population-based algorithm
Dotaz
Zobrazit nápovědu
Six population-based methods for real-valued black box optimization are thoroughly compared in this article. One of them, Nelder-Mead simplex search, is rather old, but still a popular technique of direct search. The remaining five (POEMS, G3PCX, Cauchy EDA, BIPOP-CMA-ES, and CMA-ES) are more recent and came from the evolutionary computation community. The recently proposed comparing continuous optimizers (COCO) methodology was adopted as the basis for the comparison. The results show that BIPOP-CMA-ES reaches the highest success rates and is often also quite fast. The results of the remaining algorithms are mixed, but Cauchy EDA and POEMS are usually slow.
- MeSH
- algoritmy * MeSH
- benchmarking metody MeSH
- lidé MeSH
- numerická analýza pomocí počítače MeSH
- teoretické modely * MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- srovnávací studie MeSH
OBJECTIVES: Refeeding syndrome (RFS) can be a life-threatening metabolic condition after nutritional replenishment if not recognized early and treated adequately. There is a lack of evidence-based treatment and monitoring algorithm for daily clinical practice. The aim of the study was to propose an expert consensus guideline for RFS for the medical inpatient (not including anorexic patients) regarding risk factors, diagnostic criteria, and preventive and therapeutic measures based on a previous systematic literature search. METHODS: Based on a recent qualitative systematic review on the topic, we developed clinically relevant recommendations as well as a treatment and monitoring algorithm for the clinical management of inpatients regarding RFS. With international experts, these recommendations were discussed and agreement with the recommendation was rated. RESULTS: Upon hospital admission, we recommend the use of specific screening criteria (i.e., low body mass index, large unintentional weight loss, little or no nutritional intake, history of alcohol or drug abuse) for risk assessment regarding the occurrence of RFS. According to the patient's individual risk for RFS, a careful start of nutritional therapy with a stepwise increase in energy and fluids goals and supplementation of electrolyte and vitamins, as well as close clinical monitoring, is recommended. We also propose criteria for the diagnosis of imminent and manifest RFS with practical treatment recommendations with adoption of the nutritional therapy. CONCLUSION: Based on the available evidence, we developed a practical algorithm for risk assessment, treatment, and monitoring of RFS in medical inpatients. In daily routine clinical care, this may help to optimize and standardize the management of this vulnerable patient population. We encourage future quality studies to further refine these recommendations.
- MeSH
- algoritmy * MeSH
- hodnocení rizik normy MeSH
- hodnocení stavu výživy * MeSH
- hospitalizovaní pacienti MeSH
- konsensus MeSH
- lékařská praxe založená na důkazech normy MeSH
- lidé MeSH
- metody pro podporu rozhodování * MeSH
- plošný screening normy MeSH
- realimentační syndrom diagnóza prevence a kontrola MeSH
- rizikové faktory MeSH
- směrnice pro lékařskou praxi jako téma MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
Východiska: Cílem této práce je představit algoritmus separace plazmatických buněk ze vzorků kostní dřeně pacientů s mnohočetným myelomem. Zisk vysoce čistých buněčných populací je základní podmínkou aplikace moderních výzkumných postupů u tohoto onemocnění. Materiál a metody: Vzorky kostní dřeně byly získány od pacientů z Interní hematoonkologické kliniky FN Brno. Kostní dřeň byla nejprve zbavena červené složky (metodou hustotní gradientové centrifugace nebo lyzace), plazmatické buňky byly označeny monoklonální protilátkou proti syndecanu-1 (CD138) a separovány magneticky nebo na buněčném sorteru. Čistota separované populace byla vyhodnocena na průtokovém cytometru, případně morfologicky. Výsledky: Paralelně, magnetickou a fluorescenční separací, bylo zpracováno 28 vzorků kostní dřeně a byla vyhodnocena čistota separovaných frakcí. Na základě statistického hodnocení výsledných čistot jak v celém souboru vzorků, tak ve skupinách podle vstupního zastoupení plazmatických buněk byl navržen algoritmus separace s cut-off hodnotou 5 % plazmatických buněk v mononukleární frakci KD: vzorky s < 5 % plazmatických buněk jsou nadále tříděny na buněčném sorteru, vzorky s ? 5 % plazmatických buněk jsou separovány na magnetickém separátoru. Po ročním vyhodnocení uplatnění tohoto algoritmu na souboru 210 vzorků kostní dřeně se medián čistoty separovaných plazmatických buněk zvedl z 62,4 % (0,4–99,6 %) na 94,0 % (23,9–100 %). Závěr: Zavedení metodiky fluorescenčního třídění výrazně přispělo k celkovému zvýšení úspěšnosti separace plazmatických buněk ze vzorků kostní dřeně, a to především u vzorků s jejich nízkým vstupním zastoupením, kde dosud využívaná metodika magnetické separace není dostatečně účinná. Otevřela se tím také cesta k separaci plazmatických buněk ze vzorků kostní dřeně od jedinců s monoklonální gamapatií nejasného významu, kde je zastoupení plazmatických buněk typicky velmi nízké (desetiny, max. jednotky procent).
