INTRODUCTION: Recent advances in machine learning provide new possibilities to process and analyse observational patient data to predict patient outcomes. In this paper, we introduce a data processing pipeline for cardiogenic shock (CS) prediction from the MIMIC III database of intensive cardiac care unit patients with acute coronary syndrome. The ability to identify high-risk patients could possibly allow taking pre-emptive measures and thus prevent the development of CS. METHODS: We mainly focus on techniques for the imputation of missing data by generating a pipeline for imputation and comparing the performance of various multivariate imputation algorithms, including k-nearest neighbours, two singular value decomposition (SVD)-based methods, and Multiple Imputation by Chained Equations. After imputation, we select the final subjects and variables from the imputed dataset and showcase the performance of the gradient-boosted framework that uses a tree-based classifier for cardiogenic shock prediction. RESULTS: We achieved good classification performance thanks to data cleaning and imputation (cross-validated mean area under the curve 0.805) without hyperparameter optimization. CONCLUSION: We believe our pre-processing pipeline would prove helpful also for other classification and regression experiments.
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
Cévní nádory u dětí jsou pro pediatry důležitou entitou, aby je mohli rozpoznat a správně diagnostikovat. Mohou se objevit při narození nebo se mohou vyvinout v jakémkoli období v průběhu dětského věku, nebo dospívání. Většina je benigních, ale i benigní léze mohou mít bez správného zásahu významnou morbiditu. Takovou entitou je bezesporu pyogenní granulom, známý jako lobulární kapilární hemangiom. Prezentujeme 2,5letého chlapce, u kterého byla diagnóza s histopatologickým ověřením stanovena až ve věku 28 měsíců po opakovaných stavech profuzního krvácení fragilního pyogenního granulomu.
Vascular tumors in children are an important entity for the pediatricians to recognize and correctly diagnose. They may present at birth or develop at any point during infancy, childhood, or adolescence. Most are benign, but even benign lesions may have significant morbidity without proper intervention. Such an entity is undoubtedly pyogenic granuloma, also known as lobular capillary hemangioma. We present a 2.5-year-old boy whose diagnosis with histopathological verification was only made at the age of 28 months after repeated episodes of profuse bleeding from a fragile pyogenic granuloma.
- MeSH
- čelo chirurgie patologie MeSH
- krvácení MeSH
- lidé MeSH
- opožděná diagnóza MeSH
- předškolní dítě MeSH
- pyogenní granulom * chirurgie diagnóza MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- předškolní dítě MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
- MeSH
- dítě MeSH
- lidé MeSH
- optické prostředky MeSH
- pomůcky pro sebeobsluhu klasifikace MeSH
- poruchy zraku * diagnóza terapie MeSH
- stupeň závažnosti nemoci MeSH
- zraková ostrost MeSH
- zraková percepce MeSH
- zrakově postižení * MeSH
- zrakové testy klasifikace MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- lidé MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
Výskyt ANCA protilátek bývá u pacientů se systémovým lupus erytematodes (SLE) popisován asi ve 24–31 % případů, nemají však vztah k distribuci a tíži orgánového postižení u SLE a jejich rutinní monitoring se nedoporučuje. Overlap syndrom systémového lupus erytematodes s ANCA asociovanou vaskulitidou (AAV) bývá popisován zcela vzácně, následující kazuistika pacientky SLE s těžkým postižením ledvin v rámci AAV poukazuje na obtížnou diagnostiku a léčbu tohoto syndromu.
Incidence of ANCA antibodies in patients with systemic lupus erythematosus (SLE) is described in 24–31 %, but they are not related to the distribution and severity of organ involvement in SLE; the routine monitoring is not recommended. Overlap syndrome of systemic lupus erythematosus and ANCA associated vasculitis (AAV) is rare. The difficult diagnosis and treatment of this syndrome is described in this case report of the patient with SLE and severe kidney involvement resulting from AAV.s syndrome is described in this case report of the patient with SLE and severe kidney involvement resulting from AAV.
- MeSH
- ANCA-asociované vaskulitidy * diagnóza komplikace terapie MeSH
- dospělí MeSH
- klinické laboratorní techniky MeSH
- lidé MeSH
- nediferencované onemocnění pojivové tkáně diagnóza komplikace terapie MeSH
- renální insuficience etiologie terapie MeSH
- systémový lupus erythematodes * diagnóza MeSH
- výsledek terapie MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
Invertovaný papilom středouší je vzácným nálezem. Jedná se o benigní, avšak lokálně agresivně rostoucí tumor s tendencí k malignímu zvratu. Diagnóza je obvykle stanovena až pooperačně podle definitivního histologického vyšetření, protože před- ani peroperační nález není patognomický a imponuje jako zánětlivé změny při chronickém středoušním zánětu. Léčbou volby je chirurgická terapie, radioterapie jako léčebná modalita je vyhrazena pro inoperabilní tumory, popřípadě recidivy. V naší kazuistice uvádíme případ 62letého muže, který podstoupil sanační operaci před mnoha lety ve spádové nemocnici z indikace chronického středoušního zánětu. Na naší klinice byl vyšetřován pro pulzatilní tinitus a zhoršení sluchu. Během provedené tympanoplastiky z kombinovaného přístupu nebyl očekávaný tumor (pouze tuhé jizvy) nalezen, a proto byla provedena sanace středoušní dutiny. Až definitivní histologické vyšetření ukázalo invertovaný papilom. Po operaci indikované CT s kontrastní látkou prokázalo perzistenci tumoru. Byla indikována radikální mastoidektomie, která proběhla bez komplikací. Pacient je nyní 32 měsíců v kompletní remisi, bez chronických zánětlivých změn.
Inverted papilloma is a very rare finding in the middle ear. It is a benign, though locally aggressive tumour with a tendency towards malignant transformation. The diagnosis is usually established postoperatively, based on the histological examination, because the local finding is not specific and resembles chronically inflamed tissue in chronic otitis media. Surgery is the treatment of choice. Radiotherapy is reserved for inoperable tumours or a recurrent disease. In this case report, we present a case of a 62-year-old man, who underwent canal wall down tympanoplasty for chronic otitis media in a district hospital many years ago. A few years ago he was examined for pulsatile tinnitus and hearing impairment at our clinic. A combined-approach tympanoplasty did not reveal the expected tumour (only stiff scars) and a clearance of the middle ear cavity was performed. Histological examination revealed an inverted papilloma. A CT scan performed postoperatively proved a tumour persistence. Therefore, a radical mastoidectomy was indicated. The patient is disease-free with no signs of recurrence during 32-month follow-up.
- MeSH
- histologické techniky MeSH
- invertovaný papilom chirurgie diagnóza MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mastoidektomie MeSH
- nádory ucha chirurgie diagnóza MeSH
- nedoslýchavost etiologie MeSH
- střední ucho chirurgie patologie MeSH
- výsledek terapie MeSH
- Check Tag
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
Mezi nejčastěji diagnostikované lokálně pokročilé nádory prsu s exulcerací patří maligní nádory prsní žlázy - nejčastěji invazivní duktální karcinom (dle novější histologické klasifikace invazivní karcinom NST - "no special type"), ev. invazivní lobulární karcinom prsu. V tomto sdělení je popsán histologicky vzácný případ lokálně pokročilého maligního adenomyoepiteliomu prsu. Pacientka s lokálně pokročilým exulcerovaným nádorem prsu, který ze dvou předoperačních biopsií vychází jako benigní adenomyoepiteliom, podstoupila na našem pracovišti radikální mastektomii. Z definitivní histologie vyplývá, že šlo o benigní adenomyoepiteliom s předpokládanou malignizací epitelové složky. U lokálně pokročilých nádorů benigního histologického typu je nutné předem myslet na přechodové formy těchto nádorů nebo na možnou malignizaci jedné ze složek histologicky různorodých nádorů. Vzhledem k nejisté povaze adenomyoepiteliomů by vždy měla následovat chirurgická resekce s negativními resekčními okraji.
Malignant tumors of the mammary gland - most commonly invasive ductal carcinoma (according to the new histological classification invasive carcinoma NST - no special type) and invasive lobular cancer are most frequently seen in the locally advanced breast tumors with ulceration of the skin. This report describes a histologically rare case of locally advanced malignant breast adenomyoepithelioma. A patient with locally advanced exulcerated breast tumor, with benign preoperative histopathological finding of benign adenomyoepithelioma, underwent a radical mastectomy at our department. The definitive histology suggests that it was a benign adenomyoepithelioma with supposed malignant epithelial component. In locally advanced tumors of benign histological type, it is necessary to think about the transient forms of these tumors or the possible malignancy of one of the components of histologically diverse tumors. According to uncertain nature of adenomyoepitheliomas, surgical resection with negative resection margins should always follow.
- MeSH
- adenomyoepiteliom chirurgie patologie sekundární MeSH
- imunohistochemie metody MeSH
- lidé MeSH
- mastektomie MeSH
- nádory prsu * chirurgie diagnostické zobrazování patologie MeSH
- senioři MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
Mezenteriální lipomy jsou vzácné benigní nádory zralých tukových buněk. I když bývají klinicky asymptomatické, mohou v závislosti na lokalizaci a velikosti způsobit bolesti břicha, ileus nebo volvulus tenkého střeva. Uvádíme kazuistiku 8letého chlapce s mezenteriálním lipomem, který se klinicky projevil opakovanou bolestí břicha a zvracením. Předoperační diagnóza lipomu byla vyslovena po ultrazvukovém a MR vyšetření břicha. Diagnóza lipomu vycházejícího z mezenteria tenkého střeva byla po operaci ověřena histo‑patologickým vyšetřením. Nádor byl kompletně odstraněn bez porušení střevní stěny.
