Projekt je založen na předpokladu, že u pacientů s dědičnou predispozicí ke karcinomu prsu a ovaria přísluší významná úloha dalším genům, jejichž alterace nejsou dosud v naší populaci známy. Cílem projektu je zhodnotit význam dědičných mutací nově charakterizovaných genů zasahujících do DNA-reparačních pochodů pro vznik karcinomu prsu a ovaria. Rozpoznání dědičných forem nádorového onemocnění umožňuje u pacientů kvalifikovaná rozhodnutí o rozsahu a zaměření léčby a o následné péči. Předpokládáme, že provedené analýzy potvrdí i v naší populaci význam testovaných genů u hereditárního karcinomu prsu a ovaria.; The project is based on a hypothesis that additional identified moderate-risk susceptibility genes that were not examined in our series of high-risk patients may also play an important role in familial breast and ovarian cancer. The study will estimate the contribution of inherited mutations in these genes to familial breast and ovarian cancer in the Czech Republic and will evaluate the importance of the role of these newly characterized genes in tumorigenesis. Analysis of these genes offers the opportunity to account for a higher percentage of inherited cases of breast and ovarian cancer.

• MeSH
• genetická predispozice k nemoci MeSH
• molekulární biologie MeSH
• nádory prsu MeSH
• nádory vaječníků MeSH
• riziko MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• onkologie
• gynekologie a porodnictví
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Cílem projektu je zhodnocení vlivu genů s nízkou penetrancí na vznik hereditárních forem karcinomu prsu a ovaria v České republice u vysoce rizikových pacientek bez nálezu mutací v hlavních predispozičních genech (BRCA1/2). * Bude provedena mutační analýza v genech s nízkou penetrancí (CHEK2, ATM, NBS1, RAD50, PALB2 a BRIP1) ve vzorcích pacientů z vysoce rizikových rodin s výskytem karcinomu prsu a/nebo ovaria a negativním výsledkem mutační analýzy genů BRCA1, BRCA2. * Význam nalezených alterací u karcinomu prsu bude určen na základě populační studie zahrnující neselektované pacientky s karcinomem prsu a nenádorové kontroly. * Úloha genů s nízkou penetrancí bude rovněž analyzována ve vzorcích primárních nádorů prsu. Mutační analýzy budou provedeny standardními technikami (PTT, DHPLC, RFLP, HRM, sekvenování) rutinně prováděnými v naší laboratoři při vyšetřeních kandidátních genů u nádorových syndromů. Výsledky mutačních analýz budou statisticky vyhodnoceny.; The aim of our project is to evaluate the effect of low penetrance genes on breast and ovarian cancer development in the Czech Republic in high-risk patients tested negatively for major susceptibility genes (BRCA1/2) Mutation analysis of low penetrance genes (CHEK2, ATM, NBS1, PALB2, BRIP1) will be performed in patients from high-risk families with breast and/or ovarian cancer tested negatively for mutations in BRCA1 and BRCA2 genes. To analyze the impact of identified mutations on breast cancer development in the general population, gene alterations will be analyzed in a group of incident breast cancer patients and control DNA samples. The role of low penetrance genes will be also examined in samples of breast tumors. Mutational analysis will be performed by techniques that have been tested in our laboratory (PTT, DHPLC, RFLP, HRM, sequencing) in analyses of candidate genes in cancer syndromes. Differences in mutation frequencies among groups of analyzed families will be statistically evaluated.

• MeSH
• dědičný syndrom nádoru prsu a vaječníků MeSH
• genetická anticipace MeSH
• genetická predispozice k nemoci MeSH
• geny BRCA1 MeSH
• geny BRCA2 MeSH
• geny p53 MeSH
• mutační analýza DNA MeSH
• muži MeSH
• nádory prsu diagnóza   genetika   prevence a kontrola   terapie   MeSH
• penetrance MeSH
• protein-serin-threoninkinasy analýza   MeSH
• sekvenční analýza DNA MeSH
• ženy MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• gynekologie a porodnictví
• onkologie
• biologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Navrhovaný projekt se zabývá retrospektivním studiem molekulárních charakteristik borderline nádorů vaječníků a vztahem těchto charakteristik k biologickému chování nádorů. V tkáních tumorů budou zkoumány četnosti a způsoby inaktivace některých buněčnýchcest. Analyzovány budou jak genetické ? mutace genů KRAS a BRAF a ztráta heterozygosity v chromozomálních oblastech nesoucích některé tumorsupresory -, tak epigenetické (metylace promotorových sekvencí) změny. Porovnáním molekulárních změn v benigních,borderline a maligních nádorech vaječníků budou identifikovány změny důležité pro progresi nádoru v invazivní karcinom. Získaná data budou vztažena ke klinicko-patologickým charakteristikám nádorů u jednotlivých pacientek. Výsledkem pak bude model predikce biologického chování bordeline nádorů na základě jejich molekulárních charakteristik. Takovýto model bude v kontextu výzkumu borderline ovariálních nádorů jedinečný a umožní přizpůsobit terapii konkrétním charakteristikám nádoru u konkrétní pacientky.; This proposal is designed as a retrospective study analyzing molecular characteristics of borderline ovarian tumors and comparing these characteristics to biological behavior of tumors. We will study frequency and modalities of inactivation of certain cellular pathways in tumor tissue. Analysis will comprise wide spectrum of genomic (genetic and epigenetic) changes ? mutations of oncogenes KRAS and BRAF, loss of heterozygosity in chromosomal loci harboring tumorsupressor genes and methylation of promoter sequences. Comparison of genomic changes of benign, borderline and malignant tumors will identify changes important and typical for progression to invasive disease. Collected data will be compared to clinical and pathological characteristics of concrete tumor. Model of prediction and prognosis will be reveloped as an output and is supposed to allow tailor therapy to concrete tumor characteristics in each patient.

• MeSH
• metylace DNA MeSH
• nádorová transformace buněk MeSH
• nádory vaječníků klasifikace   MeSH
• onkogenní protein p21(ras) MeSH
• promotorové oblasti (genetika) MeSH
• protoonkogenní proteiny B-raf MeSH
• protoonkogenní proteiny MeSH
• retrospektivní studie MeSH
• smíšený nádor Müllerův klasifikace   MeSH
• staging nádorů MeSH
• transformované buněčné linie MeSH
• ztráta heterozygozity MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• gynekologie a porodnictví
• onkologie
• biologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Bude analyzována úloha missens variant genů BRCA1 a BRCA2. Dále se u těchto genů zaměříme na analýzu dlouhých delecí přestaveb zasahujících genomovou DNA. Pozornost bude věnována analýze variant sestřihu u genů BRCA1 a BRCA2. Analýza genu ATM se bude provádět u pacientek s hereditární zátěží, u nichž nebyla prokázána mutace v hlavních predispozičních genech. Bude studována úloha genů BRCA1/2, ATM a p53 při vývoji nehereditárního (sporadického) karcinomu prsu. Při průkazu ztráty alel bude prováděna mutační analýza, případně budou studovány další možnosti genové inaktivace (metylace promotorových sekvencí). K prescreeningu mutací budou použity techniky založené na analýze produktů PCR - PTT-analýza, u krátkých exonů sekvenování RT-PCR fragmentů. K potvrzení a charakterizaci nalezených alterací bude vždy sekvenován amplifikovaný DNA fragment.; The role of missense variants in BRCA1 and BRCA2 genes will be analyzed in brest cancer tumorigenesis. BRCA1 a BRCA2 genes will be screened for rearrangements and splice variants. Mutational analysis of ATM gene will be performed in breast/ovarian cancerfamilies negative for mutations in genes BRCA1 and BRCA2. The role of BRCA1, BRCA2, p53 and ATM will be examined in sporadic breast tumorigenesis. A large set of primary breast tumors will be analyzed for LOH at respective loci and samples with allelicdeletions will be further screened for mutations. Deleterious mutations and other sequence variants in susceptibility genes will be analyzed by PCR-based methods. Prescreening for mutations will be performed by PTT-analysis. Samples containing truncatedprotein products will be sequenced.

• MeSH
• geny BRCA1 MeSH
• geny BRCA2 MeSH
• geny p53 MeSH
• mutace MeSH
• nádorový supresorový protein p53 analýza   MeSH
• nádory prsu genetika   MeSH
• polymerázová řetězová reakce s reverzní transkripcí MeSH
• polymerázová řetězová reakce MeSH
• teleangiektatická ataxie genetika   MeSH
• ženy MeSH
• ztráta heterozygozity MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• onkologie
• gynekologie a porodnictví
• biologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Cílem je mutační analýza genů ATM a p53 u pacientek s karcinomem prsu z rizikových rodin; v neselektovaných rodinách budou studována mutace genu BRCA1 5382insC specifická pro naši populaci. Používané techniky zahrnují: extrakci genetického materiálu, amplifikací genových fragmentů pomocí PCR a RT-PCR, prescreening PCR produktů pomocí PTT nebo DGGE, charakterizaci mutací sekvenováním, analýzy LOH.; The aim of study is mutation analysis of ATM and p53 genes in breast cancer patients from risk families. The recurrent mutation in BRCA1 gene, 5382insC, will be detected in patients not selected for a family history of cancer. Methods used in this studyinvolte: DNA and RNA izolation, PCR and RT-PCR amplification, PTT and DGGE analyses, direct suquencing, LOH analysis.

• MeSH
• genetická anticipace MeSH
• genetická predispozice k nemoci genetika   MeSH
• geny p53 MeSH
• nádory prsu genetika   prevence a kontrola   MeSH
• polymerázová řetězová reakce MeSH
• protein BRCA1 MeSH
• protein BRCA2 MeSH
• teleangiektazie MeSH
• ztráta heterozygozity MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• onkologie
• gynekologie a porodnictví
• histologie
• biologie
• genetika, lékařská genetika
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

V rodinách s predispozicí ke karcinomu prsu a ovaria bude provedena analýza mutací genu BRCA1 a BRCA2.Bude zhodnocen klinický přínos této metody pro určení prognózy onemocnění u pacienta a pro včasnou diagnost. karcinomu u zdravého nosiče mutace.; Analysis of germ-line mutations of BRCA1 and BRCA2 genes will be performed in breast and ovarian cancer families.The role of these genes in hereditary cancers should be explained in Czech population.

• MeSH
• geny BRCA1 MeSH
• geny BRCA2 MeSH
• mutace MeSH
• nádory prsu genetika   MeSH
• nádory vaječníků genetika   MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• onkologie
• biologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

• MeSH
• genetická terapie MeSH
• genetické techniky MeSH
• molekulární biologie MeSH

• Konspekt
• Biologické vědy
• NLK Obory
• biologie
• NLK Publikační typ
• učebnice vysokých škol

• Publikační typ
• abstrakt z konference MeSH

• Publikační typ
• abstrakt z konference MeSH

Recent studies have conferred that the RAD51C and RAD51D genes, which code for the essential proteins involved in homologous recombination, are ovarian cancer (OC) susceptibility genes that may explain genetic risks in high-risk patients. We performed a mutation analysis in 171 high-risk BRCA1 and BRCA2 negative OC patients, to evaluate the frequency of hereditary RAD51C and RAD51D variants in Czech population. The analysis involved direct sequencing, high resolution melting and multiple ligation-dependent probe analysis. We identified two (1.2%) and three (1.8%) inactivating germline mutations in both respective genes, two of which (c.379_380insG, p.P127Rfs*28 in RAD51C and c.879delG, p.C294Vfs*16 in RAD51D) were novel. Interestingly, an indicative family cancer history was not present in four carriers. Moreover, the ages at the OC diagnoses in identified mutation carriers were substantially lower than those reported in previous studies (four carriers were younger than 45 years). Further, we also described rare missense variants, two in RAD51C and one in RAD51D whose clinical significance needs to be verified. Truncating mutations and rare missense variants ascertained in OC patients were not detected in 1226 control samples. Although the cumulative frequency of RAD51C and RAD51D truncating mutations in our patients was lower than that of the BRCA1 and BRCA2 genes, it may explain OC susceptibility in approximately 3% of high-risk OC patients. Therefore, an RAD51C and RAD51D analysis should be implemented into the comprehensive multi-gene testing for high-risk OC patients, including early-onset OC patients without a family cancer history.

• MeSH
• DNA vazebné proteiny genetika   MeSH
• exony genetika   MeSH
• genetická predispozice k nemoci * MeSH
• geny nádorové * MeSH
• introny genetika   MeSH
• komplementární DNA genetika   MeSH
• lidé MeSH
• molekulární sekvence - údaje MeSH
• mutační analýza DNA MeSH
• nádory vaječníků genetika   MeSH
• protein BRCA1 genetika   MeSH
• protein BRCA2 genetika   MeSH
• rizikové faktory MeSH
• rodina MeSH
• sekvence nukleotidů MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH