Hlavním záměrem projektu je validace a studium mechanismu účinku námi nedávno odhalených genetických markerů, tj. genové exprese v nádorových tkáních a genových polymorfismů v krvi pacientů léčených standardní, především neoadjuvantní chemoterapií karcinomu prsu. Cílem jsou markery metabolismu (např.: cytochromy P450, NQO, SOD, dráha 5-fluorouracilu) a transportu (ABC a SLC transportéry) cytostatik ve vztahu ke klinicko-patologickým charakteristikám, přežívání a účinnosti léčby pacientek. U úspěšně validovaných kandidátů budeme studovat mechanismus jakým markery působí korelací genové exprese s hladinou proteinu a zjištěním významu genotypu. Budeme studovat i methylaci regulačních oblastí kandidátních genů jako nezávislý marker. Zvláštní pozornost budeme věnovat studiu agresivních triple-negative karcinomů u pacientů i na modelových buněčných liniích s tímto fenotypem. U buněčných modelů se pokusíme vysledovat mechanismus nezávislou cestou včetně hledání vztahu mezi typem léčiva, jeho dávkou a účinkem; Validation of differences in expression of previously identified genetic markers between patients with breast carcinoma treated by standard, mainly neoadjuvant chemotherapy, will be the main goal of this project. Markers representing metabolism (e.g. cytochromes P450, SOD, NQO) and transport (ABC and SLC transporters) of anticancer drugs will be studied in relation to clinico-pathological characteristics, therapy outcome and survival of patients. Mechanism of action of validated markers will be studied by correlation of gene expression with protein level and analysis of genotype. Methylation of regulatory elements of candidate genes will be studied as independent prognostic or predictive marker. Special attention will be paid to the study of aggressive triple-negative tumors in both patients and cell models. Breast tumor cell line models differing in expression of receptors (estrogen, progesterone, ERBB2) will be employed for elucidation of mechanisms of action of biomarkers by alternative approach.

• MeSH
• ABC transportéry analýza   MeSH
• analýza přežití MeSH
• cytostatické látky MeSH
• exprese genu MeSH
• metylace MeSH
• nádorové biomarkery analýza   MeSH
• nádory prsu farmakoterapie   genetika   MeSH
• neoadjuvantní terapie MeSH
• polymorfismus genetický MeSH
• systém (enzymů) cytochromů P-450 analýza   MeSH
• triple-negativní karcinom prsu farmakoterapie   genetika   MeSH
• vztah mezi dávkou a účinkem léčiva MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• genetika, lékařská genetika
• biologie
• farmacie a farmakologie
• onkologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Projekt řeší molekulární biologii ovariálních karcinomů ve vztahu k odpovědi na léčbu. 1)Zhodnocení genových polymorfismů ABCB1,ABCC1,GST, proteinů Pgp, MRP1-kódovaných těmito geny, chemorezistence/chemosensitivity in vitro (MTT test) u pacientek diagnostikovaných 2013-2015 a retrospektivně u pacientek s již stanoveným Pgp, MRP1, MTT testem 2006-2009 ve vztahu k PFS a OS. 2) Stanovení genových polymorfismů interleukinu 8, genové exprese endoglinu,FGF,angiopoetinu a proangiogenních faktorů(VEGF,TGF?,TGFß,bFGF) v závislosti na odpovědi a typu primární léčby u pacientek diagnostikovaných 2013-2015 a retrospektivně z ovariální nádorové tkáně zamražené 2006-2009. 3) Zhodnocení kardiotoxicity paklitaxel+karboplatina versus paklitaxel+karboplatina+bevacizumab (EKG,TK,ECHOsrdce,markery kardiotoxicity NTproBNP,cTnT,cTnI,CKMB,MYO,hFABP,GPBB) a její vztah k chemorezistenci a genovým polymorfismům. Projekt umožní molekulárně biologickou predikci odpovědi na léčbu u pacientek s karcinomem ovaria.; This project is intent on assesment of molecular biology markers useful in prediction of therapeutic response in ovarian cancer patients by:1)Determination of ABCB1, ABCC1, GST polymorphisms, resistance proteins Pgp, MRP1, in vitro drug resistance/sensitivity and evaluation of their correlation with medical outcome (PFS, OS, side effects). 2) Assay of polymorphisms of the Interleukin-8 gene, endoglin, FGF, angiopoetin gene expression, pro-angiogenesis markers (VEGF,TGF?,TGFß,bFGF) and their correlation with kind of primary farmacotherapy and medical outcome (PFS, OS).3) Analysis of cardiotoxicity of standard primary chemotherapy (Paclitaxel + Carboplatin) versus primary therapy (Paclitaxel + Carboplatin + Bevacizumab) by ECG, blood pressure, ECHO, markers of cardiotoxicity (NT-proBNP,cTnT,cTnI,CKMB,MYO,h-FABP,GPBB) and their correlation with genetic polymophisms and drug resistance. This project support molecular biology prediction of the therapeutic response in ovarian cancer patients.

• MeSH
• ABC transportéry analýza   MeSH
• analýza přežití MeSH
• bevacizumab škodlivé účinky   MeSH
• chemorezistence MeSH
• cytotoxické testy imunologické MeSH
• echokardiografie MeSH
• ELISA metody   využití   MeSH
• fibroblastový růstový faktor 2 analýza   MeSH
• glutathion-S-transferasa fí analýza   MeSH
• kalgranulin B analýza   MeSH
• karboplatina škodlivé účinky   MeSH
• karcinom farmakoterapie   MeSH
• kardiotoxicita MeSH
• molekulární biologie MeSH
• nádorové biomarkery MeSH
• nádory vaječníků farmakoterapie   MeSH
• nežádoucí účinky léčiv MeSH
• P-glykoproteiny analýza   MeSH
• paclitaxel škodlivé účinky   MeSH
• polymerázová řetězová reakce metody   využití   MeSH
• polymorfismus genetický MeSH
• proteiny spojené s mnohočetnou rezistencí k lékům analýza   MeSH
• protokoly protinádorové kombinované chemoterapie MeSH
• receptory vaskulárního endoteliálního růstového faktoru analýza   MeSH
• transformující růstový faktor alfa analýza   MeSH
• transformující růstový faktor beta analýza   MeSH
• výsledek terapie MeSH
• ženy MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• gynekologie a porodnictví
• onkologie
• biologie
• genetika, lékařská genetika
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

• MeSH
• ABC transportéry analýza   MeSH
• karcinom diagnóza   genetika   MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• metastázy nádorů diagnóza   MeSH
• nádorové biomarkery * MeSH
• nádory vaječníků * diagnóza   genetika   MeSH
• pilotní projekty MeSH
• prognóza MeSH
• progrese nemoci MeSH
• receptory cytoplazmatické a nukleární analýza   MeSH
• regulace genové exprese u nádorů MeSH
• senioři MeSH
• statistika jako téma MeSH
• Check Tag
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• senioři MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH

Progresivní familiární intrahepatální cholestáza 2. typu je autozomálně recesivně dědičná cholestáza podmíněná defektem ATP dependentní pumpy žlučových kyselin BSEP. V práci jsou uvedeny kazuistiky a souborná data šesti dětí s tímto onemocněním diagnostikovaných v ČR v letech 2005–2015, vč. výsledků jejich molekulárně genetických analýz, kterými bylo nalezeno sedm nových mutací v genu ABCB11.

Summary: Progressive familial intrahepatic cholestasis type 2 is an autosomal recessive cholestatic liver disease caused by a deficiency in canalicular ATP-dependent bile salt export pump BSEP. We present case reports and collected data of six Czech patients suffering from this disease, diagnosed between 2005 and 2015, in whom seven new mutations in ABCB11 were revealed by molecular analysis. Key words: progressive familial intrahepatic cholestasis type 2 - BSEP – ursodeoxycholic acid – pruritus – liver transplantation The authors declare they have no potential conflicts of interest concerning drugs, products, or services used in the study. The Editorial Board declares that the manuscript met the ICMJE „uniform requirements“ for biomedical papers. Submitted: 20. 11. 2015 Accepted: 27. 11. 2015

• Klíčová slova
• BSEP, ABCB1,
• MeSH
• ABC transportéry analýza   genetika   metabolismus   MeSH
• dítě MeSH
• hepatocelulární karcinom diagnóza   komplikace   MeSH
• imunohistochemie MeSH
• intrahepatální cholestáza * diagnóza   genetika   terapie   MeSH
• kojenec MeSH
• kyselina ursodeoxycholová terapeutické užití   MeSH
• lidé MeSH
• membránové glykoproteiny analýza   MeSH
• mutace MeSH
• mutační analýza DNA MeSH
• novorozenec MeSH
• předškolní dítě MeSH
• pruritus etiologie   farmakoterapie   MeSH
• transplantace jater MeSH
• transportní proteiny analýza   MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH
• kojenec MeSH
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• novorozenec MeSH
• předškolní dítě MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• kazuistiky MeSH

Při zjištění tumoru v pánvi se nalézáme před problémem stanovení jak jeho origa, tak i biologického chování. Možnost predikovat biologické chování pánevních tumorů již před léčbou je klíčem ke zvolení individuálního přístupu, který zatíží pacientku úměrně k maximálnímu možnému léčebnému efektu. V článku se dále zabýváme pouze gynekologickými nádory. Hlavní prognostické a prediktivní pooperační faktory dobře známé a rutinně používané jsou histologický typ nádoru, stádium onemocnění, stupeň diferenciace, přítomnost lymfangioinvaze, postižení lymfatických uzlin a pooperační nádorové reziduum. Při předoperační predikci biologického chování gynekologických pánevních tumorů vycházíme z anamnézy, klinických ukazatelů - věku a přidružených chorob nemocné (performance status), dále ze stanovení markerů z krve, grafických vyšetření (zejména sonografie) a charakteristik nádoru stanovených na základě histologického, imunohistochemického či molekulárně-genetického vyšetření tkáně získané z excize, laparoskopie či tru-cut biopsie. Mezi prediktivně-prognostické biomarkery, které mohou pomoci předpovídat úspěšnost naší léčby a je možné je využít v triage pacientek před léčbou, je možné zařadit například markery z periferní krve CA125, HE4, ROMA index, přítomnost BRCA 1/2 mutace, předoperační trombocytózu, neutrophil-to-lymphocyte ratio, a dále tkáňové markery, jako je mutace p53, Her2/Neu pozitivitu, přítomnost ER/PR, pozitivitu L1CAM, dále panel 9 proteinových markerů PROVAR, intraepitelální tumor-infiltrující lymfocyty, stanovení proliferační aktivity pomocí proteinu Ki67 (MIB1), genové expresní profily, proteiny rezistence atd. Tyto biomarkery budou v následujícím textu probrány. Pacientka, daný tumor a zvolený léčebný přístup tvoří vždy individualitu, jakési jedinečné spojení, jehož chování a z toho plynoucí QoL (Quality of life - kvalita života), DFI (Disease free interval - období bez nemoci) a OS (Overall survival - celkové přežití) je obtížné predikovat. Proto žádné z dosud používaných vyšetření ani žádný v současnosti známý marker nedokáže lékaři ani pacientce přesně odpovědět na tyto základní existenciální otázky, které si pacientka a její nejbližší pokládají nejčastěji.

When we detect a tumor in the pelvis we find ourselves faced with the problem of determining both the origin, and biological behavior. The possibility to predict biological behavior of pelvic tumors already before treatment is the key to individual patient management with least patient burden proportional to potentially attainable goal. In the article below we deal only with the gynecological tumors. The main postoperative prognostic and predictive factors such as staging, grading, histological type of tumor, lymph node involvement (as included in staging) and postoperative tumor residue are well known and routinely used. However, if we focus on the possibility of preoperative prediction of tumor biological behavior, it can be based on several factors. These include clinical indicators such as patient age at time of diagnosis, patient performance status, blood “markers” assessment, imaging studies results (particularly ultrasound) and processing of biopsy samples obtained by excision from the tumor during laparoscopy or tru-cut biopsy, etc. Other predictive biomarkers that can generally predict success of our therapy include, e.g. CA125, HE4, ROMA index, presence of the BRCA 1/2 or p53 mutation, Her2/neu, ER/PR or L1CAM positivity, PROVAR (a panel of 9 protein markers), intraepithelial tumor-infiltrating lym - phocytes, preoperative thrombocytosis, neutrophil-to-lymphocyte ratio, Ki67 positivity rate (MIB1), gene expression profiles, protein of resistance, etc. These biomarkers will be discussed below. Since the patient, her tumor and the therapeutic approach always form a unique combination, the resulting QoL (Quality of life), DFI (Disease free interval) and OS (Overall survival) are difficult to predict. Therefore, none of the tests used so far and no currently known marker can provide an accurate answer to these basic existential questions that a patient as well as her closest ask the most frequently.

• Klíčová slova
• predikce, biologické chování,
• MeSH
• ABC transportéry analýza   MeSH
• antigen CA-125 krev   MeSH
• lidé MeSH
• nádorové biomarkery * genetika   krev   MeSH
• nádorové proteiny genetika   MeSH
• nádory pánve * diagnóza   krev   ultrasonografie   MeSH
• nádory ženských pohlavních orgánů * diagnóza   krev   ultrasonografie   MeSH
• předoperační období * MeSH
• prognóza MeSH
• proteiny spojené s mnohočetnou rezistencí k lékům analýza   MeSH
• stanovení celkové genové exprese MeSH
• trombocytóza diagnóza   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• přehledy MeSH

• MeSH
• ABC transportéry analýza   MeSH
• analýza přežití MeSH
• chemorezistence MeSH
• dospělí MeSH
• hodnocení rizik statistika a číselné údaje   MeSH
• karcinom epidemiologie   etiologie   farmakoterapie   patofyziologie   MeSH
• léková rezistence MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mnohočetná léková rezistence MeSH
• nádory vaječníků * epidemiologie   etiologie   farmakoterapie   patofyziologie   MeSH
• P-glykoprotein analýza   MeSH
• přežití bez známek nemoci * MeSH
• proteiny spojené s mnohočetnou rezistencí k lékům * analýza   MeSH
• senioři MeSH
• vault ribonucleoprotein particles analýza   MeSH
• Check Tag
• dospělí MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• senioři MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH

Identifikace nádorových kmenových buněk v současnosti představuje jednu z nejdůležitějších oblastí výzkumu, neboť nádorové kmenové buňky hrají důležitou úlohu v iniciaci a progresi nádoru, stejně jako v procesech metastazování a relapsu onemocnění. Tento článek shrnuje současné poznatky o známých i předpokládaných markerech nádorových kmenových buněk v různých typech sarkomů kostí i měkkých tkání. Zvláštní pozornost je věnována detekci CD133, ABC transportérů, nestinu a aldehyddehydrogenázy, které byly v posledních letech intenzivně zkoumány jak v nádorové tkáni, tak v sarkomových buněčných liniích. V závěru článku je uveden přehled možných fenotypů nádorových kmenových buněk, které byly prokázány funkčními testy tumorigenicity.

The identification of cancer stem cell markers represents one of the very relevant research to­pics because cancer stem cells play important roles in tumour initiation and progression, as well as during metastasis formation and in relapse of the disease. This article summarises recent knowledge on well-known and putative cancer stem cell markers in various types of bone and soft-tissue sarcomas. Special attention is paid to the detection of CD133, ABC transporters, nestin and aldehyde dehydrogenase that have been intensively studied both in tumour tissues and in sarcoma cell lines during the past few years. Finally, an overview is given of the possible CSC phenotypes provided by functional assays of tumourigenicity.

• Klíčová slova
• tumorigenicita, aldehyddehydrogenáza, CD133, rabdomyosarkom,
• MeSH
• ABC transportéry analýza   genetika   MeSH
• aldehyddehydrogenasa analýza   genetika   MeSH
• CD antigeny analýza   genetika   MeSH
• glykoproteiny analýza   genetika   MeSH
• lidé MeSH
• nádorové biomarkery analýza   MeSH
• nádorové buněčné linie MeSH
• nádorové kmenové buňky * patologie   MeSH
• nestin MeSH
• osteosarkom diagnóza   genetika   MeSH
• peptidy analýza   genetika   MeSH
• proteiny intermediálních filament analýza   genetika   MeSH
• rhabdomyosarkom diagnóza   genetika   MeSH
• sarkom * diagnóza   genetika   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH

PURPOSE: To detect and isolate cells with stem cell (SC) characteristics in the limbus of the mouse. METHODS: Limbal tissues from BALB/c mice were trypsin-dissociated and separated on the gradient Percoll (Fluka, Buchs, Switzerland). Several fractions were isolated and characterized by real-time PCR for the presence of limbal SC markers and differentiation markers of corneal epithelial cells by flow cytometry for the determination of the side-population (SP) phenotype and growth properties in vitro. RESULTS: Cells retained in the lightest fraction (40% Percoll) and in the densest fraction (80% Percoll) of the gradient were both enriched for populations with a high expression of the SC markers ABCG2 and Lgr5 and also expressing the SP phenotype. However, the lightest fraction (representing approximately 12% of total limbal cells) contained cells with the strongest spontaneous proliferative capacity and expressed the corneal epithelial differentiation marker K12. In contrast the densest fraction (<7% of original cells) was K12 negative and contained small nonspontaneously proliferating cells, which instead were positive for p63. Unexpectedly, cells from this fraction had the highest proliferative activity when cultured on a 3T3 feeder cell monolayer. CONCLUSIONS: These findings demonstrate the presence of two distinct populations of corneal epithelial cells with limbal SC characteristics, based on differential expression of the keratin-specific marker K12 and transcription factor p63, and suggest a difference in developmental stage of the two populations, with the K12(-)p63(+) population being closer to the primitive limbal SC

• MeSH
• ABC transportéry analýza   genetika   MeSH
• buněčné dělení MeSH
• buňky 3T3 MeSH
• centrifugace - gradient hustoty metody   MeSH
• fibroblasty cytologie   MeSH
• financování organizované MeSH
• kmenové buňky cytologie   fyziologie   MeSH
• myši inbrední BALB C MeSH
• myši MeSH
• oxid křemičitý MeSH
• polymerázová řetězová reakce MeSH
• povidon MeSH
• průtoková cytometrie MeSH
• rohovkový epitel cytologie   MeSH
• separace buněk metody   MeSH
• zvířata MeSH
• Check Tag
• mužské pohlaví MeSH
• myši MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• zvířata MeSH

Breast cancer resistance protein (BCRP/ABCG2) is a member of the ATP-binding cassette transporter family that recognizes a variety of chemically unrelated compounds. Its expression has been revealed in many mammal tissues, including placenta. The purpose of this study was to describe its role in transplacental pharmacokinetics using rat placental HRP-1 cell line and dually perfused rat placenta. In HRP-1 cells, expression of Bcrp, but not P-glycoprotein, was revealed at mRNA and protein levels. Cell accumulation studies confirmed Bcrp-dependent uptake of BODIPY FL prazosin. In the placental perfusion studies, a pharmacokinetic model was applied to distinguish between passive and Bcrp-mediated transplacental passage of cimetidine as a model substrate. Bcrp was shown to act in a concentration-dependent manner and to hinder maternal-to-fetal transport of the drug. Fetal-to-maternal clearance of cimetidine was found to be 25 times higher than that in the opposite direction; this asymmetry was partly eliminated by BCRP inhibitors fumitremorgin C (2 microM) or N-(4-[2-(1,2,3,4-tetrahydro-6,7-dimethoxy-2-isoquinolinyl)ethyl]-phenyl)-9,10-dihydro-5-methoxy-9-oxo-4-acridine carboxamide (GF120918; 2 microM) and abolished at high cimetidine concentrations (1000 microM). When fetal perfusate was recirculated, Bcrp was found to actively remove cimetidine from the fetal compartment to the maternal compartment even against a concentration gradient and to establish a 2-fold maternal-to-fetal concentration ratio. Based on our results, we propose a two-level defensive role of Bcrp in the rat placenta in which the transporter 1) reduces passage of its substrates from mother to fetus but also 2) removes the drug already present in the fetal circulation.

• MeSH
• ABC transportéry analýza   fyziologie   genetika   MeSH
• buněčné linie MeSH
• cimetidin farmakokinetika   MeSH
• financování organizované MeSH
• imunohistochemie MeSH
• krysa rodu rattus MeSH
• messenger RNA analýza   MeSH
• metabolická clearance MeSH
• P-glykoprotein fyziologie   MeSH
• perfuze MeSH
• placenta metabolismus   MeSH
• potkani Wistar MeSH
• zvířata MeSH
• Check Tag
• krysa rodu rattus MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• zvířata MeSH