• MeSH
• virus spalniček růst a vývoj   MeSH

One hundred and twenty-seven exfoliative toxin-producing (ET-positive) strains of Staphylococcus aureus collected in 23 Czech and one Slovak maternity hospitals from 1998 to 2011 were genotypically characterized by multilocus sequence typing (MLST), pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) profiling, spa gene polymorphism analysis, and ETA-converting prophage carriage, which resulted in the identification of 21 genotypes grouped into 4 clonal complexes (CC). Ninety-one isolates carried the eta gene alone whilst 12 isolates harboured only the etb gene. Two new, to date not defined, spa types (t6644 and t6645) and 2 novel sequence types (ST2194 and ST2195) were identified in the set of strains under study. The predominant CC121 occurred in 13 Czech hospitals. CC15, CC9, and ST88 (CC88) exclusively included eta gene-positive strains while the strains belonging to ST121 harboured the eta and/or etb genes. This study highlights not only significant genomic diversity among impetigo strains and the distribution of major genotypes disseminated in the Czech and Slovak maternity hospitals, but also reveals their impact in epidermolytic infections.

• MeSH
• bakteriální geny * MeSH
• fenotyp MeSH
• genotyp MeSH
• impetigo mikrobiologie   MeSH
• lidé MeSH
• multilokusová sekvenční typizace MeSH
• novorozenec MeSH
• polymorfismus genetický MeSH
• porodnice * MeSH
• přenašečství mikrobiologie   MeSH
• pulzní gelová elektroforéza MeSH
• sekvence nukleotidů MeSH
• stafylokokové infekce mikrobiologie   MeSH
• Staphylococcus aureus klasifikace   genetika   izolace a purifikace   MeSH
• techniky typizace bakterií metody   MeSH
• vybavení a zásoby nemocnice mikrobiologie   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• novorozenec MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH
• Geografické názvy
• Československo MeSH

Jsou prezentovány první výsledky charakterizace kmenů Haemophilus influenzae novou metodoumultilokusové sekvenační typizace (MLST). Charakterizace souboru 28 kmenů H. influenzae izolovanýchz invazivních onemocnění v České republice ukázala klonální homogenitu těchto kmenů:z 26 testovaných kmenů H. influenzae b vykazovalo 22 kmenů jednotný sekvenční typ: ST-6. U 4kmenů byly zjištěny námi nově popsané sekvenční typy: ST-83 (3 kmeny) a ST-84 (1 kmen). U 2netypovatelných kmenů H. influenzae byly zjištěny jiné sekvenční typy než ST-6: ST-3 a námi nověpopsaný ST-85. První výsledky MLST ukazují, že ST-6 je typický pro H. influenzae b izolovanéz invazivních onemocnění v České republice. Námi nově popsané sekvenční typy ST-83, ST-84 a ST-85byly registrovány v celosvětové databázi MLST H. influenzae (http://haemophilus.mlst.net).

First results of multilocus sequence typing (MLST) of Haemophilus influenzae strains are presented.MLST of 28 H. influenzae strains isolated frompatients with invasive diseases in the Czech Republicis indicative of clonal homogeneity of these strains: 22 out of 26 H. influenzae b strains tested wereof the same sequence type, ST-6. Four strains were of two sequence types newly described in thisstudy: ST-83 (3 strains) and ST-84 (1 strain). Two nontypeable H. influenzae strains were assigned tosequence types other than ST-6: ST-3 and ST-85 newly described in this study. First MLST resultsshow ST-6 to be typical of H. influenzae b isolated from patients with invasive diseases in the CzechRepublic. The sequence types newly described in this study, i.e. ST-83, ST-84 and ST-85, weresubmitted to the worldwide H. influenzae MLST database (http://haemophilus.mlst.net).

• MeSH
• buněčné klony MeSH
• finanční podpora výzkumu jako téma MeSH
• Haemophilus influenzae genetika   patogenita   MeSH
• lidé MeSH
• polymerázová řetězová reakce MeSH
• sekvence nukleotidů MeSH
• sérotypizace metody   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• databáze MeSH
• přehledy MeSH
• srovnávací studie MeSH

