• MeSH
• genomika * MeSH
• sekvenční analýza DNA MeSH
• Publikační typ
• periodika MeSH

• Konspekt
• Obecná genetika. Obecná cytogenetika. Evoluce
• NLK Obory
• genetika, lékařská genetika

• Klíčová slova
• DNA,
• MeSH
• DNA vazebné proteiny MeSH
• DNA MeSH
• genetické techniky MeSH
• Publikační typ
• příručky MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• molekulární biologie, molekulární medicína
• genetika, lékařská genetika

• Klíčová slova
• Biologie molekulární, DNA,
• MeSH
• DNA MeSH
• molekulární biologie MeSH
• Publikační typ
• učebnice MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• biologie

• MeSH
• DNA MeSH
• genomika MeSH
• rekombinantní DNA * MeSH
• Publikační typ
• monografie MeSH

• Konspekt
• Obecná genetika. Obecná cytogenetika. Evoluce
• NLK Obory
• genetika, lékařská genetika

• MeSH
• genomika MeSH
• rekombinantní DNA MeSH
• Publikační typ
• monografie MeSH

• Konspekt
• Obecná genetika. Obecná cytogenetika. Evoluce
• NLK Obory
• genetika, lékařská genetika

A nanopore-based devices are extremely sensitive analytical techniques, which uses the electrophoretic translocation of molecules in solution through a nano-scale pores. The nanopores, which mimic the functions of natural ion channels, seems to be the promissing tool for future fast and low-cost DNA sequencing. However, some difficulties in generating usable sequence data have to be solved. In this article the nanopores were reviewed. In the first part the development of nanopore technique was described and the ubiquitous presence of nanopores in living cells was highlighted. Next, the most important part of the principles of nanopore analysis was described, and the knowledges about biological and solid-state nanopores were summarized. Also the pros and cons of both kinds of nanopores and different approaches designed to circumvent the issues were mentioned.

• Klíčová slova
• biopóry, solid-state nanopóry,
• MeSH
• hemolyziny MeSH
• nanopóry * MeSH
• sekvenční analýza DNA * metody   přístrojové vybavení   MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH
• přehledy MeSH

DNA-protein interactions play an essential role in many regulatory mechanisms such as replication, transcription or translation and are responsible for the maintenance of the genome integrity. Isolation, identification and subsequent characterization of the biological function of DNA binding proteins propose insight into the pathological mechanisms that underlie various diseases. This review brings an overview of methods used for isolation and identification of DNA binding proteins (DNA-affinity chromatography coupled with quantitative proteomics and mass spectrometry) and subsequent methods for the characterization of their biological functions (fluorescence microscopy). Principles, advantages and disadvantages of individual methods are briefly discussed.

• MeSH
• chromatografie afinitní * využití   MeSH
• DNA vazebné proteiny * analýza   MeSH
• DNA MeSH
• fluorescenční mikroskopie * MeSH
• hmotnostní spektrometrie * MeSH
• retardační test * MeSH
• vazba proteinů MeSH

• MeSH
• mutageneze MeSH
• oprava DNA MeSH
• poškození DNA MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• embryologie a teratologie
• genetika, lékařská genetika

• MeSH
• eukaryotické buňky MeSH
• oprava DNA MeSH
• poškození DNA MeSH
• prokaryotické buňky MeSH

• Konspekt
• Biotechnologie. Genetické inženýrství
• NLK Obory
• cytologie, klinická cytologie
• genetika, lékařská genetika
• biomedicínské inženýrství

Cíl studie : Stanovit trendy a potencionální prognostický význam změn hladin apoptotické (aDNA) a genomické DNA (gDNA) u pacientů, u nichž inzult různého charakteru vedl k selhávání vitálních funkcí. Typ studie: Prospektivní otevřená studie. Název a sídlo pracoviště:Klinika anesteziologie a resuscitace a Chirurgická klinika 3. LF UK a FNKV, Praha; Ústav farmakologie 3. LF UK, Praha. Materiál a metody:Do studie byla zařazeno 94 kriticky nemocných. Vzorky krve k analýze byly odebírány v den přijetí a potom 3. a 5. den hospitalizace. U každého pacienta byla sledována základní diagnóza, věk a pohlaví, pří- jmové APACHE II skóre a orgánová dysfunkce; 3. a 5. den byla hodnocena metodikou SOFA délka hospitalizace ve dnech, přežití či úmrtí, z ukazatelů zánětu C-reaktivní protein a počet leukocytů. Analýza byla provedena na sekvenátoru (ABI Prism 377) s užitím originální fenolové extrakční metody. Získané hodnoty plazmy pacientů byly porovnávány s normou získanou z plazmy 86 zdravých dobrovolníků (norma aDNA a gDNA = 100%). Výsledky:Hladina volné aDNA po zátěži ovlivňuje celkovou hladinu volné DNA zásadním způsobem. Její navýše- ní v hodnotě mediánu je 16,3násobně vyšší než u gDNA. V trendu dalších 4 dnů vykazovala v celé hodnocené skupině snížení hladin, gDNA naopak zvýšení. Rozdíl v průběhu trendů i obě kvality DNA hodnocené proti normě byly na hladině statistické významnosti p < 0,001. Byly zjištěny statisticky významná korelace mezi hladinou aDNA v době přijetí a mortalitou nemocných. Závěr:U kriticky nemocných dochází bezprostředně po inzultu k výraznému zvýšení volné aDNA v plazmě, která je v dalším průběhu i ukazatelem přežití nemocných (p < 0,05).

Objective: To establish the trends and prognostic value of plasma levels of the free apoptotic (aDNA) and geno- mic DNA (gDNA) in patients with failure of vital functions. Type of study: Prospective observational study. Setting: University Dept. of Anaesthesiology/CCM and Dept. of Surgery, Charles University, 3rd School of Medici- ne, Prague. Material and Methods : 94 critically ill patientts were evaluated. The blood samples for DNA analysis were taken on the day of admission, the third and fifth day of hospital stay. The following data were collected: ICU admission diagnosis, age and gender, APACHE II, SOFA, ICU stay in days, ICU survival, CRP and WBC count. The analy- sis was done on a sequencer (ABI PRISM 377) using of the original phenol extraction method. The results were correlated to the plasma free DNA levels of 86 healthy volunteers (normal value = 100%). Results:The contribution of aDNA to the total plasma DNA in the critically ill was ~16fold greater than the contri- bution of gDNA. Apoptotic DNA levels were highest on the day of admission and declined thereafter (P < 0.001), whilst the opposite was true for gDNA (P < 0.001) The difference in trends and the aDNA and gDNA levels in cor- relation to normal levels was found statistically significant (P < 0.001). Apoptotic DNA on the day of admission sig- nificantly differs in survivors and non-survivors (P < 0.05). Conclusion:The free apoptotic DNA plasma level on admission could be a predictor of mortality in critical illness.

• MeSH
• apoptóza MeSH
• biochemická analýza krve metody   přístrojové vybavení   statistika a číselné údaje   MeSH
• C-reaktivní protein MeSH
• DNA MeSH
• finanční podpora výzkumu jako téma MeSH
• genom MeSH
• kritický stav ošetřování   terapie   MeSH
• leukocyty MeSH
• péče o pacienty v kritickém stavu metody   MeSH
• přehledová literatura jako téma MeSH
• prognóza MeSH
• Publikační typ
• srovnávací studie MeSH