Cíl studie: Shrnutí poznatků o genetických aspektech ovariálních karcinomů. Typ studie: Přehledový článek. Název a sídlo pracoviště: Gynekologicko-porodnická klinika 1. LF UK a VFN, Praha. Metodika: Zpracování údajů z literatury. Závěr: Karcinom ovaria je onemocnění s nejvyšší mortalitou mezi gynekologickými zhoubnými nádory. Etiologie není zcela známá, předpokládá se mnohostupňový proces spojený s nahromaděním genetických alterací postihujících onkogeny, tumor-supresorové geny a mutátorové geny, které hrají klíčovou roli v buněčné regulaci. Cytogenetické a molekulárně genetické charakteristiky v korelaci s ostatními molekulárně- biologickými parametry upřesňují znalosti o karcinogenezi. Cílem je vytvoření prediktivního modelu pro klinickou praxi.
Objective: To sum up the knowledge about genetic aspects of ovarian cancer. Type of study: Review article. Setting: Department of Gynecology and Obstetrics, First Faculty of Medicine, Charles University Prague and General Teaching Hospital Prague, Prague. Methods: Compilation of data from scientific literature. Conclusions: Ovarian cancer represents the most lethal malignancy among gynecological tumours. Etiology is still largely unknown. Multistep process, with accumulation of genetic alterations concerning factors with key role in cell regulation – oncogenes, tumor-supressor genes and mismatch-repair genes is supposed. Cytogenetic and molecular-genetic characteristics, in correlation with other molecular-biological parameters extend information of carcinogenesis. The final aim is to create a predictive model for clinical use.
- MeSH
- Apoptosis MeSH
- Cytogenetic Analysis methods MeSH
- Research Support as Topic MeSH
- Genomic Imprinting physiology genetics MeSH
- Carcinoma diagnosis etiology genetics MeSH
- Tumor Suppressor Proteins physiology genetics MeSH
- Ovarian Neoplasms diagnosis etiology genetics MeSH
- DNA Repair genetics immunology MeSH
- Proto-Oncogenes physiology genetics MeSH
- Check Tag
- Female MeSH
- Publication type
- Comparative Study MeSH
Zvýšené hladiny lipoproteinu(a) jsou považovány za nezávislý rizikový faktor v procesu aterogeneze. Strukturní i funkční charakteristika částice lipoproteinu(a) je určena přítomností apolipoproteinu(a). Přestože jsou plazmatické hladiny tohoto lipoproteinu téměř zcela pod genetickou kontrolou genu pro apolipoprotein(a), vykazují značnou populační variabilitu. Velká část této variability je způsobena délkovým polymorfizmem genu pro apolipoprotein(a). Zbývající variabilita může být dána jak přítomností sekvenčních polymorfizmů v kódující sekvenci zmíněného genu, tak v jeho regulačních elementech. V kódující oblasti genu pro apolipoprotein(a) bylo zatím odhaleno jen málo polymorfních variant s funkčním významem. Rovněž analýza tří oblastí schopných regulovat expresi genu (promotor, zesilovače DHII a DHIII) prokázala nižší variabilitu, než se očekávalo. I přes dominantní úlohu jediného genu je genetická determinace hladin Lp(a) velice komplexní. Hlavní úlohu zde hraje délkový polymorfizmus genu pro apolipoprotein(a) a celá řada sekvenčních variant ovlivňujících jeho expresi a efektivitu tvorby lipoproteinové částice. Svou roli mají pravděpodobně i další genetické lokusy s minoritním účinkem a modulace negenetickými faktory.
Increased levels of lipoprotein(a) are supposed to be an independent risk factor for atherosclerosis. Apolipoprotein(a) determines structural and functional characteristics of the lipoprotein particle. The lipoprotein(a) concentration is almost entirely genetically determined at the apolipoprotein(a) gene locus, nevertheless it varies widely between individuals in all populations studied so far. Large part of the variance is correlated to the apolipoprotein(a) gene length polymorphism. Some of the variance could be additionally related to polymorphic sites either in the coding sequence or in the transcription regulatory regions. Only a few functional variants were discovered in the coding sequence of apolipoprotein(a) gene so far. Moreover, analyses of relevant regulatory regions (promoter, DHII and DHIII enhancers) have revealed less variability than was expected. Despite the lipoprotein(a) levels are under dominant control of a single locus its genetic determination is quite complex. The basic role belongs to the apolipoprotein(a) gene length polymorphism and to a panel of sequence variants affecting apolipoprotein(a) gene expression and lipoprotein(a) particle production rate. Besides, minor impact of other locuses and modulation by non–genetic factors should be considered.
Autoimunitný diabetes mellitus charakterizuje selektívna deštrukcia β pankreatických buniek celulárnou infiltráciou T (Th1) a B lymfocytmi.Markerom autoimunity je prítomnosť autoprotilátok (ICA, IAA, GADab, IA2ab). Etiológia tohto procesu nie je dodnes úplne vyjasnená. Predpokladá sa však, že na jeho patogenéze sa podieľajú genetické faktory a faktory prostredia. Interakcia genetických predispozičných faktorov s faktormi prostredia ovplyvňuje dobu vzniku i progresiu ochorenia. Najdôležitejším genetickým rizikovým faktorom autoimunitného diabetes mellitus sú alely HLA II. triedy (DQB1*0302,0201; DRB1*0301,0401; DQA1*0301,0501) a rizikové alely INS-VNTR promótorovej oblasti. V posledných rokoch sa však objavujú práce, v ktorých sa prikladá význam aj iným genetickým rizikovým faktorom. Sú to hlavne genetické polymorfizmy v génoch niektorých cytokínov (IL-10, IL-12, IL-18) a mikrosatelitový polymorfizmus v géne MHC Class I chain-related gene A (MIC-A).
Autoimmune diabetes mellitus is characterized by selective destruction of β pancreatic cells and by cellular infiltration with T-(p articularly Th1) and B-lymphocytes. The marker of autoimmunity is the presence of autoantibodies (ICA, IAA, GADab, IA2ab). Etiology of the autoimmune process is still unknown. It is suggested that the pathogenesis is activated by genetic and environmental factors. Individual predisposition can influence also the onset and progression of the disease. The most important genetic risk factors of autoimmune diabetes mellitus are the HLA class II alleles (DQB1*0302, 0201; DRB1*0301, 0401; DQA1*0301, 0501) and the risk alleles of INS-VNTR of the promoter region. Recent studies have shown various genetic risk factors for the autoimmune diabetes mellitus. Individual predispositions belong to the genetic polymorphisms in cytokine genes (IL-10, IL-12, IL-18) and the microsatelite polymorphism of MHC class I chain-related gene A (MIC-A).
- MeSH
- Autoimmune Diseases immunology pathology MeSH
- Diabetes Mellitus genetics immunology pathology MeSH
- Research Support as Topic MeSH
- Genetic Predisposition to Disease MeSH
- HLA Antigens analysis genetics MeSH
- Interleukins genetics MeSH
- Insulin genetics MeSH
- Humans MeSH
- Risk Factors MeSH
- Check Tag
- Humans MeSH
- Publication type
- Review MeSH
Cíl: Cílem studie bylo ověřit možnosti prediktivní genetiky v souboru žen s rizikem osteoporózy. Materiál a metodika: 257 žen ve věku 34–68 let ve vyšším riziku osteoporózy bylo vyšetřeno denzitometricky, biochemicky a geneticky. V rámci genetické analýzy bylo hodnoceno 8 genetických variant v genech COL1A1, ESR1, VDR, LRP5, LRP6 a ALOX12, které mají vztah k riziku vzniku osteoporózy. Celkové genetické skóre určilo, zda je kombinace genetických vloh protektivní, riziková, či neutrální. Výsledky: V testovaném souboru bylo nalezeno 16 % geneticky rizikových žen. Nejčastěji byl u žen prokázán rizikový genotyp TT genu VDR (c.1025-49G>T), tj. v 39,1 %, což je 2krát více než populační frekvence. Relativně často (37,4 % žen) se také vyskytoval protektivní genotyp AA genu ESR1 (c.453-351A>G). Ve sledované skupině žen byla diagnostikována u 15 % žen osteopenie jako klinická známka rizika osteoporózy. Při vzájemné korelaci bylo zvýšené genetické i klinické riziko zaznamenáno u 3 % žen. Závěr: Genetické vyšetření by se mohlo stát jedním z prediktorů rizika osteoporózy, což by umožnilo včasnou a cílenou prevenci.osteoporózy ještě před rozvinutím klinických nebo denzitometrických změn.
Objective: The aim of the study was to explore the utility of predictive genetic testing in a group of women with a risk of osteoporosis. Materials and methods: 257 women aged 34–68 years at an increased risk of osteoporosis were evaluated using densinometry, biochemistry and genetics. Eight genetic variants of the COL1A1, ESR1, VDR, LRP5, LRP6 and ALOX12 genes, associated with the risk of osteoporosis, were evaluated. Genetic predisposition was classified protective, high-risk or neutral based on the overall genetic score. Results: The tested sample comprised 16% of genetically high-risk women. Most frequently (39.1%), the women carried the high-risk TT genotype of the VDR gene (c.1025–49G>T); this is twice the prevalence in the general population. The protective AA genotypee of the ESR1 gene (c.453–351A>G) was also relatively frequent (37.4% of women). Osteopenia, as a clinical sign of an increased risk of osteoporosis, was diagnosed in 15% of the evaluated women. When correlated, 3% of women had an increased genetic and clinical risk. Conclusion: Genetic testing could become one of the predictors of risk of osteoporosis, which would allow early and targeted prevention of osteoporosis even prior to the development of any clinical and densinometric changes.
- MeSH
- Densitometry MeSH
- Financing, Organized MeSH
- Genetic Predisposition to Disease genetics MeSH
- Genetic Testing methods MeSH
- Bone Density genetics MeSH
- Humans MeSH
- Young Adult MeSH
- Osteoporosis epidemiology genetics MeSH
- Predictive Value of Tests MeSH
- Risk Factors MeSH
- Check Tag
- Humans MeSH
- Young Adult MeSH
- Female MeSH
Snaha zahrnout do klinické praxe genetické dispozice ústí v posledních letech k vytváření genetických rizikových skóre (GRS). Ta by měla shrnout komplexní genetické riziko jedinou hodnotou získanou z výsledků testování řady (desítek až tisíců) individuálních polymorfizmů. Existuje několik typů genetických skóre. Nevážené GRS využívá prostý součet přítomných rizikových alel, vážené GRS bere v potaz relativní vliv jednotlivých variant na fenotyp (OR, HR nebo β-koeficient) a konečně polygenní skóre, zahrnující až statisíce polymorfizmů, bere v úvahu i provázanost výskytu jednotlivých alel. Celá řada studií potvrdila důležitost GRS v odhadu rizika onemocnění nebo jeho prognózy. Protože studie jsou značně heterogenní co se týká počtu a výběru polymorfizmů zahrnutých do výpočtů GRS, nelze určit, jaká nominální hodnota je již riziková. Rovněž prozatím citelně chybí studie sledující interakce mezi GRS a životním stylem. Analýzy GRS představují další posun k využití genetických informací v každodenní, především klinické diagnostice v rámci primární prevence.
In recent years, efforts to incorporate genetic dispositions into clinical practice have led to the development of genetic risk scores (GRS). These should summarise the complex genetic risk as a single value derived from the results of testing a dozens to thousands of individual polymorphisms. There are several types of genetic risk scores. The unweighted GRS uses the simple sum of the risky alleles present, the weighted GRS takes into account the relative effect of individual variants on the phenotype (OR, HR or β coefficient), and finally the polygenic risk score (which includes up to hundreds of thousands of polymorphisms) also takes into account the linkage between the individual alleles. A number of studies have confirmed the significant effect of GRS on the estimation of disease risk or prognosis. Because studies are highly heterogeneous in the number and selection of polymorphisms included in GRS calculations, it is not possible to determine what nominal value already represent a clinical risk. There is also a significant lack of studies looking at interactions between GRS and lifestyle. GRS analyses represent a next step for the use of genetic information in everyday, primarily preventive, clinical diagnosis.
- Keywords
- genetické riziko,
- MeSH
- Genetic Testing * classification methods MeSH
- Cardiovascular Diseases genetics prevention & control MeSH
- Humans MeSH
- Prognosis MeSH
- Risk Factors * MeSH
- Statistics as Topic MeSH
- Check Tag
- Humans MeSH
- Publication type
- Research Support, Non-U.S. Gov't MeSH
- Review MeSH