Fungi represent a group of soil microorganisms fulfilling important ecological functions. Although several studies have shown that yeasts represent a significant proportion of fungal communities, our current knowledge is based mainly on cultivation experiments. In this study, we used amplicon sequencing of environmental DNA to describe the composition of yeast communities in European temperate forest and to identify the potential biotic and abiotic drivers of community assembly. Based on the analysis of ITS2 PCR amplicons, yeasts represented a substantial proportion of fungal communities ranging from 0.4 to 14.3% of fungal sequences in soil and 0.2 to 9.9% in litter. The species richness at individual sites was 28 ± 9 in soil and 31 ± 11 in litter. The basidiomycetous yeasts dominated over ascomycetous ones. In litter, yeast communities differed significantly among beech-, oak- and spruce-dominated stands. Drivers of community assembly are probably more complex in soils and comprise the effects of environmental conditions and vegetation.

• MeSH
• Biodiversity * MeSH
• Fagus microbiology   MeSH
• Fungi genetics   MeSH
• Yeasts classification   genetics   growth & development   MeSH
• Forests * MeSH
• Soil chemistry   MeSH
• Soil Microbiology * MeSH
• Saccharomyces cerevisiae MeSH
• Picea microbiology   MeSH
• Trees microbiology   MeSH
• Publication type
• Journal Article MeSH

Patogenní kvasinky rodu Candida představují nejrozšířenější příčinu mykotických onemocnění. Tyto druhy jsou úspěšnými patogeny díky tomu, že jsou schopné se rozmnožovat v nejrůznějších místech jako je například kůže, gastrointestinální trakt, krev nebo vaginální sliz- nice a také díky schopnosti adheze na abiotické povrchy. Jednou z klíčových strategií přežití těchto patogenů je jejich schopnost poliferovat v různých koncentracích oxidu uhličitého (CO2). K zvládnutí takového rozdílu používají kvasinky rodu Candida karbanické anhydrasy (CA) kódované homologem genu NCE103, které katalyzují reverzibilní hydrataci CO2 na bikarbonát. CA jsou postradatelné během infekce krevního řečiště, ale jsou nezbytné pro přežití kvasinek na kůži nebo na abiotických površích. Kvasinkové CA jsou strukturně odlišné od lidských a představují tak vhodný cíl pro vývoj profylaktických látek.

Pathogenic yeasts of the genus Candida represent the most prevalent cause of mycotic diseases worldwide. These species are successful pathogens due to their ability to proliferate under a wide variety of conditions, colonizing host niches as diverse as skin, blood, or vagina and also to adhere to abiotic surfaces. One of the key survival strategies of fungal pathogens is the ability to proliferate in different carbon dioxide (CO2) concentrations. To cope with such difference, Candida possesses carbonic anhydrase (CA), encoded by NCE103 gene, which catalyzes reversible hydratation of CO2 into bicarbonate. This enzyme is dispensable during the bloodstream infection, but it is essential for survival of the fungus on skin or abiotic surfaces. Fungal CAs are structurally unrelated to human CAs, which makes them an ideal target for prophylactic intervention.

• Keywords
• NCE103,
• MeSH
• Antifungal Agents pharmacology   classification   MeSH
• Candida enzymology   genetics   pathogenicity   MeSH
• Drug Resistance, Fungal drug effects   MeSH
• Fungi enzymology   MeSH
• Candidiasis, Invasive pathology   therapy   MeSH
• Candidiasis etiology   drug therapy   classification   pathology   MeSH
• Carbonic Anhydrases * genetics   chemistry   classification   drug effects   MeSH
• Yeasts * enzymology   classification   pathogenicity   MeSH
• Carbon Dioxide MeSH
• Publication type
• Research Support, Non-U.S. Gov't MeSH

Palmitoleic acid is found in certain dairy products and has broad applications in medicine and cosmetics. We tried to find a suitable producer of this acid among traditional biotechnological yeast species (Kluyveromyces polysporus, Torulaspora delbrueckii, Saccharomyces cerevisiae) characterized by high biomass yield and Candida krusei, Yarrowia lipolytica and Trichosporon cutaneum accumulating large amounts of lipids. The main factor affecting the content of palmitoleic acid was found to be the C/N ratio in the culture medium, with ammonium sulfate as an optimum nitrogen source leading to highest biomass yield with concomitantly increased lipid accumulation, and an increased content of ω6-linoleic acid, the precursor of prostaglandins, leukotrienes, and thromboxanes. We found that C. krusei can be conveniently used for the purpose, albeit only under certain cultivation conditions, whereas S. cerevisiae can produce high and stable amounts of palmitoleic acid in a broad range of cultivation conditions ranging from conventional to nutrient limitations.

• MeSH
• Bioreactors microbiology   MeSH
• Species Specificity MeSH
• Culture Media chemistry   metabolism   MeSH
• Yeasts classification   metabolism   MeSH
• Fatty Acids, Monounsaturated isolation & purification   metabolism   MeSH
• Lipid Metabolism physiology   MeSH
• Publication type
• Journal Article MeSH
• Research Support, Non-U.S. Gov't MeSH
• Comparative Study MeSH

Precursor-directed biosynthesis was used for directed preparation of positional isomers of heptadecanoic acid (17:1), which have convenient pharmacological properties. Cultivation of Candida sp., Kluyveromyces polysporus, Rhodotorula glutinis, Saccharomyces cerevisiae, Torulaspora delbrueckii, Trichosporon cutaneum, and Yarrowia lipolytica on 20 g/L glucose, 4 g/L acetic, or 4 g/L propionic acids yielded different proportions of 17:1. Cultivation on carbon sources with even numbers of carbon atoms (glucose and acetic acid) produced preferentially 8Z- and 10Z-heptadecenoic acids in about equal amounts, in agreement with the proposed biosynthesis of fatty acids, whereas cultivation on propionic acid as the only carbon source produced over 90 % of total fatty acids of 9-17:1 out of all possible positional isomers. The structures of positional isomers of 17:1 acid were determined using dimethyl disulfides of fatty acid methyl esters. In cultivation of Candida sp. on propionic acid, the yield of heptadecenoic acid reached 111 mg/L cultivation medium. Principal component analysis was used for identifying the effect of cultivation conditions on the production of the 17:1 acid by individual yeast strains.

• MeSH
• Isomerism MeSH
• Yeasts chemistry   classification   growth & development   metabolism   MeSH
• Fatty Acids biosynthesis   chemistry   MeSH
• Molecular Structure MeSH
• Gas Chromatography-Mass Spectrometry MeSH
• Publication type
• Journal Article MeSH
• Research Support, Non-U.S. Gov't MeSH

Tato publikace usnadní studentům lékařských fakult poznání moderní diagnostiky infekčních nemocí a porozumění principům lékařské mikrobiologie. Informace pocházejí z aktuálních odborných zdrojů a ze zkušeností autorů. Každá kapitola je rozdělena na část teoretickou a praktickou. Praktická část obsahuje vždy několik cvičení, která umožní vyzkoušet si jednoduché diagnostické metody v laboratoři lékařské mikrobiologie. Množství fotografií a diagramů zvyšuje srozumitelnost popisů elementárních principů. Každá kapitola je doplněna o několik otázek, které studentům pomohou ověřit si získané základní znalosti.Přílohu ke stažení najdete na stránce titulu.; Tato publikace usnadní studentům lékařských fakult poznání moderní diagnostiky infekčních nemocí a porozumění principům lékařské mikrobiologie. Informace pocházejí z aktuálních odborných zdrojů a ze zkušeností autorů. Každá kapitola je rozdělena na část teoretickou a praktickou. Praktická část obsahuje vždy několik cvičení, která umožní vyzkoušet si jednoduché diagnostické metody v laboratoři lékařské mikrobiologie.

• Keywords
• Ostatní lékařské obory,
• MeSH
• Bacteria classification   pathogenicity   MeSH
• Bacterial Structures MeSH
• Arthropods classification   pathogenicity   MeSH
• Yeasts classification   pathogenicity   MeSH
• Microbiological Techniques MeSH
• Microbiology MeSH
• Mycobacterium classification   pathogenicity   MeSH
• Specimen Handling MeSH

• NML Fields
• mikrobiologie, lékařská mikrobiologie
• lékařství

Tato publikace usnadní studentům lékařských fakult poznání moderní diagnostiky infekčních nemocí a porozumění principům lékařské mikrobiologie. Informace pocházejí z aktuálních odborných zdrojů a ze zkušeností autorů. Každá kapitola je rozdělena na část teoretickou a praktickou. Praktická část obsahuje vždy několik cvičení, která umožní vyzkoušet si jednoduché diagnostické metody v laboratoři lékařské mikrobiologie.

• MeSH
• Bacteria classification   pathogenicity   MeSH
• Bacterial Structures MeSH
• Arthropods classification   pathogenicity   MeSH
• Yeasts classification   pathogenicity   MeSH
• Microbiological Techniques MeSH
• Microbiology MeSH
• Mycobacterium classification   pathogenicity   MeSH
• Specimen Handling MeSH

• Conspectus
• Mikrobiologie
• Učební osnovy. Vyučovací předměty. Učebnice
• NML Fields
• mikrobiologie, lékařská mikrobiologie
• lékařství
• NML Publication type
• učebnice vysokých škol

• MeSH
• Cryptococcus gattii * genetics   isolation & purification   classification   pathogenicity   growth & development   MeSH
• Epidemics MeSH
• Climate Change MeSH
• Cryptococcosis etiology   microbiology   veterinary   MeSH
• Yeasts genetics   classification   pathogenicity   growth & development   MeSH
• Humans MeSH
• Disease Transmission, Infectious MeSH
• Temperature MeSH
• Animals MeSH
• Check Tag
• Humans MeSH
• Animals MeSH

Kultivar Aglianico je velmi stará odrůda červeného vína pocházející z regionu Campania v jižní Italii. Do nedávna bylo víno vyráběno fermentací pomocí kvasinek vyskytujících se na hroznech a ve sklepě. Mikroflora ulpívající na hroznech je složena především z kvasinek se slabými fermetačními a oxidačními schopnostmi, které nepatří do skupiny Saccharomyces. Naproti tomu většina kmenú kvasinek přítomných ve sklepě patří mezi sacharomycety. Úkolem této práce bylo vybrat nové kombinace kmenů kvasinek izolovaných z přirozeně se vyskytující mikroflory hroznů Aglianico a vinného sklepa lokalizovaného v irpinské oblasti a tyto kombinace kvasinek využít ke zlepšení organoleptických a sensorických vlastností takto připravených vín. Kvasinky izolované z hroznů i sklepa byly charakterizovány po stránce morfologické, biochemické a technické. Tyto kvasinky patří zejména mezi rody Saccharomyces, Hanseniaspora, Kloeckera, Rhodotorula, Metschnikowia and Candida. Mezi těmito kvasinkami měly nejlepší vlastnosti při přípravě vína dva kmeny (AGSW15 a FLOSW4), identifikované jako H. uvarum a S. cerevisiae na základě sekvenční analýzy úseku D1/D2 26S rDNA. Tyto kvasinky, použité při poloprovozní fermentaci, úspěšně dominovaly v průběhu alkoholické fermentace a ve zlepšení organoleptických vlastností potvrzených technikou SPME-GC/MS. Dosažené výsledky podporují použití vybraných kmenů kvasinek k zahájení fermentace umožňující zachovat zvláštnosti charakteristické pro toto typicky regionální víno.

Aglianico cultivar is an ancient red grape variety native of Campania region of the Southern of Italy. Until a few decades ago, wine was produced by natural fermentation carried out by autochthonous yeasts present on the grapes and in the cellar. The grapes epiphytic microflora is prevalently composed of apiculate yeasts with a poor fermentative power and by oxidative yeasts, belonging to nonSaccharomyces group. On the other hand, most of the yeast strains present in the cellar belong to Saccharomyces “sensu stricto”. The aim of this work was the selection of new combinations of yeast strains isolated from the autochthonous microflora of Aglianico grapes and wine cellar, located in the Irpinian area, and their use in winemaking process to improve the organoleptic and sensory peculiarities of the wine obtained. The yeasts isolated from grapes and cellar were characterized by morphological, biochemical, and technological analysis. They belonged mainly to the genus Saccharomyces, Hanseniaspora, Kloeckera, Rhodotorula, Metschnikowia and Candida. Among these yeasts the two strains (AGSW15 and FLOSW4) that showed the best winemaking performance were selected and identified as H. uvarum and S. cerevisiae by 26S rDNA D1/D2 region sequence analysis. These yeasts, when utilized in cellar for semi-industrial-scale fermentations, successfully dominate the alcoholic fermentation and contributed to the improvement of the wine organoleptic qualities as assessed by the flavor profile obtained through the SPME-GC/MS technique. These results clearly suggest the utilization of these selected strains in autochthonous fermentation starter to preserve the peculiarities of this typical regional wine.

• MeSH
• Fermentation MeSH
• Yeasts * isolation & purification   classification   growth & development   MeSH
• Microbial Viability MeSH
• Wine * analysis   MeSH
• Vitis * microbiology   MeSH

LC with atmospheric pressure chemical ionization (ACPI) MS with RP and chiral phase was used for separation of triacylglycerols (TAGs) from yeasts of the genera Candida, Kluyveromyces, Rhodotorula, Saccharomyces, Torulospora, Trichosporon, and Yarrowia. Chiral LC-APCI-MS is based on using two columns in series packed with a 3,5-dimethylphenyl carbamate modified β-cyclodextrin chiral phase. All regioisomers and enantiomers of TAGs containing one to five double bonds were separated. Molecular species of TAGs, i.e. regioisomers and enantiomers, were identified and quantified by MS/MS. Among the 94 identified TAGs, the most abundant were triolein, oleopalmitoleoolein, and dipalmitoleoolein. In strains producing palmitoleic acid in amounts >25% of total fatty acids (FAs), this acid, or unsaturated FA is bound in sn-1. In strains containing palmitoleic acid at 10-25% total FAs this acid is mainly bound in sn-3, saturated FA being bound in sn-1. Strains containing <10% palmitoleic acid form preferentially symmetrical TAGs.

• MeSH
• Chromatography, Reverse-Phase methods   MeSH
• Yeasts chemistry   classification   metabolism   MeSH
• Stereoisomerism MeSH
• Triglycerides chemistry   metabolism   MeSH
• Chromatography, High Pressure Liquid methods   MeSH
• Publication type
• Journal Article MeSH
• Evaluation Study MeSH
• Research Support, Non-U.S. Gov't MeSH

• MeSH
• Antifungal Agents * MeSH
• Cell Membrane * metabolism   MeSH
• Ergosterol MeSH
• Phosphatidylethanolamines MeSH
• Phospholipids metabolism   MeSH
• Immune System * MeSH
• Cardiolipins metabolism   MeSH
• Yeasts * classification   MeSH
• Humans MeSH
• Lipid Metabolism * MeSH
• Saccharomyces cerevisiae MeSH
• Sphingolipids metabolism   MeSH
• Sterols metabolism   MeSH
• Xenobiotics * MeSH
• Check Tag
• Humans MeSH