Phenotypic screening
Dotaz
Zobrazit nápovědu
Celiakie je nadále diagnostikována v české populaci nedostatečně často a naopak často pozdě. Příčinou je změna fenotypu choroby v posledních desetiletích. Střevní příznaky dominují jen u malých dětí. U starších dětí, mladistvých a zejména u dospělých převládají mimostřevní (atypické) příznaky. Nejdůležitější opatření k zlepšení současného stavu je cílený screening zaměřený na rizikové skupiny a choroby, podezřelé symptomy a přidružené autoimunitní choroby. Dvoustupňový screening doporučuje u probandů těchto skupin v první etapě stanovení sérových autoprotilátek k tkáňové transglutamináze ve třídě IgA (AtTGA-IgA) a celkového IgA. Při selektivním deficitu IgA se stanoví AtTGA-IgG. Pozitivní sérologie indikuje druhou etapu: histologické vyšetření perorální biopsie sliznice tenkého střeva (duodena). Přijetí tohoto programu může významně zlepšit současnou situaci. Jeho hlavní výstupy zahrnují: časnou diagnostiku, terapii a dispenzarizaci, odhalení mimostřevních forem, zjištění skutečné prevalence celiakie v České republice, prevenci komplikací, omezení a lepší kontrolu přidružených autoimunitních chorob, zlepšení kvality života celiaků a úsporu prostředků zdravotního a sociálního pojištění.
Celiac disease in Czech population remains diagnosed infrequently and at a late stage. The altered phenotype of the disease is the main cause. Intestinal symptoms dominate in small children only. Extraintestinal (atypical) symptoms are observed with increased frequency in older children, adolescents and particularly in adults. Targeted screening program aimed at risk groups and diseases, suspicious symptoms and associated autoimmune diseases represents the most important measure to improve the present situation. The two-step program is recommended in subjects of individual groups. The first step includes determination of IgA-serum antibodies to tissue transglutaminase (AtTGA-IgA) and total IgA. In isolated IgA deficiency AtTGA-IgG are followed. Positive serology indicates the second step, i.e. peroral biopsy of small-intestinal (duodenal) mucosa. Important outcomes of this approach include: early diagnosis, therapy and follow-up, recognition of extraintestinal forms, the real prevalence of celiac disease in Czech Republic, prevention of complications, decrease and better control of associated autoimmune diseases, improved quality of life for celiacs as well as savings of health and social insurance payments.
- MeSH
- autoprotilátky diagnostické užití krev MeSH
- biopsie metody MeSH
- celiakie diagnóza MeSH
- lidé MeSH
- plošný screening metody MeSH
- tenké střevo patologie MeSH
- transglutaminasy imunologie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
- MeSH
- fenotyp MeSH
- imunoenzymatické techniky MeSH
- lidé MeSH
- novorozenec MeSH
- plošný screening MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- novorozenec MeSH
[Screening of the neonatal glycemia and its pitfalls]
V prvních hodinách po porodu dochází k přirozenému poklesu hladiny plazmatické glukózy. Vlivem metabolické a hormonální adaptace dochází u většiny novorozenců časně k normalizaci hodnot glykemie. U rizikových skupin novorozenců však může být schopnost této fyziologické adaptace narušena. Již v minulosti byly publikovány poznatky o spojitosti mezi hypoglykemií v novorozeneckém období a možným následným trvalým neurologickým deficitem. Možná proto je měření glykemie jedním z nejčastějších laboratorních vyšetření realizovaných na novorozeneckých odděleních. Celosvětově však neexistují jednotná doporučení ke screeningu a terapii novorozenecké hypoglykemie. Interpretace klinických studií, s ohledem na hodnotu glykemie a případný nepříznivý neurologický outcome, je velmi omezená. Hlavním důvodem je metodologická variabilita jednotlivých studií. Národní doporučení tak spíše vznikají jako konsenzuální doporučení expertních panelů. Přehledový článek přináší základní poznatky týkající se adaptace glukózového metabolismu po porodu, uvádí základní předpoklady screeningu hypoglykemie a také pestrou paletu informací a faktorů, které ovlivňují efektivitu screeningu a interpretaci hladiny glykemie ve vztahu ke klinickému stavu a případným neurologickým následkům.
There is a natural drop in the level of plasma glucose in the first hours after birth. As a result of metabolic and hormonal adaptation, glycemic values normalize early in most newborns. However, the ability of this physiological adaptation may be impaired in risk groups of newborns. Knowledge of the connection between hypoglycemia in the neonatal period and a possible subsequent permanent neurological deficit has already been published in the past. Perhaps that is why blood glucose measurement is one of the most common laboratory tests performed in neonatal wards. However, there are no uniform recommendations for the screening and therapy of neonatal hypoglycemia worldwide. The interpretation of clinical studies, with regard to the value of glycemia and possible adverse neurological outcome, is very limited. This is primarily due to the great methodological variability of the clinical studies. National guidelines are thus rather created as consensus recommendations of experts. The review article provides basic knowledge regarding the adaptation of glucose metabolism after birth. There are the basic assumptions of screening for hypoglycemia, as well as a wide range of information and factors that can influence the effectiveness of screening and the interpretation relation between level of the glycemia, clinical condition of the baby and possible neurological consequences.
- MeSH
- fyziologická adaptace MeSH
- hypoglykemie diagnóza terapie MeSH
- krevní glukóza * analýza MeSH
- lidé MeSH
- novorozenec MeSH
- novorozenecký screening * MeSH
- rizikové faktory MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- novorozenec MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
BACKGROUND: Due to anthelmintic resistance problems, there is a need to discover and develop new drugs for the treatment and control of economically important and pathogenic nematodes of livestock animals. With this focus in mind, we screened 236 compounds from a library (called the 'Kurz-box') representing chemically diverse classes such as heterocyclic compounds (e.g. thiazoles, pyrroles, quinolines, pyrimidines, benzo[1,4]diazepines), hydoxamic acid-based metalloenzyme inhibitors, peptidomimetics (bis- and tris-pyrimidoneamides, alkoxyamides) and various intermediates on Haemonchus contortus, one of the most important parasitic nematodes of ruminants. METHODS: In the present study, we tested these compounds, and measured the inhibition of larval motility and development of exsheathed third-stage (xL3) and fourth-stage (L4) larvae of H. contortus using an optimised, whole-organism phenotypic screening assay. RESULTS: Of the 236 compounds, we identified two active compounds (called BLK127 and HBK4) that induced marked phenotypic changes in the worm in vitro. Compound BLK127 induced an 'eviscerated' phenotype in the xL3 stage and also inhibited L4 development. Compound HBK4 exerted a 'curved' phenotype in both xL3s and L4s. CONCLUSIONS: The findings from this study provide a basis for future work on the chemical optimisation of these compounds, on assessing the activity of optimised compounds on adult stages of H. contortus both in vitro and in vivo (in the host animal) and against other parasitic worms of veterinary and medical importance.
- MeSH
- anthelmintika chemie farmakologie MeSH
- fenotyp MeSH
- Haemonchus účinky léků růst a vývoj MeSH
- inhibiční koncentrace 50 MeSH
- larva účinky léků růst a vývoj MeSH
- preklinické hodnocení léčiv MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- mužské pohlaví MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
In the light of recent advances in sequencing, which is becoming increasingly available, the microarray technology has partly assumed a complementary and application role. The last two decades, however, brought into application a genuine microarray approaches and technologies, especially population (VIPTM) chips, enabling one to costeffectively screen populations of tens of thousands of individuals (from humans to microorganisms) and thus effectively generate solutions for personalized medicine as well as multi-patient studies and therapies of neurodegenerative diseases. The paper summarizes basic and advanced contemporary microarray platforms and biomarkers useful for the research and diagnostics of neurodegenerative diseases including the microarray state of the art population (VIPTM) chips. Since the development and function of the nervous system is highly dependent on the products of gene expression, individual genotype and phenotype, the described diagnostic tools will likely contribute to a highly demanded elucidation of the molecular mechanisms and therapeutic solutions for neurodegenerative diseases.
- Klíčová slova
- Ames test,
- MeSH
- celulosa oxidovaná MeSH
- farmaceutické pomocné látky MeSH
- léčivé přípravky MeSH
- lidé MeSH
- nutrigenomika MeSH
- poškození DNA MeSH
- rychlé screeningové testy MeSH
- testy genotoxicity MeSH
- vysoce účinné nukleotidové sekvenování MeSH
- zdravotnické prostředky MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
Pharmacophores such as hydroxyethylamine (HEA) and phthalimide (PHT) have been identified as potential synthons for the development of compounds against various parasitic infections. In order to further advance our progress, we conducted an experiment utilising a collection of PHT and HEA derivatives through phenotypic screening against a diverse set of protist parasites. This approach led to the identification of a number of compounds that exhibited significant effects on the survival of Entamoeba histolytica, Trypanosoma brucei, and multiple life-cycle stages of Leishmania spp. The Leishmania hits were pursued due to the pressing necessity to expand our repertoire of reliable, cost-effective, and efficient medications for the treatment of leishmaniases. Antileishmanials must possess the essential capability to efficiently penetrate the host cells and their compartments in the disease context, to effectively eliminate the intracellular parasite. Hence, we performed a study to assess the effectiveness of eradicating L. infantum intracellular amastigotes in a model of macrophage infection. Among eleven L. infantum growth inhibitors with low-micromolar potency, PHT-39, which carries a trifluoromethyl substitution, demonstrated the highest efficacy in the intramacrophage assay, with an EC50 of 1.2 +/- 3.2 μM. Cytotoxicity testing of PHT-39 in HepG2 cells indicated a promising selectivity of over 90-fold. A chemogenomic profiling approach was conducted using an orthology-based method to elucidate the mode of action of PHT-39. This genome-wide RNA interference library of T. brucei identified sensitivity determinants for PHT-39, which included a P-type ATPase that is crucial for the uptake of miltefosine and amphotericin, strongly indicating a shared route for cellular entry. Notwithstanding the favourable properties and demonstrated efficacy in the Plasmodium berghei infection model, PHT-39 was unable to eradicate L. major infection in a murine infection model of cutaneous leishmaniasis. Currently, PHT-39 is undergoing derivatization to optimize its pharmacological characteristics.
- MeSH
- amfotericin B terapeutické užití MeSH
- antiprotozoální látky * farmakologie terapeutické užití MeSH
- ftalimidy farmakologie terapeutické užití MeSH
- Leishmania infantum * MeSH
- Leishmania * MeSH
- leishmanióza kožní * parazitologie MeSH
- lidé MeSH
- myši MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- myši MeSH
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
Autorky představují tři případy dětí s deficitem 21-hydroxylázy s identickým genotypem p.I173N//chimerní gen CYP21A1P/CYP21A2. Na těchto kazuistikách je zřejmý pozitivní přínos časné diagnózy cestou novorozeneckého screeningu, který významně mění další osud dětí s výše uvedenou poruchou a také variabilita fenotypu mutace p.I173N.
The authors present case reports of three children suffering from 21-hydoxylase deficiency due to p.I173//CYP21A1P/CYP21A2 chimeric gene genotype. Case reports document the improvement of health and final height due to early diagnosis and treatment through neonatal screening and the phenotype variability of p.I173N mutation.
- MeSH
- časná diagnóza MeSH
- dítě MeSH
- fenotyp MeSH
- fludrokortison terapeutické užití MeSH
- hormon uvolňující gonadotropiny analogy a deriváty terapeutické užití MeSH
- hydrokortison terapeutické užití MeSH
- kongenitální adrenální hyperplazie * diagnóza genetika MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- mutace MeSH
- novorozenecký screening * MeSH
- předškolní dítě MeSH
- puberta MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- předškolní dítě MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
Stem cell-derived cardiomyocytes (CMs) hold great hopes for myocardium regeneration because of their ability to produce functional cardiac cells in large quantities. They also hold promise in dissecting the molecular principles involved in heart diseases and also in drug development, owing to their ability to model the diseases using patient-specific human pluripotent stem cell (hPSC)-derived CMs. The CM properties essential for the desired applications are frequently evaluated through morphologic and genotypic screenings. Even though these characterizations are necessary, they cannot in principle guarantee the CM functionality and their drug response. The CM functional characteristics can be quantified by phenotype assays, including electrophysiological, optical, and/or mechanical approaches implemented in the past decades, especially when used to investigate responses of the CMs to known stimuli (eg, adrenergic stimulation). Such methods can be used to indirectly determine the electrochemomechanics of the cardiac excitation-contraction coupling, which determines important functional properties of the hPSC-derived CMs, such as their differentiation efficacy, their maturation level, and their functionality. In this work, we aim to systematically review the techniques and methodologies implemented in the phenotype characterization of hPSC-derived CMs. Further, we introduce a novel approach combining atomic force microscopy, fluorescent microscopy, and external electrophysiology through microelectrode arrays. We demonstrate that this novel method can be used to gain unique information on the complex excitation-contraction coupling dynamics of the hPSC-derived CMs.
- MeSH
- biologické modely MeSH
- buněčná diferenciace MeSH
- fenotyp MeSH
- fluorescenční mikroskopie MeSH
- genotyp MeSH
- kardiomyocyty cytologie MeSH
- lidé MeSH
- mikroskopie atomárních sil MeSH
- pluripotentní kmenové buňky cytologie MeSH
- rychlé screeningové testy MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- přehledy MeSH