Respirační syncytiální virus (RSV) je nezanedbatelnou příčinou morbidity zejména v časném dětském věku. V článku shrnujeme pokrok a změny jak v pochopení patofyziologie této infekce i jejích dopadů, tak v diagnostice, případně terapii a prevenci.
Respiratory syncytial virus (RSV) is important cause of morbidity, especially in early childhood. In the article, we summary the improvement and changes either in understanding of RSV patofysiology, it’s acute and long term effects, same as in diagnostics, therapy or prevention.
- Klíčová slova
- palivizumab,
- MeSH
- antivirové látky terapeutické užití MeSH
- infekce respiračními syncytiálními viry * diagnóza farmakoterapie patofyziologie MeSH
- lidé MeSH
- respirační syncytiální viry patogenita ultrastruktura MeSH
- vakcinace MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
- MeSH
- analýza krevních plynů metody MeSH
- antibakteriální látky terapeutické užití MeSH
- biochemická analýza krve metody MeSH
- klinické laboratorní techniky * metody MeSH
- krevní obraz metody MeSH
- lidé MeSH
- mediátory zánětu analýza MeSH
- mikrobiologické techniky metody MeSH
- pediatrie MeSH
- pneumologie * metody MeSH
- vyšetření krevní srážlivosti metody MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
- MeSH
- COVID-19 * diagnóza patofyziologie terapie MeSH
- heparin aplikace a dávkování terapeutické užití MeSH
- intravenózní imunoglobuliny aplikace a dávkování terapeutické užití MeSH
- lidé MeSH
- methylprednisolon aplikace a dávkování terapeutické užití MeSH
- syndrom systémové zánětlivé reakce * etiologie farmakoterapie patofyziologie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
Cíl: Určit senzitivitu a specificitu testu ID-NOW™ (Abbott) v diagnostice covid-19, která je založena na detekci genu SARS-CoV-2 technologií izotermální amplifikace. Metody: Celkem 303 jedinců podstoupilo dva výtěry z nosohltanu a jeden výtěr z orofaryngu pro možnost paralelního vyšetření metodou ID-NOW™ a PCR (Allplex™ SARS-CoV-2 Assay). Podskupina 107 jedinců navštívila veřejné odběrové místo pro covid-19 ve Fakultní nemocnici v Motole v době dominance varianty delta, ostatní byli vyšetřeni cestou Oddělení urgentního příjmu dospělých v období dominance varianty omikron. Výsledky: Z 297 validních vzorků bylo 43 nalezeno pozitivních metodou PCR a 33 pozitivních metodou ID-NOW™ (senzitivita 76,74 %; 95% CI 61,37 až 88,24 %). Naopak ID-NOW™ zachytilo 3 vzorky jako pozitivní, ale pozitivita nebyla pomocí PCR potvrzena (specifita 98,82 %; 95% CI 96,59 až 99,76 %). Významný nárůst senzitivity až na hodnotu 100 % je pozorován při testování vzorků s vyšší virovou náloží (s hodnotou prahového cyklu PCR pod 30 či získaných od pacientů s příznaky onemocnění covid-19). Varianta delta ani omikron nemá na citlivost metody významný vliv. Závěr: ID-NOW™ je díky své kompaktnosti a rychlosti vyšetření vhodný diagnostický nástroj pro okamžité stanovení infekčnosti pacienta. V případě, že pacient pociťuje příznaky covid-19, je vhodné provést i přes negativní výsledek ID-NOW™ klasické PCR vyšetření SARS-CoV-2.
Objective: To determine the sensitivity and specificity of the Abbott ID-NOW™ test in the diagnosis of COVID-19. The test is based on the detection of the SARS-CoV-2 gene by isothermal amplification technology. Methods: From 303 individuals, two nasopharyngeal swabs and one oropharyngeal swab were collected to be tested in parallel by the ID-NOW™ test and PCR test (Allplex™ SARS-CoV-2 Assay). A subgroup of 107 individuals presented to the public collection point for covid-19 at the Motol University Hospital during the dominance of the Delta variant, and the others were tested via the Adult Emergency Admission Department during the dominance of the Omicron variant. Results: Of 297 valid samples, 43 were positive by the PCR assay and 33 were positive by the ID-NOW™ test (sensitivity 76.74%; 95% CI 61.37 to 88.24%). ID-NOW™ detected three samples as positive, but the positivity was not confirmed by PCR (specificity 98.82%; 95% CI 96.59 to 99.76%). A significant increase in sensitivity up to 100% is observed for samples with a higher viral load (with a PCR threshold cycle value below 30 or from patients with symptoms of COVID-19). The Delta or Omicron variant has no significant effect on the sensitivity of the test. Conclusion: Due to its ease of use and speed of result, ID-NOW™ is a suitable diagnostic tool for prompt assessment of a patient’s infectivity. If, despite the negative ID-NOW™ result, the patient has symptoms of COVID-19, it is advised to perform a classic PCR test for SARS-CoV-2.
- Klíčová slova
- ID-NOW,
- MeSH
- COVID-19 diagnóza MeSH
- klinická studie jako téma MeSH
- lidé MeSH
- point of care testing MeSH
- SARS-CoV-2 izolace a purifikace MeSH
- senzitivita a specificita MeSH
- testování na COVID-19 * metody MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
Kongenitální cytomegalovirová infekce je celosvětově nejčastější vrozenou infekcí (0,2−6 % živě narozených dětí, v zemích s vyšším ekonomickým standardem 0,2−0,6 %). Jedná se o nejčastější příčinu geneticky nepodmíněné senzorineurální ztráty sluchu, má významný podíl na neurologických vývojových poruchách. Rizika přenosu na plod se zásadně liší u primoinfekce (30−35 %) a u reaktivace nebo reinfekce (1,1−1,7 %). Zhruba 90 % novorozenců je v době porodu asymptomatických, avšak u 10−15 % se objevuje v prvních letech života porucha sluchu nebo psychomotorická retardace. Prenatálními klinickými projevy jsou růstová retardace, ventrikulomegalie, mikrocefalie, intrakraniální kalcifikace, postnatálně je nejčastěji patrná nízká porodní hmotnost, mikrocefalie, hypotonie, petechiální exantém, blueberry muffins, hepatosplenomegalie, trombocytopenie, neutropenie, hepatopatie, hyperbilirubinemie, porucha sluchu, chorioretinitida. Diagnóza by měla být stanovena co nejdříve, doporučovaným screeningovým testem je vyšetření slin nebo moči (PCR), s následným kvantitativním stanovením viremie a virurie. Léčba je zahajována v prvních 4 týdnech života u novorozenců s gestačním věkem nad 32 týdnů, vždy při postižení centrální nervové soustavy a/nebo závažném postižení dalších orgánů (játra, kostní dřeň, plíce, oko). Základním virostatikem je intravenózní ganciklovir nebo perorálně podávaný valganciklovir, který by měl být preferován. Doba léčby je 6 měsíců, v indikovaných případech až 1 rok. Dispenzarizace dětí s kongenitální CMV infekcí by měla probíhat minimálně do 4 let věku, nezbytné jsou pravidelné kontroly sluchu, psychomotorického vývoje a zraku.
Congenital cytomegalovirus infection is the most common congenital infection worldwide (0.2−6 % of live births, 0.2−0.6 % in countries with a higher economic standard). It is the most common cause of non-genetic sensorineural hearing loss and has a significant role in neurological developmental disorders. The risks of transmission to the fetus are fundamentally different for primary infection (30−35 %) and for reactivation or reinfection (1.1−1.7 %). About 90 % of newborns are asymptomatic at the time of birth, but 10−15 % develop hearing impairment or neurodevelopmental disorder in the first years of life. Prenatal clinical manifestations include intrauterine growth retardation, ventriculomegaly, microcephaly or intracranial calcification, whereas low birth weight, microcephaly, hypotonia, petechial exanthema, blueberry muffins, hepatosplenomegaly, thrombocytopenia, neutropenia, hepatopathy, hyperbilirubinemia, hearing impairment or chorioretinitis are seen postnatally. The diagnosis should be established as soon as possible, the recommended screening test is the examination of saliva or urine (PCR), followed by quantitative viremia and viruria. The treatment is started in the first 4 weeks of life in newborns with a gestational age of over 32 weeks with CNS involvement and/ or severe involvement of other organs (liver, bone marrow, lungs, eye). The basic virostatic agent is intravenous ganciclovir or oral valganciclovir. The duration of treatment is 6 months, in indicated cases up to 1 year. The follow-up of children with congenital CMV infection should last until at least 4 years of age, regular evaluation of hearing, neurodevelopmental outcome and vision are necessary.
A surge in hematopoietic stem cell transplantation (HSCT) human adenovirus A31 (HAdV-A31) infections was initially observed in late 2014/2015 at SickKids (SK) Hospital, Toronto, Canada. In response, enhanced laboratory monitoring for all adenovirus infections was conducted. Positive samples underwent genotyping, viral culture, and, in selected cases, whole-genome sequencing (WGS). HAdV-A31 specimens/DNA obtained from four international pediatric HSCT centers also underwent WGS. During the SK outbreak period (27 October 2014 to 31 October 2018), 17/20 HAdV-A31 isolates formed a distinct clade with 0 to 8 mutations between the closest neighbors. Surveillance before and after the outbreak detected six additional HAdV-A31 HSCT cases; three of the four sequenced cases clustered within the outbreak clade. Two SK outbreak isolates were identical to sequences from two patients in an outbreak in England. Three SK non-outbreak sequences also had high sequence similarity to strains from three international centers. Environmental PCR testing of the HSCT ward showed significant adenovirus contamination. Despite intense infection control efforts, we observed re-occurrence of infection with the outbreak strain. Severe but nonfatal infection was observed more commonly with HAdV-A31 compared to other genotypes, except HAdV-C1. Our findings strongly implicate nosocomial spread of HAdV-A31 over 10 years on a HSCT unit and demonstrate the value of WGS in defining and mapping the outbreak. Close linkages among strains in different countries suggest international dissemination, though the mechanism is undetermined. This large, extended outbreak emphasizes the pre-eminent role of HAdV-A31 in causing intractable pediatric HSCT outbreaks of severe illness worldwide.
- MeSH
- adenovirové infekce lidí * epidemiologie MeSH
- adenovirové infekce * MeSH
- dítě MeSH
- fylogeneze MeSH
- lidé MeSH
- lidské adenoviry * MeSH
- nemocnice MeSH
- sekvenování celého genomu MeSH
- transplantace hematopoetických kmenových buněk * škodlivé účinky MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
BACKGROUND: The rapid diagnostics tests for SARS-CoV-2 antigen vary in their sensitivities, and moreover, genomic mutations may further affect the performance of the assays. We aimed to evaluate the analytical performance of an automated antigen assay and compare its sensitivity in Delta- and Omicron-variant positive clinical samples. MATERIAL AND METHODS: The analytical performance of an automated mariPOC SARS-CoV-2 antigen test was evaluated on a population of community-dwelling subjects with mild respiratory symptoms or being asymptomatic investigated by the RT-qPCR AllplexTM SARS-CoV-2 assay. The sensitivity and specificity of the antigen test were evaluated on prospective 621 nasopharyngeal swabs along with oropharyngeal swabs. The sensitivity regarding variants determined by the AllplexTM SARS-CoV-2 Variant assays was analysed in additional, retrospective 158 Delta and 59 Omicron samples. RESULTS: The overall sensitivity of the antigen test in prospective samples was 77.9% (113/145; 95% confidence interval [CI] 70.3-84.4) with the specificity of 99.8% (95% CI 98.8-100). Regarding the variant, the sensitivity was higher in Omicron-variant samples, 93.2% (55/59; 95% CI 83.5-98.1), compared to Delta-variant samples, 71.5% (113/158; 95% CI 63.8-78.4; p = .001). CONCLUSION: In community-dwelling subjects with mild respiratory symptoms or being asymptomatic, the automated mariPOC SARS-CoV-2 antigen test showed high sensitivity over 98.0% in subgroup samples with cycle threshold (Ct) values < 25. Regarding the variant, the antigen test sensitivity was higher in the Omicron-variant samples compared to the Delta-variant samples. The analytical performance of the antigen test can differ between the SARS-CoV-2 variants, and a re-evaluation should be performed for new circulating lineages.
- MeSH
- COVID-19 * diagnóza MeSH
- lidé MeSH
- prospektivní studie MeSH
- retrospektivní studie MeSH
- SARS-CoV-2 * genetika MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- MeSH
- antifungální látky terapeutické užití MeSH
- Candida * MeSH
- kandidemie * farmakoterapie MeSH
- lidé MeSH
- rizikové faktory MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- dopisy MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
Human cytomegalovirus (HCMV) can cause significant end-organ diseases such as pneumonia in HIV-exposed infants. Complex viral factors may influence pathogenesis including: a large genome with a sizeable coding capacity, numerous gene regions of hypervariability, multiple-strain infections, and tissue compartmentalization of strains. We used a whole genome sequencing approach to assess the complexity of infection by comparing high-throughput sequencing data obtained from respiratory and blood specimens of HIV-exposed infants with severe HCMV pneumonia with those of lung transplant recipients and patients with hematological disorders. There were significantly more specimens from HIV-exposed infants showing multiple HCMV strain infection. Some genotypes, such as UL73 G4B and UL74 G4, were significantly more prevalent in HIV-exposed infants with severe HCMV pneumonia. Some genotypes were predominant in the respiratory specimens of several patients. However, the predominance was not statistically significant, precluding firm conclusions on anatomical compartmentalization in the lung.
- MeSH
- cytomegalovirové infekce * epidemiologie MeSH
- Cytomegalovirus genetika MeSH
- HIV infekce * komplikace MeSH
- kojenec MeSH
- lidé MeSH
- pneumonie * MeSH
- Check Tag
- kojenec MeSH
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- Geografické názvy
- Jihoafrická republika MeSH
- MeSH
- COVID-19 * prevence a kontrola MeSH
- glykoprotein S, koronavirus MeSH
- lidé MeSH
- messenger RNA MeSH
- plíce MeSH
- příjemce transplantátu * MeSH
- protilátky virové MeSH
- SARS-CoV-2 MeSH
- T-lymfocyty MeSH
- vakcína BNT162 MeSH
- vakcíny proti COVID-19 MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
