginines are signatures of the protein-protein interaction interface. At some extent, we can generalize that protein-protein interaction (seen through interaction between amino acids) is very similar to the intramolecular arrangement of amino acids, although intermolecular pairs have generally lower interaction energies with their neighbors. Interfaces, therefore, possess high degree of complementarity suggesting also high selectivity of the process. The utilization of our results can improve interface prediction algorithms and improve our understanding of protein-protein recognition.
- MeSH
- aminokyseliny chemie MeSH
- databáze proteinů MeSH
- houby chemie MeSH
- interakční proteinové domény a motivy MeSH
- kinetika MeSH
- krystalografie rentgenová MeSH
- lidé MeSH
- mapování interakce mezi proteiny * MeSH
- prokaryotické buňky chemie MeSH
- proteiny chemie MeSH
- rostliny chemie MeSH
- sekundární struktura proteinů MeSH
- statická elektřina MeSH
- termodynamika MeSH
- vazba proteinů MeSH
- vazebná místa MeSH
- viry chemie MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
Úvod prvé části „Cytokiny I" jsme věnovali přehledu obecných vlastností a funkcí cytokinů, především jedné skupině cytokinů - interleukinů. v této části jsou shrnuty jak cytokiny prorůstové, tak zánětotvomé, ale pro obě skupiny nejprve vytkneme společné vlastnosti: Je to společný buněčný zdroj cytokinů, společný charakter vazby a přenosu signálu, je to synergický nebo antagonistický efekt vzájemného působeni cytokinové sítě. Konečně jsou to protichůdné funkční důsledKy poammené icvantitativnimi i mterakčnimi vztahy Je to buď růstové a morfogenetické působení nebo vyvolání obranného zánětu, který se za určitých podmínek může změnit na zánět patogenetický.
The introduction of the first part „Cytokines 1" was dedicated to the survey of general properties and functions of cytokines, especially of one group of cytokines, i.e. interleukins. In this part both growth and inflammatory cytokines are summarized. For both groups, we first want to show properties common to all: It is the common cell source of cytokines, the common character of the bond and of the signal transmission, the synergic or antagonistic effect ofthe mutual action ofthe cytokine net. Finally these are the antipodal functional consequences conditioned by quantitative and interactional relationships, the either growth and morphogenetic action or incurrence of the defensive inflammation, which can under certain conditions change to a pathogenetic inflammation.
502 s.
Vojenské zdravotnické listy, ISSN 0372-7025 roč. 71, suppl. 1, December 2002
43 s. : tab., grafy ; 30 cm
- MeSH
- bakteriální proteiny MeSH
- genom bakteriální MeSH
- infekční nemoci MeSH
- mezibuněčná komunikace MeSH
- mikrobiologie MeSH
- proteom MeSH
- vojenské lékařství MeSH
- Publikační typ
- kongresy MeSH
- Konspekt
- Mikrobiologie
- NLK Obory
- mikrobiologie, lékařská mikrobiologie
- infekční lékařství
- biologie