BACKGROUND AND PURPOSE: Manual segmentation of infarct volume on follow-up MRI diffusion-weighted imaging (MRI-DWI) is considered the gold standard but is prone to rater variability. We assess the variability of manual segmentations of MRI-DWI infarct volume. METHODS: Consecutive patients (May 2018 to May 2019) with the anterior circulation stroke and endovascularly treated were enrolled. All patients underwent 24- to 32-hour follow-up MRI. Three users manually segmented DWI infarct volumes slice by slice twice. The reference standard of DWI infarct volume was generated by the STAPLE algorithm. Intra- and interrater reliability was evaluated using the intraclass correlation coefficient (ICC) by comparing manual segmentations with the reference standard. Spatial measurements were evaluated using metrics of the Dice similarity coefficient (DSC). Volumetric measurements were compared using the lesion volume. RESULTS: The dataset consisted of 44 patients, mean (SD) age was 70.1 years (±10.3), 43% were women, and median baseline NIHSS score was 16. Among three users, the mean DSC for MRI-DWI infarct volume segmentations ranged from 80.6% ± 11.7% to 88.6% ± 7.5%, and the mean absolute volume difference was 2.8 ± 6.8 to 13.0 ± 14.0 ml. Interrater ICC among the users for DSC and infarct volume was .86 (95% confidence interval [95% CI]: .78-.91) and .997 (95% CI: .995-.998). Intrarater ICC for the three users was .83 (95% CI: .69-.93), .84 (95% CI: .72-.91), and .80 (95% CI: .64-.89) for DSC, and .99 (95% CI: .987-.996), .991 (95% CI: .983-.995), and .996 (95% CI: .993-.998) for infarct volume. CONCLUSIONS: Manual segmentation of infarct volume on follow-up MRI-DWI shows excellent agreement and good spatial overlap with the reference standard, suggesting its usefulness for measuring infarct volume on 24- to 32-hour MRI-DWI.

• MeSH
• algoritmy MeSH
• difuzní magnetická rezonance metody   MeSH
• endovaskulární výkony metody   MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mozkový infarkt diagnostické zobrazování   patologie   terapie   MeSH
• reprodukovatelnost výsledků MeSH
• senioři MeSH
• Check Tag
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• senioři MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

Úvod: Laparoskopická resekce jater, ve srovnání s ostatními laparoskopickými výkony v břišní dutině, se dostává do klinické praxe až teprve v průběhu posledních let. O roboticky provedené resekci jater dostupné literární sdělení není k dispozici. Metoda: Autoři provedli 2 laparoskopické resekce jater. V prvním případě u 61letého muže z indikace ložiska velikosti 6 cm v průměru nízce diferencovaného hepatocelulárního karcinomu v segmentech SII a SIII v terénu cirhotické přestavby jater (Child A). Provedli manuální laparoskopickou levostrannou lobektomii s pomocí RFA vytvořené resekční linie a s HandPortem. Histologický nález potvrdil diagnózu a R0 resekci. U druhé 29leté pacientky provedli robotickou laparoskopickou resekci ložiska fokální nodulární hyperplazie (FNH) vyrůstajícího ze segmentů SII a SIII velikosti 7×7×5 cm. Výsledky a závěr: Oba nemocní se zhojili bez komplikací, délka hospitalizace byla 8, resp. 7 dní. Manuální laparoskopické resekce levého jaterního laloku s pomocí HandPortu se autorům jeví jako metoda bezpečná a může být pro pacienta z hlediska menšího přístupu do dutiny břišní ve srovnání s otevřeným výkonem přínosná. Podmínkou, v souladu s literárními údaji, je zkušenost v jaterní a laparoskopické chirurgii. Hodnotit přínos robotické laparoskopické resekce jater vyžaduje provedení pilotní studie.

Introduction: Laparoscopic resection of the liver, compared to other laparoscopic procedures of the abdominal cavity, have become used in a clinical practice only in recent years. No literature data on robotic liver resections are available. Methods: The authors completed 2 laparoscopic resections of the liver. The first case included a 61-year old male indicated for the procedure with a low differenciated hepatocellular carcinoma lesion in SII and SIII segments, measuring 6 cm in a diameter, in a Child A cirrhotic remodellation terrain. In-line RFA-assisted and HandPort- assisted manual laparoscopic leftsided lobectomy was completed. Histological findings confirmed the diagnosis and the R0 resection. Robotic laparoscopic resection of the focal nodular hyperplasia (FNH) lesion, growing from SII and SIII segments and measuring 7×7×5 cm was completed in the other case of a 29-year old female patient. Results and Conclusion: Both patients healed without complications, the hospitalization lasted 8 and 7 days, respectively. HandPort-assissted manual laparoscopic resections of the left liver lobe appears a safe method. The patient may benefit from a smaller entrance into the abdominal cavity, compared with open abdominal procedures. Experience in liver and laparoscopic surgery is a prerequisite, which is also supported by literature data. A pilot study must be conducted in order to assess benefits of robotic laparoscopic liver resections.

• MeSH
• laparoskopie metody   MeSH
• lidé MeSH
• nádory jater chirurgie   MeSH
• robotika využití   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• kazuistiky MeSH

Bolest v kříži chápeme jako syndrom, kde skutečná patologicko-anatomická diagnóza často zůstává skryta. Mezi jasně definované nálezy, které tvoří např. vrozené vady, degenerativní iéze, výhřezy disků, záněty, revmatická onemocnění, tumory a jiné, je třeba zařadit funkční poruchy. Ty mohou být jak ve zdravém, tak i v takto stigmatizovaném terénu. K ovlivnění funkční složky je jednou z účinných možností léčby manuální medicína (resp. tzv. myoskeletální medicína). Její znalost přináší lékaři schopnost provést podrobné funkční vyšetření jednotlivých pohybových segmentů a umožňuje v řadě případů rychlé a efektivní ošetření.Tato léčba je přízniva z hlediska ceny, protože vyžaduje minimální náklady, počet komplikací u zkušených lékařů je rovněž minimální. Pracná je doba získávání zkušeností a dovedností. Dobré výsledky jsou především u akutnich a subakutních stavů, horší u bolesti chronické, kde kromě funkční poruchy hraje roli řada faktorů, zvláště psychika pacienta. Oblast manuální medicíny se kromě vlastní manipulace s nárazem zabývá řadou technik, které mají minimálně kontraindikací a jsou použitelné i u akutní bolesti s antalgickým držením. Manipulace neprovádíme u pacientů v celkově špatném stavu, s oběhovými poruchami, hoíčnatým onemocněním, tumory, těžkou porózou skeletu nebo akutním výhřezem disku. Výstižně formuluje zásadní kontraindikací Lewit jako použití inadekvátní techniky vzhledem ke stavu pacienta a lokálnímu nálezu. V tom také spočívá riziko diskreditace jinak účinné a prospěšné léčebné techniky, jakou manuální medicína je.

Low back pain is a syndrome when the actual pathoiogical and anatomical diagnosis remains often hidden. The clearly defined findings such as congenital anomalies, degenerative lesion, intervertebral lise protrusion, inflammations, rheumatic diseases, tumours and others should include functional disorders which may be found both in a healthy region and in the region stigmatised in this way. One of the efficient possibilities of the treatment inftuencing the functional component is manual medicine (sometimes called myoskeletal medicine).The physician acquainted with this method is able to perform a detailed functional examination of individual notoric segments and in a number of cases the treatment may be fast and efficient.This treatment is also ost effective and the number of complications in experienced physicians is minimal. On the other hand it is labour-intensive from the viewpoint of gaining experience and skills. Good results are achived mainly in an acute and sub-acutte condition, worse results have been recorded in chronic pain where a significant role is played apart from functional disorders also be a number of other factors, especially the psychic condition of the patient. Manual medicine deals with a whole range of procedures which have only minimum contraindications and are applicable also in acute pain with antalgic posture. Manipulation is not performed in patients in general poor condition, with circulation disorders, fever diseases, tumours, severe osteoporosis ot the skeleton or acute disc protrusion. The principal contramdication was aptly formulated by Lewit as the apPlication of inadequate technique with regard to the condition of the patient and the local finding. This is also the main risk of otherwise efficient and useful technique of treatment which manual medicine certainiy is.

• MeSH
• bolesti zad diagnóza   etiologie   terapie   MeSH
• lidé MeSH
• manipulace ortopedická MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

In recent years, computed tomography (CT) has become a standard technique in cardiac imaging because it provides detailed information that may facilitate the diagnosis of the conditions that interfere with correct heart function. However, CT-based cardiac diagnosis requires manual segmentation of heart cavities, which is a difficult and time-consuming task. Thus, in this paper, we propose a novel technique to segment endocardium and epicardium boundaries based on a 2D approach. The proposal computes relevant information of the left ventricle and its adjacent structures using the Hermite transform. The novelty of the work is that the information is combined with active shape models and level sets to improve the segmentation. Our database consists of mid-third slices selected from 28 volumes manually segmented by expert physicians. The segmentation is assessed using Dice coefficient and Hausdorff distance. In addition, we introduce a novel metric called Ray Feature error to evaluate our method. The results show that the proposal accurately discriminates cardiac tissue. Thus, it may be a useful tool for supporting heart disease diagnosis and tailoring treatments.

• MeSH
• biologické modely MeSH
• lidé MeSH
• počítačová rentgenová tomografie metody   MeSH
• srdeční komory patologie   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

Cíl: Srovnat rychlost a přesnost měření automatické a manuální CT volumometrie jater, zároveň porovnat výsledky dvou různě zkušených radiologů. Metodika: Do retrospektivní studie bylo zahrnuto celkem 66 pacientů s jaterními metastázami kolorektálního karcinomu, kteří byli kandidáti chirurgické resekce části jater, ve všech případech pravostranné hepatektomie. Byla provedena analýza objemu celých jater a FLRV (předpokládaný zbytkový objem jater po resekci) pomocí automatické a manuální CT volumometrie. Měření prováděli dva lékaři radiologové, jeden atestovaný s dlouholetou zkušeností v oboru a druhý v předatestační přípravě. Srovnány byly výsledky objemů a časů měření mezi automatickou a manuální metodou a také mezi oběma uživateli. Výsledky: Bylo zjištěno statisticky významně rychlejší měření automatickou CT volumometrií oproti ruční metodě (p < 0,0001). Bez statistické významností bylo srovnání naměřených objemů celých jater a FLRV oběma způsoby volumometrie (p = 0,552). Nebyla pozorována závislost výsledků manuální i automatické analýzy na zkušenosti uživatele. Hodnoty časů i naměřených objemů od obou vyšetřujících se významně nelišily (p = 0,612, resp. p = 0,909). Závěr: Automatická CT volumometrie je optimální metodou pro měření jaterních objemů. Získané hodnoty jsou dostatečně přesné a rychlost měření je významně vyšší oproti manuální CT volumometrii.

Objectives: To compare speed and accuracy between both the automatic and manual CT liver volumetry and between two radiologist with different long of their medical practice. Methods: 66 patients with liver metastases of colorectal cancer were included to the study. The analysis of total liver volume and FLRV (future liver remnant volume) was performed using automatic and manual CT volumetry by two different experienced radiologist. Results: Statistically significantly faster procedure was observed by the automatic CT volumetry in comparison to the manual method (p < 0.0001). No statistically significantly different value of detected liver volumes were found by manual and automatic method (p = 0.552) neither the two performing radiologist (p = 0.612 from time and p = 0.909 from volumes). Conclusion: The automatic CT volumetry is optimal method for the measurement of the liver. The results are accurate and the speed of analysis is significantly higher in comparison to the manual CT volumetry.

• MeSH
• hepatektomie * MeSH
• játra diagnostické zobrazování   chirurgie   MeSH
• lidé MeSH
• nádory jater diagnostické zobrazování   MeSH
• předoperační vyšetření metody   MeSH
• retrospektivní studie MeSH
• tomografie emisní počítačová metody   MeSH
• velikost orgánu MeSH
• vizualizace dat MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH

Although the field of sleep study has greatly developed over recent years, the most common and efficient way to detect sleep issues remains a sleep examination performed in a sleep laboratory. This examination measures several vital signals by polysomnograph during a full night's sleep using multiple sensors connected to the patient's body. Nevertheless, despite being the gold standard, the sensors and the unfamiliar environment's connection inevitably impact the quality of the patient's sleep and the examination itself. Therefore, with the novel development of accurate and affordable 3D sensing devices, new approaches for non-contact sleep study have emerged. These methods utilize different techniques to extract the same breathing parameters but with contactless methods. However, to enable reliable remote extraction, these methods require accurate identification of the basic region of interest (ROI), i.e., the patient's chest area. The lack of automated ROI segmenting of 3D time series is currently holding back the development process. We propose an automatic chest area segmentation algorithm that given a time series of 3D frames containing a sleeping patient as input outputs a segmentation image with the pixels that correspond to the chest area. Beyond significantly speeding up the development process of the non-contact methods, accurate automatic segmentation can enable a more precise feature extraction. In addition, further tests of the algorithm on existing data demonstrate its ability to improve the sensitivity of a prior solution that uses manual ROI selection. The approach is on average 46.9% more sensitive with a maximal improvement of 220% when compared to manual ROI. All mentioned can pave the way for placing non-contact algorithms as leading candidates to replace existing traditional methods used today.

• MeSH
• algoritmy * MeSH
• dýchání MeSH
• lidé MeSH
• počítačové zpracování obrazu metody   MeSH
• polysomnografie MeSH
• spánek MeSH
• zobrazování trojrozměrné * metody   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH

Tématem pilotní studie je objektivizování závislosti zvýšeného napětí ligamenta pubovesicale na zvýšení frekvence mikce. V první fázi práce jsme srovnávali frekvenci mikce během dne a noci u skupiny 60 probandů se zvýšeným napětím ligamenta pubovesicale oproti skupině 60 probandů bez zvýšeného napětí ligamenta. V druhé fázi jsme sledovali statistickou závislost frekvence mikce na manuální ošetření ligamenta pubovesicale. Probandy se zvýšeným napětím ligamenta jsme rozdělili do tří skupin. Byla srovnávána skupina s provedeným manuálním ošetřením ligamenta proti skupině s provedenou manuální terapií v segmentech pohybového aparátu neurofyziologicky zřetězenými s močovým měchýřem a skupinou bez terapie. Závěry práce poukazují na signifikantní vliv zvýšeného napětí ligamenta na vyšší frekvenci mikce probandů během dne (p<0,05) a účinek manuálního ošetřeni ligamenta na snížení frekvence mikce během dne i noci (p<0,05).

This pilot study attempts to objectify the dependence of increased tension of pubovesical ligament on the frequency of micturition. In the first phase the author compared the micturition frequency during the night in a group of 60 probands with increased tension of pubovesical ligament as compared with a group of 60 probands without with increased tension of the ligamentum. In the second phase we followed the dependence of micturition on manual treatment of pubovesical ligament. The probands with increased tension of the ligamentum were divided into three groups. The group with performed manual treatment of pubovesical ligament was compared with that who underwent manual treatment in the segments of locomotion apparatus, which is associated with a neurophysiological chain with urinary bladder and also compared with a group without treatment. The conclusions refer to the significant influence of increased tension of the ligament on a higher frequency of micturition of the probands during the day (p<0.05) and the effect of ligament treatment on the decrease of micturition at night as well (p<0.05).

• Klíčová slova
• ligamentum pubovesicale, frekvence mikce,
• MeSH
• dospělí MeSH
• klinická studie jako téma MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• močení MeSH
• močový měchýř MeSH
• poruchy močení * rehabilitace   terapie   MeSH
• senioři MeSH
• techniky fyzikální terapie * MeSH
• Check Tag
• dospělí MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• senioři MeSH
• ženské pohlaví MeSH

PURPOSE: Infarct lesion volume (ILV) may serve as an imaging biomarker for clinical outcomes in the early post-treatment stage in patients with acute ischemic stroke. The aim of this study was to evaluate the inter- and intra-rater reliability of manual segmentation of ILV on follow-up non-contrast CT (NCCT) scans. METHODS: Fifty patients from the Prove-IT study were randomly selected for this analysis. Three raters manually segmented ILV on 24-h NCCT scans, slice by slice, three times. The reference standard for ILV was generated by the Simultaneous Truth And Performance Level estimation (STAPLE) algorithm. Intra- and inter-rater reliability was evaluated, using metrics of intraclass correlation coefficient (ICC) regarding lesion volume and the Dice similarity coefficient (DSC). RESULTS: Median age of the 50 subjects included was 74.5 years (interquartile range [IQR] 67-80), 54% were women, median baseline National Institutes of Health Stroke Scale was 18 (IQR 11-22), median baseline ASPECTS was 9 (IQR 6-10). The mean reference standard ILV was 92.5 ml (standard deviation (SD) ± 100.9 ml). The manually segmented ILV ranged from 88.2 ± 91.5 to 135.5 ± 119.9 ml (means referring to the variation between readers, SD within readers). Inter-rater ICC was 0.83 (95%CI: 0.76-0.88); intra-rater ICC ranged from 0.85 (95%CI: 0.72-0.92) to 0.95 (95%CI: 0.91-0.97). The mean DSC among the three readers ranged from 65.5 ± 22.9 to 76.4 ± 17.1% and the mean overall DSC was 72.8 ± 23.0%. CONCLUSION: Manual ILV measurements on follow-up CT scans are reliable to measure the radiological outcome despite some variability.

• MeSH
• algoritmy MeSH
• cévní mozková příhoda * diagnostické zobrazování   MeSH
• ischemická cévní mozková příhoda * MeSH
• lidé MeSH
• počítačová rentgenová tomografie metody   MeSH
• reprodukovatelnost výsledků MeSH
• senioři MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• senioři MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH

Automatic detection and segmentation of biological objects in 2D and 3D image data is central for countless biomedical research questions to be answered. While many existing computational methods are used to reduce manual labeling time, there is still a huge demand for further quality improvements of automated solutions. In the natural image domain, spatial embedding-based instance segmentation methods are known to yield high-quality results, but their utility to biomedical data is largely unexplored. Here we introduce EmbedSeg, an embedding-based instance segmentation method designed to segment instances of desired objects visible in 2D or 3D biomedical image data. We apply our method to four 2D and seven 3D benchmark datasets, showing that we either match or outperform existing state-of-the-art methods. While the 2D datasets and three of the 3D datasets are well known, we have created the required training data for four new 3D datasets, which we make publicly available online. Next to performance, also usability is important for a method to be useful. Hence, EmbedSeg is fully open source (https://github.com/juglab/EmbedSeg), offering (i) tutorial notebooks to train EmbedSeg models and use them to segment object instances in new data, and (ii) a napari plugin that can also be used for training and segmentation without requiring any programming experience. We believe that this renders EmbedSeg accessible to virtually everyone who requires high-quality instance segmentations in 2D or 3D biomedical image data.

• MeSH
• algoritmy * MeSH
• lidé MeSH
• mikroskopie * metody   MeSH
• počítačové zpracování obrazu metody   MeSH
• zobrazování trojrozměrné metody   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH

This paper describes an evaluation framework that allows a standardized and quantitative comparison of IVUS lumen and media segmentation algorithms. This framework has been introduced at the MICCAI 2011 Computing and Visualization for (Intra)Vascular Imaging (CVII) workshop, comparing the results of eight teams that participated. We describe the available data-base comprising of multi-center, multi-vendor and multi-frequency IVUS datasets, their acquisition, the creation of the reference standard and the evaluation measures. The approaches address segmentation of the lumen, the media, or both borders; semi- or fully-automatic operation; and 2-D vs. 3-D methodology. Three performance measures for quantitative analysis have been proposed. The results of the evaluation indicate that segmentation of the vessel lumen and media is possible with an accuracy that is comparable to manual annotation when semi-automatic methods are used, as well as encouraging results can be obtained also in case of fully-automatic segmentation. The analysis performed in this paper also highlights the challenges in IVUS segmentation that remains to be solved.

• MeSH
• databáze faktografické normy   MeSH
• internacionalita MeSH
• interpretace obrazu počítačem metody   normy   MeSH
• intervenční ultrasonografie metody   normy   MeSH
• lidé MeSH
• nemoci koronárních tepen ultrasonografie   MeSH
• referenční hodnoty MeSH
• reprodukovatelnost výsledků MeSH
• senzitivita a specificita MeSH
• směrnice pro lékařskou praxi jako téma * MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH
• Research Support, N.I.H., Extramural MeSH
• Research Support, U.S. Gov't, Non-P.H.S. MeSH