Transfer efficiency
Dotaz
Zobrazit nápovědu
Cíl práce: Dvoučetná gravidita je v současné době vnímána jako suboptimální výsledek léčby pomocí IVF/ICSI. Nejlepší cestou, jak snížit zastoupení dvojčat, je snížit počet transferovaných embryí ze dvou (double embryo transfer - DET) na jediné (single embryo transfer – SET). Cílem naší studie je srovnat úspěšnost SET a DET v předem definované skupině pacientek s dobrou prognózou léčby pomocí IVF/ICSI. Typ studie: prospektivní klinická observační studie Název a sídlo pracoviště: Gynekologicko-porodnická klinika 1. LF UK a VFN. Metodika: Od 1. 1. 2003 do 31. 12. 2004 jsme nabídli SET nebo DET 331 párům splňujícím vstupní kritéria: věk ženy do 35 let, získání 3 nebo více kvalitních embryí 4. den kultivace. SET si vybralo 57 párů (17,2 %), DET 274 párů (82,8 %). Srovnávali jsme pravděpodobnost klinické gravidity ve skupině SET a DET. Pro statistické zpracování jsme použili Studentův t-test a F test na hladině významnosti p<0,05. Výsledky: SET byl proveden u 57 žen (17,2 %), DET u 274 žen (82,8 %). Mezi sledovanými skupinami nebyly signifikantní rozdíly ve věku, počtu získaných oocytů a celkovém počtu transferovaných embryí. Ve skupině SET bylo prokázáno 30 klinických těhotenství (52,6 %). Ve skupině pacientek DET bylo prokázáno 151 klinických těhotenství (55,1 %).Tento rozdíl nebyl statisticky významný. Statisticky vysoce významné rozdíly (p<0,0001) byly nalezeny ve výskytu dvojčat. Ve skupině pacientek SET nebyla zachycena žádná dvoučetná gravidita (0,0 %), ve skupině DET bylo 57 dvojčat (37,7 %) a jedna trojčetná gravidita (0,4 %). Závěr: Transfer jednoho embrya ve skupině pacientek s dobrou prognózou nesnižuje významně pravděpodobnost otěhotnění, ale oproti skupině s transferem dvou embryí významně snižuje výskyt dvojčat.
Objective: Twin pregnancy is perceived as a suboptimal result of an IVF/ICSI cycle. The most effective way to reduce the number of twins in IVF/ICSI program is a single embryo transfer. The aim of our study was to compare the efficiency of elective single embryo transfer (eSET) and double embryo transfer (DET) in the couples with a very good prognosis of IVF/ICSI. Design: Prospective case observational study. Settings: Department of Obstetrics and Gynecology, Charles University, 1nd Medical Faculty and General Teaching Hospital, Prague, Czech republic. Methods: A prospective study focused on eSET was performed between 1. 1. 2003 and 31. 12. 2004. We offered eSET or eDET to 331 IVF/ICSI couples who met the following inclusion criteria: age of the women <35 years, 3 and more top quality embryos on day 4 after oocyte pick up. Fifty seven (17.2%) couples have chosen eSET and 274 (82.7%) couples preferred eDET. We compared clinical pregnancy rates in two groups of patients: In a group of patients who have chosen eSET versus patients who have preferred double embryo transfer (eDET). Student’s t-test and F test were used to compare both groups. Results: Patients in both groups were not significantly different in age, number of oocytes retrieved and total number of quality embryos. In the eSET group, we achieved 30 clinical pregnancies and the pregnancy rate (PR) was 52.6%. In the eDET group, 151 clinical pregnancies were observed and the PR was 55.1%. Although the pregnancy rate in the eDET group was higher than in the eSET group, the difference between the two groups was not statistically significant. We have not observed any twin pregnancy (0.0%) in the eSET group while 57 (37.7%) twin pregnancies and 1 pregnancy with 3 embryos (0.4%) have been observed in the eDETgroup. This difference is statistically significant (P<0.00001). Conclusion: In the group with a very good IVF/ICSI prognosis (women <35 years, 3 and more top quality embryos on day 4 after oocyte pick up), eSET did not significantly decrease the chance to achieve clinical pregnancy in comparison with DET. eSET seems to be a very efficient option to reduce the rate of twin pregnancy without compromising the pregnancy rate and should be recommended to these patients.