Mesenteric lipomas are a rare benign tumors of mature fat cells. Although generally asymptomatic, it occasionally causes abdominal pain, ileus, and small bowel volvulus, depending on its location and size. We present a case report of an 8-year-old boy with a mesenteric lipoma who has clinically presented repeated abdominal pain with vomiting. The pre-operative diagnosis of lipoma was suggested by abdominal ultrasonography and MRI. The diagnosis of lipoma arising in the leaves of the small bowel mesentery, was verified microscopically after the operation. The tumour was enucleated from the mesenterium leaving the intestine intact.
- MeSH
- bolesti břicha diagnostické zobrazování diagnóza etiologie MeSH
- dítě MeSH
- lidé MeSH
- lipom * diagnóza chirurgie patologie MeSH
- magnetická rezonanční tomografie metody MeSH
- peritoneální nádory MeSH
- ultrasonografie metody MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
Kolokolická invaginace (CCI) je neobvyklá příčina střevní obstrukce u dětí. Nejobvyklejším typem je idiopatická ileokolická invaginace. Nicméně invaginace s patologickým vedoucím bodem se vyskytují přibližně v 5 % případů. U pediatrických pacientů je Meckelův divertikl nejběžnějším vedoucím bodem, následovaný polypy a střevními duplikacemi. Hydrostatická desinvaginace a endoskopická polypektomie jsou minimálně invazivní a technicky proveditelné pro léčbu menších CCI. Představujeme případ kolokolické intususcepce, která způsobila obstrukci střev u pětiletého chlapce. Abdominální ultrasonografie potvrdila akutní kolokolickou invaginaci s velkým polypem tlustého střeva o průměru 4 cm, který byl úspěšně odstraněn laparotomickou segmentální kolektomií.
Colocolonic intussusception (CCI) is an uncommon cause of intestinal obstruction in children. The most common type is idiopathicileocolic intussusception. However, pathologic lead points occur approximately in 5% of cases. In pediatric patients, Meckel's diverticulumis the most common lead point, followed by polyps and duplication. Hydrostatic reduction and endoscopic polypectomyare minimally invasive and technically feasible for treating smaller CCI.We present a case of colocolonic intussusception which caused colonic obstruction in a 5-year-old boy. Abdominal ultrasonographyshowed an acute colocolic intussusception with a large colonic polyp, 4 centimeters in diameter, which was successfullyremoved by laparotomic segmental colectomy.
- Klíčová slova
- juvenilní polyp, kolokolická invaginace, segmentální resekce,
- MeSH
- fyzikální vyšetření MeSH
- intususcepce * diagnostické zobrazování etiologie chirurgie MeSH
- kolektomie MeSH
- laparotomie MeSH
- lidé MeSH
- nemoci tlustého střeva * diagnostické zobrazování diagnóza chirurgie MeSH
- polypy tlustého střeva * diagnostické zobrazování chirurgie patologie MeSH
- předškolní dítě MeSH
- střevní obstrukce etiologie MeSH
- ultrasonografie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- předškolní dítě MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- Publikační typ
- abstrakt z konference MeSH
Předkládaná kazuistika prezentuje případ pacientky s perzistujícími vředy žaludečního antra, u které byla zjištěna zvýšená hladina gastrinu. Jako první byla vylučována raritnější příčina hypergastrinemie – gastrinom, ale ten se přes rozsáhlý vyšetřovací proces nepodařilo nelézt. Při opakovaných biopsiích vředu byl zachycen přechod high grade dysplazie do adenokarcinomu a pacientce byla provedena antrektomie, po které následovala normalizace hladiny gastrinu. Při dodatečném pátrání po příčinných souvislostech byla jako původce hypergastrinemie diagnostikována perniciózní anémie.
We present a case-report of a woman with persisting gastric ulcers, who had elevated gastrin blood levels. First of all, a rare cause of hypergastrinaemia was excluded – a gastrinoma. It was not found despite of extensive investigation. Ulcers were repetitively biopted and transition of high grade dysplasia to adenocarcinoma was detected. Gastrin levels normalised after surgical antrectomia. Afterwards pernicious anaemia was diagnosed as the underlining cause of hypergastrinaemia.
- Klíčová slova
- gastrin,
- MeSH
- adenokarcinom diagnóza MeSH
- diferenciální diagnóza MeSH
- gastrinom diagnóza MeSH
- gastriny krev MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- nádory slinivky břišní diagnóza MeSH
- nádory žaludku diagnóza MeSH
- perniciózní anemie diagnóza krev MeSH
- Check Tag
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH