- Klíčová slova
- skórovací systém CURB 65, skorovací systém PSI,
- MeSH
- antibakteriální látky farmakologie klasifikace terapeutické užití MeSH
- C-reaktivní protein analýza MeSH
- komorbidita * MeSH
- lidé MeSH
- pneumokokové vakcíny * MeSH
- pneumonie pneumokoková * diagnostické zobrazování diagnóza farmakoterapie prevence a kontrola MeSH
- senioři MeSH
- Streptococcus pneumoniae patogenita účinky léků MeSH
- vakcíny konjugované terapeutické užití MeSH
- výzkumný projekt MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- senioři MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
Akutní zánět středouší (otitis media acuta, OMA) patří stále k nejobvyklejším onemocněním u dětí. Článek se zaměřuje na jednotlivé bakteriální původce OMA u dětí, jejich charakteristiku, změny v čase, stav rezistence a doporučené postupy léčby OMA na základě aktuálních dat.
Acute otitis media (AOM) is still one of the most common diseases in children. The article focuses on the individual bacterial agents of AOM in children, their characteristics, changes over time, the state of resistance and recommended management for the treatment of AOM based on current data.
- MeSH
- antibakteriální látky farmakologie klasifikace terapeutické užití MeSH
- dítě MeSH
- Haemophilus influenzae patogenita účinky léků MeSH
- lidé MeSH
- Moraxella catarrhalis patogenita účinky léků MeSH
- otitis media * etiologie farmakoterapie mikrobiologie MeSH
- penicilin V farmakologie terapeutické užití MeSH
- peniciliny farmakologie terapeutické užití MeSH
- směrnice pro lékařskou praxi jako téma MeSH
- Streptococcus pneumoniae patogenita účinky léků MeSH
- Streptococcus pyogenes patogenita účinky léků MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- lidé MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
- MeSH
- dítě MeSH
- lidé MeSH
- očkovací schéma MeSH
- pneumokokové vakcíny * aplikace a dávkování MeSH
- Streptococcus pneumoniae účinky léků MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- lidé MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
Streptococcus pneumoniae is an opportunistic human pathogen that encodes a single eukaryotic-type Ser/Thr protein kinase StkP and its functional counterpart, the protein phosphatase PhpP. These signaling enzymes play critical roles in coordinating cell division and growth in pneumococci. In this study, we determined the proteome and phosphoproteome profiles of relevant mutants. Comparison of those with the wild-type provided a representative dataset of novel phosphoacceptor sites and StkP-dependent substrates. StkP phosphorylates key proteins involved in cell division and cell wall biosynthesis in both the unencapsulated laboratory strain Rx1 and the encapsulated virulent strain D39. Furthermore, we show that StkP plays an important role in triggering an adaptive response induced by a cell wall-directed antibiotic. Phosphorylation of the sensor histidine kinase WalK and downregulation of proteins of the WalRK core regulon suggest crosstalk between StkP and the WalRK two-component system. Analysis of proteomic profiles led to the identification of gene clusters regulated by catabolite control mechanisms, indicating a tight coupling of carbon metabolism and cell wall homeostasis. The imbalance of steady-state protein phosphorylation in the mutants as well as after antibiotic treatment is accompanied by an accumulation of the global Spx regulator, indicating a Spx-mediated envelope stress response. In summary, StkP relays the perceived signal of cell wall status to key cell division and regulatory proteins, controlling the cell cycle and cell wall homeostasis.
- MeSH
- antibakteriální látky farmakologie MeSH
- bakteriální proteiny metabolismus MeSH
- buněčná stěna účinky léků fyziologie MeSH
- fosfoproteiny metabolismus MeSH
- fosforylace MeSH
- fyziologický stres * MeSH
- proteinkinasy metabolismus MeSH
- proteom MeSH
- Streptococcus pneumoniae účinky léků fyziologie MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- dataset MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
BACKGROUND: The resistance of Streptococcus pneumoniae to macrolides is becoming an increasingly important issue and thus it is important to understand the genetics related to adaptation of this species to the widespread use of antibiotics in Europe. The 58 isolates of S. pneumoniae belonging to sequence type (ST) 416 and serotype 19A and to several different phenotypes originated from Italy, Portugal and Czech Republic were thus sequenced on Illumina MiSeq. The aim of the study was to describe genetical origine of isolates, investigate their macrolide resistance and suggest reasons for spread of ST416 in the Czech Republic. RESULTS: Investigation of genes associated with serotype determined serotype switch between 15B and 19A serotypes and core genome multilocus sequence typing (cgMLST) confirmed the origine of concerned isolates in Netherlands15B-37 clone. Inspected genomes proved variability of genes associated with the macrolide resistance even within closely genetically relative isolates. CONCLUSIONS: Participation of 19A/ST416 on the spread of Netherlands15B-37 is accompanied by serotype switch between 19A and 15B serotypes and with acquisition of genes involved in macrolide resistance to the clone that was originally macrolide susceptible. There is evident tendency to interchanging and modifications of these and surrounding genes, that could lead to accelerate spreading of this sequence type in regions with high macrolide consumption.
- MeSH
- bakteriální léková rezistence * MeSH
- fylogeneze MeSH
- fylogeografie MeSH
- genom bakteriální MeSH
- jednonukleotidový polymorfismus MeSH
- lidé MeSH
- makrolidy farmakologie MeSH
- multilokusová sekvenční typizace MeSH
- pneumokokové infekce mikrobiologie MeSH
- sekvenování celého genomu metody MeSH
- séroskupina MeSH
- Streptococcus pneumoniae klasifikace účinky léků genetika izolace a purifikace MeSH
- vysoce účinné nukleotidové sekvenování MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
- Itálie MeSH
- Nizozemsko MeSH
- Portugalsko MeSH
BACKGROUND: The aim of this study was to evaluate the presence of pilus islet 1 (PI-1) and to determine its clade type in pneumococcal isolates with reduced susceptibility to penicillin (penicillin non-susceptible pneumococci - PNSP) and/or resistant to macrolides isolated prior to and after the introduction of pneumococcal conjugate vaccines (PCVs) in the Czech Republic. METHODS: Clinical isolates of serotypes 9V (n = 68) and 19A (n = 89) were examined. Isolates were characterised by multilocus sequence typing (MLST). The presence of PI-1 was determined by screening for the sortase B, C, and D genes located within PI-1. In the presence of PI-1 pilus, clade types were classified by PCR. RESULTS: In the pre-PCV period (2000-2007), the prevalence of PNSP was 3.9% and 2.7% of isolates were resistant to erythromycin. During 2012-2015 (post-PCV period), the rates of PNSP remained stable (3.6%), but resistance to erythromycin increased to 8.3%. While in 2000-2007, resistance to antibiotics was associated mainly with serotype 9V, in 2012-2015, it was replaced by serotype 19A. PI-1 positive isolates were seen in both serotypes. All isolates (68) of serotype 9V belonged to the Spain9V-3 (CC156) clone and carried PI-1 of clade type I while 96.5% (56/58) of isolates of 19A serotype belonged to the Netherlands15B-37 (CC199) clone and carried PI-1 of clade type II. CONCLUSIONS: Both major antibiotic resistant clones carried PI-1, although they differ in the clade type. Thus the role of PI-1 should be evaluated in further studies and potentially considered in the spread of antibiotic resistant clones.
- MeSH
- antibakteriální látky farmakologie MeSH
- erythromycin MeSH
- mikrobiální testy citlivosti MeSH
- mnohočetná bakteriální léková rezistence účinky léků genetika MeSH
- multilokusová sekvenční typizace MeSH
- peniciliny farmakologie MeSH
- pneumokokové vakcíny MeSH
- polymerázová řetězová reakce MeSH
- prevalence MeSH
- rezistence na penicilin MeSH
- séroskupina MeSH
- Streptococcus pneumoniae účinky léků genetika izolace a purifikace MeSH
- techniky typizace bakterií MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
Cíl: Účelem surveillance prováděné v období říjen až prosinec v letech 2010–2017 v České republice bylo sledování stavu a trendů citlivosti k betalaktamovým a makrolidovým antibiotikům u kmenů Streptococcus pneumoniae izolovaných od pacientů s infekcí dýchacích cest. Materiál a metody: Studie se každoročně zúčastnilo 42–55 laboratoří. Do studie byly konsekutivně zařazeny neduplicitní izoláty pneumokoků izolované z relevantních mikrobiologických vzorků od pacientů s komunitní bakteriální respirační infekcí dýchacích cest. Laboratoře zaznamenávaly do protokolu kvalitativní výsledky vyšetření citlivosti k penicilinu a erytromycinu, citlivost k antibiotikům byla stanovena diskovým difuzním testem. Izoláty necitlivé k penicilinu a/nebo rezistentní k erytromycinu byly zasílány do Národní referenční laboratoře pro antibiotika, kde byla pomocí mikrodiluční bujónové metody vyšetřena minimální inhibiční koncentrace antibiotik, v Národní referenční laboratoři pro streptokokové nákazy byl stanoven sérotyp. U 26 izolátů z roku 2017 byla provedena molekulární typizace pomocí multilokusové sekvenace. Výsledky: Celkem bylo vyšetřeno 7 491 kmenů pneumokoků, 53,7 % (4 023) pocházelo z materiálu z horních cest dýchacích, 47,7 % (3 573) tvořily vzorky od dětí mladších 15 let. Necitlivost k penicilinu klesla z 2,6 % v roce 2010 na 1,2 % v roce 2017, rezistence k erytromycinu ve stejném období stoupla ze 7,4 % na 9,7 %. Penicilin necitlivé izoláty patřily zejména do sérotypů 19A, 19F a 15A. Izoláty rezistentní k makrolidům, ale citlivé k penicilinu byly zastoupeny především sérotypem 19A a 3. Multilokusová sekvenace u penicilin necitlivých izolátů prokázala přítomnost klonu Taiwan19F-14, nejčastějším detekovaným sekvenčním typem (ST) izolátů rezistentních k makrolidům byl ST416, který patří do klonu Netherlands15B-37. Závěry: Respirační studie antibiotické rezistence u S. pneumoniae potvrdila klesající trend výskytu rezistence k penicilinu, ale odhalila narůstající rezistenci k makrolidovým antibiotikům v České republice. Výsledky naší studie potvrzují, že antibiotická rezistence je v éře vakcinace spojena především s nevakcinačními sérotypy a klonální expanze sérotypu 19A rezistentního k makrolidům byla patrně navíc podpořena narůstající preskripcí makrolidových antibiotik.
Aim: The purpose of the surveillance performed from October to December in 2010-2017 was to monitor the trends in the susceptibility to beta-lactam and macrolide antibiotics in Streptococcus pneumoniae isolates from respiratory tract infections in the Czech Republic. Material and methods: Between 42 and 55 laboratories participated in the study every year. Consecutive non-duplicate pneumococcal isolates from relevant microbiological specimens from patients with community-acquired bacterial respiratory tract infection were sequentially included in the study. Laboratories recorded qualitative results of penicillin and erythromycin susceptibility testing; susceptibility to antibiotics was determined by the disk diffusion method. Penicillin non-susceptible and/or erythromycin resistant isolates were referred to the National Reference Laboratory for Antibiotics, where the minimum inhibitory concentration of each antibiotic was tested using the broth microdilution method, and their serotyping was performed in the National Reference Laboratory for Streptococcal Infections. Twenty-six isolates from 2017 were analysed by the multilocus sequence typing method. Results: In total, 7 491 pneumococcal strains were examined, of which 53.7% (4 023) were from the upper respiratory tract and 47.7% (3 573) from children under 15 years of age. Non- -susceptibility to penicillin decreased from 2.6% in 2010 to 1.2% in 2017, while resistance to erythromycin increased from 7.4% to 9.7% over the same period. Penicillin non-susceptible isolates were mostly of serotypes 19A, 19F, and 15A. Macrolide resistant but penicillin susceptible isolates were predominantly represented by serotypes 19A and 3. The presence of the Taiwan19F-14 clone was confirmed in penicillin non-susceptible isolates by MLST, and the most frequently identified sequence type (ST) in macrolide resistant isolates was ST416 classified into the Netherlands15B-37 clone. Conclusions: The respiratory study of antibiotic resistance in S. pneumoniae confirmed the decreasing trend of resistance to penicillin but revealed a growing resistance to macrolide antibiotics in the Czech Republic. The results of our study confirm that antibiotic resistance in the vaccination era is associated primarily with the non-vaccine serotypes, and the clonal expansion of macrolide resistant serotype 19A was apparently supported by the growing prescription of macrolide antibiotics.
- Klíčová slova
- respirační studie,
- MeSH
- antibiotická rezistence * MeSH
- epidemiologické monitorování MeSH
- erythromycin terapeutické užití MeSH
- lidé MeSH
- peniciliny terapeutické užití MeSH
- Streptococcus pneumoniae * účinky léků MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
Streptococcus pneumoniae are natural competent bacteria which requires the presence of a pheromone-like molecule to do the transformation process. This study verified the influence of mesoporous silica (SBA-15 and SBA-16) on the transformation process in S. pneumoniae using a donor DNA obtained from a mutant strain of this microorganism (Sp360∆luxS). The results showed that mesoporous silica SBA-15 and SBA-16 particles doubled the transformation ratio frequency compared with negative control (without nanoparticles) in using SBA-15 (ratio 1.81 ± 0.04) and SBA-16 (ratio 2.18 ± 0.22). We demonstrated the how mesoporous silica nanoparticles were able to increase the pneumococcus transformations, which could possibly lead to the acquisition of virulence factor genes and resistance of antibiotics.
- MeSH
- bakteriální transformace účinky léků MeSH
- Escherichia coli účinky léků genetika MeSH
- látky znečišťující vzduch chemie farmakologie MeSH
- oxid křemičitý chemie farmakologie MeSH
- plazmidy genetika MeSH
- povrchové vlastnosti MeSH
- Streptococcus pneumoniae účinky léků genetika MeSH
- velikost částic MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- MeSH
- antibakteriální látky terapeutické užití MeSH
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- meningitida diagnóza MeSH
- mladý dospělý MeSH
- pneumokokové infekce * diagnóza epidemiologie farmakoterapie prevence a kontrola MeSH
- pneumokokové vakcíny MeSH
- sérotypizace MeSH
- Streptococcus pneumoniae izolace a purifikace patogenita účinky léků MeSH
- vakcinace MeSH
- výsledek terapie MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mladý dospělý MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
Alterations in PBP2a have been recognized in cefotaxime-resistant laboratory mutants and β-lactam-resistant clinical isolates of Streptococcus pneumoniae. DNA sequencing revealed fundamental differences between these two settings. Internal stop codons in pbp2a occurred in all three laboratory mutants analyzed, caused by a mutation in pbp2a of mutant C604, and tandem duplications within pbp2a resulting in premature stop codons in another two mutants C403 and C406. In contrast, mosaic PBP2a genes were observed in several penicillin-resistant clinical isolates from South Africa, the Czech Republic, Hungary, and in the clone Poland23F-16, with sequence blocks diverging from sensitive strains by over 4%. Most of these pbp2a variants except pbp2a from the South African strain contained sequences related to pbp2a of Streptococcus mitis B6, confirming that this species serves as reservoir for penicillin-resistance determinants.
- MeSH
- bakteriální geny genetika MeSH
- bakteriální proteiny genetika MeSH
- beta-laktamy farmakologie MeSH
- DNA bakterií genetika MeSH
- lidé MeSH
- mikrobiální testy citlivosti metody MeSH
- mutace genetika MeSH
- peniciliny farmakologie MeSH
- peptidsynthasy genetika MeSH
- proteiny vázající penicilin genetika MeSH
- rezistence na penicilin genetika MeSH
- Streptococcus pneumoniae účinky léků genetika MeSH
- transportní proteiny genetika MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
- Jihoafrická republika MeSH
- Maďarsko MeSH