[1. vyd.] 14 s. : obr., tab. ; 30 cm
Background: Electronic health record (EHR) systems are necessary for sharing medical information between care delivery organizations (CDOs). While many standardized data can be shared, it is still difficult to share nonstandardized clinical data. Furthermore, there remains the problem that the EHR system cannot finely control the disclosure status. We have been operating a documentbased electronic medical record system called the Document Archiving and Communication System (DACS) in which printed images of all medical records are stored in PDF format. Objectives: To develop a document-based EHR system that can disclose selected clinical documents in PDF format. Methods: With a document-based EHR system, any documents stored in the DACS can be opened to a designated CDO. These open documents can be selected by the service CDO staff. In order to manage the disclosure status, an access control list (ACL) file was designed based on the HL7 clinical document architecture header. The PDF file and its ACL file were transiently stored in the Japanese standard repository, SS-MIX2. The doctor of the designated CDO was then able to access the documents according to the information in the ACL file. Results: From March 2017 to September 2017, 308 documents of 20 patients were disclosed to 3 CDOs using this document-based EHR system. These documents included examination reports, agreement forms concerning the EHR, progress notes, summaries and surgical reports generated from five different systems. Conclusions: The document-based EHR system was able to reveal clinical documents from the EMR to medical staff under a controlled disclosure environment..
Public-access defibrillation with automated external defibrillators (AEDs) is being implemented in many countries worldwide with considerable financial implications. The potential benefit and economic consequences of focused or unfocused AED deployment are unknown. METHODS AND RESULTS: All cardiac arrests in public in Copenhagen, Denmark, from 1994 through 2005 were geographically located, as were 104 public AEDs placed by local initiatives. In accordance with European Resuscitation Council and American Heart Association (AHA) guidelines, areas with a high incidence of cardiac arrests were defined as those with 1 cardiac arrest every 2 or 5 years, respectively. There were 1274 cardiac arrests in public locations. According to the European Resuscitation Council or AHA guidelines, AEDs needed to be deployed in 1.2% and 10.6% of the city area, providing coverage for 19.5% (n=249) and 66.8% (n=851) of all cardiac arrests, respectively. The excessive cost of such AED deployments was estimated to be $33 100 or $41 000 per additional quality-adjusted life year, whereas unguided AED placement covering the entire city had an estimated cost of $108 700 per quality-adjusted life year. Areas with major train stations (1.8 arrests every 5 years per area), large public squares, and pedestrianized areas (0.6 arrests every 5 years per area) were main predictors of frequent cardiac arrests. CONCLUSIONS: To achieve wide AED coverage, AEDs need to be more widely distributed than recommended by the European Resuscitation Council guidelines but consistent with the American Heart Association guidelines. Strategic placement of AEDs is pivotal for public-access defibrillation, whereas with unguided initiatives, AEDs are likely to be placed inappropriately.
- MeSH
- Cost-Benefit Analysis MeSH
- Defibrillators economics statistics & numerical data MeSH
- Adult MeSH
- Health Services Accessibility MeSH
- Electric Countershock economics mortality instrumentation MeSH
- Financing, Organized MeSH
- Incidence MeSH
- Cardiopulmonary Resuscitation economics mortality statistics & numerical data MeSH
- Middle Aged MeSH
- Humans MeSH
- Urban Population MeSH
- Aged, 80 and over MeSH
- Aged MeSH
- Heart Arrest economics mortality therapy MeSH
- Emergency Medical Services economics statistics & numerical data MeSH
- Public Facilities MeSH
- Health Planning Guidelines MeSH
- Check Tag
- Adult MeSH
- Middle Aged MeSH
- Humans MeSH
- Male MeSH
- Aged, 80 and over MeSH
- Aged MeSH
- Female MeSH
- Geographicals
- Denmark MeSH
BACKGROUND: Sex chromosomes present a genomic region which to some extent, differs between the genders of a single species. Reliable high-throughput methods for detection of sex chromosomes specific markers are needed, especially in species where genome information is limited. Next generation sequencing (NGS) opens the door for identification of unique sequences or searching for nucleotide polymorphisms between datasets. A combination of classical genetic segregation analysis along with RNA-Seq data can present an ideal tool to map and identify sex chromosome-specific expressed markers. To address this challenge, we established genetic cross of dioecious plant Rumex acetosa and generated RNA-Seq data from both parental generation and male and female offspring. RESULTS: We present a pipeline for detection of sex linked genes based on nucleotide polymorphism analysis. In our approach, tracking of nucleotide polymorphisms is carried out using a cross of preferably distant populations. For this reason, only 4 datasets are needed - reads from high-throughput sequencing platforms for parent generation (mother and father) and F1 generation (male and female progeny). Our pipeline uses custom scripts together with external assembly, mapping and variant calling software. Given the resource-intensive nature of the computation, servers with high capacity are a requirement. Therefore, in order to keep this pipeline easily accessible and reproducible, we implemented it in Galaxy - an open, web-based platform for data-intensive biomedical research. Our tools are present in the Galaxy Tool Shed, from which they can be installed to any local Galaxy instance. As an output of the pipeline, user gets a FASTA file with candidate transcriptionally active sex-linked genes, sorted by their relevance. At the same time, a BAM file with identified genes and alignment of reads is also provided. Thus, polymorphisms following segregation pattern can be easily visualized, which significantly enhances primer design and subsequent steps of wet-lab verification. CONCLUSIONS: Our pipeline presents a simple and freely accessible software tool for identification of sex chromosome linked genes in species without an existing reference genome. Based on combination of genetic crosses and RNA-Seq data, we have designed a high-throughput, cost-effective approach for a broad community of scientists focused on sex chromosome structure and evolution.
- MeSH
- Genetic Markers genetics MeSH
- Genome, Human MeSH
- Genes, X-Linked * MeSH
- Genes, Y-Linked * MeSH
- Polymorphism, Single Nucleotide genetics MeSH
- Humans MeSH
- Polymerase Chain Reaction MeSH
- RNA genetics MeSH
- Sequence Analysis, RNA methods MeSH
- Software * MeSH
- High-Throughput Nucleotide Sequencing methods MeSH
- Check Tag
- Humans MeSH
- Male MeSH
- Female MeSH
- Publication type
- Journal Article MeSH
- Research Support, Non-U.S. Gov't MeSH
V pracovních postupech radioterapie se neustále využívají nové techniky, které zvyšují nároky na informační toky a integraci veškerých nutných informací. Tyto postupy jsou multidimenzionální a zahrnují široké spektrum dokumentů (demografické údaje pacienta, data o radioterapii, diagnostické informace nutné pro stanovení postupu léčby, obrazovou dokumentaci atd.). Data jsou nezbytně nutná pro průběh léčby pacienta a je potřebné zajistit jejich integraci se zdravotní dokumentací pacienta. Dále musejí zajistit ošetřujícímu personálu trvalý a rychlý přístup k potřebným údajům. Vzhledem k různým požadavkům na systémy a jejich různorodé využití je nevyhnutelné použití komunikačních standardů (DICOM, DICOM RT, PACS, HL7) tak, aby byla zajištěna kompatibilita a vzájemná komunikace systémů.
Working approaches to radiotherapy are constantly in contact with new techniques that simultaneously require more advanced information flow and integration of all required information. These procedures are multi-dimensional and comprise a broad spectrum of documentation (patient demography, radiotherapy data, information required for diagnosis and treatment specification, illustrative records, etc.). These data are indispensable to the patient treatment process and it is crucial that they be integrated into patient health documentation. They are also necessary to enable long-term and speedy access to the data fields required by staff involved in treatment. In view of the various requirements placed on systems and their range of usage, it is essential that communication standards (DICOM, DICOM RT, PACS, HL7) are employed in such a way as to ensure compatibility and common systems communication.
Vyšší kvalita a nižší náklady na péči o pacienta závisejí na digitalizaci zdravotních záznamů a na přechodu na elektronické záznamy o pacientech. Tyto záznamy představují typ citlivých informací označovaných také jako elektronické chráněné zdravotní záznamy (electronic Protected Health Information–ePHR). Ve srovnání se svými papírovými ekvivalenty představují citlivé informace v elektronické podobě nová slabá místa. Bezpečnostní rizika a rizika spojená s ochranou citlivých informací se vlivem řady sílících trendů ve zdravotnictví zvyšují. K takovým rizikům patří např. mobilita lékařů a využívání bezdrátových sítí, výměna zdravotnických informací, cloudové aplikace, přístup typu „přineste si vlastní počítač“ či používání osobních zdravotních záznamů (Personal Health Records–PHRs). Rafinovanost malwaru a bezpečnostní hrozby se neustále stupňují. K těmto problémům lze dále přiřadit omezené finanční prostředky, které mají zdravotnická zařízení k dispozici v oblasti snižování rizik, a zároveň zvyšující se závažnost důsledků případného selhání při ochraně citlivých informací. Tato bílá kniha popisuje standardní postup, pomocí něhož mohou zdravotnická zařízení vyhodnotit rizika a zformulovat nutné požadavky na zabezpečení a ochranu dat. Nabízíme také několikavrstvou strategii hloubkové ochrany, která může zdravotnickým organizacím pomoci v průběhu životního cyklu hrozby snížit rizika a zabezpečit tak důvěrnost, celistvost a dostupnost citlivých informací. Na základě toho pak hovoříme o specifických bezpečnostních potřebách a potřebách ochrany dat ve zdravotnických organizacích a popisujeme několik technologií Intel®, jež mohou těmto potřebám vyjít vstříc, protože snižují riziko ztráty nebo odcizení citlivých informací chrání momentálně nevyužívané, přesouvané i právě používané citlivé informace chrání přístup k citlivým informacím pomocí silné autentizace umožňují lépe plnit kritéria politiky zabezpečení a ochrany osobních dat.
Higher quality and lower costs of patient care depend on digitization of medical records and on switching to electronic patient records. These records contain a type of sensitive information also called electronic protected health information – ePHR. Compared to its paper equivalents, sensitive information in the electronic form is associated with new weak points. Security risks and risks associated with the protection of sensitive information have been rising due to a number of trends growing ever stronger in medicine. Such risks include, for example, mobility of the physicians and the use of wireless networks, medical data exchange, cloud applications, “bring your own computer“ access or the use of personal health records – PHRs. The artfulness of malware and the security threats have been rising constantly. Moreover, restricted financial resources available to medical facilities in the field of risk reduction can be added to such problems, as well as ever more serious consequences of any failure of sensitive information protection. This white book describes a standard procedure that can be used by medical facilities to assess the risks and formulate necessary requirements for data security and protection. Multiple layered strategy of deep protection is also offered, which may help medical organizations to reduce the risks in the course of the threat life cycle, and thus to secure the confidence, integrity and availability of sensitive information. Based on the above, specific security needs and data protection needs in medical organizations are discussed, and several Intel® technologies are described, which may accommodate the needs, given that they reduce the risk of loss or theft of sensitive information, they protect sensitive information currently being unused, transferred and used, and they protect access to sensitive information using strong authentication that makes it possible to better fulfil the criteria of the security and personal data protection policy.
- Keywords
- Integrované datové rozhraní zdravotnictví,
- MeSH
- Medical Records Systems, Computerized MeSH
- Information Dissemination MeSH
- Standard of Care organization & administration MeSH
- Database Management Systems instrumentation MeSH
- Telemedicine * trends legislation & jurisprudence MeSH
- Information Storage and Retrieval trends legislation & jurisprudence MeSH
- Legislation, Medical MeSH
- Health Care Quality, Access, and Evaluation MeSH
- Health Information Systems * organization & administration trends MeSH
- Publication type
- Newspaper Article MeSH
- Interview MeSH
Nasazení elektronických identifikátorů (čipových karet) do systému poskytování zdravotní péče je systémovým řešením, které podpoří zavedení lepšího sledování finančních toků ve zdravotnictví. Sníží nadužívání péče a další negativní jevy s výrazným finančním přínosem. Další výhodou je zlepšení dostupností zdravotní dokumentace a podpora vedení zdravotnické dokumentace v elektronické formě.
Nasazení moderních informačních technologií přináší zdravotnictví řadu výhod (např. možnost konzultací specializovaných pracovišť, rychlé získání výsledků vyšetření i starších informací z databáze apod.), ale i řadu problémů (např. otázky ochrany osobních údajů). Jedním z nich – otázkou, kdo je vůbec vlastníkem (zdravotnické zařízení, pacient, stát) zdravotnické dokumentace a kdo k ní má mít (a za jakých podmínek) přístup, se zabývá právě tento materiál.
- MeSH
- Medical Records Systems, Computerized organization & administration utilization legislation & jurisprudence MeSH
- Confidentiality standards legislation & jurisprudence MeSH
- Financing, Organized MeSH
- Information Systems trends utilization legislation & jurisprudence MeSH
- Humans MeSH
- Patient Rights standards legislation & jurisprudence MeSH
- Access to Information legislation & jurisprudence MeSH
- Patient Access to Records standards legislation & jurisprudence MeSH
- Ownership standards legislation & jurisprudence MeSH
- Legislation, Medical standards MeSH
- Check Tag
- Humans MeSH
Závěrečná zpráva o řešení grantu Interní grantové agentury MZ ČR
1 svazek : ilustrace, tabulky ; 30 cm
Writing algorithms for transfer and pre-processing of data on medical devices in hospitals and clinics and their purchases from hospital information systems. Creation of a data base of purchased and operated devices. Writing algorithms for data analysisusing statistical methods. Creation of a methodology for provided data analysis using data mining methods. Creation of algorithms for automated generating of analytical reports. Creation of IS modules incl. user interface and access control module.
Vytvoření algoritmů pro přenos a předběžné zpracování údajů o přístrojovém vybavení zdravotnických zařízení a jejich nákupech z informačních systémů zdravotnických zařízení. Vytvoření databáze nakoupených a provozovaných přístrojů. Vytvoření algoritmu pro analýzu dat pomocí statistických metod. Vytvoření metodiky analýzy poskytovaných dat na základě metod data miningu. Vytvoření algoritmů pro automatické generováni analytických zpráv. Vytvoření modulů informačního systému, včetně uživatelského rozhranía modulu řízení přístupu.
- MeSH
- Algorithms MeSH
- Data Mining MeSH
- Information Systems MeSH
- Information Storage and Retrieval MeSH
- User-Computer Interface MeSH
- Public Health Informatics MeSH
- Group Purchasing MeSH
- Computer Security MeSH
- Equipment and Supplies MeSH
- Conspectus
- Informační věda
- NML Fields
- technika lékařská, zdravotnický materiál a protetika
- lékařská informatika
- NML Publication type
- závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR
