Sborník prací, které se zaměřily na zdraví a sociální aspekty současného lékařství a zdravotního systému. Určeno odborné veřejnosti.

• MeSH
• dějiny lékařství MeSH
• komplementární terapie MeSH
• lékařství MeSH
• poskytování zdravotní péče MeSH
• sociální faktory MeSH
• zdraví MeSH
• Publikační typ
• sborníky MeSH

• Konspekt
• Veřejné zdraví a hygiena
• NLK Obory
• veřejné zdravotnictví
• NLK Publikační typ
• kolektivní monografie

• MeSH
• lidé MeSH
• mezibuněčná komunikace MeSH
• nádory * patofyziologie   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

Infrequent and rare genetic variants in the human population vastly outnumber common ones. Although they may contribute significantly to the genetic basis of a disease, these seldom-encountered variants may also be miss-identified as pathogenic if no correct references are available. Somatic and germline TP53 variants are associated with multiple neoplastic diseases, and thus have come to serve as a paradigm for genetic analyses in this setting. We searched 14 independent, globally distributed datasets and recovered TP53 SNPs from 202,767 cancer-free individuals. In our analyses, 19 new missense TP53 SNPs, including five novel variants specific to the Asian population, were recurrently identified in multiple datasets. Using a combination of in silico, functional, structural, and genetic approaches, we showed that none of these variants displayed loss of function compared to the normal TP53 gene. In addition, classification using ACMG criteria suggested that they are all benign. Considered together, our data reveal that the TP53 coding region shows far more polymorphism than previously thought and present high ethnic diversity. They furthermore underline the importance of correctly assessing novel variants in all variant-calling pipelines associated with genetic diagnoses for cancer.

• MeSH
• geny p53 genetika   MeSH
• jednonukleotidový polymorfismus genetika   MeSH
• lidé MeSH
• missense mutace genetika   MeSH
• nádorový supresorový protein p53 genetika   MeSH
• nádory genetika   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

Publikace se zaměřuje na vznik nádorů a jejich chování a na podobnosti v lidském chování, v kontextu systémové teorie. Určeno odborné veřejnosti.

• MeSH
• buňky patologie   MeSH
• chování MeSH
• nádorové procesy MeSH
• sociologické faktory MeSH
• systémová teorie MeSH
• Publikační typ
• monografie MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• onkologie
• behaviorální vědy

Chronic lymphocytic leukemia (CLL) represents a prototype disease in which TP53 gene defects lead to inferior prognosis. Here, we present two distinct methodologies which can be used to identify TP53 mutations in CLL patients; both protocols are primarily intended for research purposes. The functional analysis of separated alleles in yeast (FASAY) can be flexibly adapted to a variable number of samples and provides an immediate functional readout of identified mutations. Amplicon-based next-generation sequencing then allows for a high throughput and accurately detects subclonal TP53 variants (sensitivity <1% of mutated cells).

• MeSH
• alely MeSH
• chronická lymfatická leukemie krev   genetika   patologie   MeSH
• lidé MeSH
• mutace MeSH
• mutační analýza DNA přístrojové vybavení   metody   MeSH
• nádorové cirkulující buňky patologie   MeSH
• nádorový supresorový protein p53 genetika   MeSH
• reportérové geny genetika   MeSH
• Saccharomyces cerevisiae genetika   MeSH
• transfekce přístrojové vybavení   metody   MeSH
• vysoce účinné nukleotidové sekvenování přístrojové vybavení   metody   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

Mantle cell lymphoma (MCL) is characterized by the hallmark t(11;14)(q13;q32) translocation, leading to cyclin D1 over-expression. Additionally, disrupting the DNA damage response pathway through ATM or TP53 defects plays an important role in MCL pathogenesis. Using deep next-generation sequencing we analyzed the mutual composition of ATM and TP53 mutations in 72 MCL patients, and assessed their impact on progression-free survival (PFS) and overall survival (OS). Mutated ATM and TP53 alleles were found in 51% (37/72) and 22% (16/72) of the cases examined, respectively, with only three patients harboring mutations in both genes. Only a mutated TP53 gene was associated with the significantly reduced PFS and OS and the same output was observed when ATM and TP53 defective groups included also sole deletions 11q and 17p, respectively. Determining the exact ATM/p53 pathway dysfunction may influence the selection of MCL patients for innovative therapies based on the targeted inhibition of selected proteins.

• MeSH
• ATM protein genetika   metabolismus   MeSH
• genetická predispozice k nemoci * MeSH
• genetické asociační studie MeSH
• lidé MeSH
• lymfom z plášťových buněk genetika   mortalita   patologie   terapie   MeSH
• mutace * MeSH
• nádorové biomarkery MeSH
• nádorový supresorový protein p53 genetika   metabolismus   MeSH
• prognóza MeSH
• sekvenční delece MeSH
• transkripční faktory SOXC genetika   metabolismus   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

Mutations and deletions of the tumor suppressor TP53 gene are the most frequent genetic alterations detected in human tumors, though they are rather less frequent in lymphomas. However, acquisition of the TP53 mutation was demonstrated to be one of the characteristic markers in mantle cell lymphoma (MCL) and diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL) and prognostic value of the TP53 status has been recognized for these diseases. We present the complex analysis of the TP53 aberrations in 57 cases of MCL and 131 cases of DLBCL. The TP53 status was determined by functional analyses in yeast (FASAY) followed by cDNA and gDNA sequencing. The level of the p53 protein was assessed by immunoblotting and loss of the TP53-specific locus 17p13.3 was detected by FISH. Altogether, we detected 13 TP53 mutations among MCL cases (22.8%) and 29 TP53 mutations in 26 from 131 DLBCL cases (19.8%). The ratio of missense TP53 mutations was 76.9% in MCL and 82.8% in DLBCL. The frequency of TP53 locus deletion was rather low in both diseases, reaching 9.3% in MCL and 15.3% in DLBCL. The presence of TP53 mutation was associated with shorter overall survival (OS) and progression-free survival (PFS) in MCL. Among DLBCL cases, the TP53 mutations shortened both OS and PFS of patients treated with R-CHOP (rituximab, cyclophosphamide, doxorubicin, vincristine and prednisone) and decreased both OS and PFS of patients with secondary DLBCL disease.

• MeSH
• cyklofosfamid aplikace a dávkování   MeSH
• difúzní velkobuněčný B-lymfom farmakoterapie   genetika   patologie   MeSH
• dospělí MeSH
• doxorubicin aplikace a dávkování   MeSH
• Kaplanův-Meierův odhad MeSH
• kvasinky genetika   MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• lymfom z plášťových buněk farmakoterapie   genetika   patologie   MeSH
• mutace MeSH
• nádorový supresorový protein p53 genetika   MeSH
• prednison aplikace a dávkování   MeSH
• přežití po terapii bez příznaků nemoci MeSH
• prognóza * MeSH
• regulace genové exprese u nádorů účinky léků   MeSH
• rituximab aplikace a dávkování   MeSH
• senioři nad 80 let MeSH
• senioři MeSH
• vinkristin aplikace a dávkování   MeSH
• Check Tag
• dospělí MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• senioři nad 80 let MeSH
• senioři MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH

• MeSH
• alely MeSH
• analýza jednotlivých buněk metody   MeSH
• chronická lymfatická leukemie diagnóza   farmakoterapie   genetika   MeSH
• genotyp MeSH
• klonální evoluce genetika   MeSH
• lidé MeSH
• mutační analýza DNA metody   MeSH
• nádorový supresorový protein p53 genetika   MeSH
• receptor Notch1 genetika   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• dopisy MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

Lung cancer is the leading cause of cancer-related deaths worldwide. The p53 tumor suppressor is a transcription factor controlling expression of its target genes in response to various stress stimuli. Mutations of the TP53 gene occur very frequently in lung carcinomas and they play an important role in both oncogenic transformation of lung epithelial cells and lung carcinoma progression. We determined the TP53 status in 42 samples of squamous cell lung carcinoma (SQCC) and 56 samples of lung adenocarcinoma (AC) by the functional analysis FASAY and its variant called split assay. Altogether, we detected 64 TP53 mutations in 63 patients and analyzed them by cDNA and gDNA sequencing. The TP53 mutations were found in 76.2% (32/42) of SQCC cases, and 55.4% (31/56) of ACs. Immunoblotting revealed the p53 protein accumulation in 18 samples (42.9%) among SQCC cases and 19 samples (33.9%) among AC cases. Using fluorescence in situ hybridization we detected loss of the TP53-specific 17p13.3 locus in 23 from 41 analyzed SQCC samples (56.1%) and in 20 from 54 analyzed AC samples (37.0%). We did not find any statistically significant differences in overall and disease-free survival in relation to TP53 status.

• MeSH
• adenokarcinom genetika   patologie   MeSH
• dospělí MeSH
• hybridizace in situ fluorescenční MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mutace MeSH
• nádorová transformace buněk genetika   MeSH
• nádorový supresorový protein p53 genetika   MeSH
• nádory plic genetika   patologie   MeSH
• nemalobuněčný karcinom plic genetika   patologie   MeSH
• přežití po terapii bez příznaků nemoci MeSH
• prognóza MeSH
• regulace genové exprese u nádorů MeSH
• senioři MeSH
• spinocelulární karcinom genetika   patologie   MeSH
• Check Tag
• dospělí MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• senioři MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

Východiska: V současnosti je obecně přijímanou představou o kancerogenezi somatická mutační teorie. Podle ní celý proces začíná jednou „odrodilou“ buňkou, která se hromaděním genetických a epigenetických změn postupně proměňuje ze zdravé na plně maligní. Somatická mutační teorie se soustředí na mutace, genetické příčiny a buněčnou úroveň. Nádory považuje za onemocnění buněk, které ztratily kontrolu nad svou proliferací. Somatická mutační teorie, jejímiž protagonisty jsou Robert Weinberg a Douglas Hanahan, představuje převládající koncepci současné nádorové biologie. Naproti tomu teorie pole tkáňové organizace, kterou poprvé představili Carlos Sonnenschein a Ana Sotoová, považuje za klíčovou při vývoji nádorů ztrátu fyziologické struktury a organizace tkáně. Podle ní nádory vznikají na tkáňové úrovni. Vychází z představy, že stav proliferace je přednastaveným stavem buněk v mnohobuněčném organizmu. Cíl: Text nabízí odpovědi na následující dotazy: Platí i v době, kdy hlavní proud nádorové biologie posunuje svou pozornost od nádorových buněk k nádorovému mikroprostředí, nekompatibilnost a neslučitelnost zastánců somatické mutační teorie, tzv. redukcionistů, a teorie pole tkáňové organizace, tzv. organicistů? Kde hledat třetí, spojující, systemickou teorii? Je přínosné uvědomovat si možný spor mezi redukcionisty a organicisty? V čem ten přínos spočívá? Jak ovlivňuje praktickou onkologii a biologii nádorů obecně? Závěr: Není důležité rozhodnout, zda mají pravdu redukcionisté nebo organicisté. Ale je důležité být si vědom těchto dvou pojetí, protože to zpřesňuje způsob, jakým o celé problematice vzniku a vývoje nádorů přemýšlíme, jak experimentujeme a interpretujeme své výsledky.

Background: The somatic mutation theory explaining the process of carcinogenesis is generally accepted. The theory postulates that carcinogenesis begins in a first renegade cell that undergoes gradual transformation from a healthy to a fully malignant state through the accumulation of genetic and epigenetic “hits”. This theory focuses specifically on mutations and genetic aberrations, and their impact on cells. It considers tumors as populations of sick cells that lose control of their own proliferation. The theory was put forward by Robert Weinberg and Douglas Hanahan, and is the predominant view in current cancer biology. By contrast, the tissue organization field theory proposed by Carlos Sonnenschein and Ana Soto considers loss of physiological structure and function by a tissue as key events in tumor development. According to this theory, tumors arise at a tissue rather than at a cellular level. It is based on a presumption that proliferation status, rather than quiescence, is the default position of cells in multicellular organisms. Aim: The article aims to provide answers to following questions: Are the views of proponents of the somatic mutation theory (the reductionists) and proponents of the tissue organization field theory (the organicists) incompatible and incommensurable, even when the mainstream of tumor biology has shifted its attention from tumor cells toward the tumor microenvironment? Where to find a third interconnecting systemic approach? Is it useful to be aware of the controversy between reductionists and organicists? What this awareness contributes to? How do these alternative views influence practical oncology and tumor biology in general? Conclusion: Whether the true position is held by reductionists or organicists is unimportant. What is important is to be aware of the existence of these two concepts because this knowledge makes the way we think about tumor origin and development, and how we set up and interpret our experiments, more precise.

• Klíčová slova
• somatická mutační teorie, teorie pole tkáňové organizace,
• MeSH
• biologické modely * MeSH
• buňky stromatu MeSH
• karcinogeneze * MeSH
• lidé MeSH
• mutace MeSH
• nádorová transformace buněk * MeSH
• nádorové mikroprostředí MeSH
• nádory etiologie   genetika   MeSH
• nestabilita genomu MeSH
• proliferace buněk MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH
• přehledy MeSH