The aim of this paper is to overview challenges and principles of Big Data analysis in biomedicine. Recent multivariate statistical approaches to complexity reduction represent a useful (and often irreplaceable) methodology allowing performing a reliable Big Data analysis. Attention is paid to principal component analysis, partial least squares, and variable selection based on maximizing conditional entropy. Some important problems as well as ideas of complexity reduction are illustrated on examples from biomedical research tasks. These include high-dimensional data in the form of facial images or gene expression measurements from a cardiovascular genetic study.

• MeSH
• analýza dat MeSH
• analýza hlavních komponent metody   MeSH
• big data * MeSH
• biostatistika * metody   MeSH
• kardiovaskulární nemoci genetika   prevence a kontrola   MeSH
• lidé MeSH
• metoda nejmenších čtverců MeSH
• riziko MeSH
• rozpoznání obličeje MeSH
• systémy pro podporu klinického rozhodování MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH

Brožura je sborníkem prací, které se zaměřily na harm reduction prevenci nádorových nemocí. Určeno odborné veřejnosti.

• MeSH
• nádory prevence a kontrola   MeSH
• primární prevence MeSH
• sekundární prevence MeSH
• snížení rizika poškození MeSH
• Publikační typ
• sborníky MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• onkologie
• preventivní medicína
• NLK Publikační typ
• brožury

Studie FEVER sledovala rozdíl mezi intenzivnější a méně intenzivní léčbou krevního tlaku, přitom porovnala kombinaci: nízká dávka diuretika (hydrochlorothiazid 12,5 mg) s nízkou dávkou kalciového antagonisty (felodipin 5 mg) s monoterapií: nízká dávka diuretika (hydrochlorothiazid 12,5 mg) u čínských hypertenzních pacientů. Do analýzy bylo zahrnuto 9 711 hypertoniků (4 841 užívalo kombinaci hydrochlorothiazidu s felodipinem a 4 870 kombinaci hydrochlorothiazidu s placebem). Pokles krevního tlaku byl u kombinační léčby z 158,7/92,4 mm Hg na 138,1/82,3 mm Hg a při monoterapii z 158,0/92,7 mm Hg na 141,6/83,9 mm Hg. Průměrný rozdíl během celé studie byl 4,2/2,1 mm Hg. Primární cíl ? vznik fatálních a nefatálních cévních mozkových příhod (CMP) ? byl o 27 % nižší ve skupině s kombinační léčbou. I v sekundárních cílech byla úspěšnost kombinační léčby vyjádřena snížením rizika o 27 % u všech kardiovaskulárních příhod, o 35 % srdečních příhod, o 32 % koronárních příhod a počet úmrtí o 31 %. Malý rozdíl v TKs/TKd přibližně o 4/2 mm Hg byl spojen s poklesem incidence CMP a kardiovaskulárních příhod u čínských hypertoniků.

• MeSH
• cévní mozková příhoda komplikace   prevence a kontrola   MeSH
• felodipin aplikace a dávkování   terapeutické užití   MeSH
• fixní kombinace léků MeSH
• hydrochlorthiazid aplikace a dávkování   terapeutické užití   MeSH
• hypertenze farmakoterapie   MeSH
• interpretace statistických dat MeSH
• kardiovaskulární nemoci komplikace   prevence a kontrola   MeSH
• lidé MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• srovnávací studie MeSH

Cíl práce: Srovnat perinatální výsledky u vícečetných gravidit po provedené redukci a gravidit,u nichž redukce nebyla provedena.Název a sídlo pracoviště: Sanatorium Pronatal, Na Dlouhé mezi 4/12, 147 00 Praha 4 - Hodkovičky.Metodika: Analyzovali jsme výsledky těhotenství po porodu žen s dvoučetnou graviditou, kterébyly na našem pracovišti výsledkem léčby metodami asistované reprodukce v době od 1. 1. 1996do 31. 12. 1998. Ve sledované skupině bylo 122 dvoučetných gravidit, které vznikly po redukcitroj- a vícečetného těhotenství. Hodnotili jsme procento těhotenských ztrát, délku těhotenství,hmotnost novorozenců a způsob ukončení porodu. Tyto výsledky byly srovnány s kontrolní skupi-nou tvořenou 180 případy dvoučetných gravidit, které redukci nepodstoupily.Výsledky: Analýza byla provedena pouze pro matky s kompletními údaji (tj. 90 žen s dvoučetnougraviditou po redukci a 129 žen s dvoučetnou graviditou bez provedené redukce). Na 5% hladiněvýznamnosti nebylo prokázáno, že by se soubory lišily v průměrné délce těhotenství nebo vprůměrných hmotnostech dvojčat. Průměrný věk matek se lišil na 5% hladině významnosti (prů-měrné hodnoty věku 30,16 u skupiny s redukcí a 31,73 pro skupinu bez provedené redukce). Fishe-rův test na 5% hladině významnosti nezjistil významný rozdíl v pravděpodobnostech potratu veskupinách s redukcí (5,26 %) a bez redukce (12,84 %). Na 5% hladině významnosti nebyl zjištěnvýznamný rozdíl v pravděpodobnostech výskytu perinatálního úmrtí plodu a porodu mrtvéhoplodu. Je však třeba upozornit na velmi malé četnosti těchto jevů v našem souboru. Také procen-to císařských řezů se ve sledovaných skupinách nelišilo (86,24 % ve sledované skupině vs. 87,24 %ve skupině neredukovaných dvojčat).Závěr: Redukce vícečetného těhotenství nezhoršuje perinatální výsledky ve srovnání s gravidita-mi, u nichž redukce nebyla provedena, jak bylo prokázáno analýzou obou souborů.

Objective: To compare perinatal results for multi-foetal pregnancies where the reduction wasperformed with pregnancies where the reduction was not performed.Setting: Sanatorium Pronatal, Na Dlouhé mezi 4/12, 147 00, Praha 4 - Hodkovičky.Methods: We have analyzed results of pregnancies, after delivery, for women with twin pregnancywhich originated in our sanatorium, as a result of treatment with assisted reproducti on methods,in the period of time from January 1 st 1996 to December 31 st 1998. In the group being monitoredthere were 122 twin pregnancies originated as a result of reduction of triple and more-foetalpregnancies. We evaluated the percentage of miscarriages, length of pregnancies, weight of thenewborns and the manner of termination of the delivery. These results were compared with ourcontrol group consisting of 180 cases of twin pregnancies which were not a result of reduction.Results: Analysis was performed for those mothers only where complete data were available. Ata 5% level of statistical signifikance, it was not proved that both groups differed in average termof pregnancy or average weight of the twins. Average age of the mothers differed at 5% level ofsignificance (average age values were 30.16 for the group with reduction and 31.73 for the groupwithout reduction). Fisher test on 5 % significance level did not ascertain any signif icant differen-ce in the probability of miscarriage between the group with reduction (5.26 %) and the groupwithout reduction (12.84 %). At 5% level of statistical significance, no significant difference inprobability of perinatal death of the foetus or delivery of a stillborn foetus was ascertained.However, it is necessary to point out a low frequency of these phenomena in our group. Thepercentage of cesarean sections did not differ significantly in both groups (86.24 % in the groupmonitored vs 87.24 % in the group of twins without reduction).Conclusion: The analysis of both groups proves that reduction of multi-foetal pregnancies doesnot worsen perinatal results in comparison to pregnancies where reduction was not performed.

• MeSH
• dospělí MeSH
• dvojčata MeSH
• lidé MeSH
• porod MeSH
• porodní hmotnost MeSH
• redukce mnohoplodového těhotenství metody   MeSH
• těhotenství mnohočetné MeSH
• těhotenství MeSH
• výsledek těhotenství MeSH
• Check Tag
• dospělí MeSH
• lidé MeSH
• těhotenství MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• přehledy MeSH
• srovnávací studie MeSH

Najčastejším zhubným ochorením žien je karcinóm prsníka. Najčastejšou komplikáciou po operácii prsníka s exenteráciou lymfatických axilámych uzlin a následnej rádioterapii a chemoterapii býva sekundárny lymfedém hornej končatiny. Liečba lymfedému je v 98% konzervatívna. Modality používané v terapii sú manuálna lymfatická drenáž, intermitentná kompresia viackomorovými vakmi, kompresívne bandážovanie a antiedematózna gymnastika. Pre potvrdenie hypotézy o nutnosti použitia týchto terapeutických modalít sme vybrali súbor 100 pacientiek po operácii karcinómu prsníka s následným lymfedémom a spoločnou anamnézou - punkcia serómu v axile. 73 pacientiek podstúpilo kvadrantektómiu a 27 mastektómiu. Pacientky boli rozdelené do dvoch skupín. Prvý súbor tvorili pacientky do jedného roka od operácie. Do druhého súboru boli zaradené ženy po roku až do dvoch rokov po operácii, ktoré doposial neabsolvovali liečbu lymfedému. Pri použití rovnakých liečebných postupov sme v obidvoch skupinách sledovali obvody edematóznej končatiny, farbu kože, svalovú silu, zmeny teploty kože a ostatné klinické príznaky spomenuté v článku. Po vyhodnotení údajov získaných počas sledovania oboch skupín výskum jasne ukázal, neskoršie zahájenie liečby lymfedému vedie k pomalšej redukcii opuchu a ostatných symptómov.

The most frequent malignant disease of woman population is breast cancer. The most common complication after surgical performance with exenteration of lymphatic axillary nodes and further radiotherapy and chemotherapy is the lymphoedema of the upper limb. The lymphoedema treatment is in 98% conservative. The modalities used in therapy are manual lymphatic drainage, intermittent compression by multiseptate sacs, compressive bandage and antioedematose gymnastics. To show the influence of these therapeutic modalities we have chosen a set of 100 women after breast surgery with the common diagnosis ñ the seroma centesis in axille. 73 patients underwent quadrantectomy and 27 patients mastectomy. The patients were divided in two groups. The first group consisted of women who underwent the surgery within one year. In the second set were incorporated the women after one to two years after surgery; they have not until now absolved the treatment of lymphoedema. After undergoing the same rehabilitation methods both sets were compared using the measurements of the circumference of the oedematic limb, skin color, muscle power, changes of skin temperature and other symptoms mentioned later. After the evaluation of the data obtained during the follow-up of the both sets the research has clearly shown that the later entry into treatment of lymphoedema results to a slower retreat of the swelling and other symptoms. The research has also confirmed the effectiveness of the used therapeutical methods in both sets.

• MeSH
• drenáž MeSH
• lidé MeSH
• lymfedém rehabilitace   terapie   MeSH
• nádory prsu chirurgie   MeSH
• okluzivní ošetření rány MeSH
• pooperační komplikace MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• ženské pohlaví MeSH

A local molybdenum-reducing bacterium was isolated and tentatively identified as Acinetobacter calcoaceticus strain Dr.Y12 based on carbon utilization profiles using Biolog GN plates and 16S rDNA comparative analysis. Molybdate reduction was optimized under conditions of low dissolved oxygen (37 degrees C and pH 6.5). Of the electron donors tested, glucose, fructose, maltose and sucrose supported molybdate reduction after 1 d of incubation, glucose and fructose supporting the highest Mo-blue production. Optimum Mo-blue production was reached at 20 mmol/L molybdate and 5 mmol/L phosphate; increasing the phosphate concentrations inhibited the production. An increase in an overall absorption profiles, especially at peak maximum at 865 nm and the shoulder at 700 nm, was observed in direct correlation with the increased in Mo-blue amounts. Metal ions, such as chromium, cadmium, copper, mercury and lead (2 mmol/L final concentration) caused approximately 88, 53, 80, 100, and 20 % inhibition, respectively. Respiratory inhibitors, such as antimycin A, rotenone, sodium azide and cyanide showed in this bacterium no inhibition of the Mo-blue production, suggesting that the electron transport system is not a site of molybdate reduction.

• MeSH
• Acinetobacter calcoaceticus genetika   izolace a purifikace   metabolismus   MeSH
• molekulární sekvence - údaje MeSH
• molybden metabolismus   MeSH
• oxidace-redukce MeSH

In this study, we describe changes of plasma levels of the hypothalamic neuropeptide orexin A in obese children during the reduction of body weight and its relationship to other biochemical and anthropometrical parameters. We measured orexin A fasting plasma levels by the RIA method in 58 obese children - 33 girls and 25 boys; mean age 13.1±0.38 years (range 7-18.5) before and after 5 weeks of weight-reduction therapy. Leptin, IGF-1, and IGFBP-3 levels were measured in all the subjects and were compared to orexin A levels and anthropometrical data. Average weight in subjects before weight-reduction was 74.2±2.79 kg and after weight-loss 67.4±2.60 kg (p<0.0001). Orexin A levels before the therapy were 33.3±1.97 pg/ml and after the therapy 51.7±3.07 pg/ml (p<0.0001). Levels of orexin A were not significantly different between girls and boys (p=0.7842). We found negative correlation between orexin A and age (r = -0.5395; p<0.0001), body height (r = -0.4751; p=0.0002), body weight (r = -0.4030; p=0.0017) and BMI (r = -0.2607; p=0.0481). No correlation was found between orexin A and IGF-1, IGFBP-3 or leptin. Orexin A plasma levels increased during body weight loss, whereas the reverse was true for leptin levels. These findings support the hypothesis that orexin A may be involved in regulation of nutritional status in children.

• MeSH
• financování vládou MeSH
• interpretace statistických dat MeSH
• leptin izolace a purifikace   metabolismus   MeSH
• lidé MeSH
• neuropeptidy izolace a purifikace   metabolismus   MeSH
• nutriční poruchy u dětí dietoterapie   krev   metabolismus   MeSH
• obezita dietoterapie   metabolismus   MeSH
• radioimunoanalýza metody   využití   MeSH
• redukční dieta metody   využití   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• srovnávací studie MeSH

• MeSH
• dítě MeSH
• lidé MeSH
• preventivní lékařství metody   trendy   MeSH
• psychomotorické poruchy diagnóza   prevence a kontrola   MeSH
• Světová zdravotnická organizace MeSH
• výzkumný projekt MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH
• lidé MeSH

Spotřeba tabákových výrobků nejen poškozuje zdraví, ale má i negativní ekonomické důsledky. Zvýšené náklady způsobené kouřením (vyšší úmrtnost, vyšší náklady na zdravotnictví, ztráta pracovní produktivity, výdaje na cigarety) nesou spotřebitelé, stát i soukromé firmy a touto cestou dotují tabákový průmysl. Česká republika na kouření a jeho důsledky doplácí, ztráty se pohybují v miliardách Kč - např. v roce 1999 stát vybral na daních na tabák 20,2 miliardy Kč a minimálně 27,2 miliardy Kč vydal na léčení nemocí způsobených kouřením (je zde započítána pouze nemocniční péče, není zahrnuta ambulantní péče a sociální dopady kouření). Zkušenosti a dobrá praxe ze zahraničí nabízejí přístupy jak snížit ekonomické ztráty způsobené kouřením - (1) zvýšit daně na cigarety (sníží se prevalence a zároveň se zvýší příjmy státního rozpočtu), (2) zakázat reklamu na tabákové výrobky, jejich propagaci (včetně místa prodeje) a sponzorování ze strany tabákových firem, (3) zakázat kouření ve veřejných prostorách a na pracovištích, (4) vést informační kampaň zaměřenou na zdraví, návykovost a ekonomické dopady poskytující kuřákům komplexní informace (např. na krabičkách cigaret), (5) léčit závislost na nikotinu, regulovat obsah cigaret a zajistit plnou informovanost veřejnosti o jejich složení. Z kouření má ekonomický prospěch pouze tabákový průmysl. Investice do prevence kouření a léčení závislosti na nikotinu mají vysokou návratnost formou snížení ekonomické ztráty způsobené kouřením.

Consumption of tobacco products has a harmful effect on people's health but it also has negative economic consequences. Higher costs caused by smoking (higher mortality rate, higher expenses on health care, loss of work productivity, costs of cigarettes) are paid for by the consumers, the state and also by private companies. This amounts to a subsidy for the tobacco industry. The Czech Republic pays for smoking and its effects. The losses are in the region of billions of crowns. For example in 1999 the state received 20.2 billion Kc in tobacco tax and it spent at least 27.2 billion Kc on treating diseases caused by smoking (only hospital care is included, not outpatient treatment or the social impact of smoking). Experience and good practice from abroad offer possibilities of decreasing economic losses caused by smoking: 1. increasing the tax on cigarettes (prevalence drops and the state budget income increases), 2. ban on tobacco products advertising and promotion (including the shops) and sponsoring tobacco companies, 3. ban on smoking in public places and work places, 4. information campaign targeted at health, addiction and economic impact, which would provide smokers with sophisticated information (e.g. on cigarette packets), 5. treatment of addiction to tobacco, regulation of the contents of cigarettes and ensuring that consumers are fully informed about the composition of cigarettes. Only the tobacco industry profits from smoking. The return on the investment into the prevention of smoking and the treatment of nicotine addiction is very high due to the reduction of the economic loss caused by smoking.

• MeSH
• daně ekonomika   trendy   zákonodárství a právo   MeSH
• interpretace statistických dat MeSH
• inzerce jako téma ekonomika   metody   trendy   MeSH
• kouření ekonomika   škodlivé účinky   MeSH
• odvykání kouření ekonomika   metody   MeSH
• Světová zdravotnická organizace ekonomika   MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

Untargeted metabolomic approaches offer new opportunities for a deeper understanding of the molecular events related to toxic exposure. This study proposes a metabolomic investigation of biochemical alterations occurring in urine as a result of dioxin toxicity. Urine samples were collected from Czech chemical workers submitted to severe dioxin occupational exposure in a herbicide production plant in the late 1960s. Experiments were carried out with ultra-high pressure liquid chromatography (UHPLC) coupled to high-resolution quadrupole time-of-flight (QTOF) mass spectrometry. A chemistry-driven feature selection was applied to focus on steroid-related metabolites. Supervised multivariate data analysis allowed biomarkers, mainly related to bile acids, to be highlighted. These results supported the hypothesis of liver damage and oxidative stress for long-term dioxin toxicity. As a second step of data analysis, the information gained from the urine analysis of Victor Yushchenko after his poisoning was examined. A subset of relevant urinary markers of acute dioxin toxicity from this extreme phenotype, including glucuro- and sulfo-conjugated endogenous steroid metabolites and bile acids, was assessed for its ability to detect long-term effects of exposure. The metabolomic strategy presented in this work allowed the determination of metabolic patterns related to dioxin effects in human and the discovery of highly predictive subsets of biologically meaningful and clinically relevant compounds. These results are expected to provide valuable information for a deeper understanding of the molecular events related to dioxin toxicity. Furthermore, it presents an original methodology of data dimensionality reduction by using extreme phenotype as a guide to select relevant features prior to data modeling (biologically driven data reduction).

• MeSH
• biologické markery moč   MeSH
• data mining MeSH
• játra účinky léků   metabolismus   MeSH
• lidé MeSH
• metabolomika metody   MeSH
• monitorování životního prostředí metody   MeSH
• oxidační stres účinky léků   MeSH
• polychlorované dibenzodioxiny toxicita   MeSH
• pracovní expozice analýza   MeSH
• vysokoúčinná kapalinová chromatografie MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH