mutace genu Dotaz Zobrazit nápovědu
Východisko. Hereditární hemochromatóza je jedním z nejčastějších autozomálně recesivních onemocnění. Cílem práce je stanovit frekvenci mutace C282Y a H63D v genu HFE (gen pro hemochromatózu) v populaci České republiky a u nemocných s hemochromatózou a zjistit, zda se hemochromatóza v homo- či heterozygotním stavu podílí na patogenezi revmatických postižení. Metody a výsledky. U 32 nemocných s hereditární hemochromatózou, u 84 nemocných s polymyositidou a dermatomyositidou, u 246 nemocných s juvenilní idiopatickou artritidou a u 481 kontrol byla stanovena přítomnost mutací v HFE genu. Genomová DNA byla pomnožena PCR reakcí. Amplifikovaný produkt byl naštěpen restrikční endonukleázou RsaI resp. BclI a analyzován elektroforeticky na agarózovém gelu. V kontrolním souboru bylo zaznamenáno 6,86 % přenašečů mutace C282Y a 26,6% H63D. U 90,6 % (p<0,001) nemocných s hemochromatózou byla zaznamenána mutace C282Y nebo H63D v homozygotním stavu. U 12,2 % (p<0,05) nemocných s juvenilní idiopatickou artritidou byla nalezena mutace C282Y v heterozygotní formě. U nemocných s polymyositidou a dermatomyositidou jsme nezaznamenali zvýšený nález homozygotů či heterozygotů pro sledované mutace. Závěry. Prevalence mutací v genu pro hemochromatózu je v české populaci podobná jako v sousedních středoevropských zemích. Zdá se, že mutace C282Y v HFE genu je predisponujícím faktorem pro vznik juvenilní idiopatické artritidy, nikoliv však polymyositidy či dermatomyositidy.
Background. Hereditary hemochromatosis is one of the most common autosomal recessive diseases. Aim of the study. 1. To establish frequency of C282Y and H63D mutations in the HFE gene (the hemochromatosis gene) in general population of the Czech Republic and in patients with hemochromatosis. 2. To find out whether hemochromatosis in homo- or heterozygous state plays a role in the pathogenesis of rheumatic diseases. Methods and Results. In 32 patients with hereditary hemochromatosis, in 84 patients with polymyositis or dermatomyositis, in 246 patients with juvenile idiopathic arthritis and in 481 persons of the control group the presence of HFE gene mutations was etablished. The HFE gene mutations were screened for by restriction enzyme analysis performed on PCR amplified products. In the control group, 6.86 % carriers of the C282Y mutation and 26.61 % those of H63D were found. Homozygous C282Y or H63D mutation was found in 90.6% (p<0.001) of patients with hemochromatosis. Heterozygous C282Y mutation was found in 12.2 % (p<0.05) of patients with juvenile idiopathic arthritis. We didn@t detected higher prevalence of HFE gene mutations in patiens with polymyositis and dermatomyositis. Conclusions. Results of this study show that heterozygosity for C282Y mutation may be a risk factor for juvenile idiopathic arthritis but not for polymyositis and dermatomyositis.
- MeSH
- alely MeSH
- finanční podpora výzkumu jako téma MeSH
- geny MeSH
- hemochromatóza diagnóza etiologie genetika MeSH
- heterozygot MeSH
- homozygot MeSH
- juvenilní artritida diagnóza genetika MeSH
- mutace MeSH
- polymerázová řetězová reakce metody MeSH
- polymyozitida diagnóza genetika MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
Cílem studie bylo zavedení detekce bodové mutace na 12. kodonu prvního exonu Ki-ras genu u nemocných s adenokarcinomem pankreatu použitím tří modifikací polymerázové řetězové reakce a následným restrikčním štěpením (PCR-RFLP) naamplifikovaných produktů. K detekci byly využity tři dvojice primerů generujících artefaciální místo pro restrikční enzymy s pouze jednou alelickou formou. Použitím dvoustupňové PCR-RFLP a dvou modifikací jednostupňové PCRRFLP bylo vyšetřeno 12 DNA vyizolovaných ze solidních tumorů (5), pankreatických sekretů (6) a z lymfocytů periferní krve (1) u pacienta s generalizováným stadiem onemocnění. Studie podává srovnání použitých metod k detekci mutace na Ki-ras genu a kloní se k závěru, že dvoustupňová PCR-RFLP analýza vzhledem ke své citlivosti je vhodnou metodou pro detekci bodových mutací bez použití oligonukleotidových hybridizací a sekvenace DNA.
Present study was undertaken to detect Ki-ras point mutation at codon 12 in pancreatic adenocarcinomas (CaP) using the polymerase chain reaction-restriction fi"agment lengths polymorphism (PCR-RFLP). Three modifications of PCR-RFLP were performed with a mismatched primers creating a recognition site with only one allelic form (wild or mutated). Using two-step PCR-RFLP and two modifications of one-step PCR-RFLP we examined 5 resected adenocarcinomas of pancreas, 6 pancreatic juices and one DNA sample from peripheral blood of patient with generalized stadium of CaP. We compare all techniques and conclude, that the very sensitive two step PCR-RFLP is a suitable method for detection point mutations and eliminates the need for either oligonucleotide hybridization or DNA sequencing.
Východisko. Identifikace mutací v genech, které se potenciálně účastní v patogeneze esenciální hypertenze, se provádí se záměrem pochopit hlubší souvislosti rozvíjejících se patofyziologických změn, posoudit individuální riziko hypertenze v preklinických stadiích a s ohledem na zjištěný genotyp vybrat optimální terapii. Cílem této práce bylo ověřit existenci rozdílu ve výskytu dvojnásobného genotypu polymorfních kandidátních genů mezi normoten- zními a hypertenzními jedinci. Metody a výsledky. Vzorek české populace (398 osob), 192 normotoniků (věk 45,87±3,0, BMI=25,44±3,31 kg.m -2 ) a 206 hypertoniků (věk 48,71±8,42, BMI=27,18±4,16 kg.m -2 ) byl genotypizován na angiotenzinogenovém genu (AGT, polymorfizmus M235T, exon 2) a na genu pro endotelin-1 (EDN-1, Taq I polymorfizmus, intron 4) metodou PCR. Experimentální protokol byl typu „případy-kontroly”. Pro statistické analýzy byly použity metody c 2 a Fisher- exact test. Alela M genu pro angiotenzinogen byla asociována s esenciální hypertenzí (p=0,0111). Alela (-) genu pro endotelin-1 (EDN-1) byla asociována s esenciální hypertenzí s hraniční signifikancí (p=0,0622). U homozygotů (--) genu EDN-1 je u hypertoniků významný úbytek heterozygotů M235T AGT. (p=0,0025), u homozygotů M235M je vysoce výrazný přírůstek alely (-) v genu pro EDN-1 (p=0,0034). Závěry. Prokázali jsme interakci dvou polymorfních genetických variant genů pro angiotenzinogen a endotelin-1 u esenciální hypertenze. Patofyziologickým výkladem tohoto jevu je zřejmě snaha vyrovnávat vliv variability jiných genů, které kauzálně podmiňují vznik esenciální hypertenze.
Background. Identification of mutations contributing to the pathogenesis of essential hypertension performs to understand deeper consequences of developing pathophysiological changes, to value individual risk of hypertension in the preclinical stages and, regarding the observed genotype, to choose optimum therapy. The aim of the study was to prove the existence of difference in double genotype occurrence of polymorphic candidate genes between normotensive and hypertensive subjects. Methods and Results. A sample of Czech population (398 individuals), 192 normotensives (age of 45.87±3.0, BMI=25.44±3.31 kg.m -2 ) a 206 hypertensives (age of 48.71±8.42, BMI=27.18±4.16 kg.m -2 ) was genotyped at angiotensinogen (AGT, M235T polymorphism, exon 2) and endothelin-1 (EDN-1, Taq I 8000 polymorphism, intron 4) genes by PCR methods. Experimental schedule was case-control. c 2 and Fisher-exact test were used for statistical analyses. M-allele of angiotensinogen gene was associated with essential hypertension (p=0.0111). Allele (-) alone at endothelin-1 gene was associated with essential hypertension with marginal significance (p=0.0622). A significant loss of heterozygotes MT (M235 AGT) at homozygote (--) at endothelin-1 gene (p=0.0025) as well as a significant increase of allele (-) of endothelin-1 gene at homozygote MM at angiotensinogen gene (p=0.0034) were found. Conclusions. Interaction of two polymorphic genetic variants of angiotensinogen and endothelin-1 genes was found. From the pathophysiological point of view, the fact may be explained as a stream to compensate the influence of variability of other genes more causatively conditioning essential hypertension.
- MeSH
- ambulantní monitorování krevního tlaku MeSH
- angiotensinogen MeSH
- dospělí MeSH
- endotelin-1 MeSH
- finanční podpora výzkumu jako téma MeSH
- geny MeSH
- hypertenze genetika patofyziologie MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mutace MeSH
- polymorfismus genetický MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
- srovnávací studie MeSH
Východisko. Mutace v exonu 6 (657del5 a R215W) tumor supresorového genu NBS1 se vyskytují ve slovanské populaci až u 1 % populace. Mezi dospělými příbuznými pacientů s Nijmegen breakage syndromem, kteří byli heterozygoty mutace 657del5 byl opakovaně nalezen zvýšený výskyt maligních tumorů. Mezi dětskými pacienty s onkologickou problematikou jsme nalezli jen nepřesvědčivé zvýšení frekvence mutací NBS1 genu, takže se tyto mutace zřejmě ještě nepodílí významně na tumorech manifestovaných v dětství. Podíl heterozygotů mutací NBS1 genu mezi dospělými pacienty s malignitami může již představovat nezanedbatelný počet osob, u nichž léčebné schéma i další sledování by mělo respektovat jejich hyperradiosenzitivitu. Metody a výsledky. Mutace v exonu 6 NBS1 genu jsme vyšetřili u 706 dospělých pacientů s různým typem maligního onemocnění a nalezli 5 heterozygotů mutace 657del5 (1:141), což není rozdílné od očekávaného výskytu 1:129–165 v populaci. Zvýšený výskyt NBS1 heterozygotů jsme však zjistili mezi pacienty s kolorektálním karcinomem (2/101 tj 1:50), a karcinomem mamy (1/60), s kožními karcinomy a melanomy (1/98), i když nesignifikantně, srovnáme-li však s incidenci heterozygotů 657del5 mutace mezi osobami 70letými a staršími (1:435), byl by výskyt heterozygotů NBS mezi dospělými pacienty s malignitami zvýšen signifikantně. Závěry. Mezi pacienty s nonHodgkinským lymfomem byl výskyt 1/228, tedy překvapivě nízký, neboť mezi homozygoty NBS je NHL nejčastější a často letální komplikací. Ostatních typů malignit bylo v jednotlivých skupinách příliš málo a jen jeden heterozygot mutace R215W byl mezi nimi zjištěn. Identifikace heterozygotů mezi jejich potomky a dalšími příbuznými pacientů s malignitou, kteří jsou nositeli mutace nabízí možnost účinné prevence výskytu malignit zejména ochranou před ionisačními mutageny.
Background. Mutations 657del5 and R215W in exon 6 of tumor suppressor gene NBS1 are found in 1% Slavic populations. Increased occurrence of cancer was repeatedly reported in adult relatives of patients with Nijmegen breakage syndrome. Among children with oncological problematic, nonsignificantly increased frequency of NBS1 heterozygotes was found, which seems not to play any important role in cancerogenesis in childhood. However, the proportion of NBS heterozygotes among adult patients with malignancies could be significant and their therapy and follow up should respect their hyperradiosensitivity. Methods and Results. Mutations in exon were studied in 706 adult patients with malignancies. We found 5 NBS heterozygotes, which not more than the population prevalence (1:129–165). Increased frequency of NBS heterozygotes was found among patients with colon and rectal cancer (2/101), breast cancer (1/60), skin malignancies (1/98). Conclusions. Surprisingly only one NBS heterozygote was found among 228 patients with nonHodgkin lymphoma, the malignancy which is a common complication in NBS homozygotes. Other types of malignancies were uncommon and only one R215W heterozygote was found. Comparison frequency of NBS heterozygotes with incidence NBS among person older than 70 years shows significant difference. Prevention of malignancies by avoidance from ionisation could be realized also in relatives of patients after identification of their genotype.
- MeSH
- finanční podpora výzkumu jako téma MeSH
- lidé MeSH
- mutace MeSH
- nádory vyvolané zářením MeSH
- nádory genetika MeSH
- nehodgkinský lymfom MeSH
- oprava DNA imunologie účinky záření MeSH
- průřezové studie MeSH
- tumor supresorové geny účinky záření MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
Závěrečná zpráva o řešení grantu Interní grantové agentury MZ ČR
112 l. : tab., il. ; 30 cm
Mutational analysis of PML gene will be performed in patients with breast and colon cancer with suspect hereditary predisposition to cancer. Cyclin D1 and ZNF217 gene amplification analysis will be performed in breast cancer samples associated with hereditary predisposition and sporadic ones and differences between both groups will be determined.
Bude pátráno po zárodečných mutacích genu PML u pacientů s nádory prsu a kolorekta, u nichž je podezření, že onemocnění mohlo vzniknout na podkladě hereditární predispozice. Bude stanovena amplifikace genu pro cyklin D1 a ZNF217 ve vzorcích nádorů prsu na podkladě hereditární predispozice a sporadických a pátráno po rozdílech mezi oběma skupinami nádorů.
- MeSH
- amplifikace genu MeSH
- cyklin D1 MeSH
- kolorektální nádory etiologie genetika MeSH
- nádory prsu etiologie genetika MeSH
- protein SUMO-1 MeSH
- transkripční faktory Krüppel-like MeSH
- zárodečné mutace MeSH
- Konspekt
- Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
- NLK Obory
- hematologie a transfuzní lékařství
- onkologie
- biologie
- NLK Publikační typ
- závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR
Východisko. Syndrom Li-Fraumeni je poměrně vzácné familiární nádorové onemocnění asociované se zárodečnými mutacemi v tumor supresorovém genu TP53. Členové těchto rodin mohou být postiženi širokým spektrem nádorů. Záchyt zárodečné mutace v genu TP53 je zvláště pravděpodobný v rodinách pacientů trpících jedním z několika typických druhů nádorů. Metody a výsledky. Výchozím materiálem pro sledování průměrného věku diagnózy nádoru u nosičů zárodečné mutace v genu TP53 a v české populaci byla databáze 176 rodin (469 nádorů u 346 pacientů) s prokázanou mutací a údaje o incidenci novotvarů v letech 1994–1998 (ÚZIS). Porovnání věkové závislosti relativní incidence nádorů u těchto dvou skupin jasně vyčlenilo dětské pacienty s adrenokortikálními karcinomy, rabdomyosarkomy, osteosarkomy a mozkovými nádory, v jejichž rodinách by mělo být doporučeno genetické poradenství. Závěry. Pacienti s nízkým věkem při diagnóze těchto nádorů, zvláště pak v kombinaci s opakovaným výskytem nádorů či s pozitivní rodinnou onkologickou anamnézou, by měli být považování za možné nosiče zárodečné mutace v genu TP53. S tím by pak měla souviset následná léčba a sledování nejen pacientů samotných, ale i dalších členů jejich rodin.
Background. The Li-Fraumeni syndrome is a relatively rare familial cancer syndrome associated with germline mutations in the tumour-suppressor gene TP53. Members of affected families can suffer from a wide variety of tumours. Identification of a germline TP53 mutation is particularly important in families of patients affected by one of several characteristic types of tumours. Methods and Results. The data used for the distribution analysis of mean age at the cancer diagnosis in TP53 mutation carriers and in the Czech population were extracted from a database of 176 families (469 cancers in 346 patients) with germline TP53 mutations and from Czech statistical data of cancer incidence in years 1994 to 1998 (ÚZIS). The comparison of the age distribution of the relative tumour incidence in these two groups clearly separated childhood adrenocortical sarcoma, rhabdomyosarcoma, osteosarcoma and brain tumour patients. In their families genetic counselling should be recommended. Conclusions. Patients with low age at diagnosis of these tumours, particularly patients with additional personal or family history of malignancy, should be considered as potential TP53 mutation carriers. It should be relevant not only for the treatment and follow-up of the patients but also for preventive measures aimed at other members of their families.
- MeSH
- dítě MeSH
- dospělí MeSH
- finanční podpora výzkumu jako téma MeSH
- geny p53 MeSH
- lidé MeSH
- Liův-Fraumeniho syndrom genetika MeSH
- mutace MeSH
- nádory mozku diagnóza MeSH
- nádory prsu diagnóza MeSH
- nádory diagnóza genetika MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- dospělí MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- databáze MeSH
- přehledy MeSH
- srovnávací studie MeSH
Východiska: Léčba tyrozinkinázovými inhibitory, které blokují aktivaci kaskády receptoru pro epidermální růstový faktor (EGFR-TKI), představuje jednu z nových modalit léčby pokročilého NSCLC. Mutace genu EGFR, delece na 19. exonu a bodová mutace na 21. exonu (L858R) jsou prediktorem dobré odpovědi na léčbu EGFR-TKI. Zmapovali jsme incidenci mutací genu EGFR u pacientů s pokročilým NSCLC v naší populaci a posoudili jejich vliv na efekt léčby EGFR-TKI. Soubor pacientů a metody: Genetické vyšetření (delece na 19. exonu a bodová mutace na 21. exonu) bylo provedeno u 613 pacientů s pokročilým NSCLC (stadium IIIB, IV). Efekt léčby (PFS, OS) EGFR-TKI byl hodnocen u 410 pacientů léčených EGFR-TKI. Přežití bylo hodnoceno metodikou podle Kaplana-Meiera a statistické srovnání bylo provedeno log-rank testem. Výsledky: Mutace genu EGFR byla prokázána u 73 (11,9 %) pacientů, 540 pacientů bylo nositeli wild-type EGFR genu. Delece na 19. exonu byla zjištěna u 49 pacientů, bodová mutace na 21. exonu (L858R) byla zjištěna u 22 pacientů, obě mutace byly zjištěny u 2 pacientů. Byl prokázán zvýšený výskyt mutací genu EGFR u pacientů s adenokarcinomem (14,9 % vs 7,8 %, p = 0,008), žen (20,2 % vs 7,1 %, p < 0,001) a nekuřáků (29,9 % vs 7,0 %, p < 0,001). Šedesát pacientů s mutací genu EGFR a 350 pacientů s wild-type EGFR genem bylo léčeno EGFR-TKI. Medián PFS při léčbě EGFR-TKI u pacientů s mutací EGFR činil 7,2 vs 2,0 měsíce u pacientů s wild-type EGFR (p < 0,001), medián OS u pacientů s mutací EGFR činil 14,5 vs 7,5 měsíce u pacientů s wild-type EGFR (p = 0,019). Závěr: Výskyt mutací genu EGFR u NSCLC v naší populaci i jejich zvýšený výskyt u pacientů s adenokarcinomem, žen a nekuřáků koreluje s daty, která byla publikována v literatuře. Výsledky analýzy přežití u pacientů léčených EGFR-TKI potvrzují vysoký potenciál aktivačních mutací EGFR pro predikci dobrého efektu léčby EGFR-TKI.
Background: Molecular targeted therapy based on tyrosine kinase inhibitors, directed at the epidermal growth factor receptor (EGFR) is one of novel options for management of NSCLC. EGFR gene mutations, exon 19 deletions and exon 21 point mutations (L858R) are good predictors of response to EGFR-TKI treatment. The aim of this study was to assess the incidence of EGFR mutations in a large cohort of Europeans with advanced NSCLC and subsequently to evaluate their impact on the effect of EGFR-TKI treatment. Patients and Methods: In total, 613 patients with advanced stage NSCLC (IIIB, IV) were genetically tested. The effect of treatment was evaluated in 410 patients treated with EGFR-TKI. Survival was evaluated using Kaplan-Meier method, and statistical comparison was performed using log-rank test. Results: EGFR mutations were detected in 73 (11.9%) patients. Exon 19 deletions were detected in 49 patients, exon 21 point mutations (L858R) were detected in 22 patients, and both mutation types were detected in 2 patients. An increased incidence of EGFR mutations among patients with adenocarcinoma (14.9% vs 7.8%, p = 0.008), women (20.2% vs 7.1%, p < 0.001) and nonsmokers (29.9% vs 7.0%, p < 0.001) was demonstrated. Sixty patients with EGFR mutation and 350 patients with wild-type EGFR were treated with EGFR-TKI. Median PFS in patients harboring EGFR mutation was 7.2 vs 2.0 months in patients harboring wild-type EGFR (p < 0.001), median OS in patients harboring EGFR mutation was 14.5 vs 7.5 months in patients harboring wild-type EGFR (p = 0.019). Conclusion: The incidence of EGFR mutations in the studied population, their increased incidence among patients with adenocarcinoma, women and non-smokers correlated with data previously published. Results of survival analysis in patients treated with EGFR-TKI confirmed high potential of EGFR mutations to predict good effect of the EGFR-TKI treatment. Genetic testing in patients with NSCLC should be a standard part of diagnostic procedures.
- Klíčová slova
- EGFR protein, tyrozinkinázové inhibitory, EGFR mutace, molekulárně cílená léčba,
- MeSH
- bodová mutace genetika imunologie účinky léků MeSH
- chinazoliny aplikace a dávkování škodlivé účinky terapeutické užití MeSH
- cílená molekulární terapie metody trendy využití MeSH
- delece genu MeSH
- erbB receptory genetika imunologie účinky léků MeSH
- genetické testování metody trendy využití MeSH
- genetický výzkum MeSH
- geny erbB genetika imunologie účinky léků MeSH
- Kaplanův-Meierův odhad MeSH
- kouření škodlivé účinky MeSH
- lidé MeSH
- nádory plic diagnóza etiologie genetika MeSH
- nemalobuněčný karcinom plic etiologie genetika terapie MeSH
- statistika jako téma MeSH
- stupeň nádoru MeSH
- tyrosinkinasy antagonisté a inhibitory terapeutické užití MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- abstrakt z konference MeSH
- Klíčová slova
- PKD1, PKD2,
- MeSH
- dospělí MeSH
- fenotyp MeSH
- genotyp MeSH
- kationtové kanály TRPP genetika MeSH
- kohortové studie MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- polycystické ledviny autozomálně dominantní * epidemiologie genetika patofyziologie MeSH
- prognóza MeSH
- rodokmen MeSH
- rozložení podle pohlaví MeSH
- senioři MeSH
- věk při počátku nemoci MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- komentáře MeSH
- Geografické názvy
- Francie MeSH