KRAS mutation testing
Dotaz
Zobrazit nápovědu
Cílená léčba se stává součástí standardních terapeutických postupů zhoubných nádorů. V případě karcinomu tlustého střeva a konečníku je to nejčastěji terapie pomocí monoklonálních anti-EGFR protilátek (cetuximab a panitumumab). Aktivační somatické mutace v kodonech 12 a 13 exonu 2 genu KRAS jsou negativním prediktivním faktorem léčebné odpovědi na anti-EGFR terapii u pacientů s metastatickým kolorektálním karcinomem. V České republice se provádí vyšetření genu KRAS v několika referenčních laboratořích. V roce 2009 bylo v těchto laboratořích provedeno 2580 vyšetření mutačního statutu genu KRAS, z nichž bylo 60,2 % případů nemutovaných, tedy wild-type KRAS. Na příkladu jedné laboratoře je demonstrována logistika vyšetřování mutačního statutu genu KRAS. Stratifikace pacientů s metastatickým kolorektálním karcinomem zvažovaných pro cílenou anti-EGFR terapii na základě přítomnosti mutací v kodonech 12 a 13 genu KRAS je dnes standardním postupem. Laboratoř provádějící toto vyšetření by měla postupovat v souladu s doporučeními odborných společností.
Targeted therapy has become an integral part of treatment procedures of malignant tumors. Colorectal carcinomas are frequently targeted with monoclonal anti-EGFR antibodies (cetuximab and panitumumab). Activating somatic mutations in codons 12 and 13 of the exon 2 of KRAS gene are considered negative predictive factors of response to anti-EGFR therapy in patients with metastatic colorectal cancer. In the Czech Republic, evaluation of mutational status of KRAS gene is performed in several referral laboratories. In 2009, these laboratories performed 2580 tests of the KRAS mutational status – out of these, 60.2% cases reported non-mutated, wild-type KRAS. In one of the referral laboratories, we demonstrate the logistics of KRAS testing procedure. Stratification of patients with metastatic colorectal tumors based on their KRAS mutational status has evolved to a standard procedure. Laboratories performing these methods shall therefore adhere to the recommendations of the professional and accredited societies.
- Klíčová slova
- standardizace diagnostických procesů, prediktivní molekulární onkologie, anti-EGFR terapie, cílená léčba,
- MeSH
- geny ras genetika MeSH
- kolorektální nádory farmakoterapie genetika patologie sekundární MeSH
- lidé MeSH
- monoklonální protilátky terapeutické užití MeSH
- mutace MeSH
- protinádorové látky terapeutické užití MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
Diferenciální diagnostika pankreatických solidních tumorů pomocí EUS-FNA je asi v 10–15 % případů náročná. Slibnou metodou, která v těchto případech pomáhá rozlišit chronickou pankreatitidu a karcinom, je vyšetření bodové mutace proto-onkogenu KRAS. Doposud však není zavedená do klinické praxe. Cílem zkoumání bylo stanovení senzitivity testu KRAS s použitím různých typů vzorků pacientů s tumory pankreatu a testování vlivu přítomnosti mutace KRAS na prognózu přežití těchto pacientů. 147 pacientů podstoupilo EUS-FNA vyšetření pankreatického tumoru doplněné o odběr vzorku krve s následnou separací plazmy pro detekci cirkulující tumorové DNA. Část bioptického vzorku byla ponechána nativní ve stabilizačním roztoku a část byla zpracována do cytologického nátěru. Vzorky (nativní aspiráty, cytologické nátěry, plazma) byly vyšetřeny na přítomnost mutace genu KRAS metodou heteroduplexní analýzy pomocí denaturační kapilární elektroforézy. V souboru 147 pacientů s ložiskovým procesem pankreatu byl diagnostikován 118x karcinom, 26x chronická pankreatitida, 3x neuroendokrinní tumor. Celkem bylo vyšetřeno 147 nativních aspirátů, 118 cytologických nátěrů a 94 vzorků plazmy. Ve skupině pacientů s karcinomem pankreatu bylo nejvyšší senzitivity vyšetření mutace KRAS dosaženo při použití cytologických preparátů, kdy byla mutace detekována v 90 % (106/118) vzorků. Při použití nativních buněčných aspirátů byla mutace detekována v 78 % (92/118) a vyšetření plazmy bylo pozitivní ve 27 % (24/90) případů. U čtyř pacientů s chronickou pankreatitidou byla detekována mutace KRAS, ačkoliv u žádného z nich nebyl karcinom potvrzen cytologicky. U dvou z těchto pacientů byl v dalším průběhu potvrzen karcinom, jeden pacient zemřel předčasně na komplikace alkoholového deliria a poslední byl indikován k radikálnímu chirurgickému zákroku. Vyšetření mutace KRAS lze provádět u všech pacientů podstupujících EUS-FNA, přičemž nejvhodnějším typem vzorků pro toto vyšetření jsou cytologické preparáty. Vyšetření KRAS je vhodné aplikovat ve skupině pacientů s nejasnou diferenciální diagnostikou, zvláště pak u nemocných s chronickou pankreatitidou, kde metoda umožňuje identifikovat časný karcinom pankreatu v nepřehledném terénu zánětlivých změn. Klíčová slova: karcinom pankreatu, chronická pankreatitida, mutace KRAS , EUS-FNA
Differential diagnosis of solid pancreatic masses using EUS FNA is in 10−15 % of cases still challenging. Promising method, which helps to distinguish between chronic pancreatitis and cancer, is point mutations of the proto-oncogene KRAS test. This method is not established in routine clinical practice yet. Objectives were the determination of the sensitivity of the KRAS assay using various kinds of samples of patients with pancreatic mass and testing the effect of the presence of KRAS mutations on the prognosis of survival. 147 patients underwent EUS-FNA examination of pancreatic mass, accompanied by blood sampling with subsequent separation of plasma for the detection of circulating tumor DNA. Part of biopsy sample was left native in a stabilizing solution and part as cytological smear. Samples (native aspirates, cytological smears, plasma) were examined for the presence of KRAS mutation by heteroduplex analysis, denaturing capillary electrophoresis. Among 147 patients with pancreatic masses, 118 were diagnosed as a cancer, 26 chronic pancreatitis, 3 neuroendocrine tumor. In total 147 native aspirates, 118 cytological smears and 94 plasma samples were examined. The highest sensitivity of KRAS mutation was reached in the group of pancreatic cancer patients using cytology, in which 90 % of KRAS mutation was detected (106/118 of the samples). When using the native cellular aspirates, mutation was detected in 78 % (92/118 samples), and examination of plasma was positive in 27 % (24/90 samples). In four patients with chronic pancreatitis KRAS mutations was detected, although none has been cytologically confirmed as a cancer. Two of these four patients were confirmed in the course of the disease as a cancer, one patient died because of alcoholic delirium and the last one was indicated for surgery recently. Examination of KRAS mutations can be performed in all patients undergoing EUS-FNA, with the cytology being the most reliable type of sample for genetic tests. KRAS examination would be reasonable to introduce into routine clinical practice in a group of patients with unclear differential diagnosis of chronic pancreatitis, especially in those with suspicion of cancer in inflammatory terrain. Kexwords: pancreatic cancer, chronic pancreatitis, KRAS mutation , EUS-FNA
- MeSH
- biopsie tenkou jehlou pod endosonografickou kontrolou MeSH
- chronická pankreatitida * diagnóza genetika MeSH
- cytodiagnostika MeSH
- diferenciální diagnóza MeSH
- dospělí MeSH
- genetické testování MeSH
- Kaplanův-Meierův odhad MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mutace MeSH
- mutační analýza DNA MeSH
- nádory slinivky břišní * diagnóza genetika MeSH
- prediktivní hodnota testů MeSH
- protoonkogenní proteiny p21(ras) * genetika MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- senzitivita a specificita MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
- srovnávací studie MeSH
Recent retrospective evidence from several randomized studies has established that advanced colorectal cancer patients with tumors harboring a mutation in the KRAS gene do not derive benefit from the administration of epidermal growth factor receptor-directed monoclonal antibodies, such as cetuximab or panitumumab. This represents a paradigm-changing event and will have substantial impact on current and future anticancer drug development. These results add to the economic and ethical considerations involved in the development of novel targeted therapies and should increase our scrutiny of mechanisms of resistance and predictive biomarkers while in earlier developmental stages. In this article we will review the available clinical data, discuss the potential implications for future drug development in colorectal cancer, and provide a comprehensive overview of the technical aspects of KRAS mutation testing. In particular we aimed at enumerating the available procedures for mutation detection and their main characteristics, as well as comparing them from a clinical feasibility standpoint. While the true specificity and sensitivity of these methods have yet to be fully characterized, a better understanding of the differences between tests will be critical so that clinicians and pathologists can fully integrate this testing into the routine care of patients with colorectal cancer.
