Mycological diagnosis Dotaz Zobrazit nápovědu
Aspergily jsou ubikvitní houby, které u vnímavých jedinců mohou způsobit závažná onemocnění. Nejčastěji infikovaným orgánem jsou plíce. Závažnost onemocnění je závislá na stupni invaze houby do plicní tkáně, ta stoupá úměrně s rozvojem imunodeficitu pacienta. Invazivitu procesu prokáže jednoznačně pouze histologické vyšetření vzorku infikované plicní tkáně. Klasické mykologické metody detekují mikroskopickými nebo kultivačními technikami přítomnost houby ve vyšetřovaných vzorcích z dýchacích cest. Dále je možné prokázat v séru nebo bronchoalveolární tekutině specifický aspergilový antigen galaktomanan a nespecifický beta-D-glukan. Detekce protilátek proti aspergilům má přínos pouze u chronických forem onemocnění. V článku se autorka zabývá přínosem jednotlivých mykologických vyšetřovacích metod v diagnostice různých forem plicní aspergilózy.
Aspergillus are ubiquitous fungi that can cause serious illnesses in susceptible individuals. The most commonly infected organ is the lungs. The severity of the disease depends on the degree of the invasion of the lung tissue by fungi, which rises proportionally with the development of immunodeficiency. The only way to clearly determine the degree to which the lungs have been invaded is to carry out a histological examination of a sample of the infected tissue. Conventional mycological methods can detect the presence of the fungus in samples from a patient's airways by using microscopy or culture techniques. Furthermore, it is possible to determine the presence of the specific Aspergillus antigen, galactomannan, and of non-specific beta-D-glucan in the serum or bronchoalveolar lavage fluid. The detection of antibodies against Aspergillus is only relevant for chronic forms of the disease. This article discusses the benefits of different mycological examination methods in the diagnosis of various forms of pulmonary aspergillosis.
- Klíčová slova
- galaktomanan, lateral flow device,
- MeSH
- Aspergillus klasifikace patogenita MeSH
- beta-glukany analýza MeSH
- chromatografie afinitní metody MeSH
- kultivační techniky MeSH
- lidé MeSH
- lipopolysacharidy krev MeSH
- mykologické určovací techniky MeSH
- plíce anatomie a histologie MeSH
- plicní aspergilóza * diagnóza patologie MeSH
- senzitivita a specificita MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- souhrny MeSH
213 s. : il.
Předložený příspěvek poukazuje na některá problematická místa v rutinní laboratorní diagnostice mykóz ze sekretů a vzorků z dýchacích cest, čelistních dutin a vzorků kůže a kožních adnex. Text se opírá jak o vlastní dlouholeté zkušenosti autora, tak o zkušenosti získané ve spolupráci s dalšími laboratořemi. Pro zvýšení záchytu vláknitých hub v sekretech z dolních cest dýchacích je doporučeno pro kultivaci použít 0,5 ml materiálu pro jednotlivá kultivační média. Jak u sekretů, tak u dalšího biologického materiálu je zdůrazněna úloha mikroskopického vyšetření. To může u řady případů také představovat jediný spolehlivý laboratorní postup. Pro interpretaci nálezů mikromycet je doporučena úzká spolupráce s klinickými lékaři, zvláště pro získání anamnestických údajů. Ty jsou velmi důležité zvláště při diagnostice endemických mykóz. Sporné nebo neobvyklé nálezy je nutno verifikovat opakovaným laboratorním vyšetřením.
The article deals with certain problematic issues associated with routine laboratory diagnosis of mycoses from secretions and samples taken from the respiratory tract and maxillary sinuses as well as samples of skin and skin appendages. The text is based on both the author's own long-term experience and experience gained from cooperation with other laboratories. To improve the detection of filamentous fungi in lower respiratory tract secretions, it is recommended to use 0.5 mL of the material for individual culture media. In both secretions and other biological material, the role of microscopic examination is stressed. In many cases, this may also be the only reliable laboratory procedure. Detection of filamentous fungi should be interpreted in close cooperation with clinicians, especially in order to obtain history data. These are particularly important in the diagnosis of endemic mycoses. Equivocal or unusual findings should be verified by repeated laboratory tests.