Cieľom našej práce bolo zistiť efektívnosť aplikácie algoritmického programu pri ich zdokonaľovaní na prostných a zistiť transfer optimálnej techniky prevratových cvičebných tvarov na ostatné náradia gymnastického viacboja. Výskum sa realizoval v dvoch skupinách, v experimentálnej a kontrolnej skupine. V experimentálnej skupine sme použili na odstránenie chýb techniky algoritmické programy. Zistili sme, že experimentálna skupina odstánila chyby pomocou algoritmického programu a tým zlepšila techniku prevratových cvičebných tvarov na prostných, čo malo vplyv aj na transfer prevratových cvičebných tvarov z prostných na ostatné náradia gymnastického viacboja. V experimentálnej skupine sa vyskytoval väčší transfer prevratových cvičebných tvarov na ostatné náradia ako v kontrolnej skupine, čo bolo v dôsledku aplikácie algoritmických programov na odstránenie chýb techniky. Môžeme skonštatovať, že algoritmický program prevratových cvičebných tvarov je efektívny a má pozitívny vplyv na transfer.
The aim of our research was find out efficiecy of algorithm programe in forward and backward saltos. The research was carried out in two groups, the experimental and the control one. We also tried to find out transfer of this saltos from floor exercise to other gymnastics apparatures. We were interested in if forward and backward saltos, which were correct with algorithm programe have positiv effect for transfer. We put mistakes out with algorithm programe in experimental group. We found out that experimental group had better technique in forward and backward saltos like control group. We also found out that experimental group had better transfer of this saltos from floor exercise to other apparatures like control group. We can say that algorithm programe for forward and backward saltos is very effective and their good technique have positiv effect for transfer from floor exercise to other apparatures.
Cíl práce: Shrnutí přístupů k vykazování a hodnocení výkonů asistované reprodukce.Typ práce: Přehledný článek.Název a sídlo pracoviště: Centrum asistované reprodukce, Gynekologicko-porodnická klinika 1. LF UK a VFN v Praze.Metodika: V databázích pracovišť, v celostátních a mezinárodních registrech sledujeme data o cyklech in vitro fertilizace a příbuzných metodách. Cílem sledování je především zvyšování efektivity.Výsledky: Výstupy z registrů informují o absolutních počtech cyklů, porodů, narozených dětí a o relativních vztazích (implantation rate, pregnancy rate), které vyjadřují úspěšnost léčby.Závěr: Hodnocení výstupů musí brát v úvahu vliv věku žen, počet transferovaných embryí a další faktory.
Objective: Summarize different ways of assisted reproduction performance evaluation.Design: Review.Setting: Centre for Assisted Reproduction, Department of Gynaecology and Obstetrics, 1st Faculty of Medicine, Charles University, Prague.Methods: In databases of assisted reproduction centres, in national and international registers we evaluate data concerning in vitro fertilisation and related methods. Target of this evaluation is, first of all, to increase efficiency.Results: Outputs of all the registers inform about absolute numbers of cycles, deliveries, born babies and about relative parameters (implantation rate, pregnancy rate), describing the efficiency of the treatment.Conclusion: The output evaluation must consider the influence of the age of female, number of transferred embryos and other factors.
- MeSH
- fertilizace in vitro zákonodárství a právo MeSH
- lidé MeSH
- přenos embrya MeSH
- registrace MeSH
- reprodukční techniky metody MeSH
- věkové faktory MeSH
- ženská infertilita terapie MeSH
- ženy MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
Cíl studie: Zhodnotit výsledky cyklů s hormonální přípravou děložní sliznice a přenosem kryokonzervovanýchembryí.Typ studie: Prospektivní studie.Název a sídlo pracoviště: Centrum asistované reprodukce, Porodnicko-gynekologická klinika FNa LF UP, Olomouc.Metodika: Do sledovaného souboru bylo zařazeno 51 pacientek, u kterých v období leden – srpen 2003proběhlo 42 cyklů s přenosem rozmrazených kryokonzervovaných embryí. Embrya ke kryokonzervacibyla získána v cyklech klasického IVF (n = 21) nebo ICSI (n = 30) a byla mražena ve stadiu prvojader(PN). Délka uchování kryokonzervovaných embryí se pohybovala v intervalu od 3 měsíců do 5 let.Přenos kryokonzervovaných embryí (KET) proběhl v 42 cyklech s přípravou děložní sliznice orálníestrogen-progestinovou substitucí. U embryí ve stadiu PN bylo hodnoceno přežívání (intaktnostpo procesu rozmrazení) a jejich další vývoj při následné kultivaci. Úspěšnost postupu bylahodnocena následujícími ukazateli: výška endometria, počet transferovaných embryí, pregnancyrate (PR), implantation rate (IR) a těhotenské ztráty (AB).Výsledky: Bylo hodnoceno 210 rozmražených embryí. Přežívání bez ohledu na metodu oplozeníbylo 79 %. Ke 42 přenosům bylo vybráno 131 (62 %) embryí v 6-10buněčném stadiu po kultivaci48 hodin v médiích G1.2 a G2.2 fy Vitrolife. Dynamika rýhování byla pravidelnější u embryí získanýchpo IVF, po 24 h kultivace bylo 41 % embryí ve stadiu 4 buněk a po 48 h bylo 36 % embryí8buněčných (vs. po ICSI 32 % 4buněčných a 26 % 8buněčných). Výška endometria v den přenosubyla v celém souboru 10,9 ± 1,3 mm, průměrně byly přenášeny 2,4 embrya na KET. Úspěšnost přenosu ve sledovaných parametrech: PR 28,5 % (IVF 42,9 % a ICSI 20,7 %), IR 12,2 % (IVF 13,0 % a ICSI11,3 %) a AB 41,6 % (IVF 33,3 % a ICSI 50,0 %).Závěr: Zlepšení kryokonzervačních postupů, kryokonzervace embryí ve stadiu PN a v neposlednířadě optimální příprava endometria k přenosu může pozitivně ovlivnit kumulativní úspěšnostcenter asistované reprodukce.
Objective: To evaluate results of cryoembryotransfers in cycles with estrogen-progestin preparationof the endometrium.Design: Prospective study.Setting: Centre of Assisted Reproduction, Dept. of Obstetrics and Gynecology, Palacký UniversityMedical School, Olomouc.Methods: The study included 51 patients in whom in the period of January to August 2003 altogether42 cycles the embryotransfer with frozen and thawed embryos were performed. The embryosfor cryopreservation were obtained in the classical IVF (n = 21) or ICSI (n = 30) cycles and werecryopreserved in the pronuclear stage (PN). The storage interval varied from 3 months to 5 years.The endometrial preparation was performed in all cycles with oral estrogen – progestin substitution.Embryos in the PN stage were examined for survival (rate of intact embryos after thawing)and progress of their further development. Endometrial thickness, number of transferred embryos,pregnancy rate (PR), implantation rate (IR) and abortions (AB) were evaluated as outcomeparameters.Results: A total of 210 thawed embryos were evaluated. Survival was 79% without regard to themethod of fertilization. For 42 cryoembryotransfers 131 embryos (62%) in 6 to 10 blastomers after48 hours cultivation in G 1.2 and G 2.2 fy Vitrolife were selected. Further development was moreregular in embryos obtained in classical IVF cycles, where 41% of the embryos were in 4 cells stageafter 24 hours of cultivation and 36% of the embryos were in 8 cells stage after 48 hours while afterICSI 32% 4 cells embryos and 26% 8 cells embryos respectively. Endometrial thickness in the dayof transfer in all patients was 10.9 ± 1.3 mm, the average number of transferred embryos was 2.4embryos/transfer, PR was 28.5 (IVF 42.9% and ICSI 20.7%), IR 12.0% (IVF 13.0% and ICSI 11.3%) andAB 41.6% (IVF 33.3% and ICSI 50.0%).Conclusion: Improvement of cryopreservation procedures, freezing of embryos in the pronuclearstage and last but not least the optimal endometrial preparation can positively infl uence the cumulativeeffi ciency of assisted reproduction.
Úvod: Těžká paréza až plegie peroneálního svalstva se vyskytuje jak v dětském věku (dětská mozková obrna), tak i v dospělosti (léze n. peroneus, radikulopatie L5, následky traumat CNS, mozkových příhod, u neuromuskulárních chorob). Soubor pacientů a metoda: Autoři prezentují vlastní soubor 18 nemocných, 14 mužů a čtyři ženy, kterým byla provedena transpozice šlachy m. tibialis posterior skrze interosseální membránu v průměru 9,2 měsíců po vzniku parézy. Výsledky: Při kontrole po téměř třech letech udávalo 64 % pacientů výborný a 29 % uspokojivý výsledek. Diskuze: Indikační kritéria, načasování operace, spektrum nemocných i neurologické a EMG nálezy jsou předmětem diskuze. Delší trvání peroneální plegie vede k rozvoji těžko odstranitelné kontraktury zadní skupiny svalů bérce, zkrácení Achillovy šlachy, kloubních pouzder i k ekvinózní deformitě nohy. Efektivním řešením perzistující peroneální plegie je transpozice šlachy m. tibialis posterior skrze interosseální membránu a ukotvení šlachy na bázi III. metatarzu.
Purpose of the study: A severe paresis or plegia of muscles innervated by the common peroneal nerve occurs in children (cerebral palsy) and in adults (peroneal nerve lesions, radiculopathies L5, sequellae after central nervous system injuries, stroke, in neuromuscular diseases). Material and methods: The authors present their own group of 18 patients, 14 men and 4 women. These patients underwent surgery (transfer of m. tibialis posterior tendon through the interosseal membrane) on average 9.2 months after developing plegia. Results: In a follow-up assessment almost 3 years after surgery, 64% of patients stated that their results were excellent and 29% of patients found their results satisfactory. Discussion: Indication criteria, timing of surgery, spectrum of patients, neurological and EMG findings are discussed. A longer duration of peroneal plegia leads to the development of hard to remove contractures of the posterior calf muscle group, shortening of the Achille?s tendon, joint capsules and equinnous deformity of the foot. Transfer of the m. tibialis posterior tendon through the interosseal membrane and anchoring it at the base of the third metatarsal bone is an effective solution to persistent peroneal plegia.
- MeSH
- deformity nohy (od hlezna dolů) chirurgie komplikace MeSH
- dysfunkce zadní holenní šlachy chirurgie MeSH
- elektromyografie metody využití MeSH
- hodnocení výsledků zdravotní péče MeSH
- kosterní svaly chirurgie patofyziologie MeSH
- lidé MeSH
- mezioborová komunikace MeSH
- nervus peroneus patofyziologie patologie MeSH
- neuromuskulární příznaky a symptomy MeSH
- paréza komplikace patofyziologie MeSH
- přenos šlachy metody využití MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
The epidemic community-associated methicillin-resistant clone Staphylococcus aureus USA300 is a major source of skin and soft tissue infections and involves strains with a diverse set of resistance genes. In this study, we report efficient transduction of penicillinase and tetracycline resistance plasmids by bacteriophages φ80α and φJB between clinical isolates belonging to the USA300 clone. High transduction frequencies (10(-5) - 10(-6) CFU/PFU) were observed using phages propagated on donor strains as well as prophages induced from donors by ultraviolet light. Quantitative real-time PCR was employed to detect penicillinase plasmids in transducing phage particles and determine the ratio of transducing particles in phage lysates to infectious phage particles (determined as approximately 1 : 1700). Successful transfer of plasmids between strains in USA300 clone proves transduction is an effective mechanism for spreading plasmids within the clone. Such events contribute to its evolution and to emergence of new multiple drug-resistant strains of this successful clone.
- MeSH
- bakteriální léková rezistence MeSH
- bakteriofágy genetika MeSH
- lidé MeSH
- methicilin rezistentní Staphylococcus aureus genetika izolace a purifikace virologie MeSH
- plazmidy MeSH
- přenos genů horizontální MeSH
- profágy genetika MeSH
- stafylokokové infekce mikrobiologie MeSH
- transdukce genetická MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- dopisy MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
We have examined the imprecision in the estimation of PCR efficiency by means of standard curves based on strategic experimental design with large number of technical replicates. In particular, how robust this estimation is in terms of a commonly varying factors: the instrument used, the number of technical replicates performed and the effect of the volume transferred throughout the dilution series. We used six different qPCR instruments, we performed 1-16 qPCR replicates per concentration and we tested 2-10 μl volume of analyte transferred, respectively. We find that the estimated PCR efficiency varies significantly across different instruments. Using a Monte Carlo approach, we find the uncertainty in the PCR efficiency estimation may be as large as 42.5% (95% CI) if standard curve with only one qPCR replicate is used in 16 different plates. Based on our investigation we propose recommendations for the precise estimation of PCR efficiency: (1) one robust standard curve with at least 3-4 qPCR replicates at each concentration shall be generated, (2) the efficiency is instrument dependent, but reproducibly stable on one platform, and (3) using a larger volume when constructing serial dilution series reduces sampling error and enables calibration across a wider dynamic range.
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
High transformation competency of Escherichia coli is one of the critical factors in the bacterial artificial chromosome (BAC)-based DNA library construction. Many electroporation protocols have been published until now, but the majority of them was optimized for transformation of small plasmids. Large plasmids with a size above 50 kbp display reduced transformation efficiency and thereby require specific conditions in the preparation and electroporation of electrocompetent cells. In the present work, we have optimized the parameters critical to the application of BAC DNA electrotransformation into E. coli. Systematic evaluation of electroporation variables has revealed several key factors like temperature of growth, media supplements, washing buffer, and cell concentration. Improvements made in the transformation protocol have led to electrocompetent cells with transformation efficiency up to 7 × 10(8) transformants per microgram of 120 kbp BAC plasmid DNA. We have successfully used in-house prepared competent cells, the quality of which is comparable with those produced by different companies, in the construction of metagenomic libraries from the soil. Our protocol can also be beneficial for other application with limited DNA source.
- MeSH
- bakteriální transformace * MeSH
- bakteriologické techniky metody MeSH
- elektroporace metody MeSH
- Escherichia coli genetika MeSH
- mikrobiální genetika metody MeSH
- plazmidy * MeSH
- technika přenosu genů * MeSH
- umělé bakteriální chromozomy * MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
In this paper we investigate the rate coding capabilities of neurons whose input signal are alterations of the base state of balanced inhibitory and excitatory synaptic currents. We consider different regimes of excitation-inhibition relationship and an established conductance-based leaky integrator model with adaptive threshold and parameter sets recreating biologically relevant spiking regimes. We find that given mean post-synaptic firing rate, counter-intuitively, increased ratio of inhibition to excitation generally leads to higher signal to noise ratio (SNR). On the other hand, the inhibitory input significantly reduces the dynamic coding range of the neuron. We quantify the joint effect of SNR and dynamic coding range by computing the metabolic efficiency-the maximal amount of information per one ATP molecule expended (in bits/ATP). Moreover, by calculating the metabolic efficiency we are able to predict the shapes of the post-synaptic firing rate histograms that may be tested on experimental data. Likewise, optimal stimulus input distributions are predicted, however, we show that the optimum can essentially be reached with a broad range of input distributions. Finally, we examine which parameters of the used neuronal model are the most important for the metabolically efficient information transfer.
- MeSH
- adenosintrifosfát metabolismus MeSH
- akční potenciály fyziologie MeSH
- excitační postsynaptické potenciály fyziologie MeSH
- membránové potenciály fyziologie MeSH
- modely neurologické * MeSH
- nervové vedení fyziologie MeSH
- nervový přenos fyziologie MeSH
- nervový útlum fyziologie MeSH
- neurony fyziologie MeSH
- počítačová simulace MeSH
- poměr signál - šum MeSH
- výpočetní biologie MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
We report on energy transfer pathways in the main light-harvesting complex of photosynthetic relative of apicomplexan parasites, Chromera velia. This complex, denoted CLH, belongs to the family of FCP proteins and contains chlorophyll (Chl) a, violaxanthin, and the so far unidentified carbonyl carotenoid related to isofucoxanthin. The overall carotenoid-to-Chl-a energy transfer exhibits efficiency over 90% which is the largest among the FCP-like proteins studied so far. Three spectroscopically different isofucoxanthin-like molecules were identified in CLH, each having slightly different energy transfer efficiency that increases from isofucoxanthin-like molecules absorbing in the blue part of the spectrum to those absorbing in the reddest part of spectrum. Part of the energy transfer from carotenoids proceeds via the ultrafast S2 channel of both the violaxanthin and isofucoxanthin-like carotenoid, but major energy transfer pathway proceeds via the S1/ICT state of the isofucoxanthin-like carotenoid. Two S1/ICT-mediated channels characterized by time constants of ~0.5 and ~4ps were found. For the isofucoxanthin-like carotenoid excited at 480nm the slower channel dominates, while those excited at 540nm employs predominantly the fast 0.5ps channel. Comparing these data with the excited-state properties of the isofucoxanthin-like carotenoid in solution we conclude that, contrary to other members of the FCP family employing carbonyl carotenoids, CLH complex suppresses the charge transfer character of the S1/ICT state of the isofucoxanthin-like carotenoid to achieve the high carotenoid-to-Chl-a energy transfer efficiency.
