• Publikační typ
• abstrakt z konference MeSH

Metastazing colorectal carcinoma (mCRC) is 2nd the most frequent cancer-related cause of death in Europe. Despite the advances in surgery, radio-, chemotherapy and biological treatment, 5-year survival of mCRC patients remains low (7.5%) and therefore, validated predictive biomarkers are seeked for. This project aims to bring new knowledge regarding mCRC, to personalize its treatment and thus minimize drug side effects. The means is multidisciplinary cooperation among Palacky University, Teaching Hospital Olomouc, and CGB in investigating genetic and epigenetic biomarkers for adjusting therapy choice and, potentially, for new therapies. Namely, we will follow biomarkers for potentially predictive biomarkers to antiVEGF (bevacizumab) treatment, chosen based on online cancer genome database searches. These biomarkers belong to somatic, germinal, and epigenetic changes of genetic materiál and, based on literature data, they warrant to expect predictive potential for drug response.

Metastazující kolorektální karcinom(mCRC) je 2.nejčastější příčinou úmrtí na nádorové onemocnění v Evropě. Přes možnosti chirurgie, radio-, chemoterapie a biologické léčby je pětileté přežití pacientů s mCRC nízké (7,5%), a proto se hledají validované prediktivní biomarkery. Tento projekt si klade za cíl získat nové znalosti týkající se mCRC, personalizovat jeho léčbu a tím minimalizovat vedlejší účinky léků. Prostředkem je multidisciplinární spolupráce mezi Univerzitou Palackého, Fakultní nemocnicí Olomouc a CGB při zkoumání genetických a epigenetických biomarkerů pro výběr z možných terapií a pro směřování k novým terapiím. Jmenovitě se budeme věnovat potenciálně prediktivním biomarkerům pro léčbu antiVEGF protilátkou bevacizumabem, získaným z online databází nádorové genetiky. Tyto biomarkery patří mezi somatické, germinální a epigenetické změny genetického materiálu a dle literární rešerše jsou nadějí pro predikci klinické odpovědi na léčbu.

• MeSH
• bevacizumab terapeutické užití   MeSH
• epigenomika MeSH
• inhibitory angiogeneze terapeutické užití   MeSH
• kolorektální nádory farmakoterapie   MeSH
• lidé MeSH
• metastázy nádorů farmakoterapie   MeSH
• nádorové biomarkery genetika   MeSH
• výsledek terapie MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• onkologie
• gastroenterologie
• genetika, lékařská genetika
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

• MeSH
• biologická terapie etika   metody   MeSH
• cílená genová oprava etika   metody   MeSH
• CRISPR-Cas systémy genetika   MeSH
• editace genu * etika   metody   MeSH
• fertilizace in vitro metody   MeSH
• genetická terapie * etika   metody   MeSH
• genetické inženýrství etika   metody   MeSH
• HIV genetika   MeSH
• lidé MeSH
• receptory CCR5 genetika   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• novinové články MeSH

x

x

• MeSH
• Bayesova věta MeSH
• biomedicínský výzkum * metody   normy   trendy   MeSH
• farmaceutický výzkum metody   trendy   MeSH
• klinická studie jako téma MeSH
• lidé MeSH
• pravděpodobnost MeSH
• reprodukovatelnost výsledků * MeSH
• statistika jako téma MeSH
• translační biomedicínský výzkum metody   trendy   MeSH
• validační studie jako téma MeSH
• vědecký podvod etika   psychologie   zákonodárství a právo   MeSH
• výsledky a postupy - zhodnocení (zdravotní péče) * metody   trendy   využití   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH

• Klíčová slova
• vyšetřování zločinu, omyl,
• MeSH
• kontaminace DNA * MeSH
• kriminologie MeSH
• lidé MeSH
• soudní lékařství metody   MeSH
• vražda MeSH
• zločin MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

Introduction: Biliary cysts with an abnormal pancreatobiliary junction are one of the most common pancreatobiliary malformations. The main symptom is cholestasis; endoscopic retrograde cholangiopancreatography (ERCP) plays a key role in diagnosis. Aim: Retrospective evaluation of ERCP performed to diagnose abnormalities of the pancreatobiliary junction. Material and methods: We retrospectively evaluated ERCP performed to diagnose abnormalities of the pancreatobiliary junction, mainly choledochal cysts, in 112 children between 1990 and 2011. Results: We performed 112 examinations of 50 children with abnormal pancreatobiliary junction and choledochal cysts (15 males and 35 females, average age: 5 years, range: 1 month - 15 years). Cysts were associated with a common channel in 37 (74%) cases, were not associated with a common channel in 9 (18%) cases, and in 3 (6%) cases the common channel lacked cysts. We performed endoscopic papilla sphincterotomy on 33 (66%) patients; endoscopic drainage was performed 62 times, including 17 patients without papilla sphincterotomy. In 15 (30%) cases, we only performed sphincterotomy. Extraction of lithiasis was done in 2 (4%) cases. Both ERCP and magnetic resonance cholangiopancreatography (MRCP) were performed on 13 patients. There was concordance of the choledochal cyst and of the type of cyst in both methods; however, common channels could not be observed by MRCP. There was 1 serious complication (perforation after sphincterotomy) and 11 (9%) mild adverse events. Conclusions: When performed at an expert centre, ECRP is a safe and reliable procedure for children with choledochal cysts and/or an abnormal pancreatobiliary junction. Endoscopic retrograde cholangiopancreatography remains a reasonable alternative because MRCP has a limited ability to diagnose the precise anomalies of the pancreatobiliary junction and has no therapeutic capabilities.

• Publikační typ
• časopisecké články MeSH

• MeSH
• gliom MeSH
• isocitrátdehydrogenasa * genetika   MeSH
• lidé MeSH
• mutace genetika   MeSH
• nádory mozku MeSH
• polymerázová řetězová reakce MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• Publikační typ
• abstrakt z konference MeSH

Although the analysis of length polymorphism at STR loci has become a method of choice for grape cultivar identification, the standardization of methods for this purpose lags behind that of methods for DNA profiling in human and animal forensic genetics. The aim of this study was thus to design and validate a grapevine STR protocol with a practically useful level of multiplexing. Using free bioinformatics tools, published primer sequences, and nucleotide databases, we constructed and optimized a primer set for the simultaneous analysis of six STR loci (VVIi51, scu08vv, scu05vv, VVMD17, VrZAG47, and VrZAG83) by multiplex PCR and CE with laser-induced fluorescence, and tested it on 90 grape cultivars. The new protocol requires subnanogram quantities of the DNA template and enables automated, high-throughput genetic analysis with reasonable discriminatory power. As such, it represents a step toward further standardization of grape DNA profiling.

• MeSH
• algoritmy MeSH
• DNA rostlinná analýza   genetika   MeSH
• genetické markery genetika   MeSH
• mikrosatelitní repetice genetika   MeSH
• multiplexová polymerázová řetězová reakce metody   MeSH
• reprodukovatelnost výsledků MeSH
• víno MeSH
• Vitis klasifikace   genetika   MeSH
• výpočetní biologie MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH

In this paper I tested whether Contradictory Matrix with 40 Inventive Principles, the simplest instrument from the Theory of Inventive Problem Solving (TRIZ), is a useful approach to a real-life PCR scenario. The PCR challenge consisted of standardization of fluorescence melting curve measurements in Competitive Amplification of Differentially Melting Amplicons (CADMA) PCR for multiple targets. Here I describe my way of using the TRIZ Matrix to generate seven alternative solutions from which I can choose the successful solution, consisting of repeated cycles of amplification and melting in a single PCR run.

• Publikační typ
• časopisecké články MeSH