- Klíčová slova
- sekrety dolních cest dýchacích, sinusy, dermatologické vzorky, mikromicety, interpretace nálezů,
- MeSH
- dýchací soustava mikrobiologie MeSH
- kůže mikrobiologie MeSH
- lidé MeSH
- mikroskopie MeSH
- mykologické určovací techniky metody MeSH
- mykózy diagnóza MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
Molekulárně genetickě metody se stávají stále významnější součástí mykologické laboratorní diagnostiky. Jejich prostřednictvím lze detekovat houbovou nukleovou kyselinu v klinických vzorcích, provádět druhovou identifikaci mikromycet nebo zjišťovat odlišnosti kmenů uvnitř druhů, případně genetické zvláštnosti, jako je výskyt genů pro rezistenci k antimykotikům, schopnost produkce určitých faktorů virulence atd. Postupně byla za tímto účelem vyvinuta celá řada různých technik. V poslední době je patrná vzrůstající snaha o všeobecné akceptování některé z nich jako standardní, hlavně v oblasti rychlé diagnostiky invazivní aspergilózy. Pro detekci v klinických vzorcích jde především o různé modifikace polymerázové řetězové reakce (PCR), zejména uhnízděnou PCR a kvantitativní PCR v reálném čase. Z typizačnich metod jsou často používány restrikční endonukleázová analýza obvykle v kombinaci s hybridizací se specifickou DNA son(Ondou a karyotypizace pulsní elektroforézou. Rozvíjí se skupina metod na bázi PCR, k nimž patří náhodná amplifikace polymorfní DNA, délkový polymorfizmus amplifikovaných fragmentů, inter-repeat PCR, délkový polymorfizmus mikrosatelitů, amplifikace sekvenčně specifickými primery a tzv. multilokusová sekvenční typizace. Poslednně zmíněná metoda je spolu s technikou DNA mikročipů považována v současné době z hlediska vývoje široce akceptovaného standarcdního postupu za nejperspektivnější.
Molecular genetic methods are becoming increasingly important as a part of diagnostics in the clinical mycology laboratory. The methods may be used to detect nucleic acids of fungi in clinical samples, to identify fungal cultures to the species level or to evaluate interstrain differences within the species. For these purposes, numerous techniques have been developed over the past years. Recently, the effort to accept some of them as a widely accepted standard has increased, particularly in rapid diagnosis of invasive aspergillosis. Various modifications of the PCR are used to detect DNA in clinical material, particularly nested and real-time PCR. Restriction endonuclease analysis, usually followed by Southern blot hybridization, as well as karyotyping by pulsed-field gel electrophoresis are often used as typing methods. In addition, a group of PCR-based typing techniques is developed extensively. These include random amplified polymorphic DNA, ampUfied fragment length polymorphism, inter-repeat PCR, polymorphic microsatellite markers, amplification with sequence-specific primers, multilocus sequence typing and DNA microarray technique. The latter methods are considered to be most likely accepted as the gold standard in the future.
V článku je shrnuta základní charakteristika mykóz a specifikováni jejich původci se zaměřením na ty, s nimiž se lze v praxi běžně setkat. Ke stanovení nebo potvrzení klinicky suspektní mykotické infekce je nezbytným předpokladem správný odběr vzorků, jehož zásady jsou podrobně rozebrány. Dále je uveden přehled a stručná charakteristika metod, používaných v současné době v laboratořích lékařské mykologie, včetně jejich limitů z hlediska rychlosti a spolehlivosti vyšetření. Rovněž je podán aktuální přehled registrovaných antifungálních přípravků, jejich lékových forem pro celkovou i lokální aplikaci a stručně zhodnocen současný stav laboratorního testování citlivosti k antimykotikům.
In the article, basic characteristics of mycoses and etiological agents' specification are presented, with emphasis on infections frequently occurring in medical practice. Proper sampling is crucial for determination or verification of clinically suspected fungal infections. Guidelines for the collection of clinical specimen for mycological examination are described in detail. Further, an overview and brief characterization of diagnostic methods currently used in mycology laboratories are given and their limits in terms of speed and reliability are specified. Finally, a recent overview of registered antifungal drugs including their forms of administration is also presented and the current status of antifungal susceptibility testing is briefly evaluated.
- Klíčová slova
- diagnostika, odběr vzorků,
- MeSH
- allylamin MeSH
- antifungální látky farmakologie klasifikace terapeutické užití MeSH
- azoly MeSH
- bakteriologické techniky metody MeSH
- diferenciální diagnóza MeSH
- echinokandiny MeSH
- farmakoterapie metody MeSH
- financování organizované MeSH
- katalogy léků jako téma MeSH
- klinické laboratorní techniky metody MeSH
- lidé MeSH
- mikrobiologické techniky metody normy využití MeSH
- mikroskopie metody MeSH
- mykologické určovací techniky metody MeSH
- mykózy diagnóza etiologie farmakoterapie MeSH
- polyeny MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
Autorka uvádí kazuistické sdělení torpidní dermatózy u 4letého chlapce, která byla primárně považována za nummulární ekzém. Po aplikaci lokálních kortikosteroidních extern (hydrocortisoni butyras) došlo k mírnému zlepšení a problednutí ložiska, avšak krátce po vysazení přípravku dochází k opětovnému vzplanutí a rozšíření ložiska. Následná aplikace antimykotik (clotrimazol crm, koupel KMnO4) byla bez výrazného terapeutického efektu. Kultivační mykologické vyšetření prokázalo mykotickou etiopatogenezi (M. canis) klinického obrazu a potvrdilo předpokládanou diagnózu tinea incognita.
The author reports a case of refractory dermatosis in a 4-year-old boy which was primarily considered to be nummular eczema. Following an application of a local corticosteroid external medication (hydrocortisone butyrate), there occurred a minor improvement and discolouration in the site; however, shortly after the drug had been discontinued, exacerbation and expansion occurred. Subsequent administration of antifungal drugs (clotrimazole crm, KMnO4 bath) failed to exert any significant therapeutic effect. Mycological examination by culture revealed fungal aetiopathogenesis (M. canis) and confirmed the diagnosis of tinea incognito which had been suspected.
Problematika kožních onemocnění v dětském věku je nesmírně široká, právě kožní obtíže představují jeden z nejčastějších důvodů návštěvy pediatra. Nejenom léčba, ale už samotná diagnostika skýtá řadu úskalí a může představovat značnou výzvu i pro zkušeného dermatologa. Ve své praxi se autor a jeho kolegové pravidelněji setkávají s některými neúspěšně léčenými chorobami, v důsledku opakujících se chyb v předchozím diagnostickém procesu. Přestože se většinou nejedná o dramatické chyby – které by ohrozily pacienta na životě – teprve až jejich odhalení a napravení vede k vyřešení situace. Někdy dokonce ani není nutné nastavovat novou či měnit zavedenou terapii, stačí pouhé podrobnější rozebrání důvodu návštěvy a správná edukace. Na základě těchto klinických zkušenosti tak vznikl článek – s výběrem témat, jež odrážejí některé častěji se opakující situace – jehož ambicí je, aby byl co možná nejvíce užitečným pomocníkem pro každodenní praxi pediatrů a pomáhal předcházet zmiňovaným potenciálním omylům. Kvůli praktičnosti tak často není uváděna obšírná kompletní diferenciální diagnóza a jedná se spíše o soubor doporučení a rad.
Issues of skin diseases in childhood is enormously broad – the skin problems are one of the most common reasons for visitinga pediatrician. Not only treatment, but diagnostics itself provides a number of pitfalls and can be a great challenge even for anexperienced dermatologist. The author and his colleagues regularly encounter some unsuccessfully treated diseases, resulting fromrecurrent errors in the previous diagnostic proces. Although they are mostly not serious errors – which would put the patient‘s lifein danger – only the discovery and correction of the errors leads to the solution of the situation. Based on these clinical experiences,an article was created – with a selection of topics that reflects some of the more recurring situations – whose ambition is tobe as helpful as possible for the everyday practice of pediatricians and to help prevent previously mentioned potential mistakes.Because of practicality, there is often not a complete differential diagnosis, and it is rather a set of recommendations and advice.
- MeSH
- alopecia areata etiologie MeSH
- chybná diagnóza MeSH
- diferenciální diagnóza MeSH
- dítě MeSH
- exantém etiologie MeSH
- kondylomata akuminata diagnóza MeSH
- kožní nemoci * diagnóza MeSH
- lidé MeSH
- molluscum contagiosum diagnóza MeSH
- mykologické určovací techniky MeSH
- névus diagnóza klasifikace MeSH
- noha (od hlezna dolů) patologie MeSH
- sexuálně přenosné nemoci diagnóza MeSH
- svrab diagnóza terapie MeSH
- virové nemoci diagnóza MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- lidé MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
Currently, invasive candidal infections represent an increasing cause of morbidity and mortality in seriously ill hospitalised patients. Because the accurate diagnosis of candidiasis remains difficult, a fast and reliable assay for characterization of fungal pathogens is critical for the early initiation of adequate antifungal therapy and/or for introduction of preventive measures. As novel molecular genetic techniques are continuously introduced, their role in the management of infectious diseases has also been growing. Today, molecular strategies complement conventional methods and provide more accurate and detailed insight. It can be expected that future technical development will improve their potential furthermore. In this article, we provide a critical review on the value and limitations of molecular tools in pathogenic Candida species identification and strain typing regarding their sensitivity, discriminatory power, reproducibility, cost and ease of performance.
