Replication factor C
Dotaz
Zobrazit nápovědu
- MeSH
- antimetabolity MeSH
- DNA virů MeSH
- replikace viru MeSH
- RNA virová MeSH
- virové receptory MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
Virus hepatitidy C (HCV) je významný lidský patogen, který způsobuje zánět jater, pokročilou jaterní fibrózu, cirhózu (CIH) a hepatocelulární karcinom (HCC). Zejména chronická forma hepatitidy C (HC), do které onemocnění přechází v 55–85 %, představuje závažný zdravotní problém v celosvětovém měřítku. Je příčinou významné morbidity a mortality, jejichž kulminace se teprve očekává. Pokračující výzkum nových molekul pro léčbu HCV infekce je příslibem zlepšení stávající situace. Vynaložené náklady jsou však obrovské.
Hepatitis C virus (HCV) is an important human pathogen that causes hepatitis, advanced liver fibrosis, cirrhosis (CIH), and hepatocellular carcinoma (HCC). Especially the chronic form of hepatitis C (HC), with 55–85% of acute cases progressing to it, is a serious problem worldwide. HCV is a cause of the significant morbidity and mortality that are only expected to peak. An ongoing research of new therapeutic molecules for the treatment of HCV infection is a promise for a better future. The costs incurred are, however, high.
- MeSH
- antivirové látky terapeutické užití MeSH
- celosvětové zdraví * MeSH
- genotyp MeSH
- Hepacivirus genetika patogenita MeSH
- hepatitida C * diagnóza epidemiologie etiologie farmakoterapie přenos MeSH
- hepatocelulární karcinom komplikace MeSH
- jaterní cirhóza diagnóza komplikace MeSH
- lidé MeSH
- nádory jater komplikace MeSH
- prevalence MeSH
- replikace viru MeSH
- rizikové faktory MeSH
- RNA virová MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
The NS1 protein of classical swine H1N1 influenza A virus evolved dynamically during the past 80 years, most notable changes happened in the four C-terminal sequences and the C-terminal truncation of 11 amino acids. However, the role of these changes on the virulence of classical swine H1N1 influenza A virus remains unknown. Using reverse genetics, three NS1 mutant viruses (RSEV, GSEI, and EPEV) and a wild-type virus (PEQK) were generated from A/Swine/Shanghai/1/2005 virus and the pathogenicity of the viruses was determined in mice. The results showed that RSEV and PEQK viruses could not infect the mice. By contrast, GSEI and EPEV viruses could replicate in the lungs of mice without prior adaptation. The viral titers in lungs from GSEI and EPEV virus-infected mice were 2,300 and 7 pfu/g at fourth-day post-infection, respectively. Mild-to-moderate alveolitis was observed in the histopathological test of lungs from GSEI and EPEV virus-infected mice. The results indicated that C-terminal GSEI and EPEV motifs of NS1 protein involved in viral virulence and facilitated the A/Swine/Shanghai/1/2005 virus crossing the species barrier from swine to mice.
