Syphilis is a multistage sexually transmitted disease caused by Treponema pallidum ssp. pallidum. In the Czech Republic, there are around 700-800 new syphilis cases annually, continuously increasing since 2012. This study analyzed a total of 1228 samples from 2004 to 2022. Of the PCR-positive typeable samples (n = 415), 68.7% were fully-typed (FT), and 31.3% were partially-typed. Most of the identified isolates belonged to the SS14-clade and only 6.3% were the Nichols-like cluster. While in the beginning of sample collection isolates have been macrolide-susceptible, recent isolates are completely resistant to macrolides. Among the FT samples, 34 different allelic profiles (APs) were found. Most of the profiles (n = 27) appeared just once in the Czech population, while seven profiles were detected more than twice. The most frequent APs belonged to two separate groups of SS14-like isolates, including group of 1.3.1 (ST 1) and 1.26.1 (ST 25) profiles, and the second group containing 1.1.8 (ST 3), 1.1.1 (ST 2), and 1.1.3 (ST 11) (representing 57.5%, and 25.3% of all detected APs, respectively). Both groups consistently differed in 6 nucleotide positions in five genes (TP0150, TP0324, TP0515, TP0548, and TP0691) coding amino-acid replacements suggesting that one or more of these differences could be involved in the higher success of the first group.

• MeSH
• alely * MeSH
• dospělí MeSH
• genotyp MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• makrolidy farmakologie   MeSH
• multilokusová sekvenční typizace * MeSH
• syfilis * mikrobiologie   epidemiologie   genetika   MeSH
• Treponema pallidum * genetika   izolace a purifikace   MeSH
• Check Tag
• dospělí MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

Cíl práce: Kandidémie patří mezi poměrně časté infekční komplikace u kriticky nemocných pacientů. V posledním desetiletí se díky novým terapeutickým přístupům (zejména u některých skupin pacientů) mění spektrum kvasinek, které infekci způsobují. Předkládaná multicentrická studie si dala za úkol získat aktuální informace o epidemiologické situaci týkající se invazivních kandidóz (IC) v České republice. Materiál a metody: Do souboru byla zařazena data pacientů s kultivačně pozitivním nálezem kvasinky v krvi z 11 mikrobiologických pracovišť v České republice v rozmezí let 2012–2015. Byla hodnocena incidence, zastoupení jednotlivých kvasinkových druhů podle sledovaných let, podle věku a podle odborností. Dále byl posouzen vliv kolonizace a nakonec zda IC předcházela přítomnost toxigenního kmene Clostridium difficile ve stolici. U části izolovaných kmenů byly standardní metodikou stanoveny minimální inhibiční koncentrace (MIC) systémových antimykotik. Výsledky: V průběhu sledovaného období bylo v zúčastněných laboratořích zachyceno 921 kvasinkových kmenů od 886 pacientů. Celková incidence IC na 1 000 přijatých pacientů byla 0,40 (rozmezí 0,21–1,22 podle pracovišť). Takřka polovina izolátů spadala do druhu Candida albicans (49,7 %), následovaná Candida glabrata (15,3 %) a Candida parapsilosis (11,2 %). Na onkologických odděleních výrazně převažovaly non-albicans druhy (71,6 %), na rozdíl od chirurgických (40,4 %) nebo interních (52,0 %) oborů. Více než 70,0 % pacientů bylo v době pozitivní kultivace hospitalizováno na jednotkách intenzivní péče (JIP) a 65,0 % nemocných bylo kolonizováno stejným druhem kvasinky, který byl později nalezen v hemokultuře. Pouze u 5,1 % pacientů z celkového počtu byla potvrzena předchozí přítomnost toxigenního kmene C. difficile ve stolici. Celkem bylo otestováno 56 kmenů kvasinek (z 921) a byla zaznamenána zvýšená MIC u azolů pro C. glabrata. Závěr: Incidence kandidémií v České republice se ve sledovaném období výrazně neměnila a po C. albicans je druhou nejčastěji izolovanou kvasinkou v krvi C. glabrata.

Background: Candidemia is a severe and often life-threatening infection frequently occurring in critically ill patients. During the last decade, new therapeutic and prophylactic strategies influenced (at least in some patient subgroups) the epidemiological situation and the spectrum of causative Candida strains. The present multicentre study aimed to assess the current epidemiological situation of Candida strains causing invasive candidiasis (IC) in patients of tertiary care hospitals in the Czech Republic. Material and methods: Clinical and microbiological data on patients with bloodstream yeast isolates collected in 11 tertiary care hospitals in the Czech Republic between 2012 and 2015 were analysed. The incidence of cases and species distribution were assessed by study year, age, and specialty. Moreover, an association with the Candida colonization and presence of toxigenic strains of Clostridium difficile in stool prior to blood culture positivity was analysed. For some of the strains, minimum inhibitory concentrations (MICs) of systemic antifungals were determined using standard methods. Results: A total of 886 episodes of candidemia (921 yeast strains) were identified during the study period. The overall incidence per 1000 admissions was 0.40 (range 0.21–1.22 depending on the hospital). Almost half of the isolates belonged to the species Candida albicans (49.7 %), followed by Candida glabrata (15.3 %) and Candida parapsilosis (11.2 %). Non-albicans species of Candida significantly predominated in oncology wards (71.6 %) as compared to surgery (40.4 %) or internal medicine (52.0 %) departments. More than 70.0 % of patients stayed in intensive care units at the time of positive culture; in 65.0 % of patients, colonization with the same yeast species preceded blood culture positivity. In only 5.1 % of all patients, the previous presence of toxigenic strains of Clostridium difficile in stool was found. Fifty-six of the 921 yeast strains were tested for antifungal susceptibility, with an increase in MICs to azoles being observed for C. glabrata. Conclusion: The incidence of candidemia in the Czech Republic did not vary significantly between 2012 and 2015, and C. glabrata was the second most common yeast species after C. albicans isolated from blood.

• MeSH
• antifungální látky MeSH
• Candida klasifikace   patogenita   MeSH
• incidence MeSH
• infekce spojené se zdravotní péčí * MeSH
• kandidemie * diagnóza   epidemiologie   krev   MeSH
• lidé MeSH
• mikrobiální testy citlivosti metody   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• multicentrická studie MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

U pacientek s předčasným odtokem plodové vody bude ve vzorcích plodové vody odebrané transabdominální amniocentézou stanovena: a) bakteriální nálož genitálních mykoplazmat a Streptococcus agalactiae rozdílnými kvantifikačními technikami. b) intenzita intraamniální inflamatorní odpovědi na přítomnost bakterií v plodové vodě stanovením vybraných cytokinů, chemokinů a alarminů. Budou identifikovány “kritické” bakteriální nálože těchto mikroorganizmů v plodové vodě zodpovědné za rozvoj závažné intraamniální infekce a zánětu. Tento proces je zřejmě závislý na gestačním stáří, proto budou hodnoty stanoveny pro tři rozdílné periody těhotenství mezi 24.-36. týdnem gravidity. Klinické pozorování budou verifikována na experimentálním modelu vytvořeném z plodových obalů. Možnost klinického využití jednoduchého relativního kvantifikačního přístupu ke stanovení nálože genitálních mykoplazmat - threshold cycle (Ct) hodnoty z real-time PCR bude validována absolutní kvantifikací.; The sample of amniotic fluid will be retrieval by transabdominal amniocentesis. The bacterial load of genital mycoplasmas/Streptococcus agalactiae with different quantification approach along with intensity of intraamniotic inflammatory response to bacteria by a panel of cytokines, chemokines and alarmins will be determined. The “critical” values of microbial burden responsible for exhibition of intensive intraamniotic infection and inflammation will be proposed. These values will be described for three different periods of pregnancy. Clinical observations will be verified with using of amnio-chorion explant model. The efficacy of threshold cycle value of real time PCR will be validated by absolute quantification approach.

• MeSH
• amnion mikrobiologie   MeSH
• chorioamnionitida MeSH
• fyziologie bakterií MeSH
• histologie MeSH
• infekční komplikace v těhotenství MeSH
• interleukin-6 analýza   MeSH
• mykoplazmové infekce patofyziologie   MeSH
• nemoci novorozenců MeSH
• plodová voda mikrobiologie   MeSH
• předčasná porodní činnost MeSH
• předčasný odtok plodové vody MeSH
• Streptococcus agalactiae patogenita   MeSH
• těhotné ženy MeSH
• zralost orgánů plodu MeSH

• Konspekt
• Gynekologie. Porodnictví
• NLK Obory
• gynekologie a porodnictví
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

• Publikační typ
• abstrakt z konference MeSH

• Publikační typ
• abstrakt z konference MeSH

Vulvovaginální kandidóza je po bakteriální vaginóze celosvětově druhým nejčastějším zánětlivým onemocněním pochvy. Etiologickým agens jsou kvasinkové mikroorganizmy, spadající v naprosté většině případů do rodu Candida. Během fertilního období se s vulvovaginální kandidózou setká až 75 % žen, přičemž 40 % z nich má zkušenosti s rekurencí. Etiologicky převládá Candida albicans, izolovaná téměř v 90 % případů. Léčba kvasinkové infekce spočívá v podání lokálních a/nebo systémových antimykotik a v eliminaci rizikových faktorů, vedoucích k jejímu vzniku.

Vulvovaginal candidiasis is the second most common vaginal infection after bacterial vaginosis. It is caused by yeasts, the vast majority of which belong to the genus Candida. Vulvovaginal candidiasis affects as many as 75% of women during their childbearing years and 40% of them experience recurrences. The most common etiological agent is Candida albicans, which is responsible for nearly 90% of cases. Vulvovaginal candidiasis can be treated with topical and/or systemic antifungals while risk factors for the infection must be eliminated.

• MeSH
• antifungální látky aplikace a dávkování   terapeutické užití   MeSH
• Candida albicans MeSH
• diferenciální diagnóza MeSH
• kandidóza vulvovaginální * diagnóza   etiologie   farmakoterapie   patofyziologie   prevence a kontrola   MeSH
• léčivé přípravky MeSH
• lidé MeSH
• recidiva MeSH
• rizikové faktory MeSH
• způsoby aplikace léků MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH
• přehledy MeSH

Cílem práce bylo zhodnotit molekulárně genetickými metodami (MGM) spektrum původců dermatofytóz na území České republiky s rozdělením podle hlavních klinických forem. Během dvou let (červenec 2011 až červen 2013) bylo na šesti regionálních pracovištích zachyceno 3235 kultivačně pozitivních vzorků s dermatofyty. Nejvyšší počet izolátů pocházel z případů tinea unguium (55,5 %), dále t. corporis (29,2 %), t. pedis (14,6 %) a t. capitis (0,7 %). Druhová identifikace izolátů všech druhů (n = 672) s výjimkou Trichophyton rubrum (n = 2 563) byla provedena MGM (PCR-fingerprinting nebo sekvenace ITS oblasti rDNA). Pro T. rubrum byla molekulárně ověřena jen identifikace morfologicky nejednoznačných izolátů (n = 189). Celkem bylo identifikováno 14 druhů dermatofytů, přičemž nejvýznamnější změnou oproti minulosti bylo vysoké zastoupení zoofilního druhu Arthroderma benhamiae, který působil velkou část případů t. corporis (22,9 %) a t. capitis (29,2 %). Geofilní druhy působily jen 1,3 % všech infekcí, přestože se jednalo o druhově nejpočetnější skupinu, ve které byly odhaleny dva nepopsané druhy a také přehlížené druhy Microsporum persicolor a M. fulvum. Klíčová slova: Arthroderma benhamiae – DNA sekvenace – geofilní dermatofyty – ITS oblast rDNA – PCR-fingerprinting – tinea capitis – tinea corporis – tinea pedis – tinea unguium – zoofilní dermatofyty

The aim of the study was to evaluate the spectrum of causative agents of the main clinical forms of dermatophytoses in the Czech Republic by molecular genetic methods (MGM). During two years (from July 2011 to June 2013), 3255 cultivation specimens were positive for dermatophytes. The highest number of specimens was isolated from tinea unguinum (55,5%), then tinea corporis (29,2%), tinea pedis (14,6%) and tinea capitis (0,7%). The identification of isolated species (n = 672) except for Trichophytom rubrum (n = 2563) was performed by MGM (PCR fingerprinting or sequencing of ITS segments of rDNA). For T. rubrum only morphologically non-clear isolates were identified (n = 189). In total, 14 species of dermatophytes were identified. The most important change noticed compared to previous results was an increased detection of Arthroderma benhamiae in the cases of tinea corporis (22,9%) and tinea capitis (29,2%). Geophilic species caused only 1,3% of all infections even if this group comprised the highest number of species with two newly described ones and also Microsporum persicolor and M. fulvum wich are usually overlooked in the morphological examination. Key words: Arthroderma benhamiae – DNA sequencing – geophilic dermatopytes – ITS region of rDNA – PCR-fingerprinting – tinea capitis – tinea corporis – tinea pedis – tinea unguinum – zoophilic dermatophytes

• Klíčová slova
• Arthroderma benhamiae, zoofilní dermatofyty, tinea unguium, tinea corporis, PCR-fingerprinting, ITS oblast rDNA, geofilní dermatofyty, Trichophyton rubrum,
• MeSH
• Arthrodermataceae genetika   izolace a purifikace   klasifikace   MeSH
• dermatomykózy * epidemiologie   genetika   mikrobiologie   MeSH
• DNA fingerprinting MeSH
• DNA fungální analýza   MeSH
• DNA primery diagnostické užití   MeSH
• druhová specificita MeSH
• houby * genetika   izolace a purifikace   klasifikace   MeSH
• lidé MeSH
• Microsporum genetika   izolace a purifikace   klasifikace   MeSH
• mykologické určovací techniky metody   MeSH
• polymerázová řetězová reakce MeSH
• ribozomální DNA MeSH
• sekvenční analýza DNA MeSH
• tinea capitis epidemiologie   genetika   mikrobiologie   MeSH
• tinea pedis epidemiologie   genetika   mikrobiologie   MeSH
• tinea * epidemiologie   genetika   mikrobiologie   MeSH
• Trichophyton genetika   izolace a purifikace   klasifikace   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

Uvádíme kazuistiku kožní mykotické infekce typu tinea corporis u čtyřicetileté ženy. Ložisko infekce bylo lokalizované na hřbetu levé ruky a nereagovalo na úvodní lokální léčbu ciklopiroxolaminem. Změna léčby na systémovou terapii terbinafinem byla spojena s výskytem nežádoucích účinků a musela být ukončena. Ložisko bylo úspěšně vyléčeno kombinací lokálních antimykotik naftifinu a natamycinu. Jako původce infekce byl izolován zástupce geofilních dermatofytů Microsporum incurvatum, který je poměrně vzácně izolován z klinického materiálu a pravděpodobně žádný případ infekce zatím nebyl popsán v České republice. Identifikace izolátu byla ověřena sekvenací oblasti ITS rDNA. Vzhledem k morfologické podobnosti s druhy M. gypseum a M. fulvum je možné, že část infekcí přisuzovaných těmto druhům je ve skutečnosti působena právě M. incurvatum. Dále se v článku diskutuje o kontroverzní taxonomii druhu spolu s možnostmi, jak je možné ho rozlišit od příbuzných druhů. Klíčová slova: Arthroderma – ciklopiroxolamin – dermatofytózy – naftifin – natamycin – terbinafin

We present a case of mycotic infection of tinea corporis type in a forty-year old woman. The lesion was localised on the dorsal aspect of the left hand and did not react to ciclopirox olamine. The systemic therapy by terbinafine was stopped because of its side effects. The lesion was treated successfully with local antimycotics naftifine and natamycin. The geophillic dermatophyte Microsporum incurvatum was isolated and verified by the sequencing of ITS rDNA. This dermatophyte is rarely isolated from clinical material and probably no case was described in the Czech Republic. It is possible that some infections caused by M. incurvatum are attributed to M. gypseum and M. fulvum due to morphologic similarity of these species. The controversial taxonomy of this species and possibility of its differentiation from other species is discussed as well. Key words: Arthroderma – ciclopirox olamine– dermatophytoses – naftifine – natamycin – terbinafine

• Klíčová slova
• ciklopiroxolamin, naftifin, dermatofytózy,
• MeSH
• allylamin analogy a deriváty   terapeutické užití   MeSH
• antibakteriální látky terapeutické užití   MeSH
• antifungální látky * terapeutické užití   MeSH
• antiinfekční látky lokální terapeutické užití   MeSH
• Arthrodermataceae genetika   izolace a purifikace   klasifikace   MeSH
• DNA fungální MeSH
• dospělí MeSH
• inhibitory enzymů škodlivé účinky   terapeutické užití   MeSH
• kombinovaná farmakoterapie MeSH
• lidé MeSH
• Microsporum * genetika   izolace a purifikace   klasifikace   MeSH
• naftaleny škodlivé účinky   terapeutické užití   MeSH
• natamycin terapeutické užití   MeSH
• pyridony škodlivé účinky   terapeutické užití   MeSH
• ribozomální DNA MeSH
• ruka MeSH
• sekvenční analýza DNA MeSH
• terbinafin MeSH
• terminologie jako téma MeSH
• tinea * diagnóza   farmakoterapie   MeSH
• Check Tag
• dospělí MeSH
• lidé MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• kazuistiky MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

Taxonomie dermatofytů prošla v minulosti řadou výrazných změn a nikdy nebyla příliš stabilní. Poslední rozsáhlejší změny proběhly v souvislosti s revizí skupiny molekulárně genetickými metodami. Hlavním cílem této práce je seznámit čtenáře s pokroky v taxonomii dermatofytů a prostřednictvím seznamu doporučených jmen sjednotit pojmenovávání druhů napříč českými pracovišti. To by mělo nejen usnadnit komunikaci, ale také porovnávání výsledků se zahraniční literaturou. Jedním z doporučení je například ukončení používání jména Trichophyton mentagrophytes v klinické praxi. V úvodu textu se diskutuje o problematickém konceptu druhu u dermatofytů, jehož rozdílná aplikace může mít velký vliv na počet uznávaných druhů. Závěrečná část je věnována budoucím změnám souvisejícím s novým vydáním Mezinárodního kódu nomenklatury řas, hub a rostlin. Jedná se především o ukončení duální nomenklatury hub a vybrání jediného správného jména pro každý druh. Obecně se dá říci, že je vhodné preferovat jméno nepohlavního stadia (Trichophyton, Microsporum, Epidermophyton), s výjimkou případů, kde toto jméno není k dispozici (např. Arthroderma benhamiae). Klíčová slova: Arthroderma – druhový koncept – fylogeneze – Mezinárodní nomenklatorický kód – jedna houba, jedno jméno – polyfázický přístup – Trichophyton interdigitale – Trichophyton mentagrophytes

Taxonomy of dermatophytes has changed significantly in the past and it has never been stable. Last extensive changes appeared after revision of the group by molecular genetic methods. This paper introduces the advances in taxonomy of dermatophytes and helps to unify the species names in use among the Czech laboratories to simplify their communication and comparison of the results with foreign literature. The complicated species concept of dermatophytes that might be applied differently and might influence the number of accepted species is discussed in the beginning. The last part is dedicated to future changes related to a new edition of the International Code of Nomenclature for algae, fungi, and plants namely to termination of a dual nomenclature of fungi and choosing the one correct name for each species. Key words: Atrhroderma – species concept – phylogeny – the International Code of Nomenclature – one fungus one name – polyphasic approach – Trichophyton interdigitale – Trichophyton mentagrophytes

• Klíčová slova
• druhový koncept, Trichophyton mentagrophytes, Trichophyton interdigitale, polyfázický přístup, Mezinárodní nomenklatorický kód, zoofilní druhy, geofilní druhy,
• MeSH
• Arthrodermataceae klasifikace   MeSH
• dermatomykózy mikrobiologie   MeSH
• Epidermophyton klasifikace   MeSH
• fylogeneze * MeSH
• houby klasifikace   MeSH
• lidé MeSH
• Microsporum klasifikace   MeSH
• mitosporické houby * izolace a purifikace   klasifikace   MeSH
• mykologické určovací techniky MeSH
• terminologie jako téma * MeSH
• Trichophyton klasifikace   MeSH
• zoonózy MeSH
• zvířata MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• zvířata MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH
• přehledy MeSH

AIMS: The aim of this study was to evaluate the antimicrobial effects of five natural substances against 50 clinical isolates of Mycoplasma hominis. METHODS AND RESULTS: The in vitro activity of selected natural compounds, cinnamon bark oil, anethole, carvacrol, eugenol and guaiazulene, was investigated against 50 M. hominis isolates cultivated from cervical swabs by the broth dilution method. All showed valuable antimicrobial activity against the tested isolates. Oil from the bark of Cinnamomum zeylanicum (MBC90 = 500 µg/mL) however was found to be the most effective. Carvacrol (MBC90 = 600 µg/mL) and eugenol (MBC90 = 1000 µg/mL) also possessed strong antimycoplasmal activity. CONCLUSIONS: The results indicate that cinnamon bark oil, carvacrol and eugenol have strong antimycoplasmal activity and the potential for use as antimicrobial agents in the treatment of mycoplasmal infections.

• MeSH
• anisoly farmakologie   MeSH
• azuleny farmakologie   MeSH
• eugenol farmakologie   MeSH
• mikrobiální testy citlivosti MeSH
• monoterpeny farmakologie   MeSH
• Mycoplasma hominis účinky léků   MeSH
• oleje prchavé farmakologie   MeSH
• seskviterpeny farmakologie   MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH