• MeSH
• Acquired Immunodeficiency Syndrome MeSH
• HIV Infections MeSH
• HIV Seropositivity MeSH
• Urine MeSH
• AIDS Serodiagnosis MeSH
• Saliva MeSH

• Conspectus
• Patologie. Klinická medicína
• NML Fields
• dermatovenerologie
• diagnostika
• virologie
• NML Publication type
• publikace WHO

• MeSH
• Cestoda classification   MeSH
• Helminths classification   MeSH
• Trematoda classification   MeSH

• MeSH
• Cell Biology MeSH
• Cytophotometry MeSH
• Microscopy MeSH
• Image Processing, Computer-Assisted MeSH
• Publication type
• Academic Dissertation MeSH

• Conspectus
• Buněčná biologie. Cytologie
• NML Fields
• cytologie, klinická cytologie

Práce podává přehled klinického materiálu používaného pro diagnostiku syfilis metodou polymerázové řetězové reakce. PCR je rutinní metodou detekce T. pallidum ve stěrech z ulcerací a v kožně-slizničních projevech primární a sekundární syfilis. Vyšetřit lze i nesrážlivou krev, mozkomíšní mok, amniovou tekutinu, punktáty, bioptický materiál i fixované tkáně. Pro vyšetřování těchto materiálů v klinické praxi je však nutno získat více zkušeností především s citlivostí PCR v různých stadiích syfilis.

A review is presented of types of clinical specimens used for diagnosis of syphilis by polymerase chain reaction. PCR is a routine method for detection of T. pallidum in swabs of chancres and primary and secondary syphilis mucocutaneous lesions. Whole blood, cerebrospinal fluid, amniotic fluid, aspirate and biopsy specimens, and paraffin-embedded tissues can also be tested by PCR for T. pallidum. However, further research on PCR detection sensitivity at various stages of syphilis is needed before these specimens are used in clinical practice.

• MeSH
• Research Support as Topic MeSH
• Fluorescent Antibody Technique, Direct utilization   MeSH
• Humans MeSH
• Specimen Handling methods   utilization   MeSH
• Polymerase Chain Reaction methods   trends   utilization   MeSH
• Syphilis Serodiagnosis methods   trends   utilization   MeSH
• Treponema pallidum immunology   isolation & purification   MeSH
• Check Tag
• Humans MeSH

• MeSH
• Acquired Immunodeficiency Syndrome MeSH
• HIV Infections MeSH
• HIV Seropositivity MeSH
• Blood MeSH
• AIDS Serodiagnosis MeSH

• Conspectus
• Patologie. Klinická medicína
• NML Fields
• dermatovenerologie
• diagnostika
• virologie
• NML Publication type
• publikace WHO

Zavedli jsme metodu detekce chromozomální DNA Treponema pallidum subsp. pallidum dvoukrokovou (nested) PCR reakcí, která amplifikuje část genu TP0319, kódujícího hypotetický membránový lipoprotein (gen tmpC). Vyšetřili jsme 138 sér od 111 dospělých pacientů v primárním, sekundárním, časně latentním a pozdně latentním stadiu a také pacientů s podezřením na syfilis. Chromozomální DNA T. p. pallidum se v séru dospělých pacientů nepodařilo detegovat. Při vyšetření 11 kožních a slizničních stěrů (7 genitálních, 4 faryngeálních) jsme nalezli 6 pozitivních od 3 pacientů ve stadiu primární a sekundární syfilis. Pozitivní byl rovněž jeden stěr pacienta s časnou kongenitální syfilis. Sekvenování DNA genů TP0136 a TP0548 z pozitivních vzorků prokázalo výskyt dvou kmenů sekvenčně identických s kmenem T. p. pallidum SS14 a dvou unikátních syfilitických kmenů, doposud u T. p. pallidum nepopsaných. U jednoho vyšetřovaného novorozence s pozitivním výsledkem vyšetření kožního vzorku jsme prokázali treponemální DNA také v séru a v cerebrospinálním moku. Pokroky v molekulární typizaci T. p. pallidum v klinickém materiálu přispějí k rozvoji epidemiologie syfilis a přinesou možnosti rozlišení mezi reinfekcí a reaktivací syfilitického procesu.

An in-house two-step nested PCR amplification targeting the tmpC gene (TP0319, encoding putative membrane lipoprotein) was used for detection of chromosomal DNA of Treponema pallidum subsp. pallidum in clinical specimens.We tested 138 blood serum samples from 111 adult patients with suspected, primary, secondary, early or late latent syphilis. T. p. pallidum DNA was not detected in any of the analyzed specimens. Out of 11 mucocutaneous swabs (7 genital and 4 pharyngeal), 6 collected from 3 patients with primary or secondary syphilis tested positive. One skin swab from a patient with early congenital syphilis was also positive as were his serum and cerebrospinal fluid samples. DNA sequencing of the genes TP0136 and TP0548 from the positive samples revealed two strains with DNA sequences identical to that of T. p. pallidum strain SS14 and two unique previously undescribed T. p. pallidum strains. The advances in molecular typing of T. p. pallidum in clinical specimens will be of relevance to the epidemiology of syphilis and will allow for clinical discrimination between reinfection and syphilitic reactivation.

• MeSH
• Molecular Diagnostic Techniques methods   statistics & numerical data   utilization   MeSH
• Research Support as Topic MeSH
• Humans MeSH
• Specimen Handling classification   methods   statistics & numerical data   MeSH
• Polymerase Chain Reaction classification   methods   statistics & numerical data   MeSH
• Base Sequence drug effects   MeSH
• Bacterial Typing Techniques methods   statistics & numerical data   utilization   MeSH
• Treponema pallidum genetics   isolation & purification   classification   MeSH
• Check Tag
• Humans MeSH
• Male MeSH
• Female MeSH
• Publication type
• Comparative Study MeSH

At least 32 bird species were described as new to science on the basis of material collected by Franz Meyen during his circumnavigation in 1830-1832. We identified the type specimens and determined the type localities of these species, which are currently housed in the Museum für Naturkunde, Berlin, Germany. Ardea longicollis Meyen, 1834, is identified as a senior synonym of Egretta eulophotes (Swinhoe, 1860), but is set aside as a nomen oblitum. The name of a Neotropical dove is corrected from Metriopelia ceciliae zimmeri (Peters, 1937) to Metriopelia ceciliae gymnops (Chubb, 1917). A lectotype is designated for Nectarinia philippensis Meyen, 1834a.

• MeSH
• Columbidae MeSH
• Museums MeSH
• Birds * MeSH
• Animals MeSH
• Check Tag
• Animals MeSH
• Publication type
• Journal Article MeSH
• Geographicals
• Germany MeSH

A nomenclatural review of Sarcoramphus vultures resulted in the following: The genus Sarcoramphus was described by Duméril in 1805 rather than 1806. Vultur papa Linnaeus, 1758, is the type of Sarcoramphus by subsequent monotypy (Froriep in Duméril 1806), not by Vigors's (1825) designation. The type of the genus Gypagus Vieillot, 1816, is, by monotypy, Vultur gryphus Linnaeus, 1758, not Vultur papa Linnaeus, 1758. Due to this, Gypagus is a junior objective synonym of Vultur Linnaeus, 1758. Gyparchus was created by Gloger (1841) as a new genus for Vultur papa Linnaeus, 1758, not as an emendation of Gypagus Vieillot, 1816. Vultur papa Linnaeus, 1758 was found to be possibly based on syntypes from two different taxa and a lectotype is here designated. The author of Vultur sacer is Zimmermann (in Bartram 1793), not Cassin (1853). Possible speciation events in the genus Sarcoramphus are also discussed.

• MeSH
• Birds classification   MeSH
• Animal Distribution MeSH
• Terminology as Topic MeSH
• Animals MeSH
• Check Tag
• Animals MeSH
• Publication type
• Journal Article MeSH
• Research Support, Non-U.S. Gov't MeSH

Corrections of the data given in the calalogue of types of the family Buprestidae deposited in the National Forest Insect Collection, Dehradun, India. Erroneously recorded nomina nuda, wrong status of type specimens, type depositions, authorships.

• MeSH
• Coleoptera * MeSH
• Insecta * MeSH
• Forests MeSH
• Publications MeSH
• Animals MeSH
• Check Tag
• Animals MeSH
• Publication type
• Journal Article MeSH
• Geographicals
• India MeSH

Cíl práce: Druh Candida dubliniensis sdílí celou řadu fenotypových charakteristik s nejčastěji izolovanou kvasinkou z klinického materiálu, kterou je Candida albicans. To značně komplikuje jeho správnou identifikaci a záchyt v klinickém materiálu. Nedostatek informací o výskytu C. dubliniensis v České republice byl motivací ke zjištění jejího zastoupení ve vzorcích vyšetřených v Mikrobiologickém ústavu LF MU a FN u sv. Anny v Brně. Součástí práce je také posouzení spolehlivosti použitých kultivačních metod. Materiál a metodika: Celkem bylo vyšetřeno 2260 izolátů kvasinek určených původně jako C. albicans. Pro odlišení C. dubliniensis a C. albicans byly použity čtyři kultivační metody – hodnocení barvy kolonií na médiu CHROMagar Candida, kultivace na médiu s 6,5 % NaCl, růst při 42 °C a charakter kolonií na Staibově agaru. K verifikaci výsledků byla použita jednak latexová aglutinace pomocí soupravy Bichro-Dubli Fumouze, jednak druhově specifická polymerázová řetězová reakce (PCR). Výsledky: Z testovaného souboru bylo pomocí fenotypových metod, latexové aglutinace a PCR identifikováno 50 kmenů C. dubliniensis. To odpovídá 2,2 % z celkového počtu izolátů. Většina izolátů C. dubliniensis pocházela z dýchacích cest (31), zbytek byl získán z moči (3), stolice (4), z cévky (1) a jeden kmen byl zachycen z krve. S výjimkou hodnocení barvy kolonií na CHROMagaru Candida, u kterého byla specificita pouhých 85,5 %, vykazovaly všechny ostatní kultivační metody vysoké procento citlivosti a specificity. Závěr: Byl potvrzen výskyt C. dubliniensis mezi izoláty C. albicans v různých klinických materiálech, nejčastěji pocházely tyto kmeny z horních cest dýchacích. Rozlišení C. dubliniensis od C. albicans na základě barvy kolonií na chromogenním médiu CHROMagar Candida lze doporučit pouze jako screeningový test pro odlišení od ostatních druhů rodu Candida. Zbylé metody poskytují vysoké procento spolehlivosti. Konečná identifikace by měla raději vždy spočívat na použití kombinací těchto metod, případně lze výsledek verifikovat pomocí druhově specifické PCR nebo latexové aglutinace.

Study objective: The species Candida dubliniensis shares a wide range of phenotypic characteristics with Candida albicans, the most common yeast species isolated from clinical specimens. This is a considerable complication for the detection and identification of Candida dubliniensis from clinical specimens. The lack of data on the incidence of C. dubliniensis in the Czech Republic was the motivation behind the efforts to detect this pathogen in specimens analyzed at the Institute for Microbiology, Faculty of Medicine Masaryk University and St. Anne's Faculty Hospital in Brno. Another aim was to test the reliability of the culture methods used. Material and methods: Altogether 2260 yeast isolates initially identified as C. albicans were analysed. To differentiate C. dubliniensis from C. albicans, four phenotypic methods were used: colour-based differentiation on CHROMagar Candida medium, culture on medium with 6.5% of NaCl, growth at 42 °C, and colony characteristics on Staib agar. To verify the results, the Bichro-Dubli Fumouze latex agglutination test and species-specific polymerase chain reactions (PCR) were used. Results: Using phenotypic methods, latex agglutination, and PCR, 50 (2.2%) strains from the study set were assigned to C. dubliniensis. Most (31) C. dubliniensis isolates were recovered from the respiratory tract and the remaining others were three urine isolates, four stool isolates, one central venous catheter isolate, and one blood isolate. With the exception of colour-based differentiation on CHROMagar Candida medium showing a specificity of 85.5%, all the culture methods used have a high sensitivity and a high specificity. Conclusion: Identification of C. dubliniensis as C. albicans was confirmed in various clinical specimens, most often from the upper respiratory tract. The colour-based differentiation of C. dubliniensis from C. albicans on chromogenic CHROMagar Candida medium can only be recommended as a screening test for the differentiation of C. dubliniensis from other species of the genus Candida. The remaining three methods are highly reliable. The final identification should be based on a combination of these methods, with the species-specific PCR or latex agglutination test used for verification.

• MeSH
• Agglutination Tests MeSH
• Candida * isolation & purification   growth & development   MeSH
• Molecular Diagnostic Techniques MeSH
• False Negative Reactions MeSH
• False Positive Reactions MeSH
• Catheter-Related Infections microbiology   MeSH
• Clinical Laboratory Techniques MeSH
• Humans MeSH
• Microbiological Techniques MeSH
• Mycological Typing Techniques * MeSH
• Polymerase Chain Reaction MeSH
• Sensitivity and Specificity MeSH
• Check Tag
• Humans MeSH
• Publication type
• Research Support, Non-U.S. Gov't MeSH