Práce rozebírá problematiku anaerobní kultivace klinických vzorků s možností využití poloautomatických hemokultivačních přístrojů. Lahvičky Bactec Lytic, BacT/Alert FAN Anaerobic a BacT/Alert FN Anaerobic byly inokulovány kmeny Bacteroides fragilit, Clostridium perfringens, Petostreptococcus anaerobius, Peptococcus anaerobius a Feingoldia magna. Byly vyhodnoceny TTD (time to detection) pozitivních lahviček v závislosti na množství inokulovaných bakterií. Všechny lahvičky Bactec Lytic měly kratší TTD oproti lahvičkám BacT/Alert FAN anaerobic nebo BacT/Alert FN Anaerobic inokulovaných stejnou suspenzí téhož bakteriálního kmene. Statisticky významné (p = 0,05) byly rozdíly u kmenů Bacteroides fragilis a Clostridium perfringens. Feingoldia magna byla vykultivována pouze v systému Bactec Lytic. Anaerobní hemokultivační lahvičky je možné využít pro kultivaci anaerobních bakterií z jiných materiálů, než je krev (zvláště v případech, kdy není možnost včasného transportu materiálu do laboratoře a hrozí jeho znehodnocení), je však nutné počítat s omezeným spektrem detekovaných mikroorganismů. Lahvičky Bactec Lytic vykazuji rychlejší růst a vyšší pravděpodobnost úspěšné kultivace a detekce anaerobních bakterií než lahvičky BacT/Alert FAN Anaerobic a BacT/Alert FN Anaerobic.

The purpose of this study is to deal with the problem of anaerobic cultivation of clinical specimens and consider the possibility of using semi-automated blood culture instruments. The Bactec Lytic, BacT/Alert FAN Anaerobic and BacT/Alert FN Anaerobic bottles were inoculated with Bacteriodes fragiiis, Clostridium perfringens, Peptostreptococcus anaerobius and Feingoldia magna strains. The times to detection (TTD) for positive bottles were evaluated with reference to the number of inoculated bacteria. Inoculation with the same suspension of equal bacterial strain resulted in shorter TTD values for all the Bactec Lytic bottles as compared with the BacT/Alert FAN Anaerobic or BacT/Alert FN Anaerobic bottles, respectively. Statistically significant differences were recorded (p=0,05) by Bacieioides fragilis and Ciostridium perfringens species. Feingoldia magna was submitted to culture in the Bactec Lytic alone. The anaerobic blood culture bottles are deemed acceptable for application in the culture of anaerobic isolates drawn from other samples except for blood (namely when prompt delivery of the sample to the laboratory is impossible and the sample can suffer damage), however, only a limited range of microorganisms can be taken into account for the detection purposes. The Bactec Lytic bottles are more appropriately designed for the detection of anaerobic bacterial species compared to the BacT/Alert FAN Anaerobic and BacT/Alert FN Anaerobic bottles. They achieve faster growth parametres and provide more successful readings of anaerobic bacteria culture and detection.

• MeSH
• bakteriologické techniky metody   MeSH
• gramnegativní anaerobní bakterie fyziologie   izolace a purifikace   MeSH
• kultivační média speciální MeSH
• kultivované buňky MeSH
• lidé MeSH
• okultní krev MeSH
• techniky in vitro MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• hodnotící studie MeSH

Při kultivaci, izolaci a stanovení citlivosti anaerobních patogenů v humánní mikrobiologii sehrává khčovou roli kvalita bakteriologických kultivačních médií určená pro tento typ vyšetření. Vzhledem k obtížné kultivovatelnosti anaerobních bakterií a současné potenciální závažnosti anaerobních infekcí, je nezbytné věnovat přípravě, skladování i vlastnímu použití těchto kultivačních médií náležitou anaerobních bakterií.

For culture, isolation and determination of susceptibility of anaerobic pathogens in human microbiology, crucial is the quality of bacteriological culture media for this type of testing. Since anaerobic bacteria are difficult to culture and anaerobic infections are potentially serious, careful attention must be paid to preparation, storing and use of these media. The article provides an overview of numerous solid and liquid culture media used in the diagnosis of anaerobic bacteria.

• MeSH
• anaerobní bakterie izolace a purifikace   patogenita   růst a vývoj   MeSH
• financování organizované MeSH
• kultivační média speciální diagnostické užití   zásobování a distribuce   MeSH
• mikrobiální testy citlivosti metody   normy   MeSH
• Publikační typ
• přehledy MeSH

• MeSH
• anaerobní bakterie izolace a purifikace   klasifikace   růst a vývoj   MeSH
• bakteriální léková rezistence MeSH
• bakteriologické techniky metody   MeSH
• gramnegativní anaerobní bakterie izolace a purifikace   klasifikace   MeSH
• grampozitivní bakterie izolace a purifikace   klasifikace   MeSH
• kultivační média speciální MeSH

Profily těkavých karboxylových kyselin byly stanoveny plynovou chromatografií v souboru 287 mikrobiologicky pozitivních i negativních hemokultur, kultivovaných na svépomocí připravených médiích a v systému BacT/Alert. Některé aerobní bakterie poskytovaly málo chaharakteristické profily s malým obsahem kyselin, některé byly chromatograficky negativní, anaerobní bakterie poskytovaly profily s větším obsahem kyselin. v 11 % hemokultur umožnila tato metoda během 30 minut detekci mikrobů nenalezených kultivačním vyšetřením, obvykle anaerobních. V některých případech je možná i orientační přibližná identifikace etiologického agens.

The volatile fatty acid profiles were determined by gas chromatography in 287 microbiologically positive and negative blood cultures, evaluated in homemade media and by the BacT/Alert system. Some aerobic bacteria yielded less characteristic profiles with low content of acids, some of them were chromatographically negative, anaerobic bacteria yielded profiles with larger acid content. Addirional bacteria, mostly anaerobic, were detected by this method within 30 minutes in 11 % of evaluated blood cultures as compared with cultivation. In some cases, the tentative identification of etiologic agents was also possible.

• MeSH
• aerobní bakterie metabolismus   růst a vývoj   MeSH
• anaerobní bakterie metabolismus   růst a vývoj   MeSH
• chromatografie MeSH
• kultivační média MeSH
• kyseliny mastné těkavé analýza   MeSH

• MeSH
• cvičení MeSH
• fyziologie dýchací soustavy MeSH
• odporový trénink MeSH
• techniky cvičení a pohybu MeSH

• Konspekt
• Sport. Hry. Tělesná cvičení
• NLK Obory
• tělovýchovné lékařství
• NLK Publikační typ
• kolektivní monografie

Cíl: Posouzení současného klinického významu anaerobních bakteriémií ve skupině českých nemocnic. Materiál a metody: Byla provedena analýza výsledků 8 444 anaerobních hemokultivací od pacientů hospitalizovaných ve čtyřech nemocničních zařízeních v letech 2004-2007. Výsledky: Klinicky významná anaerobní bakteriémie byla zaznamenána u 16 pacientů, což představuje méně než 2 % klinicky významných bakteriémií. Asociovaná mortalita činila 18 %, u žádného z našich pacientů ale nebylo možné prokázat jasnou kauzální spojitost mezi anaerobem zachyceným v hemokultuře a úmrtím. Hlavni komorbidity predisponující ke vzniku anaerobní bakteriémie a zdroje infekce se u našich pacientů víceméně shodovali s literárními údaji. Nejčastějšími anaerobními izoláty byly bakteroidy, následovány Ciostridium perfringens a překvapivě též eubakteriemi (zejména Eubacterium lentum). Závěr: Anaerobní bakteriémie zůstávají v našich podmínkách vzácné. Porovnáni našich dat s údaji jiných autorů naznačuje, že reálný klinický dopad anaerobní bakteriémie na pacienta je bez ohledu na v literatuře udávanou vysokou mortalitu obvykle spíše diskutabilní a že průkaz anaeroba v hemokultuře také nelze považovat za důkaz jeho zvýšeného patogenního uplatnění ve zdrojovém infekčním ložisku.

Objective: To estimate tje current clinical significance of anaerobic bacteremia in a group of Czech hospitals. Material and Methods: This retrospective analysis comprised 8 444 anaerobic blood cultures in patients admitted to four Czech hospitals between 2004 and 2007. Results: In 16 patients, blood cultures yielded significant anaerobic bacteria. Thus, anaerobic bacteremia accounted for less than 2 % of clinically significant bacteremia. Four patients (18 %) died but none of the deaths could be clearly attributable to anaerobic bacteria in the bloodstream. The most common comorbidities predisposing to anaerobic bacteremia and the most frequent sources of infection were similar to those reported by other authors. The majority of anaerobic bacteremia cases were due to gram-negative bacteria, followed by Ciostridium perfringens and, surprisingly, Eubacterium spp. (particularly Eubacterium lentum). Conclusion: Anaerobic bacteremia remains rare. The comparison of our data with those by other authors suggests that (despite the reported high mortality) the actual clinical significance of anaerobic bacteremia is rather controversial and that the anaerobic bacteremia might not correspond to more serious pathogenic role of the anaerobic bacteria as the source of infection.

• Klíčová slova
• anaerobní infekce,
• MeSH
• anaerobní bakterie izolace a purifikace   MeSH
• bakteriemie komplikace   mikrobiologie   mortalita   MeSH
• dospělí MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• senioři nad 80 let MeSH
• senioři MeSH
• Check Tag
• dospělí MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• senioři nad 80 let MeSH
• senioři MeSH
• ženské pohlaví MeSH

The anaerobic fungus Anaeromyces mucronatus KF8 grown in batch culture on M10 medium with rumen fluid and microcrystalline cellulose as carbon source produced a broad range of enzymes requisite for degradation of plant structural and storage saccharides including cellulase, endoglucanase, xylanase, alpha-xylosidase, beta-xylosidase, alpha-glucosidase, beta-glucosidase, beta-galactosidase, mannosidase, cellobiohydrolase, amylase, laminarinase, pectinase and pectate lyase. These enzymes were detected in both the intra- and extracellular fractions, but production into the medium was prevalent with the exception of intracellular beta-xylosidase, chitinases, N-acetylglucosaminidase, and lipase. Xylanase activity was predominant among the polysaccharide hydrolases. Extracellular production of xylanase was stimulated by the presence of cellobiose and oat spelt xylan. Zymogram of xylanases of strain KF8 grown on different carbon sources revealed several isoforms of xylanases with approximate molar masses ranging from 26 to 130 kDa.

• MeSH
• anaerobióza MeSH
• celobiosa metabolismus   MeSH
• celulosa metabolismus   MeSH
• financování organizované MeSH
• fungální proteiny biosyntéza   MeSH
• glykosidhydrolasy biosyntéza   chemie   klasifikace   MeSH
• kultivační média chemie   MeSH
• molekulová hmotnost MeSH
• Neocallimastigales enzymologie   fyziologie   MeSH
• xylany metabolismus   MeSH

The object of this study are chitinolytic enzymes produced by bacterium Clostridium paraputrificum J4 isolated from the gastrointestinal tract of a healthy human. In particular, we focus on the development of purification protocols, determination of properties of the enzymes and their activity profiles. The process of bacteria cultivation and isolation of chitinolytic complex of enzymes showing specific activities of endo-, exo-chitinase and N-acetyl-β-glucosaminidase was optimized. A range of various purification procedures were used such as ultrafiltration, precipitation, chromatographic separations (ion-exchange, size exclusion, chromatofocusing) in altered combinations. The optimal purification protocol comprises two or three steps. Individual samples were analyzed by SDS/PAGE electrophoresis and after renaturation their activity could be detected using zymograms. Mass spectroscopy peptide fragment analysis and MALDI analysis of the purest samples indicate presence of endochitinase B (molecular mass about 85 kDa) and of 60-kDa endo- and exochitinases.

• MeSH
• anaerobióza MeSH
• bakteriální proteiny izolace a purifikace   metabolismus   sekrece   MeSH
• chitin metabolismus   MeSH
• chitinasy izolace a purifikace   metabolismus   sekrece   MeSH
• Clostridium enzymologie   růst a vývoj   MeSH
• gastrointestinální trakt mikrobiologie   MeSH
• glykosidhydrolasy izolace a purifikace   metabolismus   sekrece   MeSH
• hexosaminidasy izolace a purifikace   metabolismus   sekrece   MeSH
• kultivační techniky metody   MeSH
• lidé MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

• MeSH
• anaerobní bakterie účinky léků   MeSH
• buněčné kultury MeSH
• kyslík farmakologie   MeSH
• lidé MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• MeSH
• Bacteria růst a vývoj   MeSH
• kultivační média MeSH
• maltosa MeSH
• techniky in vitro MeSH
• železo MeSH