- MeSH
- faktory virulence genetika metabolismus MeSH
- histocytochemie MeSH
- infekce viry z čeledi Orthomyxoviridae patologie virologie MeSH
- missense mutace MeSH
- modely nemocí na zvířatech MeSH
- mutantní proteiny genetika metabolismus MeSH
- myši inbrední BALB C MeSH
- myši MeSH
- plíce patologie virologie MeSH
- replikace viru MeSH
- reverzní genetika MeSH
- virová nálož MeSH
- virové nestrukturální proteiny genetika metabolismus MeSH
- virulence MeSH
- virus chřipky A, podtyp H1N1 genetika patogenita MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- myši MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
Formou přehledného referátu podáváme rozbor základních informaci o původcích, epidemiologii, diagnostice a terapii virových hepatitid B a C. Zvláštní pozornost je věnována možnostem aktivní i pasivní imuni-zace, včetně postupů postexpozičních. Nejdůležitější cestou přenosu infekce virem hepatitidy B je v současné době heterosexuální pohlavní styk. Následuje intravenózní aplikace narkotik, homosexuální aktivity a rizikové techniky pohlavního styku. Významnou cestou je i vertikální přenos z matky na plod. Virus hepatitidy B patří mezi nejsložitější DNA viry, v průběhu jeho replikačního cyklu je původní virová DNA přepisována do RNA a teprve podle této matrice vzniká nová definitivní virová DNA. Velmi složitou je rovněž interakce mezi virem a imunitním systémem hostitelského organismu. Výsledkem této interakce je jednak různý klinický průběh akutní infekce, jednak řada různých tzv. fází infekce. Tyto fáze lze většinou odlišit pomocí sérologických vyšetřovacích metod. Ke správné interpretaci jejich výsledků je však nezbytně nutné znát význam a funkci jednotlivých antigenů a příslušných protilátek. Význam těchto proteinů a jednotlivé sérologické nálezy jsou v článku podrobně vysvětleny. Indikací k zahájení specifické protivirové terapie je v současné době pouze chronická infekce virem hepatitidy B ve fázi aktivní replikace viru. Existují dvě základní možnosti terapie: inter-feron alfa a virostatikum lamivudin. V případě infekce virem hepatitidy B je dostupná jak pasivní, tak i aktivní imunizace. Obě varianty jsou v článku podrobně popsány, včetně indikací a vakcinačních postupů. Virus hepatitidy C byl identifikován až v roce 1989. Nejdůležitější cestou přenosu infekce do roku 1992 bylo přijetí krevního derivátu, po roce 1992, kdy se na transfuzních stanicích začaly používat detekční sety k průkazu anti-HCV protilátek, klesla incidence potransfuzní hepatitidy C téměř na nulu. Nejdůležitější cestou přenosu v současné době je intravenózní toxikomanie, ale nemalou měrou se na šíření infekce podílí i zdravotní péče. Základním sérologickým markerem HCV infekce jsou anti-HCV protilátky. Tyto jsou ukazatelem kontaktu člověka s virem, neznamenají automaticky prodělanou infekci. Spíše naopak. Protože infekce virem hepatitidy C přechází do chronického stadia až v 85 % případů, znamená pozitivita anti-HCV většinou aktivní infekci virem hepatitidy C. K průkazu aktivní infekce je nezbytně nutný pozitivní průkaz virové nukleové kyseliny v séru vyšetřované osoby. Standardní terapií chronické infekce virem hepatitidy C je v současné době kombinace pegylovaných interferonů alfa a ribavirinu. Touto terapeutickou variantou je dosahováno trvalé eliminace viru v přibližně 60 % případů. U infekce virem hepatitidy C dosud nemáme dostupnou specifickou preexpoziční ani postexpoziění profylaxi. Jedinou prevencí přenosu infekce je proto předcházení všem rizikovým faktorům přenosu, a to zejména při poskytování zdravotní péče.
Prcscnted is a review of basic information on the causative agents, epidemiology, and therapy of viral hepatitis B and type C. Speciál attention is devoted to active and passive immunizalion, including posl-exposu-rc intervention. The major routě of transmission in virus hepatitis B is presently heterosexual intercourse. That is followed by intravenous drug abuse, homosexuál activities and risky techniques of sexual intercourse. A significant routě is also vertical transmission from mother to newborn. The virus of type B hepatitis belongs to the most complicated of DNA viruses, in the course of its replication cycle the originál DNA being transcribed into RNA and then according to that template new viral DNA is formed. Věry complicated is also the interacti-on between the virus and the immune systém of the host organism. That interaction results in a varying cli-nical course on the one hand, and a number of so-called stages of infection on the other. In most cases those stages can be differentiated with the aid of serological diagnostic methods. However, for a correct interpretation of their results it is necessary to know the significance and function of each antigen and cor-responding antibody. The significance of those proteins and the separate serological findings are explained in detail. Presently, specific antiviral therapy is indicated only in chronic infections with hepatitis B virus in the stage of active virus replication. There are two basic therapeutic options: interferon alpha and the virostatic lamivudin. In the čase of infection with type B hepatitis virus there is available passive as well as active immunization, both being deseribed in detail, including indications and vaccination procedures. The virus of hepatitis C has been identified in 1989. The major routě of transmission up to the year 1992 were products derived from blood; after 1992 when blood transfusion units began to use detection sets for demonstrating anti-HCV antibodies, the incidence of post-transfusion type C hepatitis fell almost to zero. Presently, the major routě of transmission is intravenous drug abuse, however, no small share is played by health care. The basic serological marker of HCV infection are anti-HCV antibodies. Those antibodies are an indicator of contact with the virus, not necessarily meaning the subject has experienced an infection. Rat-her, Ihe contrary is Ihe čase. In as hepatitis C virus infeclion passes inlo the chronic slage in up lo 85% of cases, anti-HCV activity mostly signifies active infection with type C hepatitis virus. For the demonstrati-on of active infection there is necessary a positive demonstration of viral nucleic arid in the sérum of the person investigated. The standard treatment of chronic infection with hepatitis C virus is a combination of pegylated interferon alpha and ribavirin, laeding to permanent eiimination of the virus in 60% of cascs. Thc-re is no available specific pre-exposure oř post-exposure prophylaxis of hepatitis C virus infeclion. The only prevention of transmission of the disease is the avoiding of all risk factors of transmission, námely whcn affording health care.
- MeSH
- antivirové látky aplikace a dávkování farmakologie terapeutické užití MeSH
- Flaviviridae genetika patogenita MeSH
- hepatitida B diagnóza přenos terapie MeSH
- hepatitida C diagnóza přenos terapie MeSH
- interferony aplikace a dávkování farmakologie terapeutické užití MeSH
- sérologické testy metody statistika a číselné údaje MeSH
- virus hepatitidy B fyziologie genetika ultrastruktura MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
Použití inhibitorů tumor nekrotizujícího faktoru alfa (anti-TNF alfa) představuje velký pokrok v léčbě zánětlivých revmatických onemocnění, ale zároveň je tato terapie spojená i se zvýšeným rizikem infekcí. V článku je upozorněno na možnost reaktivace hepatitidy B při anti-TNF alfa léčbě, která měla v několika případech závažný průběh. Proto je nezbytné provádět screening hepatitidy B před nasazením léčby. Anti-TNF léčba může být bezpečná i u pacientů s chronickou hepatitidou B, pokud je před zahájením této léčby preventivně nasazen lamivudin nebo adefovir a během této léčby probíhá důsledná monitorace jaterních testů a virémie. Odlišná je situace u hepatitidy C. Anti-TNF alfa léčba se zdá být bezpečná u pacientů s chronickou hepatitidou C, ale screening hepatitid a důsledná monitorace jaterních testů a virémie během léčby je rovněž nezbytná. Jedna z prezentovaným studií ukazuje, že kombinace standardní antivirové léčby hepatitidy C s anti-TNF alfa léčbou může zlepšit naději na časné zastavení replikace viru. Problematice anti-TNF alfa léčby u pacientů s chronickou hepatitidou B nebo C je třeba věnovat více pozornosti a zvážit provedení dalších studií u pacientů s koincidencí těchto onemocnění.
Administration of tumor necrosis factor alpha inhibitors (anti-TNF alpha) represents an immense progress in the treatment of inflammatory rheumatic diseases. However, it associates with increased risk of infections. The authors emphasize the possibilities of hepatitis B virus reactivation during anti-TNF alpha treatment, which caused serious complications in several cases. Therefore screening for hepatitis B before the initiation of the treatment is necessary. Anti-TNF alpha treatment could be safe in patients with chronic hepatitis B, when treatment with lamivudin or adefovir prior to anti-TNF alpha is started. Careful monitoring of liver enzymes and viraemia during this treatment is necessary. Different situation is in patients with hepatitis C. Anti-TNF alpha treatment is safe in patients with chronic hepatitis C, however screening for hepatitides, and careful monitoring of liver enzymes and viraemia during the treatment is also necessary. One of the presented study shows that combination of standard antiviral treatment of hepatitis C and anti-TNF alpha may increase the chance to suppress viral replication early. More vigilance is necessary to the issue of anti-TNF alpha treatment of patients with hepatitis B or C and further studies on coincidence of those diseases are anticipated.
Replication stress (RS) fuels genomic instability and cancer development and may contribute to aging, raising the need to identify factors involved in cellular responses to such stress. Here, we present a strategy for identification of factors affecting the maintenance of common fragile sites (CFSs), which are genomic loci that are particularly sensitive to RS and suffer from increased breakage and rearrangements in tumors. A DNA probe designed to match the high flexibility island sequence typical for the commonly expressed CFS (FRA16D) was used as specific DNA affinity bait. Proteins significantly enriched at the FRA16D fragment under normal and replication stress conditions were identified using stable isotope labeling of amino acids in cell culture-based quantitative mass spectrometry. The identified proteins interacting with the FRA16D fragment included some known CFS stabilizers, thereby validating this screening approach. Among the hits from our screen so far not implicated in CFS maintenance, we chose Xeroderma pigmentosum protein group C (XPC) for further characterization. XPC is a key factor in the DNA repair pathway known as global genomic nucleotide excision repair (GG-NER), a mechanism whose several components were enriched at the FRA16D fragment in our screen. Functional experiments revealed defective checkpoint signaling and escape of DNA replication intermediates into mitosis and the next generation of XPC-depleted cells exposed to RS. Overall, our results provide insights into an unexpected biological role of XPC in response to replication stress and document the power of proteomics-based screening strategies to elucidate mechanisms of pathophysiological significance.
- MeSH
- chromatografie afinitní MeSH
- DNA vazebné proteiny fyziologie MeSH
- fragilní místa na chromozomu MeSH
- kontrolní body buněčného cyklu MeSH
- lidé MeSH
- oprava DNA fyziologie MeSH
- proteomika metody MeSH
- replikace DNA fyziologie MeSH
- xeroderma pigmentosum MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
BACKGROUND: Proper DNA replication is essential for faithful transmission of the genome. However, replication stress has serious impact on the integrity of the cell, leading to stalling or collapse of replication forks, and has been determined as a driving force of carcinogenesis. Mus81-Mms4 complex is a structure-specific endonuclease previously shown to be involved in processing of aberrant replication intermediates and promotes POLD3-dependent DNA synthesis via break-induced replication. However, how replication components might be involved in this process is not known. RESULTS: Herein, we show the interaction and robust stimulation of Mus81-Mms4 nuclease activity by heteropentameric replication factor C (RFC) complex, the processivity factor of replicative DNA polymerases that is responsible for loading of proliferating cell nuclear antigen (PCNA) during DNA replication and repair. This stimulation is enhanced by RFC-dependent ATP hydrolysis and by PCNA loading on the DNA. Moreover, this stimulation is not specific to Rfc1, the largest of subunit of this complex, thus indicating that alternative clamp loaders may also play a role in the stimulation. We also observed a targeting of Mus81 by RFC to the nick-containing DNA substrate and we provide further evidence that indicates cooperation between Mus81 and the RFC complex in the repair of DNA lesions generated by various DNA-damaging agents. CONCLUSIONS: Identification of new interacting partners and modulators of Mus81-Mms4 nuclease, RFC, and PCNA imply the cooperation of these factors in resolution of stalled replication forks and branched DNA structures emanating from the restarted replication forks under conditions of replication stress.
- MeSH
- "flap" endonukleasy genetika metabolismus MeSH
- DNA vazebné proteiny genetika metabolismus MeSH
- endonukleasy genetika metabolismus MeSH
- proliferační antigen buněčného jádra genetika metabolismus MeSH
- rekombinace genetická MeSH
- replikace DNA MeSH
- replikační protein C genetika metabolismus MeSH
- Saccharomyces cerevisiae - proteiny genetika metabolismus MeSH
- Saccharomyces cerevisiae genetika metabolismus MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
Sliding clamps are ring-shaped protein complexes that are integral to the DNA replication machinery of all life. Sliding clamps are opened and installed onto DNA by clamp loader AAA+ ATPase complexes. However, how a clamp loader opens and closes the sliding clamp around DNA is still unknown. Here, we describe structures of the Saccharomyces cerevisiae clamp loader Replication Factor C (RFC) bound to its cognate sliding clamp Proliferating Cell Nuclear Antigen (PCNA) en route to successful loading. RFC first binds to PCNA in a dynamic, closed conformation that blocks both ATPase activity and DNA binding. RFC then opens the PCNA ring through a large-scale 'crab-claw' expansion of both RFC and PCNA that explains how RFC prefers initial binding of PCNA over DNA. Next, the open RFC:PCNA complex binds DNA and interrogates the primer-template junction using a surprising base-flipping mechanism. Our structures indicate that initial PCNA opening and subsequent closure around DNA do not require ATP hydrolysis, but are driven by binding energy. ATP hydrolysis, which is necessary for RFC release, is triggered by interactions with both PCNA and DNA, explaining RFC's switch-like ATPase activity. Our work reveals how a AAA+ machine undergoes dramatic conformational changes for achieving binding preference and substrate remodeling.
- MeSH
- adenosintrifosfát metabolismus MeSH
- adenosintrifosfatasy metabolismus MeSH
- ATPázy spojené s různými buněčnými aktivitami metabolismus MeSH
- DNA-dependentní DNA-polymerasy metabolismus MeSH
- DNA metabolismus MeSH
- elektronová kryomikroskopie MeSH
- proliferační antigen buněčného jádra metabolismus MeSH
- replikace DNA * MeSH
- replikační protein C chemie genetika metabolismus MeSH
- Saccharomyces cerevisiae * genetika MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- Research Support, N.I.H., Extramural MeSH
Ribosomal RNA genes (rDNA) have been used as valuable experimental systems in numerous studies. Here, we focus on elucidating the spatiotemporal organisation of rDNA replication in Arabidopsis thaliana To determine the subnuclear distribution of rDNA and the progression of its replication during the S phase, we apply 5-ethynyl-2'-deoxyuridine (EdU) labelling, fluorescence-activated cell sorting, fluorescence in situ hybridization and structured illumination microscopy. We show that rDNA is replicated inside and outside the nucleolus, where active transcription occurs at the same time. Nascent rDNA shows a maximum of nucleolar associations during early S phase. In addition to EdU patterns typical for early or late S phase, we describe two intermediate EdU profiles characteristic for mid S phase. Moreover, the use of lines containing mutations in the chromatin assembly factor-1 gene fas1 and wild-type progeny of fas1xfas2 crosses depleted of inactive copies allows for selective observation of the replication pattern of active rDNA. High-resolution data are presented, revealing the culmination of replication in the mid S phase in the nucleolus and its vicinity. Taken together, our results provide a detailed snapshot of replication of active and inactive rDNA during S phase progression.
- MeSH
- Arabidopsis cytologie genetika MeSH
- buněčné jadérko metabolismus MeSH
- deoxyuridin analogy a deriváty metabolismus MeSH
- genetická transkripce MeSH
- kořeny rostlin metabolismus MeSH
- replikace DNA genetika MeSH
- ribozomální DNA genetika MeSH
- S fáze genetika MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- MeSH
- fosforylace MeSH
- lidé MeSH
- replikační protein C * MeSH
- Saccharomyces cerevisiae - proteiny metabolismus MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- komentáře MeSH
- zprávy MeSH