Cíl práce: Zjištění klonálních charakteristik souboru kmenů Streptococcus pneumoniae (S. pneumoniae) působících invazivní pneu-mokokové onemocnění (IPO) v České republice (ČR) v roce 2017. Porovnání klonálního členění kmenů probíhalo v Národní referenční laboratoři pro streptokokové nákazy (NRL) použitím rutinně využívané metody multilokusové sekvenační typizace (Multilocus Sequence Typing, MLST) a nově zavedené metody multilokusové analýzy tandemových repetic (Multiple-Locus Variable number tandem repeat Analysis, MLVA). Materiál a metodika: Studován byl soubor 87 kmenů S. pneumoniae, vybraný z izolátů doručených v rámci programu surveillance IPO v roce 2017 do NRL z celé ČR. Výběr byl veden přes sérotypy S. pneumoniae tak, aby soubor zahrnoval izoláty sérotypů zastoupených v pneumokokové konjugované 13valentní vakcíně (sérotypy 1, 4, 9V) a izoláty sérotypů nevakcinačních, vyskytujících se však v ČR ve značném zastoupení (sérotypy 8, 9N, 22F). Pro studium byla použita metoda MLST, která je světově rozšířeným standardem klonální charakterizace pneumokokových izolátů a využívá sekvenování souboru genových oblastí a metoda MLVA, která charakterizuje izoláty podle počtu tandemově repetitivních úseků v intergenových oblastech. Výsledky: MLST analýza ukázala a potvrdila vysokou míru klonální homogenity izolátů S. pneumoniae sérotypů 1, 9N, 9V, 22F a značnou genetickou proměnlivost izolátů sérotypů 4 a 8. Mezi klonálním členěním, poskytnutým oběma metodami, byla rámcová korelace. V porovnání s metodou MLST poskytovala metoda MLVA detailnější klonální odlišení. U izolátů s nově zjištěnými MLVA profily je žádoucí přiřazení nového MLVA typu (MT). Tato webová podpora MLVA schématu S. pneumonie však ustupuje do pozadí a neposkytuje aktuálně všechny služby oproti webové podpoře pro MLST charakterizaci. Závěry: Metoda MLST je a nadále zůstává u izolátů S. pneumoniae standardem při klonální charakterizaci původců IPO při provádění surveillance na úrovni místní i mezinárodní. MLST charakteristiky izolátů jsou využity při sledování klonální proměnlivosti národními i nadnárodními orgány ochrany veřejného zdraví. Metoda MLVA rutinně používána není, lze ji však použít jako doplňkovou pro zrychlené zjištění klonální příbuznosti izolátů ze situací lokálního charakteru, například ohniskových výskytů infekce. Zde může snáze zachytit vznik a šíření virulentní klonální varianty.

Aim: To determine clonal characteristics of Streptococcus pneumoniae (S. pneumoniae) strains causing invasive pneumococcal disease (IPD) in the Czech Republic (CR) in 2017. Clonal assignment of strains was performed in the National Reference Laboratory for Streptococcal Infections (NRL) by the routinely used method, multilocus sequence typing (MLST), and a newly introduced method, multiple-locus variable number tandem repeat analysis (MLVA). Material and method: The study strains were 87 isolates of S. pneumoniae selected from those referred to the NRL within the IPD surveillance programme from all over the CR in 2017. The study set covers S. pneumoniae isolates of both pneumococcal 13-valent conjugate vaccine serotypes (1, 4, and 9V) and non-vaccine serotypes (8, 9N, and 22F) widely spread in the CR. The study methods were MLST, the standard method used worldwide for the characterisation of pneumococcal isolates based on sequencing of a set of gene regions, and MLVA, which allows to characterise isolates based on the number of tandem repeats in intergenic regions. Results: MLST revealed and confirmed a high level of clonal homogeneity of S. pneumoniae isolates of serotypes 1, 9N, 9V, and 22F and a considerable genetic variability of serotype 4 and 8 isolates. There was a general correlation between the MLST and MLVA clonal complex assignments. In comparison with MLST, MLVA has superior clonal discriminatory power. Isolates with the newly determined MLVA profiles should be assigned to new MLVA types (MT). Nevertheless, the new web support of the MLVA scheme for S. pneumoniae is less relevant as it does not provide services comparable to those available from the web support for MLST characterisation. Conclusions: MLST continues to be the standard method for clonal characterisation of S. pneumoniae isolates from IPD for the purposes of both national and international surveillance. MLST characteristics of isolates are helpful in the study of clonal variability conducted by both national and transnational public health protection authorities. MLVA is not routinely used but can serve as a complementary method for rapid identification of clonal relatedness between isolates, e.g. those from local outbreaks. It is more suitable for the detection of emergence and spread of a virulent clonal variant.

• MeSH
• lidé MeSH
• molekulární typizace MeSH
• pneumokokové infekce * epidemiologie   MeSH
• sekvenční analýza DNA MeSH
• sérotypizace * metody   MeSH
• Streptococcus pneumoniae izolace a purifikace   klasifikace   MeSH
• surveillance populace MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

Fifty-seven Escherichia coli O26 strains isolated from patients in six countries were investigated by PCR restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis of the flagellin-encoding (fliC) gene (fliC RFLP analysis). The strains were determined by serotyping to belong to five different H types or were nonmotile. The fliC RFLP analysis revealed only two different patterns among the 57 strains. One fliC RFLP pattern was displayed by 54 strains and was identical to that of E. coli H11 reference strain Su4321-41. The other fliC RFLP pattern was observed for three strains and was identical to that for E. coli H32 reference strain K10. The 54 strains with the H11 fliC RFLP pattern included 22 strains of serotype O26:H11, 23 nonmotile strains, and 9 strains that were initially serotyped as H2, H8, H21, and H32 but that were confirmed to express H11 by repeat serotyping. All 54 strains with the H11 fliC RFLP pattern contained the attaching-and-effacing (eae) gene. The three strains with the H32 fliC RFLP pattern belonged to serotype O26:H32, and all were eae negative. The fliC genes of 14 selected E. coli O26:H11 strains isolated between 1964 and 1999 had identical nucleotide sequences. Our results demonstrate that E. coli O26 strains that carry the eae gene belong exclusively to the H11 clonal complex. Since there were no H11 fliC allelic variations among the O26 strains tested, E. coli O26:H11 may have emerged recently. The fliC PCR-RFLP test is a reliable, easy-to-perform, and rapid method for determination of the H types of E. coli O26 isolates.

• MeSH
• antigeny bakteriální genetika   klasifikace   MeSH
• bakteriální adheziny * MeSH
• bakteriální toxiny genetika   MeSH
• Escherichia coli * genetika   klasifikace   MeSH
• flagelin genetika   MeSH
• infekce vyvolané Escherichia coli * mikrobiologie   MeSH
• lidé MeSH
• molekulární sekvence - údaje MeSH
• polymerázová řetězová reakce metody   MeSH
• polymorfismus délky restrikčních fragmentů MeSH
• proteiny vnější bakteriální membrány * genetika   MeSH
• proteiny z Escherichia coli * MeSH
• průjem * mikrobiologie   MeSH
• sekvenční analýza DNA MeSH
• sérotypizace MeSH
• techniky typizace bakterií MeSH
• transportní proteiny * MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH

For the functional analysis of insect genes as well as for the production of recombinant proteins for biomedical use, clonal transgenic silkworms are very useful. We examined if they could be produced in the parthenogenetic strain that had been maintained for more than 40years as a female line in which embryogenesis is induced with nearly 100% efficiency by a heat shock treatment of unfertilized eggs. All individuals have identical female genotype. Silkworm transgenesis requires injection of the DNA constructs into the non-diapausing eggs at the preblastodermal stage of embryogenesis. Since our parthenogenetic silkworms produce diapausing eggs, diapause programing was eliminated by incubating ovaries of the parthenogenetic strain in standard male larvae. Chorionated eggs were dissected from the implants, activated by the heat shock treatment and injected with the transgene construct. Several transgenic individuals occurred in the daughter generation. Southern blotting analysis of two randomly chosen transgenic lines VTG1 and VTG14 revealed multiple transgene insertions. Insertions found in the parental females were transferred to the next generation without any changes in their sites and copy numbers, suggesting that transgenic silkworms can be maintained as clonal strains with homozygous transgenes. Cryopreservation was developed for the storage of precious genotypes. As shown for the VTG1 and VTG14 lines, larval ovaries can be stored in DMSO at the temperature of liquid nitrogen, transferred to Grace's medium during defrosting, and then implanted into larvae of either sex of the standard silkworm strains C146 and w1-pnd. Chorionated eggs, which developed in the implants, were dissected and activated by the heat shock to obtain females (nearly 100% efficiency) or by a cold shock to induce development to both sexes in 4% of the eggs. It was then possible to establish bisexual lines homozygous for the transgene.

