Závěrečná zpráva o řešení grantu Agentury pro zdravotnický výzkum MZ ČR
nestr.
Vysoké riziko pokračujícího šíření spalniček v zemích EU/EEA včetně ČR stále přetrvává jako důsledek zejména nezanedbatelného počtu nenaočkovaných osob a nedostatečného vakcinačního pokrytí dvěma dávkami vakcíny proti spalničkám. Významnou roli v šíření infekce má i vyvanutí imunity. Laboratorní diagnostika spalniček založená na sérologickém vyšetření akutního vzorku krve (nejčastěji vyšetřovaném klinickém materiálu) neposkytuje vždy, a to zejména u reinfikovaných vakcinovaných, jednoznačně interpretovatelné výsledky V současné době je největším problémem neznalost chování viru u očkované populace a rovněž neznalost protektivního titru protilátek u standardizovaných sérologických metod. Zhodnocení klinických příznaků, imunologického profilu a epidemiologických souvislostí u pacientů neočkovaných či neúplně očkovaných v porovnání s plně naočkovanými jedinci rozšíří naše znalosti o infekci způsobené virem spalniček a umožní zlepšit systém surveillance spalniček stejně jako podpořit argumentaci pro zvýšení proočkovanosti.; The high risk of further spread of measles in the EU/EEA countries including the Czech Republic continues due to a relatively high number of unvaccinated persons and insufficient two-dose measles vaccine coverage. Waning immunity also plays an important role in the spread of infection. The laboratory diagnosis of measles based on the serological testing of an acute blood sample (as the most commonly tested clinical specimen) may not always provide unambiguously interpretable results, as is the case with the re-infected vaccinated individuals. At present, the greatest problem is the lack of knowledge of the virus behaviour in the vaccinated population and what the protective levels of antibodies are in the standardised serological tests. The comparison of clinical symptoms, immunological profiles, and epidemiological links between unvaccinated, incompletely vaccinated, and fully vaccinated patients will contribute to a better knowledge of the measles and will make it possible to improve the measles surveillance system and to put forward further arguments for a higher vaccine uptake.
- MeSH
- cesta šíření infekce MeSH
- genotyp MeSH
- neočkované osoby MeSH
- sérologické testy MeSH
- spalničky epidemiologie MeSH
- surveillance populace MeSH
- vakcinace MeSH
- virus spalniček MeSH
- Konspekt
- Patologie. Klinická medicína
- NLK Obory
- epidemiologie
- infekční lékařství
- preventivní medicína
- NLK Publikační typ
- závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR
Cíl práce: Mezi roky 2017 a 2019 došlo ke globálnímu rozšíření viru a vzniku rozsáhlé epidemie spalniček, která náhle skončila na počátku roku 2020. Také v České republice (ČR) probíhaly epidemie spalniček jako součást celosvětového postižení. V současné komplikované epidemiologické situaci nabývá na významu molekulární surveillance, která je nezbytná pro potvrzení importu onemocnění a pro sledování cest přenosu viru. Umožňuje získat důkazy o přerušení endemického šíření a je nepostradatelná pro verifikaci eliminace spalniček. Cílem práce je zjistit, zda některý z genotypů viru spalniček cirkuloval v ČR déle než 12 měsíců, a tím se potvrdilo nebo vyvrátilo endemické šíření viru na našem území ve vztahu k nedávnému odebrání statusu země s eliminovanými spalničkami. Dalším cílem je zhodnocení současné laboratorní diagnostiky v souvislosti s epidemiemi spalniček posledních let a povinností zasílat vzorky ke konfirmaci a genotypizaci. Materiál a metodika: Celkem bylo molekulárně analyzováno 243 pozitivních nazofaryngeálních výtěrů od pacientů z ohnisek nákazy z celé ČR odebraných v letech 2018 a 2019. Molekulární analýza byla provedena sekvenováním nejvariabilnější části genomu viru spalniček – genu nukleoproteinu (N-450), podle metodiky Světové zdravotnické organizace (WHO). Sekvenční analýza byla provedena Sangerovou metodou s využitím sekvenátoru Applied Biosystems 3500, data byla analyzována pomocí bioinformatického softwaru Geneious. Výsledky: V ČR se během epidemie v letech 2018–2019 uplatnily pouze dva genotypy, majoritní D8 v osmi variantách a minoritní B3 v šesti variantách, u 8 vzorků byl detekován genotyp A. Dominující genotyp roku 2017 (D8, 4283) se v ČR poprvé objevil v lednu 2018 a po čtyřech měsících byl nahrazen genotypem D8, 4683, který se v ČR uplatňoval od března 2018 až do června 2019. Vzorků s tímto genotypem bylo 170/243, tj. 70 %. Mezi první a další detekcí tohoto genotypu byly tři měsíce s nulovým záchytem, to ovšem neznamená, že by během těchto měsíců v populaci necirkuloval. Analýza sedmi vzorků z roku 2017 spolupracující Regionální referenční laboratoří v Institutu Roberta Kocha v Berlíně (RRL RKI) prokázala u pěti vzorků z Ostravy příslušnost ke genotypu B3 a dvě různé varianty genotypu D8 (Praha, Liberec). V laboratorní diagnostice byl zaznamenán posun v typu zasílaných klinických materiálů, neboť mezi lety 2017 a 2019 vzrostl podíl vzorků k přímému průkazu viru z 18 % na 43 %. Zasílání vzorků k sekvenaci do Národní referenční laboratoře v Praze (NRL) probíhalo podle nastavených legislativních pravidel. Laboratoře za rok 2018 a 2019 zaslaly celkem 424 vzorků. Sekvenace byla úspěšná u 243 z nich, tj. u téměř 60 %. U ostatních vzorků se sekvenace nepodařila pro nízkou virovou nálož. Závěry: V ČR byla zavedena sekvenace viru spalniček jako nezbytná součást molekulární surveillance, podařilo se analyzovat téměř 60 % pozitivních vzorků. Na základě provedené sekvenční analýzy bylo prokázáno endemické šíření viru spalniček, neboť mezi roky 2018 a 2019 cirkuloval nepřetržitě virus genotypu D8, 4683 MVs/Gir Somnath.IND/42.16 na území České republiky po dobu 16 měsíců. Laboratorní diagnostika se více zaměřuje na přímý průkaz viru, což společně s rozšířením genotypizace o další úsek genomu umožní zkvalitnění molekulární surveillance.
Objective: Between 2017 and 2019, measles virus spread globally, causing a large measles epidemic that suddenly ended in 2020. Measles outbreaks also occurred in the Czech Republic (CR) as part of the global public health problem. In the recent alarming epidemiological situation, molecular surveillance is becoming increasingly important as it plays a vital role in the identification of imported cases and in the monitoring of virus transmission. Molecular surveillance makes it possible to obtain evidence of the discontinuation of the endemic spread and is indispensable for the verification of measles elimination. The study aim is to find out whether any of measles virus genotypes circulated in the CR for more than 12 months in order to either confirm or refute the endemic spread of measles virus in the country in relation to the recent loss of the measles elimination status. Another aim is to assess the current laboratory diagnosis from the perspective of recent measles outbreaks and the obligation to refer samples for confirmation and genotyping. Material and methods: In total, 243 positive nasopharyngeal swabs collected from outbreak patients from all over the CR in 2018 and 2019 were analysed by molecular methods. The most variable part of the measles virus genome, the nucleoprotein gene (N-450), was sequenced according to the WHO protocol. The sequence analysis was performed by Sanger method using the Applied Biosystems 3 500 sequencer, and sequence data were analysed by the bioinformatics programe Geneious. Results: In the CR, only two genotypes were found in measles outbreaks in 2018–2019, eight variants of the dominant D8 and six B3 variants, while genotype A was detected in eight samples. The dominant genotype of 2017 (D8, 4283) was identified for the first time in the CR in January 2018. Four months later, it was replaced by genotype D8, 4683, occurring in the CR from March 2018 to June 2019. This genotype was identified in 170 of 243 samples (70%). There was a 3-month window between the first and the second detection of this genotype, which does not imply that in the meantime the virus did not circulate in the population. The analysis of seven samples from 2017 conducted by the collaborating Regional Reference Laboratory at the Robert Koch Institute (RRL RKI) in Berlin assigned five samples from Ostrava to genotype B3 and detected two variants of genotype D8 (Praha, Liberec). Laboratory diagnosis was facilitated by a higher proportion of clinical specimens available for direct detection of the virus, which increased from 18% in 2017 to 43% in 2019. Samples were referred to the National Reference Laboratory (NRL) in Prague for sequencing in accordance with the set legal rules. Between 2018 – 2019, laboratories sent 424 samples. Two hundred and forty-three samples (60%) were successfully sequenced, while the sequencing of the remaining samples failed due to low viral load. Conclusions: Measles virus sequencing was introduced in the Czech Republic as a necessary part of molecular surveillance, and almost 60% of positive samples were analysed. The sequencing analysis confirmed the endemic spread of measles virus, with genotype D8, 4683 MVs/GirSomnath.IND/42.16 found to circulate in the CR for 16 months between 2018 and 2019. Laboratory diagnosis is recently focusing more on direct detection of the virus, which along with genotyping extended to include another part of the genome will improve molecular surveillance.
- MeSH
- diagnostické techniky molekulární metody MeSH
- genotyp MeSH
- lidé MeSH
- spalničky * epidemiologie MeSH
- virus spalniček izolace a purifikace MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
Spalničky patří k nejnakažlivějším infekčním nemocem. Mohou mít u dětí i dospělých velmi závažný průběh. Za posledních 5 let se v České republice (ČR) vyskytly již tři velké epidemie i přesto, že se v naší zemi proti tomuto onemocnění povinně očkuje již od roku 1969. Vzhledem k narůstajícímu cestovnímu ruchu lze očekávat, že se s importovanými spalničkami budeme setkávat i v budoucnu. Přibývá však i počet neočkovaných dětí, čímž se reálně zvyšuje riziko autochtonního šíření spalniček v populaci. V tomto článku se autoři zaměřili na klinickou problematiku spalniček, epidemiologické údaje, historii vakcinace a doporučené postupy, doplněné zajímavými kazuistikami z Kliniky infekčních nemocí a cestovní medicíny Fakultní nemocnice v Plzni. Zároveň chtějí autoři tímto článkem poukázat na skutečnost, že spalničková hrozba se nevyhýbá ani zdravotníkům, kteří proti této nákaze nemusí být vždy dostatečně chráněni.
Measles is a highly contagious viral infection that can lead to many severe complications in children and adults. This year, in 2018, the Czech Republic is confronted with the third largest measles outbreak in the last five years, despite the availability of a safe and effective vaccine from 1969. The disease is typically imported and due to increasing tourism, we can expect an increase in outbreaks. There are also more and more unvaccinated children, causing rapid spreading of the virus within the population. In this article, the authors focus on the clinical problematic of measles, its epidemiology, vaccine history and recommended steps, in addition to interesting case reports from The Clinic of Infectious Diseases and Travel Medicine at the Pilsen Teaching Hospital. The article also points out the fact that measles are a threat even to healthcare workers, who may not always be sufficiently protected.
- MeSH
- kojenec MeSH
- lidé MeSH
- mladý dospělý MeSH
- Morbillivirus patogenita MeSH
- odmítnutí očkování MeSH
- pokrytí očkováním MeSH
- předškolní dítě MeSH
- sérologické testy MeSH
- spalničková vakcína MeSH
- spalničky * etiologie komplikace prevence a kontrola MeSH
- vakcína proti spalničkám, příušnicím a zarděnkám MeSH
- vakcinace MeSH
- Check Tag
- kojenec MeSH
- lidé MeSH
- mladý dospělý MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- předškolní dítě MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
- přehledy MeSH
Morbilliviruses, such as Cetacean morbillivirus (CeMV) or Phocine distemper virus (PDV), represent a growing threat for marine mammals on both hemispheres. Because free-ranging animal populations strongly rely on natural resistance mechanisms, innate immunity-related genes and virus cell entry receptor genes may represent key factors involved in susceptibility to CeMV in Cetaceans. Using the next generation sequencing technology, we have sequenced 11 candidate genes in two model species, Stenella coeruleoalba and Phocoena phocoena. Suitable single nucleotide polymorphism markers of potential functional importance, located in genes coding for basigin (BSG, CD147), the signaling lymphocyte activating molecule (SLAMF1), the poliovirus-related receptor-4 (NECTIN4, PVRL4), toll-like receptors 3, 7, 8 (TLR3, TLR7, TLR8), natural resistance-associated macrophage protein (SLC11A1) and natural cytotoxicity triggering receptor 1 (NCR1), were identified in each model species, along with MHC-DQB haplotypes unique for each species. This set of molecular markers represents a potentially useful tool for studying host genetic variation and susceptibility to morbillivirus infection in Cetaceans as well as for studying functionally important genetic diversity of selected Cetacean populations.
- MeSH
- basigin genetika imunologie MeSH
- biologické markery metabolismus MeSH
- delfíni rodu Stenella genetika imunologie virologie MeSH
- exprese genu MeSH
- genetická predispozice k nemoci * MeSH
- infekce viry z rodu Morbillivirus genetika imunologie virologie MeSH
- jednonukleotidový polymorfismus * MeSH
- MHC antigeny II. třídy genetika imunologie MeSH
- molekuly buněčné adheze genetika imunologie MeSH
- Morbillivirus imunologie patogenita MeSH
- Phocoena genetika imunologie virologie MeSH
- proteiny přenášející kationty genetika imunologie MeSH
- receptor 1 spouštějící přirozenou cytotoxicitu genetika imunologie MeSH
- SLAMF1 protein genetika imunologie MeSH
- toll-like receptor 3 genetika imunologie MeSH
- toll-like receptor 7 genetika imunologie MeSH
- toll-like receptor 8 genetika imunologie MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- MeSH
- dítě MeSH
- hlášení nemocí statistika a číselné údaje MeSH
- lidé MeSH
- Morbillivirus genetika izolace a purifikace patogenita MeSH
- polymerázová řetězová reakce metody MeSH
- sérologické testy metody MeSH
- spalničky * diagnóza epidemiologie prevence a kontrola přenos MeSH
- vakcína proti spalničkám, příušnicím a zarděnkám aplikace a dávkování MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- lidé MeSH
- Klíčová slova
- imunopatogeneze,
- MeSH
- Cytomegalovirus imunologie patogenita MeSH
- Herpesviridae imunologie klasifikace patogenita MeSH
- imunitní únik fyziologie imunologie MeSH
- lidé MeSH
- lidský herpesvirus 1 imunologie patogenita MeSH
- přirozená imunita MeSH
- replikace viru fyziologie imunologie MeSH
- virové nemoci imunologie patofyziologie MeSH
- virus Epsteinův-Barrové imunologie patogenita MeSH
- virus spalniček imunologie patogenita MeSH
- viry hepatitidy imunologie patogenita MeSH
- viry * imunologie klasifikace patogenita MeSH
- zánět * etiologie imunologie patofyziologie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
Zavedením plošného očkování došlo k významnému poklesu incidence různých infekčních onemocnění virového nebo bakteriálního původu, která se v minulosti podílela na zvýšené morbiditě i mortalitě obyvatelstva. U spalniček, zarděnek, ale také příušnic se vzhledem k výlučně mezilidskému přenosu a antigenní stálosti předpokládá, že by v budoucnosti mohly být eradikovány podobně jako pravé neštovice. K tomu je však zapotřebí zařazení vakcín do národních imunizačních programů zemí, které proti těmto nákazám prozatím neočkují, a podpořit zvýšení imunizace ve státech s nízkou proočkovaností. Živé očkovací látky proti spalničkám, zarděnkám a příušnicím jsou k dispozici již více než 40 let a v současnosti poskytují vysokou protektivitu s minimem nežádoucích účinků.
The introduction of universal vaccination has led to significant decrease of infectious diseases incidence either bacterial or viral origin which had been participating in increased morbidity and mortality of population. Measles, rubella and also mumps viruses are supposed to be future candidates for eradication similarly as smallpox due to their human-to-human transmission and antigenic stability. However, it is necessary to introduce vaccination in national immunization programs of countries where vaccination against measles, mumps and rubella is not established and improve immunization rate in countries with low vaccination coverage. Live attenuated vaccines against measles, mumps and rubella diseases are available for more than 40 years and currently provide high protectivity with minimum side effects.
- MeSH
- atenuované vakcíny MeSH
- celosvětové zdraví MeSH
- Evropská unie MeSH
- lidé MeSH
- morbidita MeSH
- Morbillivirus MeSH
- očkovací schéma MeSH
- příušnice * epidemiologie mortalita patofyziologie prevence a kontrola MeSH
- Rubulavirus MeSH
- spalničková vakcína dějiny terapeutické užití MeSH
- spalničky * epidemiologie mortalita patofyziologie prevence a kontrola MeSH
- vakcína proti příušnicím dějiny terapeutické užití MeSH
- vakcína proti spalničkám, příušnicím a zarděnkám * aplikace a dávkování MeSH
- vakcína proti zarděnkám dějiny terapeutické užití MeSH
- vakcinace dějiny metody MeSH
- virus zarděnek MeSH
- vymýcení nemoci MeSH
- zarděnky vrozené epidemiologie prevence a kontrola MeSH
- zarděnky * epidemiologie patofyziologie prevence a kontrola MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
Vyšetření mozkomíšního moku je základní vyšetřovací metodou v neurologii používanou k diferenciální diagnostice řady zánětlivých, autoimunitních či neurodegenerativních onemocnění CNS. V důsledku nutnosti minimalizace diagnostických chyb byl vytvořen panel laboratorních likvorových vyšetření nezbytných k diagnostice a diferenciální diagnostice roztroušené sklerózy. Patří k nim kvantitativní a kvalitativní cytologie, základní biochemické vyšetření, posouzení stavu hematolikvorové bariéry, vyšetření intratekální syntézy IgG a stanovení počtu oligoklonálních IgG pásů.
An examination of the cerebrospinal fluid (CSF) is the essential examination method used in neurology, used for differential diagnostics of a number of inflammatory, auto-immune or neurodegenerative diseases of the CNS. Due to the necessity of minimising diagnostic errors, a panel of laboratory examinations of the CSF was developed, essential for diagnosis and differential diagnostics of multiple sclerosis. Among those are quantitative and qualitative cytology, basic biochemical examinations, examination of the condition of the blood-CSF barrier, examination of intrathecal IgG synthesis and determination of the number of oligoclonal IgG bands.
- MeSH
- biologické markery MeSH
- hematoencefalická bariéra chemie MeSH
- imunoenzymatické techniky metody MeSH
- imunoglobulin G biosyntéza MeSH
- lidé MeSH
- mozkomíšní mok cytologie chemie imunologie MeSH
- oligoklonální proužky biosyntéza diagnostické užití MeSH
- protilátky virové biosyntéza diagnostické užití MeSH
- roztroušená skleróza * MeSH
- virus spalniček imunologie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Klíčová slova
- RotaTeq, Rotarix,
- MeSH
- dítě MeSH
- epidemie MeSH
- klinické zkoušky jako téma MeSH
- kojenec MeSH
- lidé MeSH
- novorozenec MeSH
- předškolní dítě MeSH
- rotavirové infekce epidemiologie mortalita prevence a kontrola přenos MeSH
- spalničková vakcína škodlivé účinky terapeutické užití MeSH
- spalničky * epidemiologie prevence a kontrola přenos MeSH
- vakcína proti rotavirům * škodlivé účinky terapeutické užití MeSH
- vakcína proti spalničkám, příušnicím a zarděnkám aplikace a dávkování škodlivé účinky terapeutické užití MeSH
- virus spalniček patogenita MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- kojenec MeSH
- lidé MeSH
- novorozenec MeSH
- předškolní dítě MeSH
- Geografické názvy
- Afrika MeSH
- Česká republika MeSH
- Texas MeSH
