Cílem práce bylo zhodnotit molekulárně genetickými metodami (MGM) spektrum původců dermatofytóz na území České republiky s rozdělením podle hlavních klinických forem. Během dvou let (červenec 2011 až červen 2013) bylo na šesti regionálních pracovištích zachyceno 3235 kultivačně pozitivních vzorků s dermatofyty. Nejvyšší počet izolátů pocházel z případů tinea unguium (55,5 %), dále t. corporis (29,2 %), t. pedis (14,6 %) a t. capitis (0,7 %). Druhová identifikace izolátů všech druhů (n = 672) s výjimkou Trichophyton rubrum (n = 2 563) byla provedena MGM (PCR-fingerprinting nebo sekvenace ITS oblasti rDNA). Pro T. rubrum byla molekulárně ověřena jen identifikace morfologicky nejednoznačných izolátů (n = 189). Celkem bylo identifikováno 14 druhů dermatofytů, přičemž nejvýznamnější změnou oproti minulosti bylo vysoké zastoupení zoofilního druhu Arthroderma benhamiae, který působil velkou část případů t. corporis (22,9 %) a t. capitis (29,2 %). Geofilní druhy působily jen 1,3 % všech infekcí, přestože se jednalo o druhově nejpočetnější skupinu, ve které byly odhaleny dva nepopsané druhy a také přehlížené druhy Microsporum persicolor a M. fulvum. Klíčová slova: Arthroderma benhamiae – DNA sekvenace – geofilní dermatofyty – ITS oblast rDNA – PCR-fingerprinting – tinea capitis – tinea corporis – tinea pedis – tinea unguium – zoofilní dermatofyty
The aim of the study was to evaluate the spectrum of causative agents of the main clinical forms of dermatophytoses in the Czech Republic by molecular genetic methods (MGM). During two years (from July 2011 to June 2013), 3255 cultivation specimens were positive for dermatophytes. The highest number of specimens was isolated from tinea unguinum (55,5%), then tinea corporis (29,2%), tinea pedis (14,6%) and tinea capitis (0,7%). The identification of isolated species (n = 672) except for Trichophytom rubrum (n = 2563) was performed by MGM (PCR fingerprinting or sequencing of ITS segments of rDNA). For T. rubrum only morphologically non-clear isolates were identified (n = 189). In total, 14 species of dermatophytes were identified. The most important change noticed compared to previous results was an increased detection of Arthroderma benhamiae in the cases of tinea corporis (22,9%) and tinea capitis (29,2%). Geophilic species caused only 1,3% of all infections even if this group comprised the highest number of species with two newly described ones and also Microsporum persicolor and M. fulvum wich are usually overlooked in the morphological examination. Key words: Arthroderma benhamiae – DNA sequencing – geophilic dermatopytes – ITS region of rDNA – PCR-fingerprinting – tinea capitis – tinea corporis – tinea pedis – tinea unguinum – zoophilic dermatophytes
- Klíčová slova
- Arthroderma benhamiae, zoofilní dermatofyty, tinea unguium, tinea corporis, PCR-fingerprinting, ITS oblast rDNA, geofilní dermatofyty, Trichophyton rubrum,
- MeSH
- Arthrodermataceae genetika izolace a purifikace klasifikace MeSH
- dermatomykózy * epidemiologie genetika mikrobiologie MeSH
- DNA fingerprinting MeSH
- DNA fungální analýza MeSH
- DNA primery diagnostické užití MeSH
- druhová specificita MeSH
- houby * genetika izolace a purifikace klasifikace MeSH
- lidé MeSH
- Microsporum genetika izolace a purifikace klasifikace MeSH
- mykologické určovací techniky metody MeSH
- polymerázová řetězová reakce MeSH
- ribozomální DNA MeSH
- sekvenční analýza DNA MeSH
- tinea capitis epidemiologie genetika mikrobiologie MeSH
- tinea pedis epidemiologie genetika mikrobiologie MeSH
- tinea * epidemiologie genetika mikrobiologie MeSH
- Trichophyton genetika izolace a purifikace klasifikace MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
Tinea capitis a corporis je dermatofytóza vyskytující se nejčastěji v dětském věku. V závislosti na druhu dermatofytu, který onemocnění vyvolal, může probíhat pod obrazem povrchové mykózy i hluboké infekce se silně zánětlivými projevy. Nejčastějším původcem v našich klimatických podmínkách je Microsporum canis. Tinea capitis je léčena systémovými antimykotiky, především terbinafinem a itrakonazolem, tinea corporis v závislosti na intenzitě projevu lokálními či systémovými antimykotiky. Naše sdělení prezentuje případy tinea capitis a corporis u tří dětí, které byly vyvolány netypickým dermatofytem Arthroderma benhamiae, přeneseným z nakažených morčat. První popisovaný případ u desetileté dívky probíhal pod obrazem silně zánětlivé reakce ve vlasové části hlavy. Infekce byla doprovázena celkovými příznaky a nereagovala na perorální léčbu terbinafinem. Druhá kazuistika popisuje infekci u dvou sourozenců, kteří byli úspěšně vyléčeni kombinací perorální léčby terbinafinem s lokální terapií. Prvotní perorální léčba tinea capitis flukonazolem u jednoho ze sourozenců se ukázala jako neúčinná, podobně jako lokální terapie ciklopiroxolaminem. Klíčová slova: tinea capitis – tinea corporis – zoofilní dermatofyty – Arthroderma benhamiae – morče – flukonazol – terbinafin – posakonazol
Tinea capitis and tinea corporis are dermatophytoses mostly appearing in childhood. Depending on the type of causative dermatophyte they might present as a superficial mycosis or a deep infection with a serious inflammatory reaction. Microsporum canis is the most common pathogen in our climate. Tinea capitis is treated by systemic antifungals, mostly terbinafine and intraconazole, tinea corporis requires local or systemic treatment according to the disease extent. We present three children with tinea capitis and corporis caused by an atypical dermatophyte Arthroderma benhamiae, spreading from an infected guinea pig. The first case manifested as a strong inflammatory lesion on the scalp of a ten-year old girl with systemic symptoms. Systemic terbinafine therapy failed. The second case describes infection in two siblings successfully treated by combination of systemic terbinafine and local therapy. The former systemic therapy of tinea capitis by fluconazole and local ciclopirox olamine treatment was not successful in one of the siblings. Key words: tinea capitis – tinea corporis – zoofilic dermatophytes – Arthroderma benhamiae – guinea pig – fluconazole – terbinafine – posaconazole
- Klíčová slova
- zoofilní dermatofyty, posakonazol, dermatofytóza,
- MeSH
- antibakteriální látky aplikace a dávkování MeSH
- antifungální látky * aplikace a dávkování MeSH
- Arthrodermataceae * genetika izolace a purifikace MeSH
- cefuroxim aplikace a dávkování MeSH
- dítě MeSH
- flukonazol aplikace a dávkování škodlivé účinky terapeutické užití MeSH
- hospitalizace MeSH
- hospodářská zvířata MeSH
- inhibitory 14-alfa-demethylasy aplikace a dávkování MeSH
- inhibitory enzymů aplikace a dávkování MeSH
- lidé MeSH
- morčata * MeSH
- naftaleny aplikace a dávkování MeSH
- předškolní dítě MeSH
- terbinafin MeSH
- tinea capitis diagnóza farmakoterapie MeSH
- tinea * diagnóza farmakoterapie přenos MeSH
- triazoly aplikace a dávkování MeSH
- Trichophyton genetika izolace a purifikace MeSH
- trypanocidální látky aplikace a dávkování MeSH
- zoonózy MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- lidé MeSH
- morčata * MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- předškolní dítě MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
Taxonomie dermatofytů prošla v minulosti řadou výrazných změn a nikdy nebyla příliš stabilní. Poslední rozsáhlejší změny proběhly v souvislosti s revizí skupiny molekulárně genetickými metodami. Hlavním cílem této práce je seznámit čtenáře s pokroky v taxonomii dermatofytů a prostřednictvím seznamu doporučených jmen sjednotit pojmenovávání druhů napříč českými pracovišti. To by mělo nejen usnadnit komunikaci, ale také porovnávání výsledků se zahraniční literaturou. Jedním z doporučení je například ukončení používání jména Trichophyton mentagrophytes v klinické praxi. V úvodu textu se diskutuje o problematickém konceptu druhu u dermatofytů, jehož rozdílná aplikace může mít velký vliv na počet uznávaných druhů. Závěrečná část je věnována budoucím změnám souvisejícím s novým vydáním Mezinárodního kódu nomenklatury řas, hub a rostlin. Jedná se především o ukončení duální nomenklatury hub a vybrání jediného správného jména pro každý druh. Obecně se dá říci, že je vhodné preferovat jméno nepohlavního stadia (Trichophyton, Microsporum, Epidermophyton), s výjimkou případů, kde toto jméno není k dispozici (např. Arthroderma benhamiae). Klíčová slova: Arthroderma – druhový koncept – fylogeneze – Mezinárodní nomenklatorický kód – jedna houba, jedno jméno – polyfázický přístup – Trichophyton interdigitale – Trichophyton mentagrophytes
Taxonomy of dermatophytes has changed significantly in the past and it has never been stable. Last extensive changes appeared after revision of the group by molecular genetic methods. This paper introduces the advances in taxonomy of dermatophytes and helps to unify the species names in use among the Czech laboratories to simplify their communication and comparison of the results with foreign literature. The complicated species concept of dermatophytes that might be applied differently and might influence the number of accepted species is discussed in the beginning. The last part is dedicated to future changes related to a new edition of the International Code of Nomenclature for algae, fungi, and plants namely to termination of a dual nomenclature of fungi and choosing the one correct name for each species. Key words: Atrhroderma – species concept – phylogeny – the International Code of Nomenclature – one fungus one name – polyphasic approach – Trichophyton interdigitale – Trichophyton mentagrophytes
- Klíčová slova
- druhový koncept, Trichophyton mentagrophytes, Trichophyton interdigitale, polyfázický přístup, Mezinárodní nomenklatorický kód, zoofilní druhy, geofilní druhy,
- MeSH
- Arthrodermataceae klasifikace MeSH
- dermatomykózy mikrobiologie MeSH
- Epidermophyton klasifikace MeSH
- fylogeneze * MeSH
- houby klasifikace MeSH
- lidé MeSH
- Microsporum klasifikace MeSH
- mitosporické houby * izolace a purifikace klasifikace MeSH
- mykologické určovací techniky MeSH
- terminologie jako téma * MeSH
- Trichophyton klasifikace MeSH
- zoonózy MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
- přehledy MeSH
An undescribed Microsporum species was isolated from skin scales recovered from a 40-mm large, annular, scaling lesion on the wrist of a 46-year-old woman. The risk factors for dermatophyte infection in the patient were frequent work in the garden, hunting, and contact with dogs and horses. Direct microscopic examination of the scales revealed the presence of dermatophyte hyphae; when the samples were cultured, a morphologically similar fungus grew on all slants in pure culture. Both of these findings strongly suggested that the isolate was the true causal agent of infection. The possible geophilic nature of the species was based on phylogenetic analysis (internal transcribed spacer region of rDNA and β-tubulin gene) that placed it in between species of the M. gypseum complex. However, its divergencies from all other Microsporum species exceeded 4% base pairs. Based on β-tubulin phylogeny, the isolated species is a sister to M. gypseum. The species produces abundant chlamydospores and clumps of hyphae similar to those of ascomatal primordia but no conidia and ascospores. The species was unable to grow at 37°C and does not grow on T6 basal medium, which is unlike other Microsporum species; hair perforation and urease tests were positive. The addition of histidine to the T6 medium resulted in rapid growth of the fungus. The phylogenetic evidence, morphology, growth parameters, and physiology justified the proposal that the isolate is a new species, M. aenigmaticum, sp. nov.
- MeSH
- fylogeneze MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mezerníky ribozomální DNA chemie genetika MeSH
- Microsporum klasifikace genetika izolace a purifikace MeSH
- molekulární sekvence - údaje MeSH
- mykologické určovací techniky MeSH
- ribozomální DNA chemie genetika MeSH
- sekvenční analýza DNA MeSH
- shluková analýza MeSH
- tinea diagnóza mikrobiologie MeSH
- tubulin genetika MeSH
- zápěstí mikrobiologie patologie MeSH
- Check Tag
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- kazuistiky MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
Auxarthron is a genus within the Onygenales encompassing keratinophilic species with typical ascomata (gymnothecia) consisting of anastomosing network of thick-walled hyphae and small globose or oblate ascospores. No association of this genus with clinically relevant cases of human or animal infection has been reported. This paper describes the isolation of an undescribed Auxarthron species as an agent of proven onychomycosis affecting almost all fingernails in a man with psoriasis. The causality of the isolated fungus was verified by repeated sampling and direct microscopy revealing irregular septate hyphae. Based on micro- and macromorphological features and unique sequence data (ITS region, benA and RPB2 gene), the isolated fungus is proposed as the new species A. ostraviense. The sibling species of A. ostraviense, A. umbrinum, was isolated from three patients with suspected onychomycosis and a detailed clinical history is provided for one of these patients. All four isolates were tested for susceptibility to selected antifungal agents. Terbinafine and clotrimazole appear to be effective in vitro. The morphological identification of Auxarthron spp. is non-trivial, time-consuming and requires cultivation media other than Sabouraud glucose agar which is routinely used in dermatomycology.
- MeSH
- antifungální látky farmakologie MeSH
- DNA fungální chemie genetika MeSH
- dospělí MeSH
- fungální proteiny genetika MeSH
- klotrimazol farmakologie MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mezerníky ribozomální DNA chemie genetika MeSH
- mikrobiální testy citlivosti MeSH
- molekulární sekvence - údaje MeSH
- naftaleny farmakologie MeSH
- onychomykóza mikrobiologie MeSH
- Onygenales klasifikace genetika izolace a purifikace MeSH
- psoriáza komplikace MeSH
- sekvenční analýza DNA MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- kazuistiky MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
Cíl práce: Cílem předkládaného projektu bylo zmapovat situaci stran invazivních kvasinkových infekcí na vybraných hematoonkologických odděleních České a Slovenské republiky a porovnat citlivost získaných izolátů k vybraným antimykotikům. Materiál a metody: V období 1. 3. 2009–31. 10. 2010 byly sbírány kmeny z potenciálně závažných klinických materiálů od pacientů s hematologickou malignitou. Každý izolát byl biochemicky určen a byla stanovena jeho in vitro citlivost k echinokandinům, amfotericinu B a vybraným azolům metodou Etest. Současně byla shromažďována relevantní klinická data. Výsledky: Do studie bylo zařazeno 63 izolátů od 61 pacientů. Mezi izolovanými druhy kvasinek převládala C. albicans a C. glabrata (28, resp. 19 %), což odpovídá světově publikovaným datům. Nicméně při vyloučení izolátů z bronchoalveolární tekutiny (BAT) se procentuální zastoupení změnilo ve prospěch C. albicans a C. parapsilosis (25, resp. 17 %). Získaná data o minimální inhibiční koncentraci svědčí o dobré citlivosti kvasinek k echinokandinům a amfotericinu B, 10 (16 %) kmenů vykazovalo zkříženou rezistenci k azolům (ve většině případů se jednalo o C. glabrata). Závěr: Invazivní kvasinkové infekce nejsou častou infekční komplikací u pacientů s hematologickou malignitou v České a Slovenské republice a druhové spektrum původců je u nás podobné, jako je ve světě. Léčbu je zejména u těchto nemocných výhodné opřít o in vitro citlivost kandid k antimykotikům.
Background: The aim of our study was to analyze the spectrum and characteristic of invasive candidiasis in selected haematological departments in the Czech and Slovak Republics, and to compare minimum inhibitory concentrations (MIC) of some antifungal agents for isolates obtained. Material and methods: Between 1 March 2009 and 31 October 2010, Candida strains from clinically important material obtained from patients with haematological malignancies were collected. Each isolate was biochemically identified and tested for in vitro susceptibility to three known echinocandins and amphotericin B and selected azoles using the E-test. Relevant clinical data were collected. Results: The study included 63 isolates from 61 patients. The most frequently isolated species were C. albicans and C. glabrata (28 % and 19 %, respectively). However, after exclusion of isolates from bronchoalveolar lavage fluid, the percentage changed in favour of C. albicans and C. parapsilosis (25 % and 17 %, respectively). The MIC data showed a high susceptibility of yeasts to echinocandins and amphotericin B. Ten (16 %) strains were cross-resistant to azoles (mostly C. glabrata). Conclusion: Invasive candidiasis is not frequent infection complication in patients with haematological malignancies in the Czech Republic and Slovakia. Moreover, the spectrum of pathogens was similar to that described in recent international studies. However, identification of susceptible and resistant strains according to MIC could be beneficial for choice of antifungal treatment.
- Klíčová slova
- hematoonkologičtí pacienti, minimální inhibiční koncentrace,
- MeSH
- antifungální látky terapeutické užití MeSH
- Candida účinky léků MeSH
- hematologické nádory mikrobiologie MeSH
- kandidóza farmakoterapie komplikace MeSH
- lidé MeSH
- mikrobiální testy citlivosti MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- MeSH
- alergie etiologie imunologie MeSH
- Aspergillus patogenita MeSH
- Fusarium patogenita MeSH
- houby * patogenita růst a vývoj MeSH
- lidé MeSH
- místní státní správa MeSH
- mykotoxiny klasifikace škodlivé účinky toxicita MeSH
- Penicillium patogenita MeSH
- záplavy * MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- přednášky MeSH