CIMP Dotaz Zobrazit nápovědu
BACKGROUND: CpG Island Methylator Phenotype (CIMP) is an epigenetic phenotype in CRC characterized by hypermethylation of CpG islands in promoter regions of tumor suppressor genes, leading to their transcriptional silencing and loss of function. While the prevalence of CRC differs across geographical regions, no studies have compared prevalence of CIMP-High phenotype across regions. The purpose of this project was to compare the prevalence of CIMP across geographical regions after adjusting for variations in methodologies to measure CIMP in a meta-analysis. METHODS: We searched PubMed, Medline, and Embase for articles focusing on CIMP published from 2000 to 2018. Two reviewers independently identified 111 articles to be included in final meta-analysis. We classified methods used to quantify CIMP into 4 categories: a) Classical (MINT marker) Panel group b) Weisenberg-Ogino (W-O) group c) Human Methylation Arrays group and d) Miscellaneous group. We compared the prevalence of CIMP across geographical regions after correcting for methodological variations using meta-regression techniques. RESULTS: The pooled prevalence of CIMP-High across all studies was 22% (95% confidence interval:21-24%; I2 = 94.75%). Pooled prevalence of CIMP-H across Asia, Australia, Europe, North America and South America was 22, 21, 21, 27 and 25%, respectively. Meta-regression analysis identified no significant differences in the prevalence of CIMP-H across geographical regions after correction for methodological variations. In exploratory analysis, we observed variations in CIMP-H prevalence across countries. CONCLUSION: Although no differences were found for CIMP-H prevalence across countries, further studies are needed to compare the influence of demographic, lifestyle and environmental factors in relation to the prevalence of CIMP across geographical regions.
- MeSH
- CpG ostrůvky genetika MeSH
- fenotyp * MeSH
- genetická heterogenita MeSH
- kohortové studie MeSH
- kolorektální nádory genetika MeSH
- lidé MeSH
- metylace DNA genetika MeSH
- pití alkoholu škodlivé účinky genetika MeSH
- prevalence MeSH
- promotorové oblasti (genetika) genetika MeSH
- publikační zkreslení MeSH
- rizikové faktory MeSH
- umlčování genů MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- metaanalýza MeSH
- systematický přehled MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
- Indie MeSH
Oligodendrogliomy patří k vzácným, avšak nejlépe prozkoumaným nádorům v neuroonkologii. Již dlouho je známa jejich větší senzitivita na radioterapii a chemoterapii ve srovnání s ostatními gliomy. Specifickým nálezem je častá přítomnost chromozomální kodelece 1p/19q. Teprve výsledky dlouhodobého sledování nemocných ve dvou zásadních klinických studiích fáze III – RTOG 9402 a EORTC 26951 prokázaly příznivý účinek kombinované onkologické léčby radioterapie a chemoterapie v kombinaci prokarbazin, lomustin‑CCNU a vinkristin (PCV) u nemocných s anaplastickým oligodendrogliomem a anaplastickým oligoastrocytomem s 1p/19q kodelecí. Přítomnost kodelece 1p/19q je důležitým diagnostickým, pozitivním prognostickým a silným prediktivním biomarkerem oligodendrogliomů. Diskutuje se o dalších molekulárně genetických charakteristikách oligodendrogliomů – mutaci metabolického enzymu Izocitrát dehydrogenázy 1 a 2 (IDH 1/2), metylaci promotoru genu pro O‑6–metylguanin‑metyltransferázu (MGMT), hypermetylačním stavu ostrůvků cytozin‑guanin nádorového genomu (G‑CIMP) a možnosti léčby těchto nádorů. Uvedeny jsou aktuální poznatky optimálního managementu anaplastických oligodendrogliomů respektující zásady personalizované medicíny.
Oligodendrogliomas are uncommon but extensively investigated tumours in neurooncology. Their superior sensitivity to radiotherapy and chemotherapy compared to other gliomas has long been known. Chromosomal codeletion 1p/19q is frequent in this tumour type. A long-term follow up of two landmark phase III trials – RTOG 9402 and EORTC 26951 has shown a favourable effect of combined radiotherapy and chemotherapy - procarbazine, lomustine (CCNU), vincristine – in patients with anaplastic oligodendrogliomas and anaplastic oligoastrocytomas carrying the codeletion 1p/19q. This codeletion serves as an important diagnostic, positive prognostic and strong predictive biomarker. The role of the other molecular biomarkers (isocitrate dehydrogenase – IDH1, IDH2 mutations, methylation of the MGMT promoter, glioma cytosine - guanine islands methylator phenotype – G-CIMP) in oligodendroglial tumours is also discussed. All these data facilitate the new personalised approach to the management and treatment of anaplastic oligodendroglial tumours.
- Klíčová slova
- RTOG 9402, EORTC 26951,
- MeSH
- alkylační protinádorové látky farmakologie MeSH
- dakarbazin analogy a deriváty terapeutické užití MeSH
- delece genu MeSH
- DNA modifikační methylasy * genetika MeSH
- enzymy opravy DNA * genetika MeSH
- glutaráty metabolismus MeSH
- isocitrátdehydrogenasa * genetika metabolismus MeSH
- klinické zkoušky, fáze III jako téma MeSH
- kombinovaná terapie MeSH
- lidé MeSH
- lidské chromozomy, pár 1 genetika MeSH
- lidské chromozomy, pár 19 genetika MeSH
- lomustin farmakologie MeSH
- molekulární biologie MeSH
- mutace genetika MeSH
- nádorové biomarkery MeSH
- nádory nervového systému * diagnóza genetika terapie MeSH
- oligodendrogliom * diagnóza genetika terapie MeSH
- přežití MeSH
- prognóza MeSH
- prokarbazin farmakologie MeSH
- protokoly protinádorové kombinované chemoterapie * terapeutické užití MeSH
- randomizované kontrolované studie jako téma MeSH
- retrospektivní studie MeSH
- staging nádorů MeSH
- vinkristin farmakologie MeSH
- výsledek terapie MeSH
- vysokoenergetická radioterapie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
- přehledy MeSH
CIEĽ PRÁCE: Zlomeniny krčka radia detí predstavujú do 10 % traumatických lézií v oblasti lakťa a 1% zlomenín v detskom veku. Liečba je závislá od stupňa axiálnej dislokácie, s indikáciou operačnej liečby pri dislokácii nad 30-40 stupňov. Cieľom práce bolo vyhodnotenie výsledkov operačnej liečby zlomenín krčka radia v detskom veku. METÓDA: Súbor 23 pacientov so zlomeninou krčka radia bol vyhodnotený retrospektívne. Typ zlomeniny bolo určený podľa Judetovej klasifikácie. Hodnotené boli kvalita repozície na základe pooperačných rtg snímkov a funkčné výsledky s použitím klasifikácie podľa Métaizeau s odstupom 3-6 rokov od úrazu. VÝSLEDKY: V súbore 25 zlomenín bola použitá metodika CIMP (closed intramedullary pinning) u 17 zlomenín. Vyhodnotených bolo 15 zlomenín s priemernou pooperačnou reziduálnou dislokáciou zlomeniny 14.35 stupňa, s výborným funkčným výsledkom u 11 (73 %) pacientov, dobrým u 3 (20 %) pacientov a zlým u jedného (7 %) pacienta. DISKUSIA A ZÁVER: Na základe autormi dosiahnutých dobrých funkčných výsledkov metóda intramedulárnej repozície a fixácie zlomenín krčka podľa Métaizeau sa javí ako bezpečná a účinná.
OBJECT: Radial neck fractures in children present l0 percent of traumatic elbow lesions and l percent of all fractures in childhood. The treatment is influenced by initial axial angulation and operative treatment is advised for fractures with angulation more than 60 degrees. The aim of the study was to assess late functional outcomes of operatively treated radial neck fractures. METHOD: Retrospective series of 23 patients with radial neck fractures were assessed with using of Judet radial neck fracture classification scheme. Authors evaluated the quality of reduction according to postoperative X-ray films and functional outcome according to Métaizeau rating system at 3-6 years follow up. RESULTS: CIMP was used in 17 of 25 fractures treatment. Among 15 followed up fractures 11 (73 %) had excellent, 3 (20 %) good, and 1 (7 %) bad functional results with average postoperative residual fracture dislocation 14,35 grades. DISCUSSION AND CONCLUSION: The method of intramedullary reduction and fixation seems safe and effective in treatment of radial neck fractures.
Východiska: Kolorektální karcinom (colorectal cancer – CRC) je nádorové onemocnění tlustého střeva s každoročně diagnostikovanými téměř 1,3 miliony nových pacientů celosvětově. Mortalita na toto závažné nádorové onemocnění dosahuje již 8,5 %. Jedná se o 2. nečastější nádorové onemocnění u žen (1. nádor prsu) a 3. u mužů (1. nádor plic, 2. nádor prostaty). Tímto CRC patří vedle nádorů prsu, prostaty a plic k nejčastějším nádorovým onemocnění u mužů a žen na světě. V České republice je stále více než 50 % pacientů s CRC diagnostikováno v pokročilém stadiu (stadium III a IV). Z molekulárně genetického pohledu je CRC velice heterogenní onemocnění, na kterém se podílí mnoho faktorů. CRC má formu jak hereditární, kde dominují mutace v genech APC (FAP, aFAP), MMR (HNPCC) atd., jejíž výskyt se pohybuje okolo 5–10 %, tak formu sporadickou s výskytem 90–95 %, kde dochází k postupné akumulaci mutací v široké škále genů. Znalost genetické podstaty (APC, KRAS, MMR, mikroRNA, CIMP atd.) jak hereditární, tak sporadické formy CRC je nezbytná nejen pro zahájení léčby, ale také pro odhadnutí celkového rizika, prognózy a následného follow-up pacienta. Závěr: Tento článek shrnuje dosavadní molekulárně genetické aspekty patogeneze CRC.
Background: Colorectal cancer (CRC) remains a major health burden with an incidence of 1.3 million new cases worldwide and a mortality of almost 8.5%. It is the 2nd most common cancer in women (1st breast carcinoma) and 3rd most common in men (1st lung carcinoma, 2nd prostate carcinoma). CRC alongside breast, lung, prostate and stomach cancer is in the top five most common cancers in men and women worldwide. There are still more than 50% of CRC patients diagnosed with advanced disease (stage III and IV) in the Czech Republic. Genetically, CRC is a very heterogeneous disease with many factors playing key roles in pathogenesis. There are two types of CRC, hereditary with an incidence of between 5% and 10% with APC (FAP, aFAP) or MMR (HNPCC) genes affected, and sporadic colorectal cancer with an incidence of 90–95% with a lot of mutations in variable genes that accumulate during pathogenesis (APC, KRAS, MMR, microRNA, CIMP etc.). Knowledge of the molecular pathogenesis of CRC (hereditary, sporadic) is crucial for treatment, assessment of risk, prognosis, and patient follow-up. Conclusion: This article summarizes the molecular pathogenesis of sporadic and hereditary CRC.
- MeSH
- chromozomální nestabilita MeSH
- kolorektální nádory * epidemiologie etiologie genetika patofyziologie MeSH
- lidé MeSH
- mutace MeSH
- rizikové faktory MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
- přehledy MeSH
AIM: To compare molecular profiles of proximal colon, distal colon and rectum in large adenomas, early and late carcinomas. To assess feasibility of testing directed at molecular markers from this study in routine clinical practice. METHODS: A prospective 3-year study has resulted in the acquisition of samples from 159 large adenomas and 138 carcinomas along with associated clinical parameters including localization, grade and histological type for adenomas and localization and stage for carcinomas. A complex molecular phenotyping has been performed using multiplex ligation-dependent probe amplification technique for the evaluation of CpG-island methylator phenotype (CIMP), PCR fragment analysis for detection of microsatellite instability and denaturing capillary electrophoresis for sensitive detection of somatic mutations in KRAS, BRAF, TP53 and APC genes. RESULTS: Molecular types according to previously introduced Jass classification have been evaluated for large adenomas and early and late carcinomas. An increase in CIMP+ type, eventually accompanied with KRAS mutations, was notable between large adenomas and early carcinomas. As expected, the longitudinal observations revealed a correlation of the CIMP+/BRAF+ type with proximal location. CONCLUSION: Prospective molecular classification of tissue specimens is feasible in routine endoscopy practice. Increased frequency of some molecular types corresponds to the developmental stages of colorectal tumors. As expected, a clear distinction is notable for tumors located in proximal colon supposedly arising from the serrated (methylation) pathway.
- MeSH
- adenom genetika patologie chirurgie MeSH
- biopsie MeSH
- CpG ostrůvky MeSH
- dospělí MeSH
- karcinom genetika patologie chirurgie MeSH
- kolonoskopie * MeSH
- kolorektální nádory genetika patologie chirurgie MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- metylace DNA MeSH
- mikrosatelitní nestabilita MeSH
- multiplexová polymerázová řetězová reakce * MeSH
- mutace MeSH
- mutační analýza DNA MeSH
- nádorové biomarkery genetika MeSH
- nádorový supresorový protein p53 genetika MeSH
- prediktivní hodnota testů MeSH
- prospektivní studie MeSH
- protein familiární adenomatózní polypózy genetika MeSH
- protoonkogenní proteiny B-raf genetika MeSH
- protoonkogenní proteiny p21(ras) genetika MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- staging nádorů MeSH
- studie proveditelnosti MeSH
- stupeň nádoru MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- hodnotící studie MeSH
Kolorektálny karcinóm je v súčasnosti jedným z najčastejších nádorových ochorení vyskytujúcich sa v rozvinutých krajinách. Pochopenie molekulárnych princípov jeho vzniku patrí opätovne v poslednom čase medzi priority v oblasti onkogenetického výskumu. Kolorektálny karcinóm je zároveň aj vhodným modelom pre štúdium kancerogenézy z dôvodu dobrej dostupnosti prekanceróznych lézií a tiež z dôvodu existencie viacerých jasne popísaných hereditárnych foriem ako familiárna adenomatózna polypóza a Lynchov syndróm. Klasický model kolorektálnej tumorigenézy, popísaný Fearonom a Vogelsteinom, predstavuje tradičnú cestu vývoja kolorektálneho karcinómu zo sekvencie adenóm‑karcinóm. Tento model bol postavený na dôkladnej analýze mutácií v jednotlivých morfologických štádiách kancerogenézy, ktorých progresívna akumulácia vedie k malígnej transformácii kolonického epitelu. V posledných rokoch bol však prijatý aj alternatívny model vývoja kolorektálneho karcinómu zo seratovaných prekurzorov. Táto cesta vývoja, nazývaná aj seratovaná cesta, priniesla nový pohľad na kolorektálnu tumorigenézu. V súčasnosti sa predpokladajú minimálne tri molekulárne cesty kolorektálnej tumorigenézy: 1. cesta chromozómovej instability reprezentovaná dedičnou formou familiárnej adenomatóznej polypózy; 2. mutátorová cesta s mismach repair fenotypom reprezentovaná dedičnou formou Lynchovho syndrómu, ale aj časťou sporadických kolorektálných karcinomov; a 3. hypermetylačná seratovaná cesta charakterizovaná vysokou frekvenciou hypermetylácie CpG ostrovčekov promótorových oblastí určitých génov (CIMP+).
Colorectal cancer is currently one of the most frequent cancers in developed countries. Understanding the molecular principles of its pathogenesis has recently come into focus of many oncogenetic studies. Colorectal cancer also represents an ideal model for the study of molecular basis of cancerogenesis owing to the wide availability of its precursor lesions and the existence of several notorious genetic predispositions such as familial adenomatous polyposis and Lynch syndrome. The classical model of colorectal tumorigenesis, described by Fearon and Vogelstein, suggested the idea of a conventional progression from adenoma to carcinoma. It was based on a careful analysis of mutations occurring within particular stages of carcinogenesis with regards to their stepwise accumulations leading to neoplastic transformation of the colonic epithelium. Recently, new evidence has pointed to an alternative model of colorectal tumorigenesis introducing the concept of serrated precursors. This alternative pathway, known as the serrated pathway, has provided a new perspective on colorectal cancer development. Nowadays, three molecular pathways leading to colorectal tumorigenesis are recognized: 1. the chromosomal instability pathway typified by familial adenomatous polyposis; 2. the mutator pathway characterized by inactivation of DNA mismatch repair genes such as in Lynch syndrome or a number of sporadic colorectal cancers; 3. the hypermethylation serrated neoplasia pathway characterized by excessive methylation of some CpG islands in the promoter region of certain genes (positive CpG islands methylator phenotype) (CIMP+). Key words: colorectal cancer – colorectal tumorigenesis – Lynch syndrome – microsatellite instability – hypermethylation phenotype The author declares she has no potential conflicts of interest concerning drugs, products, or services used in the study. The Editorial Board declares that the manuscript met the ICMJE recommendation for biomedical papers. Submitted: 14. 7. 2016 Accepted: 8. 9. 2016
- Klíčová slova
- hypermetylační fenotyp, mutátorové geny,
- MeSH
- chromozomální nestabilita MeSH
- dědičné nepolypózní kolorektální nádory * diagnóza genetika MeSH
- epigeneze genetická MeSH
- geny APC MeSH
- imunohistochemie MeSH
- karcinogeneze * MeSH
- kolorektální nádory * etiologie genetika MeSH
- lidé MeSH
- metylace DNA MeSH
- mikrosatelitní nestabilita MeSH
- nádorová transformace buněk MeSH
- polypy tlustého střeva genetika MeSH
- střevní polypóza genetika MeSH
- tumor supresorové geny MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
Germ cell tumors and particularly seminomas reflect the epigenomic features of their parental primordial germ cells (PGCs), including genomic DNA hypomethylation and expression of pluripotent cell markers. Because the DNA hypomethylation might be a result of TET dioxygenase activity, we examined expression of TET1-3 enzymes and the level of their product, 5-hydroxymethylcytosine (5hmC), in a panel of histologically characterized seminomas and non-seminomatous germ cell tumors. Expression of TET dioxygenase mRNAs was quantified by real-time PCR. TET1 expression and the level of 5hmC were examined immunohistochemically. Quantitative assessment of 5-methylcytosine (5mC) and 5hmC levels was done by the liquid chromatography-mass spectroscopy technique. We found highly increased expression of TET1 dioxygenase in most seminomas and strong TET1 staining in seminoma cells. Isocitrate dehydrogenase 1 and 2 mutations were not detected, suggesting the enzymatic activity of TET1. The levels of 5mC and 5hmC in seminomas were found decreased in comparison to non-seminomatous germ cell tumors and healthy testicular tissue. We propose that TET1 expression should be studied as a potential marker of seminomas and mixed germ cell tumors and we suggest that elevated expression of TET dioxygenase enzymes is associated with the maintenance of low DNA methylation levels in seminomas. This "anti-methylator" phenotype of seminomas is in contrast to the CpG island methylator phenotype (CIMP) observed in a fraction of tumors of various types.
- MeSH
- 5-methylcytosin analogy a deriváty analýza MeSH
- dioxygenasy analýza genetika MeSH
- DNA vazebné proteiny analýza genetika MeSH
- dospělí MeSH
- lidé MeSH
- metylace DNA * MeSH
- oxygenasy se smíšenou funkcí analýza genetika MeSH
- protoonkogenní proteiny analýza genetika MeSH
- regulace genové exprese u nádorů MeSH
- seminom genetika patologie MeSH
- testikulární nádory genetika patologie MeSH
- testis metabolismus patologie MeSH
- upregulace MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
Cílem prospektivní studie bylo analyzovat elektrofyziologické abnormality u kriticky nemocných a jejich korelaci s histopatologickými abnormalitami, a tím ověřit možnost elektrofyziologické diferenciace polyneuropatie a myopatie kritického stavu (CIPM). Soubor 79 kriticky nemocných byl sledován po dobu 1 měsíce klinicky a elektrofyziologicky. Sledování dokončilo 48 nemocných. Elektrofyziologické abnormality svědčící pro nově vzniklou CIPM byly zjištěny během 5. týdne u 27 nemocných, u 9 nemocných byly přítomny již při vstupním vyšetření během 1. týdne. Dominujícími elektrofyziologickými abnormalitami (s výjimkou 1 nemocného) bylo snížení sumačních svalových akčních potenciálů (CMAP) či abnormální spontánní aktivita svědčící pro motorickou axonopatii nebo myopatii. U 11 nemocných s touto abnormalitou byla provedena svalová biopsie prokazující známky myogenního postižení ve všech případech (v 7 v kombinaci s neurogenním postižením). Snížení CMAP při přímé svalové stimulaci bylo nalezeno u 7 nemocných s histologickými známkami myopatie. Elektrofyziologické známky senzitivní neuropatie byly přítomny u 14 nemocných, pouze V 1 případě izolovaně. Studie potvrdila vysokou prevalenci CIPM u kriticky nemocných (56 %) s dominujícím motorickým postižením typu axonální neuropatie a myopatie, obvykle v kombinaci. Elektrofyziologická diferenciace obou typů postižení není spolehlivě možná. Nejcennějším elektrofyziologickým parametrem je amplituda CMAP umožňující časnou detekci a sledování stupně a dynamiky postižení.
The objective of the prospective study was to analyze electrophysiological abnormalities in critically ill patients and their correlation with histopathological abnormalities and to test thus the possibility of electrophysiological differentiation of critical illnes polyneurophathy and myopathy (CIPM). A group of 79 critically ill patients was followed up for one month by clinical and electrophysiological methods. The investigation was completed by 48 patients. Electrophysiological abnormalities suggesting a newly developed CIPM were found during the 5th week in 27 patients, in 9 patients they were present already during the baseline examination during the first week. The dominating electrophysiological abnormalities (with the exception of one patient) were a reduction of the total muscular action potentials (CMAP) or abnormal spontaneous activity suggesting motor axonopathy or myopathy. In 11 patients with this abnormality muscle biopsy was performed which proved signs of myogenetic affection in all instances (in 7 in combination with neurogenetic affection). Reduced CMAP during direct muscle stimulation was found in 7 patients with histological signs of myopathy. Electrophysiological signs of sensitive neuropathy were present in 14 patients, only in one patient isolated sensitive neuropathy. The investigation confirmed the high prevalence of CIMP in critically ill patients (56 %) with a dominating motor affection of the type of axonal neuropathy and myopathy, usually combined. Electrophysiological differentiation of both types of affections is not reliable. The most valuable electrophysiological parameter is the CMAP amplitude which makes early detection and the follow up of the grade and dynamics of the affection possible.