• MeSH
• bakteriologické techniky MeSH
• Morganella morganii izolace a purifikace   MeSH
• Pseudomonas aeruginosa izolace a purifikace   MeSH
• řízení kvality MeSH
• Salmonella izolace a purifikace   MeSH
• Streptococcus izolace a purifikace   MeSH
• testování odbornosti laboratoří * MeSH

We report a very rare case of Streptococcus canis native infective endocarditis in a 73-year-old woman living in close contact with her dog. Her echocardiography showed large calcifications in the mitral annulus, massive regurgitation below the posterior leaflet, and adjacent vegetation. Blood culture was positive for Streptococcus Lancefield group G. A coronary artery bypass and mitral valve replacement had to be done. Streptococcus canis was detected in a heart valve using a broad range PCR followed by 16S rRNA and confirmed by tuf gene sequencing, while tissue culture remained negative. The patient was not bitten by her dog nor did she have comorbidities or skin ulcers. She fully recovered.

• MeSH
• bakteriální endokarditida diagnóza   mikrobiologie   patologie   chirurgie   MeSH
• DNA bakterií chemie   genetika   MeSH
• echokardiografie MeSH
• elongační faktor Tu genetika   MeSH
• fylogeneze MeSH
• kalcinóza diagnostické zobrazování   MeSH
• koronární bypass MeSH
• krev mikrobiologie   MeSH
• lidé MeSH
• mitrální chlopeň diagnostické zobrazování   patologie   chirurgie   MeSH
• polymerázová řetězová reakce MeSH
• ribozomální DNA chemie   genetika   MeSH
• RNA ribozomální 16S genetika   MeSH
• sekvenční analýza DNA MeSH
• senioři MeSH
• shluková analýza MeSH
• Streptococcus klasifikace   izolace a purifikace   MeSH
• streptokokové infekce diagnóza   mikrobiologie   patologie   chirurgie   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• senioři MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• kazuistiky MeSH

V roce 2017 bylo do surveillance databáze (spojující data NRL a data EPIDATu) zařazeno celkem 444 případůinvazivních pneumokokových onemocnění (IPO). Celková nemocnost IPO v roce 2017 dosáhla hodnoty 4,2/100000 obyvatel a oproti roku 2016 stoupla z hodnoty 3,1/100 000 obyvatel. Tento vzestup celkové nemocnostizpůsobil vzestup nemocnosti především ve věkové skupině dětí do 1 roku s hodnotou 3,6/100 000 obyvatel, tj. 4případy IPO (v roce 2016 - 0,9/100 000 obyvatel, 1 IPO). Nejvíce případů IPO opět zůstává ve věkové skupině 65let a starší s absolutním počtem 238 IPO a s nemocností 12/100 000 obyvatel.Množství očkovaných případů IPO pneumokokovými vakcínami bylo 22, děti: 0-4 roky 5 případů IPO, 5-9 let 3případy IPO. Vzrostl počet naočkovaných pacientů ve věkové skupině 65 let a starší.Zaznamenali jsme 3 onemocnění IPO u dětí pod 5 let věku, které přestože byly naočkované pneumokokovouvakcínou, onemocněly sérotypem, který se v dané vakcíně vyskytuje.Celková smrtnost zaznamenala pokles, z 20,4% v roce 2016 na 17,8% v roce 2017. Bylo hlášeno 79 úmrtí naIPO, tedy o 13 úmrtí více než v roce 2016. Nejvíce ve věkové skupině 65 let a starší (45 úmrtí na IPO, smrtnost18,9%). Žádné úmrtí ve věkové skupině dětí pod 5 let věku.Z 444 případů IPO bylo zasláno do NRL k typizaci 420 (95%) izolátů Streptococcus pneumoniae. Všechny přípa-dy IPO jsou nahlášeny v EPIDATu.20 případů IPO bylo identifikováno pouze z klinického materiálu metodou PCR. U 31 případů IPO nebyl zjištěn sérotyp, v 7 případech z důvodu nedodání izolátu do NRL.Sérotypy 3 a 19A byly v roce 2017 zastoupeny nejčastěji.

In 2017, altogether 444 cases of invasive pneumococcal disease (IPD) were entered in the surveillance database(integrating NRL and EPIDAT data). The overall incidence of IPD increased from 3.1/100 000 population in 2016to 4.2/100 000 in 2017. This increase was mainly due to a higher incidence of IPD in children under 1 year of age,reaching 3.6/100 000, which represents nearly four cases per 100 000 children of this age group, i.e. four timesthe figure of 2016 (0.9/100 000, i.e. nearly 1 case per 100 000). The most afflicted age group was again 65 yearsand over, with 238 cases reported, corresponding to an incidence of 12/100 000.Twenty-two cases of IPD occurred in persons previously vaccinated with pneumococcal vaccines, five of whomwere children aged 0-4 years and three were five- to nine-year-olds. The number of vaccinated increased in theage group 65 years and over.Three cases of IPD caused by a vaccine serotype were reported in previously vaccinated children under five yearsof age.The overall case fatality rate decreased from 20.4 % in 2016 to 17.8 % in 2017. Seventy-nine deaths due to IPDwere reported in 2017, i.e. 13 deaths more than in 2016. The most afflicted age group was 65 years and over, with45 deaths due to IPD and a case fatality rate of 18.9 %. No fatal case occurred in children under five years of age.Four hundred and twenty (95 %) isolates of Streptococcus pneumoniae recovered from 444 cases of IPD werereferred to the NRL for typing. All cases of IPD were reported to the EPIDAT database.Twenty cases of IPD were diagnosed from clinical specimens by the PCR method alone. Serotype was not identi-fied in 31 cases; in seven cases because of failure to refer the isolates to the NRL.Serotypes 3 and 19A were most commonly identified in 2017.

• MeSH
• Haemophilus influenzae izolace a purifikace   MeSH
• hlášení nemocí MeSH
• kontrola infekčních nemocí MeSH
• lidé MeSH
• Neisseria meningitidis izolace a purifikace   MeSH
• pneumokokové infekce * epidemiologie   mikrobiologie   mortalita   MeSH
• sérotypizace MeSH
• Streptococcus izolace a purifikace   MeSH
• věkové rozložení MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• tabulky MeSH

Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis (SDSE), belonging to the group C and G streptococci, are human pathogens reported to cause clinical manifestations similar to infections caused by Streptococcus pyogenes. To scrutinize the distribution of gene coding for S. pyogenes virulence factors in SDSE, 255 isolates were collected from humans infected with SDSE in Vellore, a region in southern India, with high incidence of SDSE infections. Initial evaluation indicated SDSE isolates comprising of 82.35% group G and 17.64% group C. A multiplex PCR system was used to detect 21 gene encoding virulence-associated factors of S. pyogenes, like superantigens, DNases, proteinases, and other immune modulatory toxins. As validated by DNA sequencing of the PCR products, sequences homologous to speC, speG, speH, speI, speL, ssa and smeZ of the family of superantigen coding genes and for DNases like sdaD and sdc were detected in the SDSE collection. Furthermore, there was high abundance (48.12% in group G and 86.6% in group C SDSE) of scpA, the gene coding for C5a peptidase in these isolates. Higher abundance of S. pyogenes virulence factor genes was observed in SDSE of Lancefield group C as compared to group G, even though the incidence rates in former were lower. This study not only substantiates detection of S. pyogenes virulence factor genes in whole genome sequenced SDSE but also makes significant contribution towards the understanding of SDSE and its increasing virulence potential.

• MeSH
• bakteriální geny genetika   MeSH
• DNA bakterií genetika   MeSH
• faktory virulence genetika   MeSH
• genom bakteriální MeSH
• lidé MeSH
• molekulární sekvence - údaje MeSH
• multiplexová polymerázová řetězová reakce MeSH
• reprodukovatelnost výsledků MeSH
• Streptococcus pyogenes genetika   MeSH
• Streptococcus genetika   izolace a purifikace   patogenita   MeSH
• streptokokové infekce mikrobiologie   MeSH
• superantigeny genetika   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• Geografické názvy
• Indie MeSH

• MeSH
• bakteriologické techniky * MeSH
• mikrobiální testy citlivosti * statistika a číselné údaje   MeSH
• Neisseria gonorrhoeae izolace a purifikace   MeSH
• Pasteurella multocida izolace a purifikace   účinky léků   MeSH
• řízení kvality MeSH
• Salmonella enterica izolace a purifikace   MeSH
• Streptococcus pneumoniae účinky léků   MeSH
• Streptococcus izolace a purifikace   MeSH
• testování odbornosti laboratoří * statistika a číselné údaje   MeSH

Peritonzilárny absces u detí je veľmi zriedkavý. Ešte zriedkavejší je u detí v predškolskom veku a mladších. Manažment peritonzilárneho abscesu v detskej populácii sa v istých aspektoch líši od postupu u dospelých. Jeho diagnostika a liečba je do značnej miery ovplyvnená spoluprácou dieťaťa a anamnestickými údajmi o prekonaných infektoch. Nie vo všetkých prípadoch sa prejavuje typickými klinickými príznakmi a lokálnym nálezom. Včasná diagnóza a liečba peritonzilárneho abscesu u mladších detí sú obzvlášť dôležité, pretože respiračná insuficiencia môže nastať v skorom štádiu z dôvodu relatívne menších a viac zraniteľných dýchacích ciest u detského pacienta. Prezentujeme prípad peritonzilárneho abscesu u 15-mesačného dieťaťa s atypickým lokálnym nálezom.

Peritonsillar abscess in children is a rare condition, especially in case of children of preschool age. Management of peritonsillar abscess in children is different than those of adults in the certain aspects. Diagnosis and treatment is largely influenced by the cooperation of the child's and medical history data to overcome diseases. The typical clinical signs and local findings are not always shown. We report a case of a peritonsillar abscess in a 15 month old infant with atypical local findings.

• Klíčová slova
• Streptococcus betaheamolyticus, abscestonzilektomie,
• MeSH
• antibakteriální látky MeSH
• drenáž MeSH
• kojenec MeSH
• lidé MeSH
• peritonzilární absces * diagnóza   mikrobiologie   terapie   MeSH
• počítačová rentgenová tomografie MeSH
• Streptococcus izolace a purifikace   MeSH
• streptokokové infekce mikrobiologie   MeSH
• tonzilektomie MeSH
• Check Tag
• kojenec MeSH
• lidé MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• kazuistiky MeSH

• MeSH
• bakteriální infekce * diagnóza   MeSH
• Bordetella izolace a purifikace   MeSH
• Klebsiella izolace a purifikace   MeSH
• laboratoře MeSH
• lidé MeSH
• řízení kvality MeSH
• Salmonella izolace a purifikace   MeSH
• Streptococcus izolace a purifikace   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

Identification of vaginal fluids is an important step in the process of sexual assaults confirmation. Advances in both microbiology and molecular biology defined technical approaches allowing the discrimination of body fluids. These protocols are based on the identification of specific bacterial communities by microfloraDNA (mfDNA) amplification. A multiplex real time-PCR assay (ForFLUID kit) has been developed for identifying biological fluids and for discrimination among vaginal, oral and fecal samples. In order to test its efficacy and reliability of the assay in the identification of vaginal fluids, an interlaboratory evaluation has been performed on homogeneous vaginal swabs. All the involved laboratories were able to correctly recognize all the vaginal swabs, and no false positives were identified when the assay was applied on non-vaginal samples. The assay represents an useful molecular tool that can be easily adopted by forensic geneticists involved in vaginal fluid identification.

• MeSH
• cervikální hlen mikrobiologie   MeSH
• DNA bakterií genetika   MeSH
• dospělí MeSH
• Enterococcus faecalis genetika   izolace a purifikace   MeSH
• kvantitativní polymerázová řetězová reakce * MeSH
• laboratoře normy   MeSH
• Lactobacillus genetika   izolace a purifikace   MeSH
• lidé MeSH
• multiplexová polymerázová řetězová reakce * MeSH
• soudní lékařství normy   MeSH
• Staphylococcus genetika   izolace a purifikace   MeSH
• Streptococcus genetika   izolace a purifikace   MeSH
• vagina mikrobiologie   MeSH
• Check Tag
• dospělí MeSH
• lidé MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• hodnotící studie MeSH

Early childhood caries (ECC) has become a serious medical problem worldwide in the last decade. Bacterial microflora of the dental plaque and oral cavity is considered an important factor in the formation and progression of dental caries. The aim of this study was strain typing and comparison of bacterial isolates retrieved from caries lesions and root canal contents of the same teeth. In total, 18 pairs of presumptive streptococci and lactobacilli retrieved from dental caries and root canals isolated from ECC-affected children, were selected on the basis of biotyping results and rep-PCR fingerprinting with (GTG)5 primer. Strain typing was further done using the RiboPrinter microbial characterization system (DuPont Qualicon). The automated ribotyping determined 14 pairs of the strains (77.8 %) to be identical. The results obtained confirmed that identical bacterial strains colonized both the decayed dental surface and the necrotic content of the dental pulp cavity during the cariogenesis. Our finding supports the assumption that bacteria could penetrate through the damaged dental surface to the inner parts of the teeth.

• MeSH
• dítě MeSH
• DNA fingerprinting MeSH
• kavita zubní dřeně mikrobiologie   MeSH
• Lactococcus klasifikace   genetika   izolace a purifikace   fyziologie   MeSH
• lidé MeSH
• polymerázová řetězová reakce MeSH
• předškolní dítě MeSH
• ribotypizace MeSH
• Streptococcus klasifikace   genetika   izolace a purifikace   fyziologie   MeSH
• techniky typizace bakterií MeSH
• zubní kaz mikrobiologie   MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• předškolní dítě MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH
• srovnávací studie MeSH

• MeSH
• kongresy jako téma MeSH
• Streptococcus izolace a purifikace   patogenita   MeSH
• streptokokové infekce diagnóza   farmakoterapie   MeSH