Q128574723 Dotaz Zobrazit nápovědu
- MeSH
- individualizovaná medicína MeSH
- lidé MeSH
- mnohočetný myelom * genetika MeSH
- mutace MeSH
- reziduální nádor MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- Publikační typ
- abstrakt z konference MeSH
- Publikační typ
- abstrakt z konference MeSH
- Publikační typ
- abstrakt z konference MeSH
AIMS: Amyloidosis is caused by deposition of abnormal protein fibrils, leading to damage of organ function. Hereditary amyloidosis represents a monogenic disease caused by germline mutations in 11 amyloidogenic precursor protein genes. One of the important but non-specific symptoms of amyloidosis is hypertrophic cardiomyopathy. Diagnostics of hereditary amyloidosis is complicated and the real cause can remain overlooked. We aimed to design hereditary amyloidosis gene panel and to introduce new next-generation sequencing (NGS) approach to investigate hereditary amyloidosis in a cohort of patients with hypertrophic cardiomyopathy of unknown significance. METHODS: Design of target enrichment DNA library preparation using Haloplex Custom Kit containing 11 amyloidogenic genes was followed by MiSeq Illumina sequencing and bioinformatics identification of germline variants using tool VarScan in a cohort of 40 patients. RESULTS: We present design of NGS panel for 11 genes (TTR, FGA, APOA1, APOA2, LYZ, GSN, CST3, PRNP, APP, B2M, ITM2B) connected to various forms of amyloidosis. We detected one mutation, which is responsible for hereditary amyloidosis. Some other single nucleotide variants are so far undescribed or rare variants or represent common polymorphisms in European population. CONCLUSIONS: We report one positive case of hereditary amyloidosis in a cohort of patients with hypertrophic cardiomyopathy of unknown significance and set up first panel for NGS in hereditary amyloidosis. This work may facilitate successful implementation of the NGS method by other researchers or clinicians and may improve the diagnostic process after validation.
- MeSH
- dospělí MeSH
- familiární amyloidóza diagnóza genetika MeSH
- fenotyp MeSH
- frekvence genu MeSH
- genetická predispozice k nemoci MeSH
- genetické markery MeSH
- hypertrofická kardiomyopatie diagnóza genetika MeSH
- jednonukleotidový polymorfismus * MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mutace * MeSH
- mutační analýza DNA metody MeSH
- pilotní projekty MeSH
- prediktivní hodnota testů MeSH
- reprodukovatelnost výsledků MeSH
- rizikové faktory MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- stanovení celkové genové exprese metody MeSH
- transkriptom * MeSH
- výpočetní biologie MeSH
- vysoce účinné nukleotidové sekvenování * MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
Waldenström's macroglobulinemia (WM) is a complex disease characterized by apparent morphological heterogeneity within the malignant clonal cells representing a continuum of small lymphocytes, plasmacytoid lymphocytes, and plasma cells. At the molecular level, the neoplastic B cell-derived clone has undergone somatic hypermutation, but not isotype switching, and retains the capability of plasmacytic differentiation. Although by classical definition, WM is formed by monoclonal expansion, long-lived clonal B lymphocytes are of heterogeneous origin. Even more, according to current opinion, plasma cells also conform certain population with pathogenic and clinical significance. In this article, we review the recent advances in the WM clonal architecture, briefly describe B-cell development during which the molecular changes lead to the malignant transformation and mainly focus on differences between two principal B-lineage clones, including analysis of their genome and transcriptome profiles, as well as immunophenotype features. We assume that the correct identification of a number of specific immunophenotypic molecular and expression alterations leading to proper aberrant clone detection can help to guide patient monitoring throughout treatment and successfully implement therapy strategies directed against both B- and plasma cell tumor WM clones.
- MeSH
- B-lymfocyty metabolismus patologie MeSH
- fenotyp MeSH
- genetická heterogenita MeSH
- genetická variace MeSH
- imunofenotypizace MeSH
- klonální evoluce genetika MeSH
- lidé MeSH
- plazmatické buňky metabolismus patologie MeSH
- regulace genové exprese u nádorů MeSH
- signální transdukce MeSH
- tumor burden MeSH
- Waldenströmova makroglobulinemie diagnóza etiologie MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- přehledy MeSH
Amyloidóza lehkých řetězců imunoglobulinů (AL amyloidosis – ALA) je monoklonální gamapatie charakteristická přítomností aberantních plazmatických buněk produkujících amyloidogenní lehké řetězce imunoglobulinů. To vede k tvorbě amyloidních fibril v cílových orgánech a tkáních, především v srdci a ledvinách, což způsobuje jejich dysfunkci. Jelikož tvorba amyloidních depozit je nezvratný proces, je kladeno velké úsilí k nalezení biomarkeru, který by odlišil ALA od ostatních monoklonálních gamapatií v časném stadiu onemocnění, kdy amyloidní depozita ještě nemají fatální následky. Vysoce výkonné technologie přinášejí nové možnosti v rámci moderního výzkumu nádorů, jelikož umožňují studovat nemoc v rámci jeho komplexnosti. Moderní metody, jako jsou sekvenování nové generace, genové expresní profilování a profilování cirkulujících mikroRNA u aberantních buněk ALA pacientů a příbuzných onemocnění patří mezi nové přístupy využívané ke studiu aberantních plazmatických buněk amyloidózy lehkých řetězců a jiných příbuzných onemocnění. Zatímco obecně známé mutace u pacientů s mnohočetným myelomem (KRAS, NRAS, MYC, TP53) nebyly u ALA pacientů nalezeny, počet mutovaných genů u jednotlivých diagnóz není rozdílný. Transkriptom ALA pacientů se jeví být podobnější pacientům s monoklonální gamapatií nejasného významu, a zároveň exprese cirkulujících mikroRNA, pro které je známá korelace s poškozením srdce je zvýšená právě u ALA pacientů, u nichž je poškození srdce typickým projevem.
Immunoglobulin light chain amyloidosis (AL amyloidosis – ALA) is a monoclonal gammopathy characterized by presence of aberrant plasma cells producing amyloidogenic immunoglobulin light chains. This leads to formation of amyloid fibrils in various organs and tissues, mainly in heart and kidney, and causes their dysfunction. As amyloid depositing in target organs is irreversible, there is a big effort to identify biomarker that could help to distinguish ALA from other monoclonal gammopathies in the early stages of disease, when amyloid deposits are not fatal yet. High throughput technologies bring new opportunities to modern cancer research as they enable to study disease within its complexity. Sophisticated methods such as next generation sequencing, gene expression profiling and circulating microRNA profiling are new approaches to study aberrant plasma cells from patients with light chain amyloidosis and related diseases. While generally known mutation in multiple myeloma patients (KRAS, NRAS, MYC, TP53) were not found in ALA, number of mutated genes is comparable. Transcriptome of ALA patients proves to be more similar to monoclonal gammopathy of undetermined significance patients, moreover level of circulating microRNA, that are known to correlate with heart damage, is increased in ALA patients, where heart damage in ALA typical symptom.
- MeSH
- amyloidóza * diagnóza krev patologie MeSH
- genom genetika MeSH
- interpretace statistických dat MeSH
- lidé MeSH
- mikro RNA analýza fyziologie MeSH
- paraproteinemie klasifikace patologie MeSH
- plazmatické buňky * fyziologie MeSH
- průtoková cytometrie MeSH
- transkriptom fyziologie genetika MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
Mnohočetný myelom je dyskrazie plazmatických buněk. Je to druhá nejčastější hematologická malignita, která je charakterizována proliferací klonálních plazmatických buněk produkujících škodlivý monoklonální imunoglobulin. Navzdory možnostem léčby, která se v posledním desetiletí velmi vyvinula, se i u pacientů po terapii často nachází malé množství abnormálních reziduálních buněk, které mohou způsobit návrat onemocnění. Charakterizace reziduálních rezistentních klonů může pomoci odhalit důležité terapeutické cíle pro aplikaci účinné personalizované léčby. Pro tento výzkum používáme aberantní plazmatické buňky vysortované podle markerů CD38, CD45, CD56 a CD19, následované sekvenováním nové generace jejich exomu. Ze seznamu 213 genů, ve kterých byla přítomna alespoň jedna varianta, byl přítomen zajímavý gen NRAS, který je jedním z nejčastěji mutovaných genů u mnohočetného myelomu, homology genů z panelu 88 genů dříve použitých pro sekvenování nové generace u mnohočetného myelomu, mezi kterými byl i gen identifikovaný jako významný při rezistenci na bortezomib. Přes to, že jsou výsledky exomového sekvenování prvního pacienta zajímavé, jsou pouze předběžné a při jejich interpretaci je potřeba být obezřetný, neboť závisí na optimalizaci bioinformatické analýzy, která stále probíhá. Získané výsledky je také potřeba validovat Sangerovým sekvenováním. Brzy budou prezentovány definitivní výsledky podpořené větší kohortou pacientů.
Multiple myeloma is a plasma cell dyscrasia. It is the second most common hematological malignancy which is characterized by proliferation of clonal plasma cells producing harmful monoclonal immunoglobulin. Despite treatment modalities greatly evolved during the last decade, small amount of aberrant residual cells reside in patients after therapy and can cause relapse of the disease. Characterization of the residual, resistant clones can help to reveal important therapeutic targets for application of effective and precious treatment. We use CD38, CD45, CD56 and CD19 sorted aberrant plasma cells to perform next generation sequencing of their exome. Among the 213 genes in which at least one variant was present, the most interesting was found gene NRAS, one of the most often mutated gene in multiple myeloma, and homologs of 88 gene panel previously used for multiple myeloma sequencing among which was a gene previously identified as gene meaningful in bortezomib resistance. Nevertheless, the results of next generation exome sequencing need to be interpreted with caution, since they rely on bioinformatical analysis, which is still being optimized. The results of next generation sequencing will also have to be confirmed by Sanger sequencing. Final results supported by larger cohort of patients will be published soon.
- MeSH
- DNA izolace a purifikace MeSH
- exom fyziologie MeSH
- kostní dřeň patologie MeSH
- lidé MeSH
- mnohočetný myelom * diagnóza terapie MeSH
- mutace genetika MeSH
- reziduální nádor diagnóza genetika patologie MeSH
- vyšetřování kostní dřeně MeSH
- vysoce účinné nukleotidové sekvenování * metody MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
Waldenströmova makroglobulinemie (WM) je B buněčné maligní onemocnění charakteristické vysokou hladinou monoklonálního imunoglobulinu M (IgM) v krevním séru a je spojeno s infiltrací kostní dřeně lymfoproliferativní populací maligních buněk. Navzdory pokrokům v léčbě zůstává toto vzácné onemocnění stále nevyléčitelné. Téměř všechny případy WM souvisí s přítomností somatické bodové mutace L265P v proteinu MYD88. Pacienti s touto mutací mají signifikantně vyšší riziko progrese z IgM monoklonální gamapatie nejistého významu (IgM MGUS) do WM, což nasvědčuje významnou roli této mutace v nádorové transformaci. Druhá nejčastější mutace v genu pro chemokinový receptor CXCR4 je spojena s klinickým významem, konkrétně ovlivňuje rezistenci k léčbě. Detekce zmíněných mutací (MYD88L265P a CXCR4S338X) se tudíž jeví být užitečným diagnostickým a prognostickým nástrojem u pacientů s WM. Zatímco vyšetření mutací z kostní dřeně je běžné, našim cílem bylo porovnat senzitivitu záchytu mutací z odlišných buněčných frakcí periferní krve a kostní dřeně. Výsledky ukazují na možnost vyšetření mutačního stavu i z periferní krve (senzitivita pro MYD88L265P je 100 %, pro CXCR4S338X je 91 %), což výrazně usnadňuje odběr potřebného materiálu. Navíc obdobná senzitivita záchytu mutací ze vzorků kostní dřeně a neinvazivního vyšetření periferní krve během progrese onemocnění a léčby se zdá být příslibem pro rutinní diagnostiku a monitorování onemocnění.
Waldenström's macroglobulinemia (WM) is a B-cell malignancy characterized by high level of monoclonal immunoglobulin M (IgM) paraprotein in blood serum and associated with the bone marrow infiltration by malignant cells with lymphoplasmacytic differentiation. WM remains incurable advances in therapy. Most of WM cases are associated with a somatic point mutation L265P in MYD88. Significantly higher risk of progression from the IgM monoclonal gammopathy of undetermined significance (IgM MGUS) to WM for patients with mutated MYD88 gene suggests that this mutation is an early oncogenic event and plays a central role in development of malignant clones. The second, most prevalent mutation in WM is found in the CXCR4 gene and is often associated with drug resistance and aggressive disease presentation. Therefore, detection of these mutations (MYD88L265P and CXCR4S338X) could be useful diagnostic and prognostic tool for the patients with WM. While detection of these mutations in bone marrow sample is common, the aim of our study was to compare sensitivity of detection of mutation from different cell fraction from peripheral blood and bone marrow. The results show possibility to describe MYD88 and CXCR4 mutation status even from peripheral blood sample (sensitivity for MYD88L265P was 100%, for CXCR4S338X 91%), which significantly facilitate material collection. Moreover, comparable detection sensitivity of these mutations in bone marrow and peripheral blood samples examined before and during the therapy offers a promising tool for more routine diagnostic and monitoring of disease progression.
- MeSH
- kostní dřeň patologie MeSH
- lidé MeSH
- mutace genetika MeSH
- myeloidní diferenciační faktor 88 fyziologie genetika krev MeSH
- polymerázová řetězová reakce využití MeSH
- receptory CXCR4 fyziologie genetika MeSH
- vyšetřování kostní dřeně MeSH
- vzácné nemoci MeSH
- Waldenströmova makroglobulinemie * diagnóza genetika terapie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
