V předkládaném projektu se snažíme nalézt nové molekulární markery (efektorové molekuly signalizace EGFR, mikroRNA) umožňující predikovat odpověď na anti-EGFR terapii ve skupině pacientů s metastatickým kolorektálním karcinomem s nemutovaným onkogenem KRAS, které mohou vést nejen k pochopení dalších molekulárních mechanizmů rezistence, ale také k individualizaci léčby, a tím i k dosažení lepších léčebných výsledků a vyšší kvality života pacientů s metastatickým kolorektálním karcinomem.; In the proposed project we are aiming idetification of the new molecular markers (effector molecules of EGFR signalling, microRNAs) enabling response prediction to anti-EGFR therapy in patients with metastastic colorectal cancer carrying wild-type oncogene KRAS, which can lead not only to better understanding of molecular mechanisms of resistance, but also to individualization of therapy and therefore achievement of better therapeutical results and higher quality of life in patients with metastatic colorectal cancer.

• MeSH
• cetuximab MeSH
• cílená molekulární terapie MeSH
• erbB receptory analýza   MeSH
• humanizované monoklonální protilátky terapeutické užití   MeSH
• individualizovaná medicína MeSH
• kolorektální nádory farmakoterapie   MeSH
• kvantitativní polymerázová řetězová reakce MeSH
• mikro RNA MeSH
• přežití MeSH
• protoonkogenní proteiny p21(ras) MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• gastroenterologie
• onkologie
• molekulární biologie, molekulární medicína
• farmakoterapie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

MikroRNA představují extrémně rychle rostoucí oblast molekulární biologie a poznatky o nich se již staly jedním ze základních stavebních kamenů nádorové biologie. Z tohoto postavení vyplývá i potenciální využití mikroRNA v klinické praxi, a to jak v diagnostice, tak v terapii nádorových onemocnění. To, že se jedná o reálné předpoklady, dokazuje i vstup prvních léčiv na bázi mikroRNA do klinických hodnocení. První monografie na toto téma v naší literatuře přináší informace o základních principech biologie mikroRNA a metodách jejich studia, ale především systematicky zpracovává zapojení mikroRNA do patogeneze hlavních skupin solidních a hematologických malignit, s užším zaměřením na využití mikroRNA jako biomarkerů v diagnostické a prediktivní onkologii a pro terapeutické účely. Monografii připravil kolektiv autorů, kteří mají s výzkumem mikroRNA praktické zkušenosti a své poznatky publikují v mezinárodních odborných časopisech.

• MeSH
• biologické markery MeSH
• genetická transkripce MeSH
• hematologické nádory diagnóza   patofyziologie   terapie   MeSH
• mikro RNA diagnostické užití   terapeutické užití   MeSH
• nádory podle lokalizace MeSH
• regulace genové exprese MeSH
• transformované buněčné linie MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• biologie
• onkologie
• NLK Publikační typ
• kolektivní monografie

• MeSH
• cílená molekulární terapie MeSH
• diagnostické techniky molekulární MeSH
• individualizovaná medicína MeSH
• lékařská onkologie MeSH
• mikročipová analýza MeSH
• výzkum MeSH
• Publikační typ
• sborníky MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• onkologie

Porucha regulační mikroRNA je jednou z klíčových událostí v patogenezi celé řady nádorových onemocnění včetně karcinomu rekta. MikroRNA jsou abundantní a identifikovatelné nejen v nádorové tkáni, ale také v krevní plazmě a vykazují zde vysokou míru stability. V rámci naší studie chceme pomocí vysokokapacitní analýzy mikroRNA v tkáni/krevní plazmě pacientů s karcinomem rekta identifikovat mikroRNA, které (i) umožní predikovat léčebnou odpověď na neodajuvantní chemoradioterapii a následně v kombinaci s nálezy zobrazovacích metod (TRUS, MRI), (ii) zpřesní hodnocení léčebné odpovědi = restaging (především změny na úrovni T a N stádia a postižení resekčních okrajů, CRM) po ukončení této léčby. Predikce léčebné odpovědi na neoadjuvantní chemoradioterapii by umožnila její individualizované podání pouze pacientům, u kterých je předpokládán klinický benefit. Zdokonalení restagingu umožní přesnější plánování chirurgické léčby a následně také lepší léčebné výsledky.; Alteration of the microRNA regulatory network is one of the key events in pathogenesis of wide range of malignancies including rectal cancer. MicroRNAs are abundant and could be determined not only in tumor tissue, but also in blood plasma, where they were proved to be highly stable. In our study, by use of genome-wide expression analysis of microRNAs we plan to identify microRNAs (i) enabling sensitive prediction of therapeutic response to neoadjuvant chemoradiotherapy, and consequently, in combination with results of MRI/TRUS, (ii) to improve diagnostic accuracy of restaging (mainly in regards to T and N stage, positivity of resection margins and CRM) after this treatment. Prediction of therapeutic response would enable more individualized indication of this therapy only to patients expected to have clinical benefit. Improvement of the restaging accuracy will enable more precise planning of the surgery treatment and as a consequence better therapeutic results.

• MeSH
• cirkulující mikroRNA analýza   MeSH
• krevní plazma MeSH
• kvantitativní polymerázová řetězová reakce MeSH
• lidé MeSH
• nádorové biomarkery analýza   MeSH
• nádory rekta farmakoterapie   MeSH
• neoadjuvantní terapie MeSH
• staging nádorů MeSH
• výsledek terapie MeSH
• vysoce účinné nukleotidové sekvenování MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• koloproktologie
• genetika, lékařská genetika
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Cytostatika a ionizující záření jsou známé svým karcinogenním, mutagenním a teratogenním působením. Zdravotničtí pracovníci a pacienti, kteří s nimi přícházejí do kontaktu, jsou tak v potenciálním riziku vzniku nádorového onemocnění a/nebo problémů s plodností. Chromozomové aberace (ChA) lymfocytů jsou biomarkerem expozice genotoxickým faktorům (GF) a mohou predikovat její důsledky. Bohužel, běžně používané standardní cytogenetické metody mají značné limity, které způsobují, že výsledky těchto metod odráží spíše krátkodobou expozici GF a jsou ovlivnitelné vedlejšími faktory, např. virovou infekcí, životním stylem atd. Nepřesnost testu může vést ke zbytečnému stažení zaměstnance z pracovního procesu nebo naopak k podhodnocení rizika malignity. Detekce stabilních ChA metodou FISH je pravděpodobně mnohem přesnější k vyšetření kumulativní (dlouhodobé) expozice GF. Chceme zjistit, zda je tato metoda použitelná k biologické dozimetrii u pracovníků v rizikových provozech a případně zda má potenciál pro využití k vyhledávání onkologických pacientů se zvýšeným rizikem sekundárních malignit.; Cytostatics and ionizing radiation have been found to have carcinogenic, mutagenic and teratogenic activity and so medical staff handling these substances as well as the treated patients are potentially at increased cancer risk or fertility problems. Chromosome aberrations (CA) in lymphocytes are used as biomarkers of the exposure to genotoxic agents (GA) and their expected consequences; however, the commonly used conventional cytogenetic testing has many methodological limitations and thus the test result mainly reflects short-term exposure to GA and is greatly influenced by confounding factors, such as viral infection, life style etc. The test inaccuracy may lead to unnecessary withdrawal of employees from working process or may underestimate the risk of malignancy. FISH detecting of stable CA is probably more accurate method for the risk assessment of a long-term cumulative exposure to GA. We want to test whether this method is suitable for biodosimetry of employees at risk and whether it has the potential to identify cancer patients at increased risk of second malignancies.

• MeSH
• chromozomální aberace MeSH
• cytogenetika MeSH
• hybridizace in situ fluorescenční MeSH
• molekulární biologie MeSH
• mutageny MeSH
• nádorové biomarkery MeSH
• nádory MeSH
• pracovní expozice MeSH
• primární prevence MeSH
• radiometrie MeSH
• rizikové faktory MeSH
• sekundární malignity MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• molekulární biologie, molekulární medicína
• genetika, lékařská genetika
• pracovní lékařství
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Projekt je zaměřen na pacienty s lokálně pokročilým nádorem konečníku, s cílem stanovit profil genové exprese těchto nádorů pomocí DNA čipů. Biologické koreláty genové exprese jsou identifikovatelné, a proto předpokládáme, že biostatistickými nástroji lze integrovat data z DNA čipových analýz a klinickopatologické parametry nádorů a identifikovat prediktivní profily genové exprese. Navrhovaný projekt a použitá metodika dávají předpoklad k identifikaci molekulárních prediktorů a k jejich budoucímu začlenění do funkční diagnostiky nádorů konečníku. Funkční diagnostika a silné molekulární prediktory jsou předpokladem k individualizaci terapie a k dosažení lepších léčebných výsledků a vyšší kvality života pacientů.; The project is focused on patients with locally advanced rectal cancer and the aim is to identify gene expression profile of these tumors (in vivo). It is clearly demonstrated that biological correlates of gene expression are identifiable, therefore combining microarrays analysis with clinicopathological data, we are able to identify gene expression profiles relating to respond to a given therapy. The ability to provide the individualized therapy is based on existence of strong predictive molecular markes. We expect that by using these profiles to minimalize adverse effects and to achieve the highest quality of live of patients with rectal cancer.

• MeSH
• adjuvantní chemoterapie MeSH
• čipová analýza proteinů MeSH
• diagnostické techniky molekulární MeSH
• exprese genu MeSH
• genetické testování MeSH
• kolorektální nádory terapie   MeSH
• kvalita života MeSH
• nanotechnologie MeSH
• prediktivní hodnota testů MeSH
• radioterapie MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• biochemie
• gastroenterologie
• onkologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Publikace se zaměřuje na možné nežádoucí následky onkologické léčby a na jejich terapii. Určeno odborné veřejnosti.; Monografie našich předních odborníků je základní praktickou příručkou všech zdravotníků podílejících se na péči o pacienty, kteří prošli kurativní onkologickou léčbou.

• MeSH
• indukce remise MeSH
• nádory farmakoterapie   MeSH
• následná péče MeSH
• nežádoucí účinky léčiv MeSH
• období po vyléčení MeSH
• rekonvalescence MeSH
• spontánní regrese nádoru MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• onkologie
• NLK Publikační typ
• kolektivní monografie

Přestože se spektrum biomarkerů užívaných v onkologii neustále rozšiřuje, zůstává stanovení morfologie nádorů rozhodujícím kritériem diagnostiky. U karcinomů prsu bylo nedávno zjištěno, že stupeň diferenciace je provázen změnami exprese miRNA. Není však nic známo o tom, zda popsané změny souvisí se změnou morfologie a zda mají individuální nebo obecný charakter. Cílem navrhovaného projektu je použít zatím unikátní přístup a srovnat expresní profil miRNA z různých částí téhož nádoru s rozdílnou morfologickou charakteristikou i nádorů se stejnou morfologií od různých pacientek a zároveň zjistit, zda je možné tyto specifické miRNA detekovat v krvi. Pro řešení navrhujeme použít mikrodisekční metody izolace buněk z parafínových bloků TNBC a mikročipovou analýzu miRNA. Tkáňové a sérové hladiny vybraných miRNA budou sledovány pomocí qPCR v rozšířeném validačním souboru a jejich funkce bude studována pomocí experimentů na buněčných liniích. Projekt by mohl přispět k odhalení nových principů řídících morfogenezi v nádorech a rovněž k identifikaci nových diagnostických a prognostických znaků.; Although the spectrum of cancer biomarkers is constantly expanding, determining the morphology is a decisive criterion for diagnosis. Recent research in breast cancer has shown that the degree of differentiation is accompanied by changes in miRNA expression. However, nothing is known about relationship between the described changes and tumor morphology or whether these changes have an individual or general character. We suggest to compare the miRNA expression profiles from different parts of the same tumor which have different morphology as well as tumors with the same morphology from different patients and analyse whether specific miRNAs are released into blood. Microdissection of cells from paraffin blocks of TNBC and miRNA microarray analysis will be used. Tissue and serum levels of selected miRNAs will be monitored by qPCR in an extended validation set and their functions will be studied by experiments on cell lines. The project could contribute to the discovery of new principles governing morphogenesis in tumors as well as identify novel diagnostic and prognostic markers.

• MeSH
• časná detekce nádoru MeSH
• exprese genu MeSH
• lidé MeSH
• mikro RNA MeSH
• mikročipová analýza MeSH
• mikrodisekce MeSH
• morfogeneze MeSH
• nádorové biomarkery analýza   MeSH
• prognóza MeSH
• triple-negativní karcinom prsu diagnóza   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• ženské pohlaví MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• onkologie
• genetika, lékařská genetika
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Projekt je zaměřen na studium epidemiologických, genetických a klinicko-patologických aspektů CDK12 pozitivních a/nebo mutovaných karcinomů v populaci žen se ZN prsu a vaječníků, s možností rozšíření na další malignity. Na primárních tumorech a na preklinických modelech chceme identifikovat CDK12-dependentní geny a popsat molekulární funkci CDK12 v procesu karcinogeneze. Předpokládáme, že získané poznatky budou použitelné ke zpřesnění diagnostiky studovaných onemocnění a k predikci efektivity protinádorové léčby jejíž účinek je založený na poškození DNA.; The primary focus of the project is to study epidemiological, genetical and clinico-pathological aspects of CDK12 positive and/or mutated cancers in the population of women with breast and ovarian cancers, with a possible extension to other malignancies. Further, we want to describe the molecular function of CDK12 in carcinogenesis using primary and clinically related models. We assume that data acquired during the project realization will be used for more accurate diagnosis of studied diseases and for the effectiveness of cancer treatment with effect based on DNA damage.

• MeSH
• checkpoint kinasa 1 antagonisté a inhibitory   MeSH
• chromatinová imunoprecipitace MeSH
• cyklin-dependentní kinasy MeSH
• genetická transkripce MeSH
• geny BRCA1 MeSH
• nádorový supresorový protein p53 MeSH
• nádory prsu MeSH
• nádory vaječníků MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• molekulární biologie, molekulární medicína
• gynekologie a porodnictví
• onkologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

První komplexně pojatá monografie na toto téma u nás podává aktuální přehled možností molekulárně genetických vyšetření v oboru onkologie. Tato vyšetření umožňují lékařům mnohem lépe uplatňovat principy individualizované medicíny, a to ve všech oblastech poskytované zdravotní péče, tj. v prevenci, diagnostice i léčbě. Takovýto postup, jak již bylo prokázáno, zvyšuje šance na dlouhodobé přežití a lepší kvalitu života onkologických pacientů. Samostatné kapitoly jsou proto věnovány solidním tumorům, hematologickým malignitám, farmakogenetice a hereditárním nádorovým syndromům. V závěru knihy se autoři zabývají současnou situací i s ohledem na vstup nových technologií a perspektivou molekulární genetiky do budoucna.

• MeSH
• farmakogenetika MeSH
• individualizovaná medicína MeSH
• molekulární biologie MeSH
• nádory genetika   MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• genetika, lékařská genetika
• biologie
• NLK Publikační typ
• kolektivní monografie