• MeSH
• bourec genetika   MeSH
• embryonální vývoj MeSH
• geneticky modifikovaná zvířata MeSH
• hmyzí geny * MeSH
• kryoprezervace metody   MeSH
• partenogeneze MeSH
• reakce na tepelný šok MeSH
• technika přenosu genů MeSH
• zvířata MeSH
• Check Tag
• mužské pohlaví MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• zvířata MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

Cíl: Cílem předložené práce byla molekulárně-biologická analýza kmenů Enterococcus faecium VanA, izolovaných z klinického materiálu pacientů Hemato-onkologické kliniky Fakultní nemocnice Olomouc v období 1997-2002, z prostředí uvedené kliniky a formulace hypotézy o zdroji a šíření VRE. Materiál a metody: Z klinického materiálu pacientů byly standardními kultivačními metodami izolovány a identifikovány enterokoky, včetně stanovení citlivosti k antibiotikům. Molekulárně-biologická analýza byla provedena u vankomycin-rezistentních kmenů E. faecium s fenotypem VanA. Ke stanovení příbuznosti kmenů byla použita makrorestrikční analýza celkové chromozomální DNA naštěpěné restrikční endonukleázou Smal. Výsledky: Celkem bylo ve sledovaném období izolováno 2 647 kmenů Enterococcus sp., přičemž 121 kmenů (4,6 %) bylo identifikováno jako VRE. Nejčastěji se jednalo o kmeny E. faecium VanA (78 %) a E. faecalis VanB (10 %). Z prostředí uvedené kliniky, včetně biologického materiálu ošetřujícího personálu, bylo izolováno 5 vankomycin-rezistentních kmenů E. faecium VanA. 5mal makrorestrikční spektrum genomové DNA analyzovaných kmenů E. faecium VanA tvořilo více než 25 fragmentů o velikosti od 18 do 470 kb. U 60 kmenů bylo identifikováno 28 jedinečných restrikčních profilů, jejichž podobnost se pohybovala od 62 do 97 %. Mezi těmito profily byly dále identifikovány 4 často zastoupené klonální typy, obsahující 5 a více kmenů, s podobností DNA-profilu 90 % a vyšší. Diskuze a závěr. Na základě získaných výsledků lze předpokládat endogenní i exogenní původ izolovaných kmenů E. faecium VanA. Lze potvrdit možnost přežívání těchto kmenů v prostředí nemocničního oddělení a následný přenos na hospitalizované pacienty. Současně je však nutné připustit i endogenní původ těchto kmenů a následnou selekci vlivem širokospektré antibiotické léčby.

Aim of the stady. The aim of this work was the molecular-biology analysis of Enterococcus faecium VanA strains that were isolated from clinical material of the patients hospitalized at the Department of Hemato-Oncology (DHO) of the Teaching Hospital in Olomouc (Czech Republic) from 1997 to 2002, from the environment of this deoartment and formulation of the hypothesis on the source and spread of the VRE. Material and methods: Enterococci were isolated and identified using conventional methods of cultivation including determination of antibiotic susceptibility. Molecular-biology analysis was performed in vancomycin-resistant E. faecium VanA strains isolated in various patients and from the environment of the DHO. A macrorestriction analysis of the total chromosomal DNA that was cleaved by the restriction endonucleasis Smal was used for the determination of the relationship of strains. This analysis was performed by pulsed - field gel electrophoresis (CHEF, Mapper, Bio-Rad) that was followed by statistical processing of the restriction profiles by cluster analysis (Gel Compar, Applied Maths). Results: 2 647 strains of Enterococcus sp. were isolated during the follow-up period totally and 121 of them (4.6 %) were identified as VRE. Most common strains were £. faecium phenotype VanA (78 %) and E. faecalis phenotype VanB (10 %). Five strains of E. faecium VanA were isolated from the environment of the DHO including nasal swabs, hair and uniforms of health care providers. Twenty five to thirty three fragments sized 18 to 470 kb originate in Smal macrorestrictional spectrum of genomic DNA of 60 E. faecium VanA strains and 28 unique restriction profiles were identified, whose similarity varied from 62 to 97 %. Four frequently presented clonal types with 5 and more strains, whose similarity of DNA-profile was > 90 %, were identified among these profiles. Three from five E. faecium VanA strains isolated from the environment had a unique profile that did not correspond with to any of clinical isolates and two strains were identical with the strains isolated from the patients. Conclusion: Based on the results, both endogenous and exogenous origins of isolated E. faecium VanA could be supposed. Possibility of survival of these strains in the hospital department environment and subsequent transmission to hospitalized patients could be confirmed. Simultaneously, endogenous origin of these strains and subsequent selection caused by broad spectrum antibiotic treatment should be admitted.

• MeSH
• Enterococcus faecium genetika   patogenita   MeSH
• finanční podpora výzkumu jako téma MeSH
• hematologické nádory MeSH
• hospitalizovaní pacienti MeSH
• infekce diagnóza   mikrobiologie   přenos   MeSH
• lidé MeSH
• molekulární biologie MeSH
• restrikční enzymy diagnostické užití   MeSH
• rezistence na vankomycin MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• přehledy MeSH
• srovnávací studie MeSH

Molecular surveillance studies have documented the extensive spread of methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) clones. Studies carried out by Centro de Epidemiologia Molecular-Network for Tracking Gram-Positive Pathogenic Bacteria (CEM/NET) led to the identification of two international multidrug-resistant strains, which were designated as the Iberian and Brazilian MRSA clones and which were defined by multiple genomic typing methods; these included ClaI restriction digests hybridized with mecA- and Tn554-specific DNA probes and pulsed-field gel electrophoresis (PFGE). The genotypic characteristics of these clones are distinct: the Iberian clone is defined as mecA type I, Tn554 type E (or its variants), and PFGE pattern A (I:E:A), whereas the Brazilian clone is defined as mecA type XI (or its variants), Tn554 type B, and PFGE pattern B (XI:B:B). In this study, we characterized 59 single-patient isolates of MRSA collected during 1996 and 1997 at seven hospitals located in Prague and five other cities in the Czech Republic by using the methodologies mentioned above and by using ribotyping of EcoRI and HindIII digests hybridized with a 16S-23S DNA probe. The Brazilian MRSA clone (XI:B:B) was the major clone (80%) spread in two hospitals located in Prague and one located in Brno; the Iberian MRSA clone (I:E:A or its variant I:DD:A), although less representative (12%), was detected in two hospitals, one in Prague and the other in Plzen. Almost all the strains belonging to clone XI:B:B (45 of 47) corresponded to a unique ribotype, E1H1, whereas most strains of the I:E:A and I:DD:A clonal types (6 of 7) corresponded to ribotype E2H2.

• MeSH
• bakteriální proteiny genetika   MeSH
• hexosyltransferasy * MeSH
• karboxypeptidasatranspeptidasa genetika   MeSH
• mikrobiální testy citlivosti MeSH
• oxacilin farmakologie   MeSH
• peptidyltransferasy * MeSH
• proteiny vázající penicilin MeSH
• pulzní gelová elektroforéza MeSH
• rezistence na methicilin * MeSH
• Staphylococcus aureus * genetika   klasifikace   účinky léků   MeSH
• transportní proteiny genetika   MeSH
• transpozibilní elementy DNA MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH

Úvod: Jedním z problémů současné medicíny je zvyšující se počet bakteriálních kmenů s nebezpečnými fenotypy rezistence, včetně Klebsiella pneumoniae s produkcí širokospektrých β -laktamáz AmpA (ESBL). Cílem studie bylo stanovení prevalence a molekulárněbiologická charakteristika ESBL-pozitivních kmenů Klebsiella. Pneumoniae v České republice. Materiál a metody. Studie probíhala na 16 pracovištích v České republice v období září až říjen 2004. Z kUnického materiálu všech hospitalizovaných pacientů byly izolovány a standardními identifikačními postupy určovány kmeny Klebsiella pneumoniae. Jejich citlivost k antibiotikům byla testována standardní diluční mikrometodou. K fenotypovému průkazu produkce ESBL byl použit Double Disk Synergy Test. Geny biaTEM, biaSHV a bJaOXA, kódující produkci ESBL, byly prokazovány pomocí PCR. Molekulárně-biologická charakteristika ESBL-pozitivních kmenů byla provedena izolací genomové DNA, naštěpením restriktázou Xbal a rozdělením pomocí PFGE. Získané restrikční mapy jednotlivých izolátů byly porovnány pomocí programu GelCompar II, poté byla stanovena jejich příbuznost. Výsledky. Ve sledovaném období bylo izolováno 913 kmenů KlebsieJIa pneumoniae, které vyvolaly klinicky prokazatelné onemocnění, přičemž u 234 (25,6 %) byla prokázána produkce ESBL. Prevalence ESBL-pozitivních kmenů činila na jednotkách intenzivní péče 38,5 %, na standardních odděleních pak 15,8 %. Účinnost na více jak 50 % ESBL-pozitivních izolátů byla prokázána pouze u meropenemu (98 %), cefoperazon/sulbactamu (61 %) a amikacinu (54 %). Naopak ESBL-negativní kmeny vykazovaly dobrou citlivost na všechna testovaná antibiotika (76-99 %). Molekulárně-biologická analýza prokázala výskyt 18 klonálních typů obsahujících 2-6 identických kmenů. 17 klonů obsahovalo izobáty vždy z jedné nemocnice, pouze v 1 klonu byly identifikovány kmeny ze dvou nemocnic. Závér. Na základě uvedených výsledků lze konstatovat, že výskyt ESBL-pozitivních kmenů Klebsiella pneumoniae je v České republice relativně vysoký, především na jednotkách intenzivní péče. Lze demonstrovat extenzivní šíření „epidemických klonů“ v rámci českých nemocnic a v omezeném rozsahu i mezi nimi.

Background: One of the problems of contemporary medicine is an increasing number of bacterial strains with hazardous phenotypes of resistance. The feared bacterial pathogens include KJebsieiia pneumoniae strains producing AmpA extended-spectrum beta-lactamases. The study focused on the molecular biological characteristics of ESBL-positive strains of Klebsiella pneumoniae collected in the Czech Republic. Materials and Methods: Clinical material from patients hospitalized in 16 Czech hospitals in September and October 2004 was used to isolate and determine KJebsieIJa pneumoniae strains by standard identification procedures. Their susceptibility to antibiotics was tested using a dilution micromethod. A Double-Disk Synergy Test was used for phenotype determination of ESBL production. The biaTEM, biaSHV and bJaOXA genes coding ESBL production were demonstrated by PCK Molecular biological characteristics of ESBL-positive strains utilized the genomic DNA isolation, Xbal restrictase digestion and PFGE differentiation. The acquired restriction maps of individual isolates were compared using GelCompar II software and their relationship was determined. Results: During the monitored period, 913 Klebsiella pneumoniae strains causing clinically detectable diseases were isolated. Of these, 234 (25.6 %) were determined as ESBL-positive strains. The prevalence of ESBL-positive strains was 38.5 % in ICUs and 15.8 % in standard wards. More than 50 % of ESBL-positive isolates were effectively treated only with meropenem (98 %), cefoperazone/sulbactam (61 %) and amikacin (54 %). Conversely, ESBL-negative strains showed high susceptibility to all tested antibiotics (76-99 %). The molecular biological analysis identified 18 clonal types containing 2-6 identical strains. 17 clones usually contained isolates from one hospital and only in one clone strains from two hospitals were identified. Conclusion: Based on the above mentioned results, the prevalence of ESBL-positive strains of Klebsiella pneumoniae in the Czech Republic can be perceived as relatively high, especially in the ICUs. An extensive spread of „epidemic clones" within Czech hospitals and, to a limited extent, between them can be demonstrated.

• MeSH
• antibakteriální látky farmakologie   terapeutické užití   MeSH
• bakteriální léková rezistence MeSH
• diagnostické techniky molekulární metody   MeSH
• fenotyp MeSH
• finanční podpora výzkumu jako téma MeSH
• Klebsiella pneumoniae izolace a purifikace   klasifikace   patogenita   MeSH
• lidé MeSH
• polymerázová řetězová reakce MeSH
• prevalence MeSH
• techniky in vitro MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

The aim of this study was to compare the plasmid contents of methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) strains classified into different clonal clusters (CCs). The isolates were collected from 15 Czech hospitals in 2000-2008. Plasmid DNA was detected in 65 (89%) strains, and 33 of them harbored more than one plasmid type. Altogether 24 different types of plasmids were identified, ranging in size from 1.3 to 55 kb. Restriction endonuclease analysis, plasmid elimination, DNA hybridization, and sequencing were used for their further characterization. It has been found that the conjugative, erythromycin resistance and enterotoxin D encoding plasmids are harbored by strains from different CCs. On the other hand, chloramphenicol and tetracycline resistance plasmids, and most of the penicillinase and cryptic plasmids were only detected in certain CCs. Especially, the pUSA300-like plasmids were found exclusively in the USA300 clone strains. The high diversity in plasmid content detected in the study strains implies that plasmids play a major role in evolution of MRSA clonal lineages.

• MeSH
• bakteriální léková rezistence genetika   MeSH
• buněčné klony MeSH
• genetická variace * MeSH
• genotyp MeSH
• methicilin rezistentní Staphylococcus aureus genetika   MeSH
• molekulární sekvence - údaje MeSH
• penicilinasa genetika   MeSH
• plazmidy genetika   MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH