causative agent
Dotaz
Zobrazit nápovědu
- MeSH
- houby imunologie patogenita MeSH
- mutace metody MeSH
- myši MeSH
- plicní mykózy etiologie imunologie MeSH
- Check Tag
- myši MeSH
Cíl práce: Identifikace mikroorganismu izolovaného z likvoru u pacientky s nosokomiální purulentní meningitidou. Materiál a metodika: je popsán klinický průběh onemocnění, záchyt gram negativních tyček z likvoru, způsob identifikace a citlivost k antimikrobním látkám. Výsledky: Izolovaný kmen byl identifikován jako Weeksella virosa podle mikroskopické i makroskopické morfologie, růstových a biochemických vlastností, typického antibiogramu a porovnáním s referenčním kmenem. Závěr: Weeksella virosa lze identifikovat jak pomocí firemních diagnostických souprav, tak i konvenčními testy.
Objective: Identification of a microorganism isolated from cerebrospinal fluid in case of nosocomial purulent meningitis. Methods: The clinical course of illness, isolation of gram negative rods from cerebrospinal fluid, the way of identification and susceptibility to antimicrobial agents are desribed. Results: The isolated culture was identified as Weeksella virosahy microscopic and macroscopic morfology, growing abilities and biochemical characteristics, typical antimicrobial susceptibility and by comparing with the national colection strain. Conclusion: The identification of Weeksella virosa is possible by using of commercially produced diagnostics sets, but also by conventional tests.
- MeSH
- cefalosporiny terapeutické užití MeSH
- Flavobacterium izolace a purifikace metabolismus účinky léků MeSH
- infekce spojené se zdravotní péčí farmakoterapie mikrobiologie MeSH
- lidé MeSH
- meningitida bakteriální farmakoterapie mikrobiologie MeSH
- mikrobiální testy citlivosti MeSH
- mladiství MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
Pri rutinnom vyšetrení sme od dvoch pacientov s klinicky suspektnou mykózou nechtov palcov nôh (potvrdená mikroskopicky nálezom úlomkov/tenších hýf) izolovali početné kolónie morfologicky nezvyčajnej hyfomycéty. Na základe podrobného štúdia morfologických a fyziologických znakov kultúr sme izoláty identifikovali ako Arthrographis kalrae. Ide pravdepodobne o prvé zverejnené prípady izolácie tejto termálne dimorfnej keratinolytickej huby na Slovensku.
At a routine examination, multiple colonies of hyphomycetes of uncommon morphology were isolated from two patients with clinically suspected mycosis of the big toes (and confirmed microscopically by the presence of fragmented/thin hyphae). Based on the detailed study of the morphological and physiological characteristics of the cultures, the isolates were identified as Arthrographis kalrae. To our knowledge, this is the first isolation of the thermally dimorphic keratinolytic fungus to be reported in Slovakia.
- MeSH
- antifungální látky terapeutické užití MeSH
- houby izolace a purifikace růst a vývoj účinky léků MeSH
- kokultivační techniky metody využití MeSH
- mikroskopie metody využití MeSH
- onychomykóza diagnóza etiologie terapie MeSH
- palec nohy MeSH
- ureasa izolace a purifikace MeSH
- Geografické názvy
- Slovenská republika MeSH
V článku je popsána infekce spojivky u starší pacientky hospitalizované pro jiný zdravotní problém. Z odebraného materiálu byla izolována grampozitivní koryneformní tyčka, která byla do druhu identifikována jako Corynebacterium macginleyi. Jiný mikroorganismu nebyl zachycen a vzhledem k afinitě tohoto druhu k tkáním oka, zejména pak ke spojivce, předpokládáme jeho etiologickou významnost. Po nasazené lokální antibiotické léčbě symptomatologie rychle ustoupila.
A case report is presented of an elderly woman with conjunctivitis admitted to the hospital for another reason. From the collected specimens, a Gram-positive coryneform rod was isolated and identified as belonging to the species Corynebacterium macginleyi. As no other microbe was detected and given the affinity of the species identified for eye tissues in general and for the conjunctiva in particular, its etiological role was suggested. After local antibiotherapy, the symptoms rapidly resolved.
- Klíčová slova
- Corynebacterium macginleyi, lokální antibiotická terapie,
- MeSH
- antibakteriální látky aplikace a dávkování terapeutické užití MeSH
- bakteriální konjunktivitida * diagnóza etiologie farmakoterapie mikrobiologie MeSH
- korynebakteriální infekce patologie přenos MeSH
- lidé MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
Cíl práce: Cílem práce bylo upozornit na možnou souvislost mezi případy akutních průjmových onemocnění a konkrétním druhem rodu Aeromonas. Materiál a metodiky: Osm studovaných kmenů bylo identifikováno jako Aeromonas spp. a blíže charakterizováno na základě výsledků biochemických testů, analýzy mastných kyselin a ribotypizace. Výsledky: Aeromonády byly opakovaně zachyceny u čtyř dětí do jednoho roku, z nichž dvě musely být pro vodnaté průjmy i hospitalizovány. Z osmi kmenů izolovaných aeromonád bylo šest kmenů identifikováno jako A. caviae, jeden jako A. veronii bv. sobria a jeden kmen se nepodařilo zařadit do druhu. Pouze v jednom případě byla ribotypizací prokázána identita dvou A. caviae kmenů od stejného pacienta, v ostatních případech byly izolovány různé kmeny odlišných druhů aeromonád. Pravděpodobným zdrojem infekcí aeromonádami byla kontaminovaná voda nebo potraviny; v jednom případě i kontakt s cestovateli, kteří se vrátili s průjmovým onemocněním. Závěr: Dokumentované čtyři případy akutních průjmových onemocnění malých dětí ukazují, že aeromonády nejsou vzácné a mohou způsobovat vážné zdravotní problémy. Podrobné epidemiologické souvislosti však zůstávají nejasné. Nepodařilo se prokázat, že klinicky závažné případy byly spojeny s jedním konkrétním druhem rodu Aeromonas, i když výsledky naznačují dominantní úlohu druhu A. caviae.
Study objective: To establish whether there is a link between cases of acute watery diarrhoea and a specific Aeromonas species. Materials and Methods: Eight strains studied were identified as aeromonads and were further characterized by biochemical tests, fatty acid analysis and ribotyping. Results: Aeromonads were isolated repeatedly from stool specimens of four children under one year of age with acute diarrhoea, two of whom were admitted to hospital. Of eight isolated aeromonads strains six were identified as A. caviae, one was classified into A. veronii bv. sobria and one could not be identified to the species level. Only two A. caviae strains from one patient were found to be identical by ribotyping while the Aeromonas species (strains) isolated from the other cases differed from one another. Contaminated fresh water, contaminated food and contact with travellers with imported diarrhoea were identified as probable sources of infection. Conclusion: Four cases of acute gastroenteritis in small children document that aeromonads are not rare and can cause serious health problems. However, epidemiological links remain unclear. We did not prove correlation between the four serious cases of acute diarrhoea and specific Aeromonas species but the results suggest the predominant role of A. caviae.
- MeSH
- Aeromonas izolace a purifikace klasifikace patogenita MeSH
- finanční podpora výzkumu jako téma MeSH
- kontaminace potravin MeSH
- lidé MeSH
- mikrobiologie vody MeSH
- předškolní dítě MeSH
- průjem kojenců epidemiologie etiologie MeSH
- ribotypizace klasifikace metody statistika a číselné údaje MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- předškolní dítě MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
- srovnávací studie MeSH
Cílem sdělení jsou možnosti dvoustupňové polyfázové identifikace původce nokardiózy u pacienta s abscesem mozku, vyšetření citlivosti na antibiotika a etiologická léčba pacienta po neurochirurgickém zákroku. Pacient léčený kortikoidy pro fibrózu plic byl přijat na neurochirurgickou kliniku s pestrými neurologickými projevy. Při CT vyšetření a při kontrastním zobrazení pomocí magnetické rezonance (MRI) byl zjištěn multilokulární expanzní proces velikosti 4,5 x 3,5 cm v parietálním laloku vlevo, diferenciálně diagnosticky označen jako maligní gliom. Byla provedena punkce ložiska. Histologicky byl diagnostikován absces mozku obsahující leukocyty a nekrotické hmoty. Z hnisu získaného punkcí byly vykultivovány bakterie rodu Nocardia, které byly fenotypovými metodami (grampozitivita, částečná acidorezistence, průkaz vzdušného mycelia, růst při 45 °C, rezistence na lysozym a fenotyp rezistence na antibiotika) v prvním stupni fenotypové diagnostiky zařazeny do fenotypu rezistence V., v.s. N. farcinica (rezistence na aminoglykosidy kromě amikacinu a rezistence na cefalosporiny III. generace). Ve druhém stupni polyfázové diagnostiky byla izolována rDNA a byla provedena sekvenace genu pro 16S rRNA ve velikosti 1000 bp. Získaná sekvence byla určena v databázi GenBank pomocí softwaru BLAST jako N. farcinica (100%). Citlivost kmene byla vyšetřena diluční metodou podle standardu NCCLS /CLSI. Kmen byl dobře citlivý na kotrimoxazol, amikacin a imipenem. Pacient byl dlouhodobě intravenózně léčen kombinací kotrimoxazolu s amikacinem s pokračující úpravou klinického stavu a hodnot zánětlivých parametrů. N.farcinica patří mezi tři nejčastěji izolované nokardie v Evropě i v ČR. Byla opakovaně izolována v České republice zejména z plic a dýchacích cest u případů systémové nokardiózy obvykle u pacientů s imunodeficiencí.
This case report describes a two-step protocol for the identification of the causative agent of nocardiosis in a patient with brain abscess, antibiotic susceptibility testing and etiological treatment after neurosurgery. The patient treated with corticosteroids for pulmonary fibrosis and presenting with multiple neurological manifestations was admitted to a neurosurgery clinic. CT and contrast MRI revealed an expansive multilocular lesion 45 x 35 mm in size in the left parietal lobe, differentially diagnosed as malignant glioma. The lesion was biopsied and the histology showed a brain abscess containing white blood cells and dead tissue. The aspirated pus culture yielded bacteria of the genus Nocardia that were further identified, in the first step, by phenotypic methods (Gram positivity, partial acidoresistance, airborne mycelium detection, growth at 45 °C, lysozyme resistance and antibiotic resistance phenotype) as belonging to resistance phenotype V., v.s. N. farcinica (resistance to aminoglycosides except amikacin and to third-generation cephalosporins). In the second step of the polyphasic identification, rDNA was isolated and a 1000 bp part of the 16S rRNA gene was sequenced. Sequence comparison with the GenBank database using BLAST software identified the agent as N. farcinica (100%). The isolate was tested for susceptibility by the NCCLS /CLSI dilution method and showed good susceptibility to co-trimoxazole, amikacin and imipenem. The patient was treated with long-term intravenous cotrimoxazole acid in combination with amikacin and his clinical condition and laboratory parameters of inflammation improved. N. farcinica is among the three most frequently isolated Nocardia species in Europe as well as in the Czech Republic where it was repeatedly recovered from the lungs and respiratory tract of immunocompromised patients with systemic nocardiosis.
- MeSH
- absces mozku farmakoterapie chirurgie mikrobiologie MeSH
- antibakteriální látky aplikace a dávkování MeSH
- diagnostické techniky molekulární využití MeSH
- financování organizované MeSH
- fixní kombinace léků MeSH
- lidé MeSH
- mikrobiální testy citlivosti využití MeSH
- mikrobiologické techniky využití MeSH
- Nocardia izolace a purifikace MeSH
- nokardióza diagnóza genetika MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