- MeSH
- chemorezistence genetika MeSH
- erbB receptory antagonisté a inhibitory MeSH
- kolorektální nádory farmakoterapie MeSH
- lidé MeSH
- monoklonální protilátky farmakologie MeSH
- mutace MeSH
- mutační analýza DNA metody MeSH
- protoonkogenní proteiny genetika MeSH
- racionální návrh léčiv MeSH
- ras proteiny genetika MeSH
- senzitivita a specificita MeSH
- výběr pacientů MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
Úvod: Nízkomolekulární inhibitory tyrozinkinázy EGFR erlotinib a gefitinib prokázaly účinnost u některých skupin nemocných s nemalobuněčným karcinomem plic (NSCLC), v době do progrese a přežívání nemocných. Cíl: Cílem studie bylo nepřímé porovnání obou preparátů ve vztahu ke genetickým prediktorům: senzitivním mutacím genu pro EGFR, mutacím genu KRAS, morfologickým typům novotvarů a kuřáckým zvyklostem nemocných. Soubory a metodika: Autoři vyšetřili výše uvedené mutace u 367 nemocných s NSCLC, 280 nemocných léčených v rámci EAP gefitinibem a 87 nemocných léčených erlotinibem. Genové mutace byly vyšetřovány pomocí PCR fragmentační analýzy a denaturační pro kapilární elektroforézy. Kaplan-Meyerovy křivky byly konstruovány pro čas do progrese a celkové přežití u dvou uvedených léčebných schémat po rozdělení do podskupin na základě histologického typu nádoru, kuřáckého statusu a výskytu mutace. Výsledky: V žádné ze sledovaných podskupin nebyl nalezen statisticky významný rozdíl mezi erlotinibem a gefitinibem v době do progrese nemoci. Celková doba přežití byla delší při léčbě erlotinibem (erlotinib-gefitinib MST 281 vs 207 dní, p = 0,0076, HR = 1,4851,95% CI 1,1018 - 1,8852). Ve skupině nemocných léčených erlotinibem bylo celkové přežití významně delší u nekuřáků (p MST erlotinib nedosažen, gefitinib 268 dní, p = 0,0036), u adenokarcinomů (MST erlotinib vs gefitinib 562 vs 231 dní, p = 0,0046), u EGFR negativních adenokarcinomů (MST erlotinib vs gefitinib 228 vs 119 dní, p = 0,0162) a u nekuřáků se st. nemoci IV (erlotinib vs gefitinib MST erlotinibu nedosažen, gefitinib 322 dní, p = 0,0249). Naproti tomu celkové přežití KRAS pozitivních epidermoidních karcinomů je významně delší při léčbě gefitinibem (MST erlotinib vs. gefitinib 64 vs 252 dní, p = 0,0122). Závěr: Výsledky srovnávací studie dokládají delší přežití nemocných léčených erlotinibem, rozdíly je možno dle literárních údajů vysvětlit výhodnější farmakokinetikou erlotinibu. Farmakokinetiku erlotinibu může nepříznivě ovlivnit kouření. Účinnost obou preparátů se jeví srovnatelná u nemocných s pozitivními mutacemi EGFR, lepší účinnost gefitinibu u KRAS pozitivních epidermoidních karcinomů by měla být potvrzena nebo vyloučena další studií.
Introduction: Low-molecular-weight tyrosine-kinase inhibitors (TKIs) gefitinib and erlotinib have demonstrated efficacy in some patients with non-small cell lung cancer (NSCLC) in terms of time to progression as well as the overall survival. Aims: The main purpose of the study was indirect comparison of both therapies in relation to established molecular-genetic predictors (activating mutations in EGFR and KRAS genes), morphology of the tumours and patients' smoking status. Patients and Methods: Samples from a total of 367 NSCLC patients were tested for mutations. Of those, 280 atients were treated within the gefitinib EAP programme and 87 with erlotinib. Mutations were analyzed using a combination of PCR fragment analysis and denaturing capillary electrophoresis. Kaplan-Meier survival curves were derived for the time to progression and overall survival for the two therapies after grouping by parameters such as tumour type, smoking status and mutation status. Results: No statistical difference was found when comparing time to progression for the two therapies in any of the subgroups. In a comparison without subgrouping, the overall survival for erlotinib was longer than for getinib (281 vs. 207 days, p = 0.0076, HR = 1.4851, 95 % CI 1.1018-1.8852). Survival with erlotinib was also longer for non-smokers (mean not reached for erlotinib vs. 268 days for gefitinib, p = 0.0036), for unselected adenocarcinomas (562 vs. 231 days, p = 0.0046), for EGFR-negative adenocarcinomas (228 vs. 119 days, p = 0.0162) and for non-smokers in stage IV disease (mean not reached for erlotinib vs. 322 days for gefitinib, p = 0.0249). On the other hand, overall survival for gefitinib was longer in case of KRAS-positive epidermoid tumours (erlotinib vs. gefitinib 64 vs. 252 days, p = 0.0122). Conclusions: The results of this indirect comparison suggest longer survival for patients treated with erlotinib. According to the literature, the difference may be attributed to more favourable pharmacokinetics of erlotinib. However, erlotinib pharmacokinetics may be negatively influenced by smoking. EGFR-positive patients have comparable survival with both therapies. Better survival of KRAS-positive patients with epidermoid tumours tieated with gefitinib should be further examined due to limited sampling.
- MeSH
- amplifikace genu genetika MeSH
- analýza přežití MeSH
- chinazoliny aplikace a dávkování MeSH
- erbB receptory antagonisté a inhibitory terapeutické užití MeSH
- financování organizované MeSH
- geny erbB genetika účinky léků MeSH
- lidé MeSH
- nemalobuněčný karcinom plic diagnóza genetika klasifikace MeSH
- onkogenní protein p21(ras) genetika MeSH
- progrese nemoci MeSH
- staging nádorů metody MeSH
- tyrosinkinasy antagonisté a inhibitory terapeutické užití MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
Whole genome amplification replicates the entire DNA content of a sample and can thus help to circumvent material limitations when insufficient DNA is available for planned genetic analyses. However, there are conflicting data in the literature whether whole genome amplification introduces bias or reflects precisely the spectrum of starting DNA. We analyzed the origins of discrepancies in KRAS (Kirsten rat sarcoma viral oncogene homolog gene) mutation detection in six of ten samples amplified using the GenomePlex® Tissue Whole Genome Amplification kit 5 (WGA5; Sigma-Aldrich, St. Louis, MO, USA) and KRAS StripAssay® (KRAS SA; ViennaLab Diagnostics, Vienna, Austria). We undertook reextraction, reamplification, retyping, authentication, reanalysis, and reinterpretation to determine whether the discrepancies originated during the preanalytical, analytical, and/or interpretative phase of genotyping. We conclude that a combination of glass slide/sample heterogeneity and biased amplification due to stochastic effects in the early phases of whole genome amplification (WGA) may have adversely affected the results obtained. Our findings are relevant for both forensic genetics testing and massively parallel sequencing using preamplification.
- MeSH
- genom lidský genetika MeSH
- genomika metody MeSH
- genotypizační techniky metody MeSH
- geny ras genetika MeSH
- kolorektální nádory genetika MeSH
- lidé MeSH
- sekvenční analýza DNA MeSH
- techniky amplifikace nukleových kyselin metody MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
Epidermal growth factor receptor tyrosine kinase inhibitors (EGFR-TKIs) represent novel effective agents approved for the treatment of patients with advanced-stage NSCLC. KRAS mutations have been reported as a negative prognostic and predictive factor in patients with NSCLC treated with EGFR-TKIs. Several studies have recently shown that statins can block tumour cell growth, invasion and metastatic potential. We analysed clinical data of 67 patients with locally advanced (IIIB) or metastatic stage (IV) NSCLC harbouring Kirsten rat sarcoma viral oncogene (KRAS) mutation treated with erlotinib or gefitinib. Twelve patients were treated with combination of EGFR-TKI and statin and 55 patients were treated with EGFR-TKI alone. Comparison of patients' survival (progression-free survival (PFS) and overall survival (OS)) according to the treatment used was performed using the Gehan-Wilcoxon test. The median of PFS and OS for patients treated with EGFR-TKI alone was 1.0 and 5.4 months compared to 2.0 and 14.0 months for patients treated with combination of EGFR-TKI and statin (p = 0.025, p = 0.130). In conclusion, the study results suggest significant improvement of PFS for patients treated with combination of statin and EGFR-TKI, and the difference in OS was not significant.
- MeSH
- adenokarcinom farmakoterapie genetika patologie MeSH
- chinazoliny aplikace a dávkování MeSH
- erbB receptory antagonisté a inhibitory genetika MeSH
- erlotinib MeSH
- inhibitory proteinkinas aplikace a dávkování MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mutace MeSH
- nemalobuněčný karcinom plic farmakoterapie genetika patologie MeSH
- přežití bez známek nemoci MeSH
- prognóza MeSH
- protoonkogenní proteiny genetika MeSH
- ras proteiny genetika MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- staging nádorů MeSH
- statiny aplikace a dávkování MeSH
- Check Tag
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
The utility of KRAS mutations in plasma circulating cell-free DNA (cfDNA) samples as non-invasive biomarkers for the detection of pancreatic cancer has never been evaluated in a large case-control series. We applied a KRAS amplicon-based deep sequencing strategy combined with analytical pipeline specifically designed for the detection of low-abundance mutations to screen plasma samples of 437 pancreatic cancer cases, 141 chronic pancreatitis subjects, and 394 healthy controls. We detected mutations in 21.1% (N=92) of cases, of whom 82 (89.1%) carried at least one mutation at hotspot codons 12, 13 or 61, with mutant allelic fractions from 0.08% to 79%. Advanced stages were associated with an increased proportion of detection, with KRAS cfDNA mutations detected in 10.3%, 17,5% and 33.3% of cases with local, regional and systemic stages, respectively. We also detected KRAS cfDNA mutations in 3.7% (N=14) of healthy controls and in 4.3% (N=6) of subjects with chronic pancreatitis, but at significantly lower allelic fractions than in cases. Combining cfDNA KRAS mutations and CA19-9 plasma levels on a limited set of case-control samples did not improve the overall performance of the biomarkers as compared to CA19-9 alone. Whether the limited sensitivity and specificity observed in our series of KRAS mutations in plasma cfDNA as biomarkers for pancreatic cancer detection are attributable to methodological limitations or to the biology of cfDNA should be further assessed in large case-control series.
- MeSH
- antigen CA-19-9 krev MeSH
- cirkulující nádorová DNA krev genetika MeSH
- duktální karcinom slinivky břišní krev genetika patologie MeSH
- fenotyp MeSH
- frekvence genu MeSH
- genetická predispozice k nemoci MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mutace * MeSH
- mutační analýza DNA MeSH
- nádorové biomarkery krev genetika MeSH
- nádory slinivky břišní krev genetika patologie MeSH
- pilotní projekty MeSH
- prediktivní hodnota testů MeSH
- protoonkogenní proteiny p21(ras) krev genetika MeSH
- reprodukovatelnost výsledků MeSH
- senioři MeSH
- staging nádorů MeSH
- studie případů a kontrol MeSH
- Check Tag
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- multicentrická studie MeSH
- validační studie MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
- Slovenská republika MeSH
BACKGROUND: The mutation status of the BRAF and KRAS genes has been proposed as prognostic biomarker in colorectal cancer. Of them, only the BRAF V600E mutation has been validated independently as prognostic for overall survival and survival after relapse, while the prognostic value of KRAS mutation is still unclear. We investigated the prognostic value of BRAF and KRAS mutations in various contexts defined by stratifications of the patient population. METHODS: We retrospectively analyzed a cohort of patients with stage II and III colorectal cancer from the PETACC-3 clinical trial (N = 1,423), by assessing the prognostic value of the BRAF and KRAS mutations in subpopulations defined by all possible combinations of the following clinico-pathological variables: T stage, N stage, tumor site, tumor grade and microsatellite instability status. In each such subpopulation, the prognostic value was assessed by log rank test for three endpoints: overall survival, relapse-free survival, and survival after relapse. The significance level was set to 0.01 for Bonferroni-adjusted p-values, and a second threshold for a trend towards statistical significance was set at 0.05 for unadjusted p-values. The significance of the interactions was tested by Wald test, with significance level of 0.05. RESULTS: In stage II-III colorectal cancer, BRAF mutation was confirmed a marker of poor survival only in subpopulations involving microsatellite stable and left-sided tumors, with higher effects than in the whole population. There was no evidence for prognostic value in microsatellite instable or right-sided tumor groups. We found that BRAF was also prognostic for relapse-free survival in some subpopulations. We found no evidence that KRAS mutations had prognostic value, although a trend was observed in some stratifications. We also show evidence of heterogeneity in survival of patients with BRAF V600E mutation. CONCLUSIONS: The BRAF mutation represents an additional risk factor only in some subpopulations of colorectal cancers, in others having limited prognostic value. However, in the subpopulations where it is prognostic, it represents a marker of much higher risk than previously considered. KRAS mutation status does not seem to represent a strong prognostic variable.
- MeSH
- kolorektální nádory genetika mortalita patologie MeSH
- lidé MeSH
- mutace * MeSH
- prognóza MeSH
- protoonkogenní proteiny B-raf genetika MeSH
- protoonkogenní proteiny genetika MeSH
- ras proteiny genetika MeSH
- recidiva MeSH
- retrospektivní studie MeSH
- staging nádorů MeSH
- stupeň nádoru MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
U nádorů gastrointestinálního traktu dnes vedle stanovení histologické diagnózy, grade a stage hraje zásadní roli rovněž tzv. prediktivní testování. To slouží zejména k identifikaci molekulárních cílů pro moderní onkologickou terapii. U karcinomů jícnu a žaludku je dnes standardem vyšetření exprese a amplifikace HER2, exprese proteinů mismatch repair (MMR) systému a vyšetření exprese PD-L1. U karcinomu žaludku se v blízké budoucnosti testování rozšíří o další markery, zejména exprese claudinu 18.2 či receptoru FGFR2a. U kolorektálního karcinomu je standardem prediktivního vyšetření stanovení mutací RAS (KRAS a NRAS), BRAF a dále zhodnocení mikrosatelitní instability, jen vzácně lze nalézt rovněž terapeuticky cílitelné genové fúze. U karcinomu pankreatu se lze setkat s případy deficience MMR, mutacemi BRCA1/2, zcela raritně lze identifikovat další cílitelné aberace. U nádorů žlučníku a žlučových cest hledáme zejména mutace IDH1 a IDH2, fúze a mutace genu FGFR2, amplifikace či mutace HER2, mutace BRAF či mutace BRCA1/2. Všechny výsledky by měly být projednány v rámci molekulárního tumor boardu.
In addition to the histological diagnosis, grade and stage, predictive testing plays a crucial role in gastrointestinal tumours today. This is mainly used to identify molecular targets for modern cancer therapy. In esophageal and gastric cancers, HER2 expression and amplification, mismatch repair (MMR) system protein deficiency and PD-L1 expression are tested routinely. In colorectal cancer, it is namely detection of RAS (KRAS and NRAS) and BRAF mutations, as well as the assessment of microsatellite instability; targetable gene fusions are found rarely only. In pancreatic cancer, cases of MMR deficiency, BRCA1/2 mutations and other targetable aberrations can be identified quite rarely. In gallbladder and biliary tract cancers, we are mainly looking for IDH1 and IDH2 mutations, FGFR2 gene fusions and mutations, HER2 amplifications or mutations, as well as mutations of BRAF or BRCA1/2. All results should be discussed within the molecular tumor board.
- MeSH
- diagnostické techniky molekulární MeSH
- gastrointestinální nádory * diagnóza genetika klasifikace MeSH
- genetické testování MeSH
- lidé MeSH
- mutace genetika MeSH
- nádorové biomarkery * genetika MeSH
- prediktivní hodnota testů MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
- přehledy MeSH
The role of KRAS mutations in molecular targeted therapy by epidermal growth factor receptor tyrosine kinase inhibitors (EGFR-TKIs) in non-small cell lung cancer (NSCLC) has not been fully understood. The present investigation is aimed at an elucidation of the role of specific KRAS mutation types in predicting outcomes of patients with advanced NSCLC receiving EGFR-TKI therapy. Initially, 448 NSCLC patients were tested for the presence of KRAS mutations, to obtain frequencies of specific KRAS mutation types. Subsequently, the clinical outcome of treatment was evaluated in a subgroup of 38 KRAS-positive patients receiving EGFR-TKI therapy. KRAS mutations were detected in 69 of 448 patients (15.4%), mostly in smokers (17.86% vs. 5.8%, P = 0.0048), and appeared more frequently in adenocarcinomas than in squamous cell NSCLC or NSCLC that is not otherwise specified (21% vs. 6.99% vs. 4.4%, P = 0.0004). The most frequent type of KRAS mutation was G12C. The progression-free survival (PFS) was doubled in a group of non-G12C patients compared with that of the G12C group (9.0 wk vs. 4.3 wk, P = 0.009). The overall survival (OS) was not significantly different between non-G12C and G12C groups (12.1 wk vs. 9.3 wk, P = 0.068). The G12C KRAS mutation is a strong negative predictor for EGFR-TKI treatment, whereas other KRAS mutation types have not negatively predicted treatment efficacy compared with that for the wild-type KRAS genotype.
- MeSH
- biomarkery farmakologické metabolismus MeSH
- chemorezistence genetika MeSH
- cystein genetika MeSH
- dospělí MeSH
- erbB receptory antagonisté a inhibitory MeSH
- glycin genetika MeSH
- inhibitory proteinkinas terapeutické užití MeSH
- kohortové studie MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- missense mutace fyziologie MeSH
- nádorové biomarkery genetika fyziologie MeSH
- nádory plic diagnóza farmakoterapie genetika MeSH
- nemalobuněčný karcinom plic diagnóza farmakoterapie genetika MeSH
- prognóza MeSH
- protinádorové látky terapeutické užití MeSH
- protoonkogenní proteiny genetika metabolismus fyziologie MeSH
- ras proteiny genetika metabolismus fyziologie MeSH
- senioři MeSH
- studie případů a kontrol MeSH
- substituce aminokyselin fyziologie MeSH
- tyrosinkinasy antagonisté a inhibitory MeSH
- výsledek terapie MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- hodnotící studie MeSH
- práce podpořená grantem MeSH