kvantitativní přístup Dotaz Zobrazit nápovědu
Molekulární analýza zařazená po bok morfologickým vyšetřením plní v moderní onkopatologii 3 hlavní úlohy – diferenciálně diagnostickou, v molekulárním sledování chování nemoci a při stanovení prognostických faktorů. V této práci shrnujeme využití molekulární analýzy u pacientů s lymfomem z buněk pláště (mantle cell lymphoma, MCL). Prokazujeme, že hladina mRNA cyklinu D1 slouží jako spolehlivý molekulární marker pro 98 % pacientů s MCL. Kvantitativní analýza cyklinu D1 je specifickým a citlivým molekulárním nástrojem pro diferenciální diagnózu i pro molekulární sledování onemocnění v kostní dřeni. Sledování dynamiky cyklinu D1 v kostní dřeni navíc odráží dynamiku onemocnění a předpovídá následný klinický průběh nemoci. Molekulární analýzu jsme rovněž využili pro kvantitativní stanovení proliferačních markerů, Ki-67, topoisomerázy II? a TPX2, jako prognosticky významných molekul. S využitím molekulární analýzy lze reprodukovatelně měřit proliferační aktivitu a techniku lze standardizovat napříč pracovišti. Možnost standardizace a reprodukovatelnost vyšetření je nutnou podmínkou pro využití proliferační aktivity v klinických studiích. Ve srovnání s imunofenotypizací lze shrnout, že kvantitativní PCR je spolehlivý, rychlý, reprodukovatelný, citlivý a specifický přístup, který rozšiřuje diagnostické možnosti hematopatologie. Ve srovnání s interfázní FISH je kvantitativní PCR méně technicky a časově náročná a navíc poskytuje přesnou a reprodukovatelnou informaci o hladině exprese vybraných molekul. Kvantitativní PCR je citlivější a lze ji využít i pro detekci malých změn hladiny mRNA. Kvantitativní PCR tak může sloužit pro sledování úbytku nebo nárůstu sledovaného nádorového znaku ve srovnání s předchozím odběrem a stává se tak účinným nástrojem sledování průběhu onemocnění v korelaci s klinickými informacemi.
A molecular analysis has three major roles in modern oncopathology – as an aid in the differential diagnosis, in molecular monitoring of diseases, and in estimation of the potential prognosis. In this report we review the application of the molecular analysis in a group of patients with mantle cell lymphoma (MCL). We demonstrate that detection of the cyclin D1 mRNA level is a molecular marker in 98 % of patients with MCL. Cyclin D1 quantitative monitoring is specific and sensitive for the differential diagnosis and for the molecular monitoring of the disease in the bone marrow. Moreover, the dynamics of cyclin D1 in bone marrow reflects the disease development and it predicts the clinical course. We employed the molecular analysis for a precise quantitative detection of proliferation markers, Ki-67, topoisomerase II?, and TPX2, that are described as effective prognostic factors. Using the molecular approach it is possible to measure the proliferation rate in a reproducible, standard way which is an essential prerequisite for using the proliferation activity as a routine clinical tool. Comparing with immunophenotyping we may conclude that the quantitative PCR-based analysis is a useful, reliable, rapid, reproducible, sensitive and specific method broadening our diagnostic tools in hematopathology. In comparison to interphase FISH in paraffin sections quantitative PCR is less technically demanding and less time-consuming and furthermore it is more sensitive in detecting small changes in the mRNA level. Moreover, quantitative PCR is the only technology which provides precise and reproducible quantitative information about the expression level. Therefore it may be used to demonstrate the decrease or increase of a tumor-specific marker in bone marrow in comparison with a previously aspirated specimen. Thus, it has a powerful potential to monitor the course of the disease in correlation with clinical data.
- Klíčová slova
- kvantitativní PCR, minimální residuální choroba, proliferační markery,
- MeSH
- B-buněčný lymfom diagnóza MeSH
- cyklin D1 diagnostické užití izolace a purifikace MeSH
- diagnostické techniky molekulární metody využití MeSH
- financování organizované MeSH
- lidé MeSH
- lymfom z plášťových buněk diagnóza MeSH
- nádorové biomarkery MeSH
- nehodgkinský lymfom diagnóza MeSH
- polymerázová řetězová reakce s reverzní transkripcí metody využití MeSH
- proliferace buněk MeSH
- reziduální nádor MeSH
- statistika jako téma MeSH
- vyšetřování kostní dřeně MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
Sdělení ukazuje možnosti komplexního přístupu k hodnocení poruch acidobazické rovnováhy. Metoda vychází z kvantitativní analýzy plazmy definované v 80. letech Stewartem. Je založena na teorii nezávisle proměnných veličin, které ve svých interakcích přímo určují výsledné pH, a respektuje fyziologické zákonitosti. Standardní hodnocení acidobazické rovnováhy vychází z hodnocení veličin závisle proměnných (pH, hydrogenkarbonát, base exces) a neposkytuje tak podrobný pohled do patofyziologie celého procesu.
This article analyzes the possibility of evaluation of acid-base disorders using the methods which are based on the quantitative acid-base chemistry. This method was proposed back in the eighties by Stewart. The whole method of analysis is based on the theory of the independent and dependent variables. Their interactions determine the resulting pH. This method respects the laws of physiology, because the independent variables directly determine the acid-base disturbances in the blood. The standard classification of acid-base disturbances calculates however with the dependent variables i.e. pH, standard bicarbonate, base excess. This methods does not give the accurate insights in the pathophysiology of the whole process.
- MeSH
- klinická chemie MeSH
- koncentrace vodíkových iontů MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- metabolismus patofyziologie MeSH
- poruchy acidobazické rovnováhy patofyziologie MeSH
- senioři MeSH
- Check Tag
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
Konvenční pohled na acidobazickou rovnováhu (ABR) tělesných tekutin je založen na disociační rovnici kyseliny uhličité, hodnotě tzv. aniontové mezery ”anion gap” (AG) a výchylce bazí ”base excess” (BE). Nepřesnosti, které jsou tomuto pohledu vlastní, mohou vést k nesprávné interpretaci kombinovaných poruch ABR, zejména u komplikovaných nemocných v kritickém stavu. Zde popsaný kvantitativní přístup při hodnocení ABR analyzuje tělesné tekutiny jako systém, ve kterém je hodnota pH důsledkem změny nezávisle proměnných veličin, jakými jsou 1. parciální tlak CO 2 , 2. rozdíl mezi hodnotou kladných a záporných nábojů na tzv. silných iontech (SID – strong ion difference) a 3. celková koncentrace slabých neprchavých kyselin. Příčinu změny pH lze pak definovat jako změnu některé z nezávisle proměnných veličin a přiměřeně případně ji korigovat. Při použití jednoduchého počítačového programu je analýza poruchy a monitorování její korekce velmi snadná.
The conventional concept of acid-base balance (ABB) of body fluids is based on the dissociation formula of carbonic acid, anion gap (AG), and base excess (BE). The inaccuracies inherent in this concept may lead to incorrect interpretation of combined ABB disorders, especially so in the critically-ill patients. The quantitative approach to ABB assessment described below analyzes body fluids as a system whereby pH is the consequence of changes in independent variables such as (1) partial CO 2 pressure, (2) the difference between the values of positiveli and negativeli charged ions, so-called strong-ion difference (SID), and (3) total levels of weak non-volatile acids. The cause of a change in pH can then be defined as a change in some of the independent variables and can be corrected if needed. Using simple software, an analysis of the disorders and monitoring of its correction are an easy task.
Článek předkládá srovnání čtyř brněnských mateřských škol (běžná MŠ, MŠ podporující zdraví, MŠ zaměřující se na pohyb a Montessori MŠ) z hlediska kurikulárního a také z hlediska experimentálního. První část článku vytyčuje hlavní priority programu „Škola podporující zdraví“, které jsou srovnávány se školními vzdělávacími plány jednotlivých mateřských škol. Druhá část předkládá vyhodnocení pozorování jednoho dopoledního programu. Cílem článku je předložit sondu z různých prostředí mateřských škol a jejich přístupu a vedení ke zdraví.
This paper presents a comparison of four Brno kindergartens (a regular kindergarten, a healthy life-style supporting kindergarten, a kindergarten focusing on exercise activities, and a Montessori kindergarten) from both curricular and experimental points of view. The fi rst part of the paper sets out the main priorities of the „School Supporting Health“ program, which are compared with the school educational plans of the individual kindergartens. The second part presents the evaluations from the observation of one morning program. The objective of the paper is to present a probe from the different environments of the kindergartens and their approach and guidance towards health.
- Klíčová slova
- Školní vzdělávací program, Program Škola podporující zdraví, Škola podporující pohyb, Montessori škola,
- MeSH
- dítě MeSH
- hodnotící studie jako téma MeSH
- kurikulum MeSH
- lidé MeSH
- předškolní dítě MeSH
- programy Healthy People * využití MeSH
- školky * organizace a řízení MeSH
- výchova dítěte MeSH
- zdraví - znalosti, postoje, praxe MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- lidé MeSH
- předškolní dítě MeSH
The paper deals with the application of duplex real-time ultrasonography in the area of portal vein system. The attention is centered to the method of quantification of the flow. The author first analyzes the methodology and refers to some main technical factors influencing validity of the results obtained. The author then draws attention to basic ultrasonographic symptoms of portal hypertension. Having analyzed literature data he refers to limited importance of measuring the portal vein flow for the diagnosis of portal hypertension, draws attention to the contribution of respiratory changes in the area of portal vascular bed and the changes in blood flow velocity for this diagnosis. Finally, attention is paid to the possibility of suitable combination of these two signs by creating s. c. "congestive index" (18).
- MeSH
- lidé MeSH
- portální hypertenze diagnóza patofyziologie MeSH
- regionální krevní průtok MeSH
- ultrasonografie * MeSH
- vena portae patofyziologie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- anglický abstrakt MeSH
- časopisecké články MeSH
Ústní hygiena je záležitostí každého jednotlivce a spočívá především v domácí péči o chrup a dutinu ústní. Tato péče je integrální součástí osobní hygieny civilizovaného člověka a její význam je stejný jak v primární, tak sekundární i terciální prevenci onemocnění zubů a parodontu. Pro zjištění znalostí a přístupu mládeže k ústní hygieně bylo provedeno šetření u studentů středních škol ve Východních Čechách. Dotazováni byli studenti tří typů škol – gymnázia, střední zdravotnické školy a střední integrované školy obchodní.
Oral hygiene is a concern of every individual and consists, first of all, in the home care of dentition and of the oral cavity. This care is an integral part of the personal hygiene of a civilised man and its importance is the same in both primary and secondary, or tertiary, prevention of teeth diseases of parodontium. To find out the knowledge of and the attitude of the youth to the oral hygiene investigation has been performed among secondary school students in East Bohemia. Interrogated were students of three school types: of a grammar school, medical college, and of an integrated business school.
- Klíčová slova
- ústní zdraví, ústní hygiena, pomůcky k dentální hygieně,
- MeSH
- hodnotící studie jako téma MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- orální hygiena * psychologie výchova MeSH
- primární prevence MeSH
- statistika jako téma MeSH
- stomatologická péče MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- ženské pohlaví MeSH
Východisko. Kvantifikace fluorescenčně značených PCR produktů na kapilární elektroforéze (QF PCR) má své limity především v citlivějších analýzách, ve kterých je potřebné zachytit minoritní buněčnou linii a rozpoznat malé změny v závislosti na čase. V těchto případech může být chyba měření a reprodukovatelnost výsledků velmi ovlivněna hlavně lidským faktorem a efektivitou PCR. Hlavním cílem studie bylo posoudit a optimalizovat kvantitativní možnosti inovované QF PCR s přímou návazností na kvantifikaci Y sekvencí u gonozomálních mozaik. Metody a výsledky. Arteficiálně vytvořené Y/X DNA mozaiky byly testovány a kvantifikovány inovovanou QF PCR, která nahrazuje a rozšiřuje real-time PCR. Na základě porovnání intenzity fluorescence PCR produktů po jednotlivých cyklech byly sestrojeny grafy nárůstu fluorescence pro různá ředění. Analýzou podílu signálu vnitřní kontroly a příslušné mozaiky byla sestrojena kalibrační křivka pro kvantifikaci Y sekvencí. Pro výpočet vzácných mozaik byl sestaven empirický vzorec. Závěry. Rozšíření QF PCR o manuální real-time PCR eliminuje meze QF PCR a zpřesňuje kvantifikační analýzy založené na PCR. Novelizovaný DNA diagnostický přístup – IQF PCR, který se vyznačuje vysokou citlivostí a přesností, umožňuje významný posun v analýze gonozomálních Y/X mozaik.
Background. Quantification of fluorescence labelled PCR products on capillary electrophoresis (QF PCR) has limits primarily in the possibility of more sensitive analyses to detect minority cell lines and small time related variations. PCR efficiency and human factor affect measuring error and reproducibility of results in these cases. The aim of this work was to assess and optimise of innovated (I)QF PCR in quantification of Y sequences in gonosomal mosaics. Methods and Results. Artificially prepared Y/X mosaics were tested and quantified by IQF PCR, which replaces real-time PCR. Comparison of relative fluorescence to PCR cycles in different Y/X dilutions was plotted on the graphs. Calibration curve for Y sequences quantification was set by the analyses of ratio of Y/X fluorescent signals. An empirical formula was created for the rare mosaic calculation. Conclusions. QF PCR refined by manual real-time PCR eliminates limits of QF PCR and specifies quantitative analyses based on PCR. The outstanding feature of IQF PCR is its high sensitivity and accuracy in quantification of Y/X gonosomal mosaics.
Cíl práce: Zavedení sekvenace enterovirů jako progresivní metody umožňující zařazení izolovaných virů podle nové nomenklatury a detailní posouzení charakteru izolátu. Materiál a metody: Bylo analyzováno 75 vzorků pocházejících od 64 pacientů ze 2 pracovišť – Krajské nemocnice v Liberci a Fakultní nemocnice Plzeň. Věk sledovaných pacientů se pohyboval v intervalu od 4 do 54 let, medián věku byl 15 let u mužů a 16 let u žen. Důvodem hospitalizace byly u převažujícího počtu pacientů intenzivní bolesti hlavy, horečky, zvracení, únava, meningeální příznaky, u dvou pacientů byly příznaky střevní a u jednoho kožní. Vyšetřované vzorky byly výtěry z rekta, krku, mozkomíšní moky a stolice. Molekulární detekce a typizace byla provedena s využitím metody RT-PCR. Pro typizaci byl vybrán úsek z nekódující oblasti 5´RNA. Vzorky byly amplifikovány jednokrokovou PCR s vnějšími primery a se stejnými primery prodlouženými o M13 sekvence (Generi-Biotech). Editace, sestava a kvalitativní analýza sekvencí byla provedena pomocí programu LASERGENE (DIASTAR). Získané sekvence byly vyhodnoceny centrální databází sekvencí GenBank pomocí algoritmu BLAST. Výsledky: V izolátech jsme identifikovali 61 ECHO virů 30, 3 coxsackieviry B1, 1 coxsackievirus B3, 1 coxsackievirus A9, 1 enterovirus 86, 1 enterovirus 71, 2 ECHO virus 13/ coxsackievirus B5, 1 ECHO virus 7/30/coxsackievirus B4, 1 coxsackievirus B4/enterovirus B, 1 enterovirus 87/ECHO virus 30/enterovirus B a 1 ECHO virus 3. Všechny izolované viry, mimo enteroviru 71 patřícího do skupiny A, spadají do skupiny B. Závěr: Enteroviry bylo možné jednoznačně identifikovat, ačkoliv byl sekvenován krátký konzervativní úsek se značnou variabilitou. Sekvenace v plné míře nahradila bližší určování enterovirů virusneutralizací a umožnila detailní posouzení izolátů. Převaha ECHO 30 jako kauzálního agens vyvolávajícího aseptické meningitidy je ve shodě s literárními údaji.
Objective: Introducing enterovirus sequencing as an advanced approach to classify the viruses isolated according to the novel nomenclature and to characterize isolates in detail. Material and methods: Seventy-five specimens collected from 64 patients in two hospitals, Liberec Regional Hospital, and Plzeň University Hospital, were analyzed. The study patients' age ranged from four to 54 years, with a median of 15 years in males and 16 years in females. In most patients, the reasons for admission were intense headache, fever, vomiting, tiredness, meningeal symptoms, intestinal symptoms (in two patients), and skin symptoms (in one patient). The speci-mens collected were rectal and throat swabs, cerebrospinal fluid (CSF) and stool specimens. Molecular detection and typing were performed using the RT-PCR method. A segment of the 5´non-coding RNA was selected for typing. Specimens were amplified using single-step PCR with external primers and with the same primers extended to include M13 sequen-ces (Generi-Biotech). The LASERGENE software (DIASTAR) was used in sequence editing, alignment, and quality check. The sequences obtained were checked against the central GenBank sequence database using the BLAST algorithm. Results: The identification of the study isolates resulted in 61 ECHO viruses 30, three coxsackie viruses B1, one coxsackie virus B3, one coxsackie virus A9, one enterovirus 86, one enterovirus 71, Two ECHO viruses 13/coxsackie virus B5, one ECHO virus 7/30/coxsackie virus B4, one coxsackie virus B4/enterovirus B, one enterovirus 87/ECHO virus 30/enterovirus B, and one ECHO virus 3. All viruses isolated, except enterovirus 71 classified into group A, were of group B. Conclusion: The enteroviruses were identified unambigously, although the sequencing only targeted a short, conserved segment that showed considerable variability. The sequencing was an effective alternative to enterovirus identification by the neutralisation test and allowed for detailed characterization of the isolates. The predominance of ECHO 30 as the cause of aseptic meningitis is in accordance with the literature data.
- MeSH
- dítě MeSH
- dospělí MeSH
- ECHO virové infekce virologie MeSH
- enterovirové infekce * virologie MeSH
- enterovirus B lidský genetika izolace a purifikace MeSH
- Enterovirus * genetika izolace a purifikace MeSH
- feces virologie MeSH
- genotyp MeSH
- kvantitativní polymerázová řetězová reakce MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- meningitida aseptická virologie MeSH
- mladiství MeSH
- mladý dospělý MeSH
- mozkomíšní mok virologie MeSH
- odběr biologického vzorku MeSH
- předškolní dítě MeSH
- RNA virová * genetika MeSH
- sekvenční analýza RNA * MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- mladý dospělý MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- předškolní dítě MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH