urine microRNAs
Dotaz
Zobrazit nápovědu
BACKGROUND: In this study, we aimed to identify microRNA from urine of multiple myeloma patients that could serve as a biomarker for the disease. RESULTS: Analysis of urine samples was performed using Serum/Plasma Focus PCR MicroRNA Panel (Exiqon) and verified using individual TaqMan miRNA assays for qPCR. We found 20 deregulated microRNA (p < 0.05); for further validation, we chose 8 of them. Nevertheless, only differences in expression levels of miR-22-3p remained close to statistical significance. CONCLUSIONS: Our preliminary results did not confirm urine microRNA as a potential biomarker for multiple myeloma.
- MeSH
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mikro RNA genetika moč MeSH
- mnohočetný myelom diagnóza genetika moč MeSH
- nádorové biomarkery moč MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- stanovení celkové genové exprese metody MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
Východiska: V současnosti nejsou klinicky využitelné tumorové markery založené na analýze moči, které by byly dostatečně citlivé a specifické, aby nahradily cystoskopii v detekci karcinomu močového měchýře (bladder cancer – BCA). Jednou z možností jsou močové mikroRNA (miRNA) představující novou skupinu biomarkerů pro časnou a neinvazivní diagnostiku urologických malignit. Soubor pacientů a metody: Do studie bylo zařazeno 155 pacientů s BCA a 83 zdravých kontrol. Expresní profily močových miRNA byly identifikovány za použití Affymetrix miRNA microarrays. Kandidátní miRNA byly dále validovány na nezávislé kohortě pacientů pomocí specifických TaqMan assays metodou kvantitativní real-time polymerázové řetězové reakce. Výsledky: Globální profilování genové exprese odhalilo panel miRNA, které byly významně rozdílně exprimovány u pacientů s BCA ve srovnání se zdravými kontrolami (p < 0,01). V rámci validační fáze byla u tří miRNA potvrzena významně vyšší koncentrace v moči pacientů s BCA v porovnání s kontrolními skupinami (p < 0,0001). Závěr: Identifikovali jsme miRNA, jejichž hladina je významně zvýšena v moči pacientů s BCA. Naše data ukazují, že močové miRNA mohou sloužit jako senzitivní a specifické biomarkery pro časnou a neinvazivní detekci BCA.
Background: Currently, there are no urinary-based tumour markers with sufficient sensitivity and specificity to replace cystoscopy in the detection of bladder cancer (BCA). Urinary microRNAs are emerging as clinically useful class of biomarkers for early and non-invasive detection of urologic malignancies. Patients and Methods: In this study, 155 patients with BCA and 83 healthy controls were enrolled. Expression profiles of urinary miRNAs were obtained using Affymetrix miRNA microarrays and candidate miRNAs further validated in independent cohort using specific TaqMan assays and quantitative real-time polymerase chain reaction method. Results: Whole-genome profiling identified miRNA signature with significantly different concentrations in urine of BCA compared to controls (p < 0.01). In the independent validation phase of the study, three miRNAs were confirmed to have significantly higher levels in urine of patients with BCA in comparison with control groups (p < 0.0001). In addition, we observed significant decrease in two miRNAs (p < 0.01) concentrations in the urinary samples collected 3 months after surgery compared to pre-operative samples. Conclusion: We identified and validated miRNAs to have significantly higher concentrations in urine of patients with BCA in comparison with controls. Our data have shown that urinary miRNAs could serve as sensitive and specific biomarkers enabling non-invasive detection of BCA.
- MeSH
- kohortové studie MeSH
- kvantitativní polymerázová řetězová reakce MeSH
- lidé MeSH
- mikro RNA * moč MeSH
- nádorové biomarkery * genetika moč MeSH
- nádory močového měchýře * diagnóza genetika moč MeSH
- regulace genové exprese u nádorů MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
Micro-ribonucleic acids (miRNAs) are small noncoding RNAs that posttranscriptionally regulate gene expression. The ability of miRNAs to inhibit translation of oncogenes and tumor suppressors implies that they may be involved in carcinogenesis. Our review focuses on the potential of urinary miRNAs to serve as biomarkers of urologic cancers. We discuss in detail the recent knowledge about the origin of urinary miRNAs, their stability, quality control, and their utility as a potential new class of biomarkers in urologic cancer. Finally, we summarize the studies focusing on detection and characterization of urinary miRNAs as potential biomarkers in bladder, prostate, and kidney cancers.
- MeSH
- lidé MeSH
- mikro RNA genetika moč MeSH
- nádorové biomarkery genetika moč MeSH
- nádory ledvin diagnóza genetika moč MeSH
- nádory močového měchýře diagnóza genetika moč MeSH
- nádory prostaty diagnóza genetika moč MeSH
- prognóza MeSH
- senzitivita a specificita MeSH
- urologické nádory diagnóza genetika moč MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- přehledy MeSH
Among gynaecological cancers, epithelial ovarian cancers are the most deadly cancers while endometrial cancers are the most common diseases. Efforts to establish relevant novel diagnostic, screening and prognostic markers are aimed to help reduce the high level of mortality, chemoresistance and recurrence, particularly in ovarian cancer. MicroRNAs, the class of post-transcriptional regulators, have emerged as the promising diagnostic and prognostic markers associated with various diseased states recently. Urine has been shown as the source of microRNAs several years ago; however, there has been lack of information on urine microRNA expression in ovarian and endometrial cancers till now. In this pilot study, we examined the expression of candidate cell-free urine microRNAs in ovarian cancer and endometrial cancer patients using quantitative real-time PCR. We compared the expression between pre- and post-surgery ovarian cancer samples, and between patients with ovarian and endometrial cancers and healthy controls, within three types of experiments. These experiments evaluated three different isolation methods of urine RNA, representing two supernatant and one exosome fractions of extracellular microRNA. In ovarian cancer, we found miR-92a significantly up-regulated, and miR-106b significantly down-regulated in comparison with control samples. In endometrial cancer, only miR-106b was found down-regulated significantly compared to control samples. Using exosome RNA, no significant de-regulations in microRNAs expression could be found in either of the cancers investigated. We propose that more research should now focus on confirming the diagnostic potential of urine microRNAs in gynaecological cancers using more clinical samples and large-scale expression profiling methods.
- MeSH
- down regulace genetika MeSH
- exozómy genetika MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mikro RNA genetika moč MeSH
- nádorové biomarkery genetika moč MeSH
- nádory endometria diagnóza genetika moč MeSH
- nádory vaječníků diagnóza genetika moč MeSH
- pilotní projekty MeSH
- prognóza MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- studie případů a kontrol MeSH
- upregulace genetika MeSH
- Check Tag
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
Malé regulační molekuly, tzv. mikroRNA, se podílejí na regulaci všech základních životních procesů v buňkách. Jsou regulátory exprese genů na posttranskripční úrovni. Ovlivňují tuto expresi vazbou na cílové mRNA, která vede k blokaci translace a štěpení mRNA. Nejnovější výzkumy ukázaly, že jejich výskyt není omezen jen na buňky, ale mikroRNA se vyskytují také v tělních tekutinách. Vzhledem k tomu, že diferenciální exprese určitých mikroRNA je často asociovaná s mnoha patologickými procesy, detekce deregulovaných mikroRNA v diagnosticky relevantních vzorcích (např. krvi, plazmě/séru, moči) se může stát základem nových diagnostických postupů. U gynekologických nádorových onemocnění je nalezení nových diagnostických biomarkerů důležitým cílem současných výzkumů. V tomto článku naleznete přehled cirkulujících a extracelulárních mikroRNA, které byly nejnověji nalezeny deregulovány u karcinomu ovaria, endometria a cervixu, především ve vzorcích krve, séra/plazmy a moči.
Small, non-coding molecules of RNA, microRNAs, have been shown to participate in regulation of key biological processes in the cells. They regulate the expression at post-transcriptional level by binding to target mRNA, resulting in mRNA degradation or translation inhibition. The most recent investigations revealed that microRNAs may occur not only in the cells, but also in many body fluids. Differential expression of particular microRNAs is often associated with many pathological states. Therefore, the detection of deregulated microRNAs in diagnostically relevant samples such as blood, plasma/serum, or urine may become the basis for the establishment of novel diagnostic procedures. Finding alternative diagnostic biomarkers for gynecological cancers is the goal of many recent investigations. We present here the survey of novel circulating and extracellular microRNAs which have been found deregulated in ovarian cancer, endometrial cancer and cervical cancer, particularly in blood, plasma/serum and urine samples.
- MeSH
- gynekologická onemocnění * diagnóza krev MeSH
- lidé MeSH
- mikro RNA * diagnostické užití krev MeSH
- nádorové biomarkery krev MeSH
- nádory děložního čípku krev MeSH
- nádory endometria krev MeSH
- nádory vaječníků krev MeSH
- nádory ženských pohlavních orgánů * diagnóza krev MeSH
- regulace genové exprese u nádorů * MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
- Klíčová slova
- qPCR, neinvazivní markery, supernatant,
- MeSH
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mikro RNA * klasifikace moč MeSH
- nádorové biomarkery * moč MeSH
- nádory močového měchýře * diagnóza MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- výzkum MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
MicroRNAs (miRNAs) in urine are examined as potential biomarkers. We examined the urine samples from 70 individuals (45 males, 25 females, mean age 65 years, range 20-84 years). Of the urine donors, 15 were healthy volunteers, 5 were patients with non-cancer diseases, 50 were patients with different stages of bladder cancer. To examine the spectrum of miRNAs in the cell-free fraction of urine, TaqMan Human miRNA Array Card A v.2.1 was used. A set of 30 miRNAs were found that are constantly present in urine supernatants independently of sex, age and health status of the subjects. We compared this set with miRNAs found in plasma, expressed in kidney and genito-urinary tract. Our results indicate that some miRNA could be transferred from the circulation into urine.
- MeSH
- dospělí MeSH
- ledviny metabolismus MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mikro RNA krev genetika moč MeSH
- mladý dospělý MeSH
- nádorové biomarkery krev genetika moč MeSH
- nádory močového měchýře diagnóza genetika MeSH
- polymerázová řetězová reakce s reverzní transkripcí MeSH
- regulace genové exprese u nádorů MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mladý dospělý MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- srovnávací studie MeSH
Karcinom prostaty je jedním z nejčastějších onkologických onemocnění mužů ve světě. Diagnostika a stratifikace pacientů jsou klíčové pro zajištění včasné a adekvátní terapie. Současné standardy se opírají převážně o PSA, jehož nádorová specificita je limitována. Tento přehled se zaměřuje na neinvazivní potenciální onkomarkery získané z moči včetně oxidačního stresu, metabolomiky a analýzy nukleových kyselin. V rámci některých studií se ukazuje, že zvýšené hladiny markerů jako F2-isoprostanáza, sarcosin a PCA3 mohou indikovat přítomnost a agresivitu karcinomu prostaty. Nové kombinované testy Prostarix, Mi-Prostate Score, SelectMDX nebo ExoDX nabízejí potenciál pro zlepšení stratifikace pacientů a snížení počtu negativních biopsií. Klinické využití těchto nových markerů je zatím omezené. Vzhledem k heterogenitě tohoto onemocnění je nezbytné pokračovat ve výzkumu, který usnadní personalizovaný přístup v léčbě.
Prostate cancer is one of the most common oncological diseases among men worldwide. Accurate diagnosis and patient stratification are crucial for ensuring timely and appropriate therapy. Current standards primarily rely on PSA, whose tumor specificity is limited. This review focuses on non-invasive potential oncological markers derived from urine, including oxidative stress, metabolomics and nucleic acid analysis. Some studies indicate that elevated levels of markers such as F2-isoprostane, sarcosine or PCA3 may signify the presence and aggressiveness of prostate cancer. New combined tests Prostarix, Mi-Prostate Score, SelectMDX and ExoDX offer potential for improved diagnosis and patient stratification, as well as a reduction in negative biopsies. However, the clinical application of these new markers remains limited. Considering the heterogeneity of this disease, ongoing research is essential to support a personalized approach to treatment.
- MeSH
- aminokyseliny moč MeSH
- biopsie metody MeSH
- časná detekce nádoru metody MeSH
- diagnostické techniky molekulární MeSH
- exozómy fyziologie MeSH
- lidé MeSH
- metabolomika metody MeSH
- mikro RNA moč MeSH
- nádorové biomarkery * moč MeSH
- nádory prostaty * diagnóza MeSH
- oxidační stres fyziologie MeSH
- prostatický specifický antigen krev MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
MicroRNAs (miRNAs) comprise a large group of small noncoding RNAs within a heterogeneous entity of noncoding RNAs, forming potent functional tools regulating the crucial biological processes within cells and the body. Cell-free miRNAs have become one of the novel promising diagnostic, predictive, and prognostic biomarkers for various diseases extensively investigated in recent years. This is due to their presence within extracellular fractions of various body fluids suggesting their potential as noninvasive "liquid biopsy" in case of their dysregulated expression.Among the body fluids, blood plasma and serum along with urine are the most commonly investigated sources of various types of cell-free miRNAs. Another body fluid, i.e., ascites (effusion, peritoneal/pleural fluid) may be the clinically important fluid particularly associated with carcinogenesis in ovarian carcinomas and hepatocellular carcinomas or in case of liver cirrhosis.Here, we provide a protocol for an expression profiling study based on qPCR analyses aimed at finding novel candidate miRNAs via small-scale or large-scale screening and evaluation experiments using liquid biopsies of blood plasma, ascites, and urine. Using this approach may be worth in cases where no (or limited) information is available on miRNA expression in particular diseases and geographic regions, for validation of previously published miRNAs with promising diagnostic potential, particularly in situations where follow-up study is aimed at validating miRNAs coming from (micro) array or NGS experiments, or where funding for large-scale experiments is not available. We demonstrate that assessment of plasma, ascites, and urine miRNAs expression may represent a feasible method to explore the potential for finding novel diagnostic, predictive, and prognostic biomarkers for various diseases.
INTRODUCTION: Currently, there is no accurate diagnostic molecular biomarker for renal cell carcinoma (RCC). The aim of this study was to assess the expression of microRNA-15a (miR-15a) in urine of patients with RCC and to evaluate its potential as a diagnostic molecular biomarker. MATERIALS AND METHODS: In total, 67 patients with solid renal tumors were enrolled: clear-cell RCC (ccRCC, n = 22), papillary RCC (pRCC, n = 16), chromophobe RCC (chRCC, n = 14), oncocytoma (n = 8), papillary adenoma (n = 2) and angiomyolipoma (n = 5). MiRNA-15a expression levels measurement in urine were performed using qPCR. Urine of 15 healthy volunteers without kidney pathology was used as control. RESULTS: We observed a difference in mean miR-15a expression values in groups of pre-operative patients with RCC, benign renal tumors and healthy persons (2.50E-01 ± 2.72E-01 vs 1.32E-03 ± 3.90E-03 vs 3.36E-07 ± 1.04E-07 RFU, respectively, p < 0.01). There was no difference in miR-15a expression between ccRCC, pRCC and chRCC (p > 0.05). Direct association between RCC size and miR-15a expression values was obtained (Pearson correlation coefficient-0.873). On the 8th day after nephrectomy, mean expression value in patients with RCC decreased by 99.53% (p < 0.01). MiR-15a expression differentiated RCC from benign renal tumors with 98.1% specificity, 100% sensitivity at a cut-off value of 5.00E-06 RFU, with AUC-0.955. CONCLUSIONS: MiR-15a expression measured in urine may be used as diagnostic molecular biomarker for RCC.
- MeSH
- adenom moč MeSH
- angiomyolipom moč MeSH
- karcinom z renálních buněk diagnóza patologie chirurgie moč MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mikro RNA moč MeSH
- nádorové biomarkery moč MeSH
- nádory ledvin diagnóza patologie chirurgie moč MeSH
- nefrektomie MeSH
- oxyfilní adenom moč MeSH
- polymerázová řetězová reakce MeSH
- senioři MeSH
- senzitivita a specificita MeSH
- staging nádorů MeSH
- studie případů a kontrol MeSH
- tumor burden MeSH
- Check Tag
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH