Hereditární angioedém (HAE) je charakterizován rekurentími atakami otoků a je spojen se sníženou hladinou a/nebo funkcí C1 inhibitoru (SERPING1), což vede k lokální nadprodukci bradykininu a následnému rozvoji angioedému. I v rodinách se stejnou mutací v SERPING1 se HAE projevuje s různou závažností. Genetická determinace této různorodosti je dosud neobjasněna. Projekt by měl vysvětlit, které genetické faktory přispívají k této variabilitě. S použitím cílené DNA-seq bude charakterizováno celkem 70 genů souvisejících s funkčností bradykininu u pacientů s různou závažností HAE. Další faktory, které mohou způsobovat rozdílnost fenotypu se týkají regulace genové exprese, což nemusí souviset přímo se změnami sekvencí těchto genů, ale spíše se změnami regulačních faktorů, které ovlivňují expresi jednotlivých genů. Proto budeme pomocí cíleného RNA-seq sledovat expresi vybraných genů (včetně SERPING1) v monocytech/makrofázích u vybrané skupiny pacientů. Unikátní kombinace genomických i transkriptomických dat by měla přispět k porozumění mechanismu angioedémů a cílenější medikaci.; Hereditary angioedema (HAE) is one of bradykinin-associated angioedema characterized by recurrent attacks of swelling. It is characterized by decreased level and/or function of C1 inhibitor (SERPING1), which results in local bradykinin overproduction and subsequent angioedema development. The severity of HAE in terms of frequency and extent of attacks varies from very mild to very serious even in families with the same SERPING1 mutation, but the genetic determination of this heterogeneity remains to be clarified. We would like to elucidate which genetic factors largely contribute to this variability. We will determine genetic background of patients with diverse severity of HAE in 70 genes associated with bradykinin function using targeted DNA-seq. Another explanation labours with disrupted regulation of gene expression. Thus expression of selected genes (incl. SERPING1) in patients' macrophages will be determined using RNA-seq in a defined set of patients. Unique combination of transcriptomic and genomic approaches may improve our knowledge in all bradykinin-mediated angioedema.

• Klíčová slova
• Next generation sequencing, genová exprese, gene expression, hereditary angioedema, hereditární angioedém, bradykinin, C1 inhibitor, SERPING1, asociační studie, sekvenování příští generace, bradykinin, c1 inhibitor, SERPING1, association study,

• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

• Publikační typ
• abstrakt z konference MeSH

• Publikační typ
• abstrakt z konference MeSH

• Publikační typ
• abstrakt z konference MeSH

Značná část lidských chorob má genetickou příčinu a pro úspěšnou léčbu je často nezbytné přesně určit, která mutace chorobu způsobuje. Identifikace kauzálních mutací však není vždy jednoznačná, a to i tehdy, máme-li k dispozici relevantní sekvence DNA. Moderní celogenomové metody odhalí řadu sekvenčních variant, u kterých není příčinná souvislost s chorobou zřejmá. Mnohé varianty ovlivňují genovou expresi změnou sestřihu pre-mRNA, ale tento efekt nemusí být odhalen, pokud nebylo již dříve prokázáno, že daná oblast obsahuje regulační elementy sestřihu (SRE). Jejich identifikace je proto klíčovým faktorem pro vyhodnocení vlivu takových mutací na vznik choroby. Projekt si klade za cíl lokalizovat funkční SRE a pokusit se nalézt obecná pravidla jejich výskytu v cílových sekvencích. Proto bude provedena systematická experimentální analýza vybraných oblastí genů, které jsou zodpovědné za vznik závažných lidských chorob. Získaná mapa míst náchylných k mutacím vyvolávajícím změny sestřihu bude využita jako pomocný nástroj pro diagnostiku aberantního sestřihu u nově identifikovaných mutací.; Significant proportion of human diseases is genetically determined and successful treatment is dependent on precise diagnosis of causal mutations. However, their identification is not always so unambiguous, although relevant sequence data is available. Modern genomic methods are able to uncover a considerable number of sequence variants with unknown impact on disease. Sequence variants frequently influence the gene expression through alteration of pre-mRNA splicing, but this effect can be hidden, if the splicing regulatory function of mutated regions was not proven in advance. The identification of splicing regulatory elements (SREs) is therefore a crucial step in evaluation of each mutation as potentially pathogenic. The aim of the project is to localize functional SREs and to try to define some rules for their occurrence by performing a systematic experimental analysis of ten regions in genes involved in disease development. Acquired „hot spot“ map of splicing affecting regions should act as an additional tool for diagnostics of aberrant splicing in newly identified gene variants.

• MeSH
• genetická predispozice k nemoci MeSH
• genetické nemoci vrozené genetika   MeSH
• lidé MeSH
• mutace genetika   MeSH
• sestřih RNA genetika   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• genetika, lékařská genetika
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

• Publikační typ
• abstrakt z konference MeSH

Základním kamenem laboratorní diagnostiky etiologie infekčních nemocí jsou postupy založené na kultivaci mikrobů. Stále více se však i v běžné klinické praxi uplatňují molekulárně biologické, na kultivaci nezávislé metody detekce mikroorganizmů, které jsou důležitým doplňkem konvenčních postupů a v některých případech se již staly zlatým diagnostickým standardem. Nejčastěji jsou používány metody založené na polymerázové řetězové reakci (PCR – polymerase chain reaction).

The practices based on microbe cultivation are the corner stone of laboratory diagnostics of infectious diseases etiology. However, cultivation-independent molecular methods for microorganism detection are increasingly being used in a routine clinical setting as an important complement to the conventional procedures and, in some cases, they have already become the golden diagnostic standard. The PCR-based methods are used the most frequently.

• MeSH
• bakteriální infekce * diagnóza   genetika   MeSH
• Cardiobacterium genetika   izolace a purifikace   MeSH
• DNA bakterií MeSH
• dospělí MeSH
• endokarditida diagnóza   etiologie   genetika   MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mykózy diagnóza   genetika   MeSH
• polymerázová řetězová reakce * MeSH
• Tropheryma genetika   izolace a purifikace   MeSH
• virové nemoci * diagnóza   genetika   MeSH
• Check Tag
• dospělí MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• kazuistiky MeSH
• přehledy MeSH

• MeSH
• ateroskleróza etiologie   prevence a kontrola   MeSH
• ezetimib terapeutické užití   MeSH
• heterozygot MeSH
• hodnocení rizik MeSH
• homozygot MeSH
• hyperlipoproteinemie typ II * diagnóza   genetika   terapie   MeSH
• hypolipidemika terapeutické užití   MeSH
• ischemická choroba srdeční prevence a kontrola   MeSH
• LDL-cholesterol metabolismus   MeSH
• lidé MeSH
• mutace MeSH
• rizikové faktory MeSH
• statiny terapeutické užití   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH
• přehledy MeSH

Familiární hypercholesterolemie (FH) je nejčastějším autosomálně dominantně dědičným onemocněním, které je charakterizováno snížením katabolizmu LDL-cholesterolu a předčasnou klinickou manifestací aterosklerotického postižení cév. Projekt MedPed (Make early diagnosis to Prevent early deaths) má za cíl diagnostikovat pacienty s FH co nejdříve, aby co nejvíce profitovali ze včasně zahájené terapie a nedospěli k předčasné kardiovaskulární příhodě. V současné době (k 31. 10. 2016) evidujeme v celonárodní české databázi 6 947 pacientů s FH z 5 223 rodin. Při prevalenci FH 1 : 250 to představuje 17,4 % z celkového očekávaného počtu pacientů s FH v ČR. Určení mutace zodpovědné za FH, k němuž je nyní v ČR využívána moderní technologie sekvenování nové generace, vede ke zpřesnění diagnostiky, zvýšení spolupráce ze strany pacientů a především usnadnění kaskádovitého screeningu v rodinách. Přestože patříme z hlediska záchytu FH k nejúspěšnějším zemím na světě, většina pacientů zůstává stále nediagnostikována. Navíc se ukazuje, že při současných léčebných možnostech většina pacientů s FH nedosahuje cílových hodnot. V tomto směru jsou velkým příslibem nově schválené léky, inhibitory PCSK9, které budou snad v nejbližší době k dispozici i v České republice pro vybrané vysoce rizikové pacienty s FH.

Familial hypercholesterolemia (FH) is the most frequent autosomal dominant hereditary disease which is characterized by a decreased LDL-cholesterol catabolism and early clinical manifestation of atherosclerosis affecting blood vessels. The MedPed (Make early diagnosis to Prevent early deaths) project aims to diagnose patients with FH as early as possible, so that they can profit the most from a therapy started in a timely manner and avoid premature cardiovascular events. Currently, as of 31 October 2016, the Czech national database keeps records of 6 947 patients with FH from 5 223 families. Considering the prevalence of FH equalling 1 : 250, this represents 17.4 % of the overall expected number of patients with FH in the Czech Republic. Determining the mutation responsible for FH, now using a next generation sequencing technology in the Czech Republic, brings with it higher diagnostic accuracy, better cooperation of patients and in particular facilitation of cascade screening in families. Although we are among the most successful countries in the world with regard to FH detection, the majority of patients are still undiagnosed. Moreover, as it turns out, most FH patients do not reach the target values with the current therapeutic possibilities. In this regard the newly approved hypolipidemic drugs, PCSK9 inhibitors, to be hopefully available also in the Czech Republic in the near future for chosen patients with FH at high risk, hold great promise.

• Klíčová slova
• projekt MedPed,
• MeSH
• časná diagnóza MeSH
• diferenciální diagnóza MeSH
• hyperlipoproteinemie typ II * diagnóza   farmakoterapie   genetika   MeSH
• LDL-cholesterol analýza   škodlivé účinky   MeSH
• lidé MeSH
• mutace genetika   MeSH
• plošný screening metody   MeSH
• rizikové faktory MeSH
• vrozené poruchy metabolismu tuků MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

Nedávné studie ukázaly, že prevalence familiární hypercholesterolemie (FH) je přibližně dvojnásobná oproti dřívějším předpokladům a onemocnění tak postihuje přibližně jednoho z 250 jedinců obecné populace. Jedná se tedy o nejčastější vrozené metabolické onemocnění vůbec. V důsledku geneticky podmíněné poruchy v metabolizmu LDL-cholesterolu dochází k jeho hromadění v cirkulaci a ve tkáních, což vede předčasnému rozvoji aterosklerózy. Neléčení jedinci mohou mít infarkt myokardu ve 3. nebo 4. dekádě života, až v jedné třetině případů s fatálním koncem. Onemocnění je celosvětově nedostatečně diagnostikováno a léčeno. V České republice běží již od roku 1998 projekt MedPed, který se soustředí na včasnou diagnostiku FH s cílem zahájit léčbu co nejdříve, a snížit tak u postižených jedinců riziko předčasné klinické manifestace ischemické choroby srdeční a předčasného úmrtí. Důležitým bodem projektu je kaskádovitý screening mezi příbuznými pacientů s FH. V celonárodní databázi evidujeme již více než 6 350 pacientů s FH, což představuje asi 16 % z očekávaného počtu pacientů v České republice. Takový záchyt nás řadí mezi nejúspěšnější země na světě, ale i s ohledem na příchod nových terapeutických možností zůstává detekce a včasné zahájení léčby nemocných s FH v centru naší pozornosti. Klíčová slova: familiární hypercholesterolemie – kardiovaskulární riziko – kaskádovitý screening – MedPed

Recent studies have revealed the prevalence of familial hypercholesterolemia (FH) is approximately twice higher than previously estimated and, thus, the disease affects one in 250 persons from the general population. Therefore FH remains the most frequent inherited metabolic disorder. Due to the genetic defect LDL-cholesterol accumulates both in the plasma and tissues leading to premature and accelerated atherosclerosis. Untreated patients with FH might suffer from myocardial infarction in the third or fourth decade, one third of these events being fatal. The disease is under­diagnosed and undertreated worldwide. In the Czech Republic the MedPed project focused on early diagnosis and initiation of proper treatment of FH aiming at lowering of the above mentioned risks was initiated in 1998. A crucial part of the project is so called cascade screening among the relatives of identified FH probands. There are 6,350 registered FH subjects in the nationwide registry, which represents 16% of the expected number of FH patients in the Czech Republic. This result of screening efforts ranks among the top countries in the world, however, also in spite of the recent expansion of FH treatment options early detection and initiation of treatment of FH remains in the centre of our attention. Key words: familial hypercholesterolemia – cardiovascular risk – cascade screening – MedPed

• Klíčová slova
• kaskádovitý screening,
• MeSH
• anamnéza MeSH
• časná diagnóza * MeSH
• fenotyp MeSH
• genetické testování MeSH
• hodnocení rizik MeSH
• hyperlipoproteinemie typ II * diagnóza   epidemiologie   genetika   MeSH
• LDL-cholesterol MeSH
• lidé MeSH
• plošný screening * metody   organizace a řízení   MeSH
• rodokmen MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH
• přehledy MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH