- MeSH
- Cystic Fibrosis genetics MeSH
- Haplotypes MeSH
- Humans MeSH
- Meconium MeSH
- Intestinal Obstruction MeSH
- Check Tag
- Humans MeSH
Východisko. Celiakální sprue (CD) jemultifaktoriální onemocnění dané celoživotní abnormální imunitní odpovědí s autoimunitními rysy na lepek způsobující u geneticky vnímavých jedinců morfologické změny střevní sliznice. Definice geneticky vnímavého jedince k CD stále není přesně stanovena, je ale zřejmé, že onemocnění má velmi úzký vztah k HLA genům II. třídy. Cílem naší studie je zmapování asociace alel a haplotypů HLA II. třídy DRB1/DQA1/DQB1 u českých dětí s CD. Metody a výsledky. U 77 českých dětí s CD, diagnostikované dle kritérií ESPGHAN, byly metodikou PCR-SSP genotypizovány alely HLA lokusů DRB1/DQA1/DQB1. Genotypizace HLA haplotypů II. třídy HLA- -DRB1/DQA1/DQB1 prokázala statisticky vysoce významnou asociaci CD s alelami a haplotypy tohoto genetického systému. 92,2 % nemocných má ve svém fenotypu alelu DQA1*0501 v cis nebo trans pozici s DQB1 alelou *0201/*0202. Rozšířený HLA haplotyp DRB1*0301/DQA1*0501/DQB1*0201, stejně jako haplotyp DRB1*0701/DQA1*0201/DQB1*0202 jsou přítomné u 63,6 %, respektive u 61,0 % nemocných. Jednotlivé HLA alely II. třídy DRB1*0301, *0701, DQA1*0501, *0201 a DQB1*0201, *0202 včetně výše vyjmenovaných haplotypů mají statisticky významně odlišné genotypové frekvence HLA než zdravá česká populace (P<0,06±0,001). Tyto výsledky podporují názor, že HLA molekula, exprimovaná na buněčném povrchu jako αβ heterodimer kódovaný alelami DQA1*0501 a DQB1*0201/*0202 v konfiguraci cis nebo trans je zodpovědná za vnímavost k této nemoci. Ve sledované skupině jsme nebyli schopni nalézt asociaci různých klinických forem CD s určitým HLA haplotypem. Závěr. Pacienti s CD mají ve srovnání se zdravou populací významně odlišnou frekvenci HLA haplotypů II. třídy. Jakkoliv nález těchto alel nestačí k jednoznačnému potvrzení diagnózy, průkaz rizikového HLA haplotypu může k diagnóze významně přispět, zvláště u potenciálních nebo latentních forem této choroby.
Background. The celiac disease (CD) is amultifactor disease resulting from a life time abnormal immune response to gluten accompanied by autoimmune characteristics, which can in sensitive individuals evoke small bowel mucosa morphologic changes. The genetically sensitive individual to CD has not been defined yet, it is obvious, however, that this illness is closely linked to the HLA class II genes. The objective of our study was to detect associations of HLA class II alleles and haplotypes DRB1/DQA1/DQB1 in Czech CD children. Methods and Results. A group of Czech CD children diagnosed according to ESPGHAN criteria was genotyped HLA for alleles of DRB1/DQA1/DQB1 loci. Genotyping of the HLA-DRB1/DQA1/DQB1 haplotypes proved statistically significant association CD with haplotypes and alleles of this genetic system. 92.9 % of patients have in their HLA phenotype allele DQA1*0501 in either cis or trans configuration with the DQB1 allele *0201/*0202. The extended HLA haplotype DRB*0301/DQA1*0501/DRB1*0201 as well as the haplotype DRB1*0701/ DQA1*0201/DQB1*0202, are presented in 63.6 % or in 61.0 % CD patients respectively. The individual HLA class II alleles DRB*0301, *0701, DQA1*0201, *0501, DQB1*0201, *0202 and the above mentioned HLA haplotypes inclusively provide genotypic frequencies significantly different from healthy Czech individuals (P<0.06±0.001). These results support the opinion that the HLA molecule expressed on the cellular surface as a αβ heterodimer encoded by the DQA1*0501 and DQB1*0201/02 alleles in either cis or trans configuration is responsible for the primary sensitivity to this disease. We were, however, not able to find an association of various clinical forms of the CD with a certain HLA haplotype in the followed group. Conclusion. The CD patients have in comparison with healthy population significantly different frequency of HLA class II haplotypes. Though the finding of these alleles is not sufficient for an explicit confirmation of this diagnosis, the proof of this risky haplotype/s may notably contribute to it, namely in case of potential or latent forms of this disease.
- MeSH
- Alleles MeSH
- Celiac Disease diagnosis etiology genetics MeSH
- Child MeSH
- Research Support as Topic MeSH
- Genotype MeSH
- Haplotypes MeSH
- HLA-DQ Antigens MeSH
- HLA-DR Antigens MeSH
- Humans MeSH
- Adolescent MeSH
- Check Tag
- Child MeSH
- Humans MeSH
- Adolescent MeSH
- Publication type
- Review MeSH
- Comparative Study MeSH
- MeSH
- beta-Thalassemia epidemiology genetics MeSH
- Globins MeSH
- Haplotypes MeSH
- Hemoglobinopathies genetics MeSH
- Geographicals
- Czech Republic MeSH
- Slovakia MeSH
STAT6 je protein, který má důležitou roli v tvorbě IgE, je zapojený do signální dráhy ovlivňované IL-4 a IL-13. Gen pro STAT6 patří mezi nejčastěji studované kandidátské geny ovlivňující asociaci astmatu a zvýšené hladiny IgE. Současně zvýšené hladiny IgE u dětí byly pozorovány častěji pri výskytu atopic u matky než u otce. V naší studii jsme studovali možnou asociaci mezi haplotypy polymorfismů STAT6 (sestavené % polymorfismů řs324012, rs324011, rs84]718, rs3024974, rs 1059513 a rs4559), astmatem a hladinou IgE. Následně jsme posuzovali rozdíl distribuce haplotypů u pacientů vzhledem k rodičovskému původu. Do studie jsme zařadili 109 dětí s asthma bronchiale a 45 zdravých dětí jako kontrolu. V zastoupení haplotypů mezi pacienty a kontrolami nebyl významný rozdíl, avšak nejčastěji se vyskytující haplotyp si (ATTCAA) byl významně vázaný na zvýšené hladiny celkového IgE u pacientů. Zároveň jsme překvapivě zjisfili, že si haplotyp byl významně častěji patemálního původu. Samotný si haplotyp tedy musí být ovlivněný ještě jiným faktorem. S velkou pravděpodobností se bude jednat o rozdílnou "^ ^XV^aci regulačních oblastí genu pro STAT6, pričemž tento typ metylace se zřejmě častěji přenáší patemálně.
The STAT6 protein has important role in IgE production and is involved in IL-4/IL-13 signalling pathway. Gene for STAT6 belongs to the most studied asthma or atopy candidate genes. Elevated IgE levels were more frequently observed in children in case of maternal atopy. We investigated possible association of haplotypes of STAT6 (constructed from single nucleotide polymorphisms rs324012, rs324011, rs841718, rs3024974, rs1059513 and rs4559) with asthma and total IgE level. Subsequently we evaluated difference in parental origin of ha plotypes in group of patients with asthma. We enrolled 109 children with asthma and 45 healthy controls. Genotyping was performed by TaqMan probes and confirmed by sequencing. Haplotype construction was based on the knowledge of parental genotypes and also inferred by using the EM algorithm and Bayes’ theorem. There was no significant difference in haplotypes frequencies between patients and control group. However, the most frequent haplotype s1 (ATTCAA) was significantly linked to elevated total IgE level in patients. And moreover, the hap lotype was significantly transmitted from fathers. Therefore, effect of s1 haplotype must be modulated by another factor, most likely by different methylation of STAT6 regulatory regions. This type of methylation probably transmits more frequently from fathers.
- MeSH
- Diabetes Mellitus, Type 1 genetics immunology MeSH
- Genetics MeSH
- HLA Antigens analysis genetics classification MeSH
- Family MeSH
- Publication type
- Comparative Study MeSH
