Anaplastic lymphoma kinase-positive anaplastic large cell lymphoma (ALK+ ALCL) originates from the T-lineage and is marked by rearrangements of the ALK gene. More than 10 fusion partners with the ALK gene are known, with the most common being the t(2;5)(p23;q35) translocation resulting in the NPM1::ALK fusion. In 10% to 20% of the ALK+ ALCL cases, the ALK gene fuses with various other partners. Modern molecular techniques, especially next-generation sequencing (NGS), have eased the identification of ALK gene fusion partners and have allowed in-depth characterization of the T-cell receptor (TCR) repertoire. We devised a real-time quantitative reverse-transcription polymerase chain reaction to measure the expression of the translocated portion of the ALK gene. Fusion partners for the ALK gene were analyzed using rapid amplification of 5'cDNA ends (RACE) method or NGS. TCR immunoprofiling was performed by amplicon NGS. We studied 96 ALK+ ALCL patients. NPM1::ALK fusion gene was observed in 71 patients, ATIC::ALK in 9, and TPM3::ALK in 3. CLTC::ALK, MYH9::ALK, and RNF213::ALK fusions were identified in 2 patients each. We also discovered the TPM4::ALK and SATB1::ALK fusion genes, plus the following 2 previously unidentified ALK+ ALCL fusions: SQSTM1::ALK and CAPRIN1::ALK. High expression of the translocated ALK gene segment was observed in all 93 analyzed samples. TCR testing was conducted on 23 patients with available DNA. In 18 (78%) patients, we discerned at least one (ranging from 1 to 4) clonal TCR rearrangement. In 59% of the patients, clonal TCR beta junctions corresponded with sequences previously observed in both healthy donors and under various pathological conditions. Reverse-transcriptase quantitative detection of ALK expression is a fast and reliable method for both diagnosing and monitoring treatment response in ALK+ ALCL patients, irrespective of the ALK gene translocation. NGS reveals new ALK translocation partners. Both malignant and reactive TCR repertoires in ALK+ ALCL patients are unique and do not consistently occur among different patients.
- MeSH
- adenosintrifosfatasy genetika MeSH
- anaplastická lymfomová kináza genetika MeSH
- anaplastický velkobuněčný lymfom * genetika patologie MeSH
- jaderné proteiny genetika MeSH
- lidé MeSH
- proteiny buněčného cyklu genetika MeSH
- receptory antigenů T-buněk genetika MeSH
- transkripční faktory genetika MeSH
- translokace genetická MeSH
- tyrosinkinasové receptory genetika MeSH
- tyrosinkinasy genetika MeSH
- ubikvitinligasy * MeSH
- vazebné proteiny DNA v oblastech připojení k matrix * MeSH
- vysoce účinné nukleotidové sekvenování MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
Congenital erythrocytoses represent a heterogenous group of rare defects of erythropoiesis characterized by elevated erythrocyte mass. We performed molecular-genetic analysis of 21 Czech patients with congenital erythrocytosis and assessed the mutual link between chronic erythrocyte overproduction and iron homoeostasis. Causative mutations in erythropoietin receptor (EPOR), hypoxia-inducible factor 2 alpha (HIF2A) or Von Hippel-Lindau (VHL) genes were detected in nine patients, including a novel p.A421Cfs*4 EPOR and a homozygous intronic c.340+770T>C VHL mutation. The association and possible cooperation of five identified missense germline EPOR or Janus kinase 2 (JAK2) variants with other genetic/non-genetic factors in erythrocytosis manifestation may involve variants of Piezo-type mechanosensitive ion channel component 1 (PIEZO1) or Ten-eleven translocation 2 (TET2), but this requires further research. In two families, hepcidin levels appeared to prevent or promote phenotypic expression of the disease. No major contribution of heterozygous haemochromatosis gene (HFE) mutations to the erythrocytic phenotype or hepcidin levels was observed in our cohort. VHL- and HIF2A-mutant erythrocytosis showed increased erythroferrone and suppressed hepcidin, whereas no overproduction of erythroferrone was detected in other patients regardless of molecular defect, age or therapy. Understanding the interplay between iron metabolism and erythropoiesis in different subgroups of congenital erythrocytosis may improve current treatment options.
- MeSH
- hepcidiny genetika MeSH
- iontové kanály genetika MeSH
- kyslík metabolismus MeSH
- lidé MeSH
- mutace MeSH
- polycytemie * genetika MeSH
- receptory erythropoetinu genetika MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
Souběžný výskyt germinálních tumorů a hematologických malignit byl poprvé popsán v roce 1985. Od té doby bylo publikováno více než 60 případů pacientů s těmito onemocněními, u nichž se nejčastěji jednalo o akutní megakaryoblastickou leukemii a neseminomový germinální tumor mediastina. Akutní megakaryoblastická leukemie a germinální tumory patří mezi vzácná nádorová onemocnění mající obvykle nepříznivý průběh s mediánem celkového přežití méně než 6 měsíců od stanovení diagnózy. Vzhledem k přítomnosti isochromozomu 12p a mutací TP53, PTEN a NRAS u obou nádorů se v případě jejich souběžného výskytu předpokládá existence společného progenitoru. Popisujeme vzácný případ současného výskytu akutní megakaryoblastické leukemie a germinálního tumoru mediastina a přinášíme přehled dosud publikovaných prací na toto téma.
The occurrence of haematological malignancies associated with germ cell tumours was described for the first time in literature in 1985. Since then, more than 60 cases have been published, mostly involving mediastinal germ cell tumour and acute megakaryoblastic leukaemia. Germ cell tumours as well as acute megakaryoblastic leukaemias are rare neoplasms characterized by poor prognosis when concurrent, with a dismal median survival of 6 months from the date of diagnosis. Recent data suggest a clonal relationship between these two neoplasms when occurring concurrently due to the common presence of isochromosome 12p and mutations of TP53, NRAS and PTEN in both. Our case report presents a rare case of concurrent mediastinal germ cell tumour and acute megakaryoblastic leukaemia treated at our centre as well as a review of literature focusing on molecular changes in these neoplasms.
- MeSH
- akutní megakaryoblastická leukemie * diagnóza patologie terapie MeSH
- dospělí MeSH
- fatální výsledek MeSH
- germinální a embryonální nádory * diagnóza patologie terapie MeSH
- imunohistochemie MeSH
- lidé MeSH
- nádory mediastina diagnóza patologie terapie MeSH
- PET/CT MeSH
- protokoly antitumorózní kombinované chemoterapie MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
Úvod: Primární myelofibróza je řazena mezi Ph (Philadelphia chromosome) negativní myeloproliferativní nemoci (Ph-MPN), spolu s pravou polycytemií a esenciální trombocytemií, které ve svém průběhu taktéž mohou přecházet do fibrózy kostní dřeně. V práci byly hodnoceny biochemické markery kostní remodelace a osteoprotegerin s cílem nalezení vhodného parametru pro neinvazivní monitorování pokročilosti fibrózy kostní dřeně, dále byl posuzován kostní metabolismus, zejména význam vitaminu D. Pacienti a metody: U 34 pacientů s myelofibrózou, 13 nemocných v prefibrotické fázi primární myelofibrózy a 28 nemocných s pravou polycytemií či esenciální trombocytemií byly analyzovány markery kostní remodelace (bALP, P1NP, ICTP), kostní metabolismus a osteoprotegerin. Výsledky: Nebylo prokázáno zvýšení bALP, P1NP byl zvýšen u 18 %, ICTP u 32 % nemocných s myelofibrózou. Hodnoty nekorelovaly s pokročilostí fibrózy, nevykazovaly významný rozdíl oproti prefibrotické fázi primární myelofibrózy ani ostatním Ph-MPN. Osteoprotegerin byl zvýšen u 53 % myelofibróz, hodnoty korelovaly s pokročilostí nemoci (p = 0,0043), ale nebyly signifikantně rozdílné ve srovnání s prefibrotickou fází primární myelofibrózy či ostatními Ph-MPN. Z hodnocených parametrů kostního metabolismu byly zaznamenány významné rozdíly v hladinách vitaminu D. Ve srovnání s ostatními Ph-MPN byl jeho deficit častěji zjištěn ve skupině myelofibróz (p = 0,0003), u kterých sérové koncentrace vitaminu D korelovaly s pokročilostí choroby (p = 0,05). Závěr: Testované plazmatické parametry nejsou dostatečně citlivé pro neinvazivní monitorování fibrózy kostní dřeně v rutinní klinické praxi. Zvýšená exprese OPG zřejmě hraje roli v patogenezi myelofibrózy. U MF jsou nižší sérové koncentrace vitaminu D ve srovnání s ostatními Ph-MPN, tíže jeho deficitu koreluje s pokročilostí choroby. S ohledem na skutečnost, že se vitamin D spolupodílí na inhibici JAK/STAT signální dráhy, vyvstává aktuální potřeba ověřit jeho prognostický význam v éře JAK inhibitorů.
Introduction: Primary myelofibrosis belongs to a group of Philadelphia chromosome-negative myeloproliferative neoplasms (Ph-MPN) together with essential thrombocythemia and polycythemia vera, which may also progress to bone marrow fibrosis. The study assessed biochemical markers of bone remodeling and osteoprotegerin to find a suitable marker for non-invasive monitoring of bone marrow fibrosis, as well as bone metabolism, in particular the role of vitamin D. Patients and methods: Bone remodeling markers (bALP, P1NP, ICTP), bone metabolism and osteoprotegerin were analyzed in 34 patients with myelofibrosis, 13 patients with prefibrotic primary myelofibrosis and a group of 28 patients with essential thrombocythemia and polycythemia vera. Results: There was no increase in bALP, P1NP and ICTP were elevated in 18% and 32% of MF, respectively. The values neither correlated with fibrosis stage nor showed significant differences compared to the other Ph-MPN. Osteoprotegerin was increased in 53% of myelofibrosis, values correlated with myelofibrosis risk status (p = 0.0043) but did not show a significant difference compared to the other Ph-MPN. Among bone metabolism parameters, significant differences were noted for vitamin D levels. Myelofibrosis had significantly lower vitamin D levels than the other Ph-MPN (p = 0.0003), the values correlated with MF risk status (p = 0.05). Conclusion: The tested parameters are not sensitive enough for non-invasive monitoring of bone marrow fibrosis in routine clinical practice. Increased expression of osteoprotegerin is likely to play a role in the pathogenesis of myelofibrosis. Serum concentrations of vitamin D are significantly lower in myelofibrosis; the severity of its deficiency correlates with disease stage. Given the fact that vitamin D participates in inhibition of the JAK/STAT signaling pathway, there is an urgent need to verify its prognostic value in the present-day era of JAK inhibitors.
- Klíčová slova
- Ph-myeloproliferace, kostní obrat,
- MeSH
- dospělí MeSH
- klinická studie jako téma MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- nedostatek vitaminu D * MeSH
- osteoprotegerin analýza MeSH
- primární myelofibróza * genetika patologie MeSH
- senioři MeSH
- vitamin D analýza MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
OBJECTIVES: A complex karyotype (CK) is considered a poor prognostic marker in chronic lymphocytic leukemia (CLL). METHODS: The study analyzed 644 untreated CLL patients (pts) using conventional/molecular cytogenetics to reveal the presence of a CK and its composition and to assess its predictive value. The mutational status ofTP53 was detected by next generation sequencing. RESULTS: A CK was detected in 79 pts (12.3%). Patients with a CK showed shorter overall survival (OS) compared to those without a CK (77 months vs. 115 months, p < 0.0001). Chromosomes most frequently included in a CK were 13, 11, 17, 8, 2, and 6. The most common aberrations in a CK were translocations, numerical changes and dicentric chromosomes (with no effect on OS). Patients with aberrations ofTP53 and ATM were shown to have adverse prognosis comparable to patients with a CK without these abnormalities. A stronger impact of a CK on OS of female and older CLL patients was observed. CONCLUSIONS: The determining of the presence of a CK is essential in modern clinical CLL practice. According to recent studies, the presence of a CK affects clinical and treatment decision-making.
- MeSH
- abnormální karyotyp * MeSH
- chromozomální aberace * MeSH
- chronická lymfatická leukemie diagnóza genetika mortalita terapie MeSH
- dospělí MeSH
- genetická predispozice k nemoci * MeSH
- genetické asociační studie * MeSH
- hybridizace in situ fluorescenční MeSH
- Kaplanův-Meierův odhad MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- management nemoci MeSH
- mutace MeSH
- nádorové biomarkery MeSH
- následné studie MeSH
- prognóza MeSH
- rizikové faktory MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- srovnávací genomová hybridizace MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
Přehledný článek přibližuje molekulárně-genetickou podstatu hemoglobinopatií, jejich klasifikaci a fenotypické projevy. Popis jednotlivých podskupin je doplněn o kazuistické příklady nemocných z české populace. Je uveden přehled 14 typů α-talasemických mutací, 34 β-talasemických alel, 4 4 δβ-talasemické alely a 22 hemoglobinových variant identifikovaných v české populaci u 876 osob z 579 rodin. Podrobněji jsou popsány hemoglobinopatie, které zde byly diagnostikovány prioritně: β-talasemická alela CD 38/39 (-C); Hb Olomouc; Hb Haná; Hb Hradec Králové a α-tal.-2 delece DNA o délce 18,3 kb, jejíž identifikace umožnila odhalit nový mechanizmus vzniku α-talasemie-2. Skutečnost, že hemoglobinopatie byly v ČR do konce roku 2017 diagnostikovány u téměř 900 nemocných, ukazuje, že u nás nejsou vzácné. To klade zvýšené nároky na jejich diagnostiku, včetně diagnostiky prenatální.
This article summarize molecular-genetic basis of hemoglobinopathies, their classification and phenotypic manifestations. The description of individual subgroups is supplemented with a case reports of patients diagnosed in the Czech population. This paper provides an overview of 14 types of α-thalassemic mutations, 34 β-thalassemic alleles, 4 4 δβ-thalassemic alleles and 22 hemoglobin variants identified in the Czech population in 876 persons from 579 families. In more detail are described hemoglobinopathies, that have been diagnosed and described as novel: β-thalassemic mutation CD 38/39 (-C); Hb Olomouc; Hb Hana; Hb Hradec Kralove and 18.3 kb deletion downstream of α-globin cluster leading to a new mechanism of α-thalassemia-2. The fact that until the end of 2017 hemoglobinopathies were diagnosed in nearly 900 patients shows that they are not rare in the Czech Republic. This brings increased demands for their diagnostics, including prenatal diagnosis.
- MeSH
- alfa-talasemie diagnóza genetika patologie MeSH
- beta-talasemie diagnóza genetika patologie MeSH
- delece genu MeSH
- hemoglobinopatie * diagnóza genetika patologie MeSH
- hemoglobiny analýza klasifikace MeSH
- lidé MeSH
- methemoglobinemie diagnóza patologie MeSH
- mutace genetika MeSH
- slezina patologie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
- Klíčová slova
- JAK2 V617F,
- MeSH
- dospělí MeSH
- esenciální trombocytemie komplikace MeSH
- Janus kinasa 2 genetika MeSH
- kalretikulin genetika MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- mladý dospělý MeSH
- mutace MeSH
- myeloproliferativní poruchy * genetika komplikace patologie MeSH
- polycythaemia vera komplikace MeSH
- primární myelofibróza * MeSH
- prognóza MeSH
- retrospektivní studie MeSH
- senioři MeSH
- signální transdukce MeSH
- transkripční faktory STAT MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- mladý dospělý MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
- MeSH
- akutní lymfatická leukemie * diagnóza terapie MeSH
- antilymfocytární sérum aplikace a dávkování terapeutické užití MeSH
- antitumorózní látky alkylující MeSH
- antivirové látky MeSH
- cyklosporin terapeutické užití MeSH
- imunosupresiva MeSH
- lidé MeSH
- melfalan aplikace a dávkování terapeutické užití MeSH
- nemoc štěpu proti hostiteli diagnóza MeSH
- pooperační komplikace MeSH
- transplantace hematopoetických kmenových buněk * MeSH
- vidarabin analogy a deriváty aplikace a dávkování terapeutické užití MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
Talasémie tvoří heterogenní skupinu vrozených poruch červené krevní řady. Příčinou je nerovnováha globinových řetězců v molekule hemoglobinu, která vede k neefektivní erytropoéze v kostní dřeni a ke zkrácení životního cyklu erytrocytů. Klinická a laboratorní manifestace je značně rozdílná a závisí na počtu postižených globinových genů. Jedinci s nosičstvím talasemické alely jsou asymptomatičtí a nacházíme u nich jen mikrocytózu erytrocytů a u některých snížení hladiny hemoglobinu. Těžší formy talasémií jsou provázeny závažnou mikrocytární anémií s vystupňovanou hemolýzou a s tím souvisejícími komplikacemi. Diagnostika talasémií spočívá v analýze hemoglobinového spektra a v detekci kauzální mutace molekulárně genetickými metodami. Léčba nositelů talasemické alely většinou není nutná, u těžších forem talasémie spočívá v pravidelné substituci erytrocytárními koncentráty a léčbě přidružených komplikací. Kauzální terapií je transplantace kmenových buněk krvetvorby a genová terapie. U vybraných párů je dostupná prenatální diagnostika.
Thalassemias represent heterogenic group of inhereted red blood cells disorders. It is caused by imbalance of globin chains in hemoglobin molecule, which leads to ineffective erythropoiesis in a bone marrow and shortening of erythrocyte´s life span. Clinical and laboratory presentation is heterogenic and depends on number of affected genes. Thalassemia carriers are asymptomatic with microcytic erythrocytes and hemoglobin level can be decreased in some cases. Severe forms of thalassemia are associated with severe microcytic hypochromic anemia, an increased hemolysis and with a related complications. Diagnosis of thalassemia consists of analysis of hemoglobin spectrum and detection of the causal mutations by molecular genetic methods.. Carriers of thlassemia allele require no therapy, patients with severe form need a regular transfusion regime. As a curative procedures, hematopoetic stem cell transplantation and gene therapy can be used. Prenatal testing is also available.
