BACKGROUND: High-throughput bioinformatics analyses of next generation sequencing (NGS) data often require challenging pipeline optimization. The key problem is choosing appropriate tools and selecting the best parameters for optimal precision and recall. RESULTS: Here we introduce ToTem, a tool for automated pipeline optimization. ToTem is a stand-alone web application with a comprehensive graphical user interface (GUI). ToTem is written in Java and PHP with an underlying connection to a MySQL database. Its primary role is to automatically generate, execute and benchmark different variant calling pipeline settings. Our tool allows an analysis to be started from any level of the process and with the possibility of plugging almost any tool or code. To prevent an over-fitting of pipeline parameters, ToTem ensures the reproducibility of these by using cross validation techniques that penalize the final precision, recall and F-measure. The results are interpreted as interactive graphs and tables allowing an optimal pipeline to be selected, based on the user's priorities. Using ToTem, we were able to optimize somatic variant calling from ultra-deep targeted gene sequencing (TGS) data and germline variant detection in whole genome sequencing (WGS) data. CONCLUSIONS: ToTem is a tool for automated pipeline optimization which is freely available as a web application at  https://totem.software .

• MeSH
• Reproducibility of Results MeSH
• Software MeSH
• Computational Biology methods   MeSH
• High-Throughput Nucleotide Sequencing methods   MeSH
• Research Design MeSH
• Publication type
• Journal Article MeSH
• Research Support, Non-U.S. Gov't MeSH

U osob s chronickým srdečním selháním při významné systolické dysfunkci levé komory a prodlouženém komplexu QRS slouží srdeční resynchronizační léčba (SRL) k nápravě synchronicity depolarizace myokardu. Míra zlepšení klinického stavu a echokardiografického nálezu po jejím zavedení však závisí na různých parametrech – strukturálních změnách myokardu, poruchách nitrokomorového vedení a umístění stimulačních elektrod. K individualizaci léčby lze na implantovaných SRL přístrojích nastavit různé parametry, z nichž nejdůležitější jsou AV a VV intervaly. Ačkoliv jejich optimalizace byla předmětem rozsáhlých klinických studií, nepochybný důkaz o prospěšnosti optimalizace těchto intervalů stále chybí. Nejčastěji se k hodnocení optimalizace používá echokardiografie a metody založené na intrakardiální elektrokardiografii. Kvůli nedostatkům ve statistickém zpracování však nelze označit některou z metod jako referenční nebo použitelnou v každodenní klinické praxi. Echokardiografie je zatížena značnou variabilitou výsledků, jejichž kvalita je navíc silně závislá na zkušenosti vyšetřujícího. Optimalizace na podkladě intrakardiálních elektrokardiogramů zatím neprokázala jasně lepší výsledky než empirické nastavení přístroje. Slibnější metodou se zatím jeví hodnocení hemodynamiky prstovou pletysmografií, neboť získaná data jsou vysoce reproducibilní a nezávislá na erudici vyšetřujícího. Zatím však chybějí randomizované multicentrické dvojitě zaslepené studie s prstovou pletysmografií, které by zhodnotily význam této metody v optimalizaci SRL. Měření informačního obsahu jakýchkoliv dat týkajících se optimalizace SRL, analýza jejich reproducibility a všeobecné používání konfidenčních intervalů by mohly též pomoci nalézt další použitelné metody. Při hodnocení výsledků je často nezbytná úzká spolupráce se statistikem.

In patients with heart failure, left ventricular systolic dysfunction and prolonged QRS complex, cardiac resynchronization therapy (CRT) is a treatment method aimed at restoration of myocardial depolarization synchronicity. However, the extent of clinical and echocardiographic improvement depends on anatomical relations in individual patients, on structural changes in the heart, on intrinsic electrical activation, and on the position of pacing leads. Many parameters of CRT devices may be changed in order to tailor the function of CRT to the needs of a particular patient; the most important among them is AV and VV interval. The largest trials studying CRT used various methods for optimization of these intervals but unequivocal proof of the benefit brought by optimization is still lacking. Many methods were evaluated, most frequently based on echocardiography and intracardiac electrogram interval measurement. However, drawbacks in statistics make the studies of limited value for establishing a reference method or guidance for daily practice. Echocardiography has inherent variability of results and is highly operator dependent. Optimization based on intracardiac electrogram intervals has not proved yet to be of clear benefit above arbitrary AV interval. The most promising method is finger plethysmography. Measured data are highly reproducible and operator-independent. A randomized multicenter double-blind study using finger plethysmography is needed to prove the value of this method and of CRT optimization in general. The measurement of information content in any data suitable for CRT optimization, analysis of reproducibility and general usage of confidence intervals may show other methods appropriate for it, too. The cooperation with a statistician is oftentimes a necessity.

• MeSH
• Algorithms MeSH
• Ventricular Dysfunction, Left diagnosis   etiology   therapy   MeSH
• Echocardiography methods   utilization   MeSH
• Hemodynamics MeSH
• Cardiac Pacing, Artificial * methods   utilization   MeSH
• Humans MeSH
• Meta-Analysis as Topic MeSH
• Plethysmography methods   utilization   MeSH
• Signal Processing, Computer-Assisted MeSH
• Arrhythmias, Cardiac diagnosis   complications   therapy   MeSH
• Cardiac Resynchronization Therapy * methods   trends   utilization   MeSH
• Heart Failure * MeSH
• Statistics as Topic MeSH
• Check Tag
• Humans MeSH
• Publication type
• Research Support, Non-U.S. Gov't MeSH
• Review MeSH

Since their discovery, fermentation processes have gone along not only with the industrial beverages production and breweries, but since the times of Alexander Fleming, they have become a crucial part of the health care due to antibiotics production. However, complicated dynamics and strong nonlinearities cause that the production with the use of linear control methods achieves only suboptimal yields. From the variety of nonlinear approaches, gradient method has proved the ability to handle these issues--nevertheless, its potential in the field of fermentation processes has not been revealed completely. This paper describes constant vaporization control strategy based on a double-input optimization approach with a successful reduction to a single-input optimization task. To accomplish this, model structure used in the previous work is modified so that it corresponds with the new optimization strategy. Furthermore, choice of search step is explored and various alternatives are evaluated and compared.

• MeSH
• Algorithms MeSH
• Anti-Bacterial Agents biosynthesis   MeSH
• Chemistry, Pharmaceutical methods   MeSH
• Technology, Pharmaceutical MeSH
• Fermentation * MeSH
• Nonlinear Dynamics MeSH
• Penicillins biosynthesis   MeSH
• Computer Simulation MeSH
• Volatilization MeSH
• Research Design MeSH
• Publication type
• Journal Article MeSH
• Research Support, Non-U.S. Gov't MeSH

Retrospektivní analýza souboru 54 dospělých nemocných s chronickou myeloidní leukemií (CML) v chronické fázi, kteří byli léčeni imatinib mesylátem (IM) v 1. linii, se zaměřuje na zhodnocení prognostického významu časné molekulární odpovědi po 3 měsících léčby jako kritéria předpovídajícího rychlost dosažení optimální léčebné odpovědi na IM. Léčebná odpověď byla hodnocena cytogenetickými a molekulárními metodami s využitím kritérií European LeukemiaNet (ELN) z roku 2009. Celková délka sledování byla 12 až 95 měsíců (medián 37 měsíců). Odhadované přežití bez progrese (PFS), přežití bez události (EFS) a celkové přežití (OS) celého souboru nemocných v 5 letech je 80 %, 71 % a 89 %. Celkový výskyt kompletní cytogenetické odpovědi (CCyR) a velké molekulární odpovědi (MMR) po 18 měsících léčby byl 81 % a 56 %. Podle kritérií ELN dosáhlo 32 (59 %) nemocných optimální a 13 (24 %) suboptimální odpověď, zatímco u 9 (17 %) nemocných došlo k selhání léčby. Nemocní byli dále rozděleni podle hladiny exprese BCR-ABL (IS) po 3 měsících léčby IM do 3 skupin: ≤ 1,0 % (12 nemocných), > 1,0 a ≤ 10 % (26 nemocných) a > 10 % (16 nemocných). Při porovnání těchto 3 skupin bylo prokázáno, že nemocní s nižšími hladinami BCR-ABL (IS) po 3 měsících léčby IM měli signifikantně vyšší pravděpodobnost následného dosažení CCyR (p < 0,0001) a MMR (p < 0,0001) než nemocní s vyššími hladinami transkriptu. Pokud byla hodnocena odpověď na léčbu dle ELN kritérií, bylo prokázáno, že úroveň molekulární odpovědi po 3 měsících určila nemocné rychleji dosahující optimální léčebnou odpověď. Časné hodnocení molekulární odpovědi po 3 měsících léčby IM tak může u nemocných s CML identifikovat ty nemocné, kteří dříve dosáhnou CCyR a MMR.

Retrospective analysis of 54 adult patients with chronic myeloid leukemia in chronic phase treated with imatinib mesylate (IM) in first line is focused on evaluation of prognostic value of early molecular response after 3 months therapy as a predictive landmark of rate achievement optimal IM response. Treatment response was evaluated in cytogenetic and molecular analysis with application of European LeukemiaNet (ELN) 2009 criteria. The follow-up was 12 to 95 months (median 37 months). Estimated progression-free survival (PFS), event-free survival (EFS) and overall survival (OS) at 5 years were 80%, 71% a 89%. At 18 months, cumulative incidence of complete cytogenetic response (CCyR) and major molecular response (MMR) were 81% and 56%, respectively. According to ELN criteria; 32 patients (59%) achieved an optimal and 13 patients (24%) had a suboptimal response while 9 patients (17%) failed IM. Patients were divided into 3 categories according to the results of BCR-ABL transcript levels after 3 months IM therapy: ≤ 1,0% (12 patients), > 1,0 to ≤ 10% (26 patients) and > 10% (16 patients). Comparing these groups of patients it was revealed that patients with lower BCR-ABL (IS) levels after 3 months IM therapy had a significantly higher probability of subsequently obtaining a CCyR (p<0.0001) and MMR (p<0.0001) than patients with higher transcript levels. When we evaluated IM response according to the ELN criteria it was demonstrated that the degree of molecular response after 3 months determined patients quickly achieved optimal treatment response. Early evaluation of molecular response after 3 months of IM therapy in patients with CML can identify patients who early achieve CCyR and MMR.

• MeSH
• Leukemia, Myelogenous, Chronic, BCR-ABL Positive diagnosis   drug therapy   MeSH
• Molecular Mechanisms of Pharmacological Action MeSH
• Financing, Organized MeSH
• Humans MeSH
• Meta-Analysis as Topic MeSH
• Piperazines administration & dosage   adverse effects   therapeutic use   MeSH
• Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction methods   utilization   MeSH
• Prognosis MeSH
• Pyrimidines administration & dosage   adverse effects   therapeutic use   MeSH
• Retrospective Studies MeSH
• Statistics as Topic MeSH
• Outcome and Process Assessment, Health Care MeSH
• Check Tag
• Humans MeSH

Přehledný článek se zabývá současným postavením výživy a nutričních doporučení u chronického onemocnění ledvin. V úvodu je uveden stručný vývoj názorů na problematiku diety u nemocí ledvin od dvacátých let 20. století až do současnosti, kdy jsou známy závěry velkých studií. Je diskutována role diety s omezením bílkovin v různých stádiích onemocnění ledvin, včetně komplexních doporučení pro výživu u nemocných v pokročilejších stádiích renálního selhání, kdy je třeba respektovat další dietní omezení. V závěru jsou uvedeny některé praktické aspekty dietoterapie u nemocných léčených náhradou funkce ledvin a možnosti, jak zlepšit jejich nutriční stav a udržet dobrou kvalitu života.

The nutrition and current nutritional recommendations are reviewed in chronic kidney disease. The introduction presents a brief overview of theories on renal nutrition from the twenties of the 20th century to most recent studies including the results of large studies. The authors discuss the role of the diets with protein restriction in different stages of chronic kidney disease. The review also provides the comprehensive recommendations for optimal nutrition in patients with advanced chronic renal failure with a special attention to other dietary restrictions. Concluding remarks include some practical aspects of optimizing dietary nutrient intak e in patients receiving renal replacement therapy and also specific measures to improve the nutritional status and maintain a good q uality of life in patients with chronic kidney disease.

• MeSH
• Kidney Failure, Chronic * diet therapy   MeSH
• Nutritional Physiological Phenomena MeSH
• Humans MeSH
• Meta-Analysis as Topic MeSH
• Diet, Protein-Restricted * MeSH
• Practice Guidelines as Topic MeSH
• Check Tag
• Humans MeSH
• Publication type
• Review MeSH

Zdravá strava je důležitá pro udržování celkového zdraví a pocitu celkové spokojenosti, prevenci chronických onemocnění, optimalizaci očekávané délky života a klinickou péči o prakticky všechny chorobné stavy. Dietní mýty (tj. představy týkající se výživy, které nejsou podloženy vědeckými důkazy nebo jim odporují) mohou být překážkou pro konzumaci zdravé stravy. Dietní mýty existují v oblasti mikronutrientů, makronutrientů, nevýživových složek a energie získávané z potravy. Příklady mýtů z každé z výše uvedených skupin zahrnují tvrzení, že se pacienti musejí zaměřit na příjem dostatečného množství kalcia, aby měli zdravé kosti, že tuk v potravě vede k obezitě a má škodlivý vliv na zdraví cévních stěn, že veškerá vláknina (ať už přirozeně se vyskytující, nebo dodaná uměle) je prospěšná a že energie přijatá stravou se lineárním vztahem s jednoduchou aritmetikou přeměňuje na kilogramy tělesné hmotnosti. Běžnou oblastí dietních mýtů jsou některé názory výživových poradců, které zdůrazňují vybrané složky stravy v protikladu ke stravě jako celku. Doporučení týkající se zdravé stravy představují celostnější pohled; odpovídající důkazy podporují doporučení omezit příjem výrazně technologicky upravených potravin a naopak doporučují konzumaci minimálně zpracovaných potravin, obecně ve formě, která se co nejvíce blíží té, v jaké se potrava vyskytuje v přírodě. Praktičtí lékaři mohou být pacientům nápomocni vyvracením těchto mýtů a poskytováním rozumných rad týkajících se stravy s tím, že se zaměří na současnou stravu a širší výživové modely.

Healthy dietary intake is important for the maintenance of general health and wellness, the prevention of chronic illness, the optimization of life expectancy, and the clinical management of virtually all disease states. Dietary myths (i.e., concepts about nutrition that are poorly supported or contradicted by scientific evidence) may stand in the way of healthy dietary intake. Dietary myths exist about micronutrients, macronutrients, non-nutrients, and food energy. Representative myths of each type include following: that patients need to focus on consuming enough calcium to ensure bone health, dietary fat leads to obesity and is detrimental to vascular health, all fiber (whether naturally occurring or artificially added) is beneficial, and food calories translate to pounds of body weight through a linear relationship and simple arithmetic. A common theme for dietary myths is a reductionist view of diet that emphasizes selected food constituents as opposed to whole foods. Healthy dietary advice takes a more holistic view; consistent evidence supports recommendations to limit the consumption of ultraprocessed foods and to eat whole or minimally processed foods, generally in a form that is as close to what occurs in nature as possible. Family physicians can help dispel myths for patients and give sound nutritional advice by focusing on actual foods and broader dietary patterns.

• MeSH
• Diet methods   utilization   MeSH
• Child MeSH
• Adult MeSH
• Nutritional Physiological Phenomena MeSH
• Cardiovascular Diseases prevention & control   therapy   MeSH
• Bone Density drug effects   MeSH
• Humans MeSH
• Meta-Analysis as Topic MeSH
• Dairy Products utilization   MeSH
• Vitamin D Deficiency * drug therapy   metabolism   prevention & control   MeSH
• Obesity MeSH
• Osteoporotic Fractures diagnosis   prevention & control   therapy   MeSH
• Osteoporosis diagnosis   metabolism   prevention & control   MeSH
• Osteoporosis, Postmenopausal diagnosis   complications   prevention & control   MeSH
• Food Technology methods   MeSH
• Dietary Fiber * utilization   MeSH
• Weight Reduction Programs methods   manpower   MeSH
• Surveys and Questionnaires utilization   MeSH
• Aged MeSH
• Guidelines as Topic MeSH
• Raw Foods utilization   MeSH
• Fats * administration & dosage   metabolism   adverse effects   MeSH
• Calcium * administration & dosage   metabolism   adverse effects   MeSH
• Treatment Outcome MeSH
• Nutrition Policy * MeSH
• Patient Education as Topic MeSH
• Check Tag
• Child MeSH
• Adult MeSH
• Humans MeSH
• Male MeSH
• Aged MeSH
• Female MeSH

Goal: To seek and describe current scientific knowledge on the preparedness of medical personnel for an active shooter attack, with the identification of an optimal preparation strategy concerning prevention and potential management of this emergency on the premises of a medical facility. Methods: A scoping study with five phases of methodological steps was applied on the basis of the identified research question. According to the PCC (population, concept, context) format, the research question was divided into individual keywords in selected languages used for the search. Primary studies published between 2000 and December 2023 were included in the selection process. The sources were searched in December 2023 and freely available. Licensed databases EBSCOhost, Cinahl Plus with Full text, Medline, Medline Complete, and Google were used to find relevant studies. We used the "find similar articles" function in many databases. Selected English language keywords were searched using Boolean operators and placeholders. Results: The final analysis included nine studies. As precautions, the authors recommended the development of guidelines and establishment of a system, not only at the national level, but also within individual facilities interconnected with the police, regular training of employees with practical simulation, orientation signs in buildings, communication links for quick information and, last but not least, knowledge of warning behaviour. Conclusion: Healthcare providers should be systematically prepared for an active shooter emergency.

• MeSH
• Inservice Training MeSH
• Humans MeSH
• Mass Shooting Events * MeSH
• Meta-Analysis as Topic MeSH
• Health Facilities MeSH
• Check Tag
• Humans MeSH

Diskuse o významu a užitečnosti tuků jsou často zavádějící. Konzumace tuků s sebou nese částečně negativa, ale současně je jejich vliv i pozitivní. Při správné skladbě stravy se bez nich neobejdeme. Záleží na spotřebovaném množství. Optimální množství nalezneme v mezinárodních doporučeních. Autoři diskutují o pozitivním i negativním smýšlení o tucích a upozorňují na to, že nikoliv tuky, ale snížená fyzická aktivita současné populace vede k nárůstu obezity. Také zdůrazňují, že výskyt kardiovaskulárních onemocnění je významně ovlivněn konzumací nasycených a transmastných kyselin. Součástí sdělení je porovnání studií a názorů na doporučené denní dávky nutrientů. Cílem sdělení je zpřehlednit poznatky z oblasti výživy, které se mj. také přenášejí do legislativy, jako například v roce 2006 publikované Nařízení o nutričních a zdravotních tvrzeních.

Discussion of the importance and usefulness of fat are often misleading. Eating fat carries some negatives, but it might have a positive impact too. Considering proper diet composition we cannot do without it. It depends on the quantities consumed. The optimal amount can be found in international recommendations. The authors discuss the positive and negative beliefs about fat and point out that not fat, but reduced physical activity of present population leads to an increase in obesity. They also emphasize that cardiovascular disease is significantly influenced by the consumption of saturated and trans-fatty acids. Part of this article is a comparison of studies and views on the recommended daily doses of nutrients. It aims to clarify the knowledge of nutrition, which is taken into legislation also, such as that published in 2006 – Regulation on nutritive and health statements

• Keywords
• nasycené a transmastné, mastné kyseliny vícenenasycené,
• MeSH
• Cholesterol MeSH
• Dietary Fats MeSH
• Nutritional Physiological Phenomena MeSH
• Humans MeSH
• Meta-Analysis as Topic MeSH
• Feeding Methods MeSH
• Fatty Acids, Unsaturated MeSH
• Nutritional Requirements MeSH
• Practice Guidelines as Topic MeSH
• Legislation as Topic MeSH
• Check Tag
• Humans MeSH

Východiska: Projekt HARDROCK je koncipován jako retrospektivní sběr klinických dat v lokálně provozovaném databázovém systému, který splňuje požadavky na základní verzi elektronické zdravotnické dokumentace onkologického pacienta. Diagnostická skupina nádorů ORL byla vybrána cíleně, neboť představuje velkou zátěž pro Onkologické centrum v Ostravě a její sledování je také aktuální s ohledem na poměrně vysokou incidenci a mortalitu v Moravskoslezském kraji. Cílovými parametry hodnocení jsou krátkodobé i dlouhodobé výsledky léčby pacientů s nádory hlavy a krku hodnocené standardními ukazateli dosažené léčebné odpovědi a přežití. Zvláštní důraz je kladen na hlavní léčebné modality, tedy chirurgii a radioterapii, a na komplikace, které jsou s nimi spojeny. Soubor pacientů a metody: V tomto článku prezentujeme malou část výsledků získaných z dat z registru HARDROCK. Data byla rozdělena do dvou skupin podle doby léčby pacientů: data získána od pacientů léčených v letech 2004–2005 a data z let 2006–2010. Toto rozdělení bylo dáno změnou organizace pracoviště a protokolů léčby. V roce 2006 bylo do standardních postupů zavedeno ozáření v akcelerovaném režimu s využitím konkominantního boostu a dále byly do ozařovacího pole zahrnuty další oblasti lymfatických uzlin (zadní krční uzliny, nadklíčky). Oproti tomu před rokem 2006 byli pacienti ozařováni téměř výhradně v režimu normofrakcionace a hyperfrakcionace. Výsledky: Prezentujeme zde, že nové ozařovací techniky nezvyšují podíl časné toxicity, mírně zvyšují počet pacientů s pozdní toxicitou nízkého stupně. Důležitým zjištěním bylo, že u pacientů s onemocněním ve IV. stadiu léčených v letech 2006–2010 došlo ke snížení výskytu relapsů onemocnění a zlepšení celkového přežití. Závěr: Výsledky projektu metodicky přispějí k exaktnímu hodnocení diagnostiky a léčby pacientů s touto chorobou a napomohou optimalizaci léčebné péče.

Background: The HARDROCK project has been designed as a retrospective data collection study in a locally run database system, which fulfils the requirements on the basic version of electronic medical records of cancer patients. The diagnostic category of head and neck tumors has been selected on purpose, as it presents a major problem in the Comprehensive Cancer Centre of Ostrava, and it is relevant given the high incidence and mortality in the Moravian-Silesian Region. The target parameters of the assessment include short-term as well as long-term treatment results in patients with head and neck tumors, evaluated with standard indicators of treatment response and survival. A special emphasis is put on major treatment modalities, i.e. surgery and radiation therapy, and on related complications. Patients and Methods: In this article, we present a sample of collected data. The data from patients has been separated into two groups based on the time of their acquisition: data from patients treated in 2004–2005 versus patients treated in 2006–2010. This division was given by the change of treatment protocols in 2006 introducing acceleratedradiotherapy with concomitant boost and expanded lymph node irradiation field compared to normofractionation and hyperfractionation regimes used before 2006. Results: Introduction of new irradiation techniques did not increase the rate of acute toxicity but slightly increased late toxicity. Further, we found a decrease of number of relapse and improved overall survival in patients with stage IV disease treated in 2006–2010. Conclusion: The project results will contribute methodically to the exact evaluation of diagnostics and treatment of patients with head and neck cancer and will help to optimize their medical care.

• Keywords
• nádory hlavy a krku,, radioterapie,, populační registr,
• MeSH
• Survival Analysis MeSH
• Surgical Procedures, Operative methods   utilization   MeSH
• Databases as Topic MeSH
• Electronic Health Records standards   trends   utilization   MeSH
• Dose Fractionation, Radiation MeSH
• Humans MeSH
• Head and Neck Neoplasms diagnosis   surgery   radiotherapy   MeSH
• Cancer Care Facilities standards   statistics & numerical data   utilization   MeSH
• Radiotherapy methods   standards   trends   MeSH
• Recurrence MeSH
• Reference Standards MeSH
• Registries classification   standards   statistics & numerical data   MeSH
• Retrospective Studies MeSH
• Quality Control MeSH
• Risk Factors MeSH
• Secondary Prevention MeSH
• Endpoint Determination methods   standards   trends   MeSH
• Statistics as Topic MeSH
• Outcome and Process Assessment, Health Care MeSH
• Research Design MeSH
• Check Tag
• Humans MeSH

BACKGROUND AND OBJECTIVE: There has been a recent surge in the development of agents for bacillus Calmette-Guérin-unresponsive (BCG-U) non-muscle-invasive bladder cancer (NMIBC). Critical assessment of these agents and practical recommendations for optimal selection of patients and therapies are urgently needed, especially in the absence of randomized trials on bladder-sparing treatment (BST) options. METHODS: A global committee of bladder cancer experts was assembled to develop recommendations on BST for BCG-U NMIBC. Working groups reviewed the literature and developed draft recommendations, which were then voted on by International Bladder Cancer Group (IBCG) members using a modified Delphi process. During a live meeting in August 2023, voting results and supporting evidence were presented, and recommendations were refined on the basis of meeting discussions. Final recommendations achieved >75% agreement during the meeting, and some were further refined via web conferences and e-mail discussions. KEY FINDINGS AND LIMITATIONS: There is currently no single optimal agent for patients with BCG-U disease who seek to avoid radical cystectomy (RC). BST selection should be personalized, taking into account individual patient characteristics and preferences, tumor attributes, and efficacy/toxicity data for the agents available. For patients with BCG-U carcinoma in situ (CIS), gemcitabine/docetaxel (GEM/DOCE), nadofaragene firadenovec (NFF), and nogapendekin alfa inbakicept-pmln (NAI) + BCG are recommended; because of its systemic toxicity, pembrolizumab should only be offered after other options are exhausted. For patients with BCG-U papillary-only tumors, GEM/DOCE, NFF, NAI + BCG, single-agent chemotherapy, hyperthermic mitomycin C, and pembrolizumab are recommended. Given the modest efficacy of available options, clinical trial participation is encouraged. For unapproved agents with reported data, IBCG recommendations await the final results of pivotal trials. CONCLUSIONS AND CLINICAL IMPLICATIONS: The IBCG consensus recommendations provide practical guidance on BST for BCG-U NMIBC.

• MeSH
• Adjuvants, Immunologic therapeutic use   MeSH
• BCG Vaccine * therapeutic use   MeSH
• Cystectomy MeSH
• Neoplasm Invasiveness * MeSH
• Organ Sparing Treatments * MeSH
• Humans MeSH
• Non-Muscle Invasive Bladder Neoplasms MeSH
• Urinary Bladder Neoplasms * drug therapy   pathology   MeSH
• Patient Selection * MeSH
• Check Tag
• Humans MeSH
• Publication type
• Journal Article MeSH
• Review MeSH
• Practice Guideline MeSH