molecular epidemiology
Dotaz
Zobrazit nápovědu
elektronický časopis
- Konspekt
- Biologické vědy
- NLK Obory
- genetika, lékařská genetika
- biologie
- NLK Publikační typ
- elektronické časopisy
Principles and practice
1st ed. xii, 214 s.
[1st ed.] XX, 588 s. : grafy, tab., přeruš.lit., věc.rejstř. ; 22 cm
Metodou analýzy polymorfie restrikčních fragmentů DNA (RFLP) s použitím sondy IS6110 byl vyšetřen soubor 22 polyrezistentních kmenů M. tuberculosis vylučovaných nemocnými se suspektními vzájemnými kontakty. V souboru byly 4 nemocní s anamnézou společného pobytu ve vězení, 4 byli bezdomovci, další udávali trvalé bydliště ve 4 různých krajích České republiky a 4 zemřeli. Touto metodou byl prokázán v podskupině A u 14 nemocných identický profil RFLP tvořený čtyřmi kopiemi 1S6110. U zbývajících 7 nemocných podskupiny B byl nalezen stejný základní typ fingerprintu jako u nemocných skupiny A, který vsak vykazoval další dvě kopie IS6110 navíc. U jednoho nemocného byly prokázány v odstupu dvou let typy RFLP profilů. Autoři považují oba subklony za geneticky příbuzné a nálezy přídatných kopií 1S6110 v subklonu B vysvětlují transpozicí ť tohoto elementu související pravděpodobně s nestabilitou původního genotypu DNA. Tuto domněnku podporuje časový odstup výskytu prvních kmenů s profilem B, které byly zaznamenány teprve po 4 letech od rozpoznání klonu nesoucího profil A. Jeden nemocný vykazoval zcela odlišný profil RFLP tvořený 9 kopiemi IS6110 a jeho spoluúčast v řetězu popsané mikroepidemie byla proto vyloučena.
A group of 22 multidrug resistant strains of Mycobacterium tuberculosis excreted by patients with suspicion of man-to-man contact, using the method of DNA restrictive fragment polymorphy (RFLP) with 1S6110 probe were examined. Among these patients 4 had a history of commonstay in a prison, 4 were homeless persons, the further had 4 various lodgings in the Czech republic and 4 died. With this method in the subgroup A in 14 patients an remaining 7 patients of subgroup B the same basic fingerprint was found as in the group A, but these had further two copies of IS6110. In one of these patients after two years both type of RFLP profiles were found. Authors suppose, that both subtypes are genetically related. They explain the finding of additional copies of IS6110 in the subgroup B as a transposition of this element, probably connecting with the instability of the primary DNA genotype. This assumption is supported by the time distance of appearance of the first smears with the profile B, found 4 years after the discovery of the clone with the profile A. One patient had a different profile RFLP consisting from 9 copies IS6110 and his participation in the chain of described microepidemy was therefore excluded.
elektronický časopis
- MeSH
- infekční nemoci epidemiologie genetika MeSH
- molekulární epidemiologie MeSH
- molekulární evoluce MeSH
- Konspekt
- Obecná genetika. Obecná cytogenetika. Evoluce
- NLK Obory
- genetika, lékařská genetika
- epidemiologie
- NLK Publikační typ
- elektronické časopisy
348 s.
The objective of the study is to analyze molecular epidemiologic surveillance for norovirus infection in Belarus over the past five years (2009-2013). Laboratory diagnostics was carried out by RT-PCR in 684 patients. Two regions of norovirus genome, localized in RNA-polymerase and capsid protein genes, were used for phylogenetic analysis. Noroviruses were predominant causative agents in adults and second only to rotaviruses in children, they also prevailed among aetiological agents of outbreaks (66.7% of outbreaks). In 2009-2013, the major norovirus genotype was GII.4 (58.3% of all genotyped isolates). Genovariant GII.4 2006b circulated in 2009 and 2010, genovariant GII.4 2009 New Orleans - in 2010 and 2012. In addition to GII.4, genotypes GII.6 (16.6%), GII.2 (4.1%), GII.3 (2.2%), and recombinant genotypes GII.g-GII.12 and GII.g-GII.1 (10.4% and 8.3%, respectively) circulated in Belarus. The findings indicate a significant contribution of noroviruses in development of sporadic morbidity and outbreaks of acute gastroenteritis in Belarus. Outbreaks or prominent increases of sporadic morbidity were mostly due to the emergence of a new genotype, or an epidemic genovariant.
- MeSH
- dítě MeSH
- fylogeneze MeSH
- genotyp MeSH
- infekce viry z čeledi Caliciviridae epidemiologie virologie MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- molekulární epidemiologie * MeSH
- Norovirus genetika izolace a purifikace MeSH
- předškolní dítě MeSH
- surveillance populace MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- předškolní dítě MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- Geografické názvy
- Běloruská republika MeSH
444 s. : il. ; 23 cm
- MeSH
- epidemiologické metody MeSH
- molekulární epidemiologie MeSH
- populační genetika MeSH
- virové nemoci epidemiologie MeSH
- Publikační typ
- monografie MeSH
- Konspekt
- Patologie. Klinická medicína
- NLK Obory
- virologie
- epidemiologie
