Optimal descriptors calculated with Simplified Molecular Input Line Entry System (SMILES) notation have been used in quantitative structure-property relationships (QSPR) of half-wave potential of N-benzylsalicylthioamides. The QSPR developed is one-variable model based on the optimal descriptors calculated with the Monte Carlo method. The approach has been checked up with three random splits into the training and test sets. Mechanistic interpretations (structural alerts related to the half-wave potential) of the model are discussed.

• MeSH
• kvantitativní vztahy mezi strukturou a aktivitou * MeSH
• metoda Monte Carlo MeSH
• molekulární struktura MeSH
• thioamidy chemická syntéza   chemie   farmakologie   MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

Quantitative structure–activity relationship (QSAR) modelling is one of the most popular techniques of virtual screening used to predict the activity of a compound toward a biological target. While QSAR classification models are able to predict whether a compound is active or inactive (class) toward a target, regression models try to predict its exact activity value. To find the relationship between the structure and activity of a compound, common machine learning methods are employed (e.g., Support Vector Machines, Random Forest, Neural Networks etc.) together with diverse types of compound descriptors (e.g., physico-chemical properties, structural keys, binary fingerprints etc.). QSAR models are generally very fast and, when a correct approach to their validation and applicability domain setting is used, also reliable. They became a common part of computational drug design workflows employed to detect new drug candidates, elucidate their side/adverse effects or assess their potential toxicity risks.

• Klíčová slova
• virtuální screening,
• MeSH
• databáze jako téma MeSH
• kvantitativní vztahy mezi strukturou a aktivitou * MeSH
• počítačová simulace MeSH
• racionální návrh léčiv MeSH
• strojové učení MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH
• přehledy MeSH

Mucoadhesive buccal films (MBFs) provide an innovative way to facilitate the efficient site-specific delivery of active compounds while simultaneously separating the lesions from the environment of the oral cavity. The structural diversity of these complex multicomponent and mostly multiphase systems as well as an experimental strategy for their structural characterization at molecular scale with atomic resolution were demonstrated using MBFs of ciclopirox olamine (CPX) in a poly(ethylene oxide) (PEO) matrix as a case study. A detailed description of each component of the CPX/PEO films was followed by an analysis of the relationships between each component and the physicochemical properties of the MBFs. Two distinct MBFs were identified by solid-state NMR spectroscopy: (i) at low API (active pharmaceutical ingredient) loading, a nanoheterogeneous solid solution of CPX molecularly dispersed in an amorphous PEO matrix was created; and (ii) at high API loading, a pseudoco-crystalline system containing CPX-2-aminoethanol nanocrystals incorporated into the interlamellar space of a crystalline PEO matrix was revealed. These structural differences were found to be closely related to the mechanical and physicochemical properties of the prepared MBFs. At low API loading, the polymer chains of PEO provided sufficient quantities of binding sites to stabilize the CPX that was molecularly dispersed in the highly amorphous semiflexible polymer matrix. Consequently, the resulting MBFs were soft, with low tensile strength, plasticity, and swelling index, supporting rapid drug release. At high CPX content, however, the active compounds and the polymer chains simultaneously cocrystallized, leaving the CPX to form nanocrystals grown directly inside the spherulites of PEO. Interfacial polymer-drug interactions were thus responsible not only for the considerably enhanced plasticity of the system but also for the exclusive crystallization of CPX in the thermodynamically most stable polymorphic form, Form I, which exhibited reduced dissolution kinetics. The bioavailability of CPX olamine formulated as PEO-based MBFs can thus be effectively controlled by inducing the complete dispersion and/or microsegregation and nanocrystallization of CPX olamine in the polymer matrix. Solid-state NMR spectroscopy is an efficient tool for exploring structure-property relationships in these complex pharmaceutical solids.

• MeSH
• adheziva chemie   metabolismus   MeSH
• biologická dostupnost MeSH
• ethylenoxid chemie   MeSH
• farmaceutická chemie metody   MeSH
• krystalizace metody   MeSH
• magnetická rezonanční spektroskopie metody   MeSH
• nanočástice chemie   MeSH
• orální absorpce fyziologie   MeSH
• polyethylenglykoly chemie   metabolismus   MeSH
• polymery chemie   MeSH
• pyridony chemie   MeSH
• rozpustnost MeSH
• ústní sliznice metabolismus   MeSH
• uvolňování léčiv fyziologie   MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

• MeSH
• anestetika lokální MeSH
• karbamáty MeSH
• vztahy mezi strukturou a aktivitou MeSH

Cíle. Cílem studie bylo ověřit psychometrické charakteristiky české verze Škály sklonu k nudě (Boredom Proneness Scale; BPS). Metoda. Škála byla administrována 661 žákům středních škol ve věku 15 až 24 let (M = 17; SD = 1,36) spolu s dalšími nástroji měřícími příbuzné konstrukty. Statistické analýzy. Veškeré statistické analýzy byly realizovány v prostředí IBM SPSS Statisics (ver. 27) a JASP. Vnitřní konzistence byla ověřována s využitím koeficientů reliability Cronbachovo α a McDonaldovo ω. Byly realizovány konfirmační faktorové analýzy ověřující diskriminační validitu pro existující faktorové modely. Faktorová struktura u daného vzorku byla následně zjišťována metodou PAF s šikmým řešením Promax. Konvergentní validita byla zjišťována s využitím korelační analýzy a pro zhodnocení rozdílů z hlediska pohlaví a studijního průměru bylo použito testů Mann-Whitney a Kruskal-Wallis. Výsledky. Vnitřní konzistence pro celkový skór BPS se ukázala být adekvátní, položková analýza však vyloučila unidimenzionalitu škály. S využitím konfirmačních faktorových analýz byly testovány tři faktorové modely z předchozích výzkumů, avšak žádný z nich nevykázal dostatečnou shodu s daty. Metodou explorační faktorové analýzy bylo u českého vzorku následně identifikováno jako nejvhodnější třífaktorové řešení. Přestože se nepodařilo jeden z faktorů z matematického hlediska obhájit, jeho validita a konceptuální hodnota vzhledem k celkovému konstruktu BPS a dalším proměnným se ukazuje v rámci tohoto výzkumu jako opodstatněná. Výsledky studie naznačují, že faktorové řešení o minimálně třech faktorech přináší detailnější výsledky, pokud jde o vztah BPS k příbuzným onstruktům. Výsledky studie přinášejí doporučení pro další práci na vývoji škály tak, aby byl plně využit její výzkumný i diagnostický potenciál. Omezení studie. S ohledem na nereprezentativnost výzkumného vzorku je pro budoucí výzkum v této oblasti potřebné zahrnutí také dalších populačních souborů.

Objectives. The study is focused on the psychometric properties of the Czech version of the Boredom Proneness Scale (BPS) evaluation. Sample and settings. The scale was completed by 661 secondary school students aged between 15 to 24 (M=17; SD=1,36) together with other measures of related constructs. Statistical analysis. Statistical analyses were realised using the environment of IBM SPSS Statistics (ver. 27) and JASP. Cronbachʼs α and McDonaldʼs ω were used to assess the internal consistency. Confirmatory factor analyses were performed to test the discriminant validity of different existing models. As none of them was a good fit to the present data, exploratory factor analysis using the Principal axis factoring method with promax solution was used to reveal specific factor structure within this sample. Correlation analysis was used for convergent validity estimation. Differences between men and women and with regard to grade point average were assessed using Mann-Whitney and Kruskal-Wallis tests. Results. The internal consistency of the BPS total score was adequate, but the item analysis did not confirm the scale to be unidimensional within this sample. Three-factor models derived from previous research studies were tested using the CFAs, but none of them was a reasonable fit to the data. Based on the results of EFA, a three-factor solution appeared to be the best fit to the sample. Despite the fact that one of the revealed factors could not have been fully mathematically supported, its validity and conceptual value within the BPS construct and with regard to other measured variables is further corroborated in this study. The study results indicate that the three-factor solution brings at least more subtle findings with regard to the relationship between the BPS and related constructs. Directions for further scale development and improvement are outlined in order to maximalize the research and diagnostic potential of the scale. Limitations: The major study limitation is related to the low representativeness of the research sample. Therefore, further research with different population samples is needed. Cíle. Cílem studie bylo ověřit psychometrické charakteristiky české verze Škály sklonu k nudě (Boredom Proneness Scale; BPS). Metoda. Škála byla administrována 661 žákům středních škol ve věku 15 až 24 let (M = 17; SD = 1,36) spolu s dalšími nástroji měřícími příbuzné konstrukty. Statistické analýzy. Veškeré statistické analýzy byly realizovány v prostředí IBM SPSS Statistics (ver. 27) a JASP. Vnitřní konzistence byla ověřována s využitím koeficientů reliability Cronbachovo α a McDonaldovo ω. Byly realizovány konfirmační faktorové analýzy ověřující diskriminační validitu pro existující faktorové modely. Faktorová struktura u daného vzorku byla následně zjišťována metodou PAF s šikmým řešením Promax. Konvergentní validita byla zjišťována s využitím korelační analýzy a pro zhodnocení rozdílů z hlediska pohlaví a studijního průměru bylo použito testů Mann-Whitney a Kruskal-Wallis. Výsledky. Vnitřní konzistence pro celkový skór BPS se ukázala být adekvátní, položková analýza však vyloučila unidimenzionalitu škály. S využitím konfirmačních faktorových analýz byly testovány tři faktorové modely z předchozích výzkumů, avšak žádný z nich nevykázal dostatečnou shodu s daty. Metodou explorační faktorové analýzy bylo u českého vzorku následně identifikováno jako nejvhodnější třífaktorové řešení. Přestože se nepodařilo jeden z faktorů z matematického hlediska obhájit, jeho validita a konceptuální hodnota vzhledem k celkovému konstruktu BPS a dalším proměnným se ukazuje v rámci tohoto výzkumu jako opodstatněná. Výsledky studie naznačují, že faktorové řešení o minimálně třech faktorech přináší detailnější výsledky, pokud jde o vztah BPS k příbuzným konstruktům. Výsledky studie přinášejí doporučení pro další práci na vývoji škály tak, aby byl plně využit její výzkumný i diagnostický potenciál. Omezení studie. S ohledem na nereprezentativnost výzkumného vzorku je pro budoucí výzkum v této oblasti potřebné zahrnutí také dalších populačních souborů.

The compound originally known as TIC10 or ONC201 is a new anticancer drug developed by Oncoceutics, Inc. The agent's Investigational New Drug Application for phase I/II clinical studies has been recently approved by Food & Drug Administration. However, a Scripp Institute's group revealed that the compound structure given in all documents, including patents, was erroneous and applied for a patent protection for the correct structure. Chemistry backgrounds associated with this case is reviewed together with the relevant consequences regarding the intellectual property issue.

• Klíčová slova
• bosutinib,
• MeSH
• apoptóza MeSH
• chemické techniky analytické metody   využití   MeSH
• duševní vlastnictví * MeSH
• farmaceutická technologie MeSH
• isomerie * MeSH
• krystalografie rentgenová MeSH
• kvantitativní vztahy mezi strukturou a aktivitou MeSH
• lidé MeSH
• magnetická rezonanční tomografie MeSH
• příprava léků MeSH
• protein TRAIL MeSH
• protinádorové látky farmakokinetika   chemie   zásobování a distribuce   MeSH
• tyrosinkinasy * antagonisté a inhibitory   chemie   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

Quantitative structure-property/activity relationships (QSPRs/QSARs) are a tool (in silico) to rapidly predict various endpoints in general, and drug toxicity in particular. However, this dynamic evolution of experimental data (expansion of existing experimental data on drugs toxicity) leads to the problem of critical estimation of the data. The carcinogenicity, mutagenicity, liver effects and cardiac toxicity should be evaluated as the most important aspects of the drug toxicity. The toxicity is a multidimensional phenomenon. It is apparent that the main reasons for the increase in applications of in silico prediction of toxicity include the following: (i) the need to reduce animal testing; (ii) computational models provide reliable toxicity prediction; (iii) development of legislation that is related to use of new substances; (iv) filling data gaps; (v) reduction of cost and time; (vi) designing of new compounds; (vii) advancement of understanding of biology and chemistry. This mini-review provides analysis of existing databases and software which are necessary for use of robust computational assessments and robust prediction of potential drug toxicities by means of in silico methods.

• MeSH
• databáze faktografické * MeSH
• kvantitativní vztahy mezi strukturou a aktivitou * MeSH
• lidé MeSH
• nežádoucí účinky léčiv * MeSH
• počítačová simulace MeSH
• software MeSH
• testy toxicity MeSH
• výpočetní biologie * MeSH
• zvířata MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• zvířata MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• přehledy MeSH

The aim of this study was to compare the toxic effects of selected two- and three-ringed PAHs (naphthalene, phenanthrene, and anthracene) and their N-heterocyclic analogs with one (quinoline, acridine, and phenanthridine) or two (quinoxaline, phenazine, and 1,10-phenanthroline) nitrogen atoms on the survival and reproduction of Enchytraeus crypticus in artificial soil. Toxicity of compounds was recalculated to soil pore-water concentrations using the data of chemical analyses of 0.01 M CaCl(2) extracts of spiked soils. When toxicity was based on molar concentrations in pore water (μmol/L), it significantly increased with increasing K(ow) value. This relationship indicates nonpolar narcosis as the general toxicity mechanism of the tested compounds. In addition, significant correlation between the toxicity of PACs and their ionization potential has been identified by multidimensional QSAR models.

• MeSH
• akridiny toxicita   MeSH
• anthraceny chemie   toxicita   MeSH
• chinoliny toxicita   MeSH
• dusík toxicita   MeSH
• fenantreny chemie   toxicita   MeSH
• fenantroliny chemie   toxicita   MeSH
• kvantitativní vztahy mezi strukturou a aktivitou MeSH
• látky znečišťující půdu chemie   toxicita   MeSH
• Oligochaeta účinky léků   MeSH
• polycyklické aromatické uhlovodíky chemie   toxicita   MeSH
• půda analýza   MeSH
• rozmnožování účinky léků   MeSH
• zvířata MeSH
• Check Tag
• zvířata MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

In plants, oxysterols brassinosteroids (BR) and ecdysteroids (ES) can be found. BR act as plant hormones with a positive effect on growth, stress tolerance or senescence. Their mechanism of action is based on signal transduction via a membrane receptor cascade, with or without assistance of oxysterol-binding proteins. The role of ES as insect hormones in plants is unknown. ES are likely to show an antifeedant effect on herbivorous pests, but other as yet unknown roles in plants are not excluded. A range of affinity carriers with immobilized synthetic analogues of plant BS and ES were prepared. Using these carriers, some proteins with affinity to the oxysterols were separated from cytosol extracts of plants. The proteins were assessed by electrophoresis and identified by sequencing. One of them is an osmotin-like protein precursor known as a pathogenesis- related protein. Another protein, RuBisCO, is known as the key enzyme in the Calvine cycle of the dark phase of photosynthesis. The interactions of these proteins with the oxysterols remain unclear.

• MeSH
• chromatografie afinitní metody   využití   MeSH
• financování organizované MeSH
• fytosteroly analýza   farmakokinetika   MeSH
• kvantitativní vztahy mezi strukturou a aktivitou MeSH

• MeSH
• analgetika * farmakokinetika   chemie   klasifikace   toxicita   MeSH
• bolest farmakoterapie   MeSH
• jedy dějiny   MeSH
• kvantitativní vztahy mezi strukturou a aktivitou MeSH
• lidé MeSH
• nežádoucí účinky léčiv MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• přehledy MeSH