Backgrounds: The aim of this paper is to present an algorithm for plasma cell separation from bone marrow samples of multiple myeloma patients. The main prerequisite for applying modern research methods in this disease is gaining pure cell populations. Material and Methods: Bone marrow samples were collected from outpatients or inpatients of the Internal Haematology and Oncology Clinic of the Faculty Hospital Brno, after they had signed an Informed Consent Form. The bone marrow was first depleted of red cells (by density gradient centrifugation or erythrolysis), plasma cells were labelled by monoclonal antibody against syndecan-1 (CD138) and separated either magnetically or by cell sorter. The purity of separated population was evaluated by flow cytometry or, alternatively, morfologically. Results: We processed 28 bone marrow samples, in parallel, by magnetic or fluorescence-based separation, and we evaluated the purity of the separated fractions. Based on a statistical evaluation of resulting purities in the entire sample set as well as the individual groups divided according to the initial plasma cell content, a separation algorithm was proposed with a cut-off value of 5% of plasma cells in mononuclear fraction of bone marrow: samples with less than 5% of plasma cells are henceforth separated on cell sorter, samples with more than 5% are separated magnetically. The effectiveness of this algorithm was evaluated after the first year of its application on a dataset of 210 bone marrow samples: median purity of the separated plasma cells increased from 62.4% (0.4–99.6%) to 94.0% (23.9–100%). Conclusion: The introduction of a fluorescence-based separation markedly increased the effectiveness of plasma cell separation from bone marrow samples, mainly in samples with low plasma cell content where magnetic separation used thus far is not sufficient. This finding also opened a door for plasma cell separation of bone marrow samples from patients with monoclonal gammopathy of undetermined significance, where plasma cell count is typically below or just over one percent.
- Klíčová slova
- magnetická separace, buněčný sorter,
- MeSH
- algoritmy MeSH
- financování organizované MeSH
- imunomagnetická separace MeSH
- kostní dřeň patologie MeSH
- lidé MeSH
- mnohočetný myelom patologie MeSH
- monoklonální gamapatie nejasného významu MeSH
- plazmatické buňky patologie MeSH
- průtoková cytometrie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
Od ledna 2014 bylo v České republice zahájeno adresné zvaní pojištěnců do programů screeningu zhoubných nádorů, konkrétně screeningu nádorů hrdla děložního a nádorů prsu (mamografického screeningu) u žen, a dále nádorů tlustého střeva a konečníku (kolorekta) u žen a mužů. Cílem je posílit stávající programy prevence a zvýšit dosud nedostatečnou účast v nich – proto jsou adresně zváni občané, kteří se těchto programů dlouhodobě neúčastní a riskují tak závažné nádorové onemocnění. Projekt je koordinován Ministerstvem zdravotnictví ČR ve spolupráci se zástupci dotčených odborných společností (gynekologie, gastroenterologie, gastrointestinální onkologie, radiodiagnostika, všeobecné lékařství, PL), zástupců zdravotních pojišťoven a dalších expertů jmenovaných ministrem zdravotnictví. Své klienty (pojištěnce) zvou k preventivním vyšetřením všechny zdravotní pojišťovny, které také hradí veškerá potřebná vyšetření. Projekt je realizován s pomocí finančních prostředků z fondů EU. Tento článek popisuje plošně implementovanou metodiku adresného zvaní, její datovou základnu a první výsledky projektu z první poloviny roku 2014, kdy bylo pozváno téměř 1,3 mil. českých občanů.
In January 2014, a programme of personalised invitations was launched in the Czech Republic, with the objective of inviting insured persons to cancer screening programmes; namely breast cancer screening and cervical cancer screening in women, and colorectal cancer screening both in women and men. This programme aims at strengthening the current cancer prevention programmes, and to increase the currently inadequate participation of the target population in these programmes; therefore, personalised invitations are sent to citizens who have not participated in these programmes for several years and therefore at risk of developing a serious disease. The project is coordinated by the Czech Ministry of Health in cooperation with the expert medical societies involved (gynaecology, gastroenterology, gastrointestinal oncology, diagnostic radiology, general practice), representatives of health care payers, and other experts nominated by the Minister of Health. All health care payers invite their clients (insured persons) to preventive check-ups, covering all examinations needed. The project has been realised with the assistance of financial resources from EU funds. This article describes the methodology of personalised invitations which has been implemented nationwide, its data background, and the first results of the project in the first half of 2014, when almost 1.3 million Czech citizens were invited. Key words: personalised invitation – screening – cancer – prevention – general practitioner – gynaecologist This study was supported by the project 36/14//NAP “Development and implementation of methodology for the evaluation of effectiveness of personalised invitations of citizens to cancer screening programmes” as part of the programme of the Czech Ministry of Health “National action plans and conceptions”. The authors declare they have no potential conflicts of interest concerning drugs, products, or services used in the study. The Editorial Board declares that the manuscript met the ICMJE “uniform requirements” for biomedical papers. Submitted: 29. 8. 2014 Accepted: 30. 9. 2014
- Klíčová slova
- adresné zvaní,
- MeSH
- algoritmy MeSH
- časná detekce nádoru MeSH
- databáze jako téma MeSH
- dospělí MeSH
- hodnocení programu statistika a číselné údaje MeSH
- kolorektální nádory * prevence a kontrola MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- mladý dospělý MeSH
- nádory děložního čípku * prevence a kontrola MeSH
- nádory prsu * prevence a kontrola MeSH
- pacientův souhlas se zdravotní péčí * statistika a číselné údaje MeSH
- plošný screening * metody organizace a řízení statistika a číselné údaje MeSH
- poštovní služby MeSH
- připomínače a organizéry MeSH
- senioři MeSH
- všeobecné zdravotní pojištění MeSH
- výběr pacientů MeSH
- zlepšení kvality MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- mladý dospělý MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
Identification of risk factors for transient ischemic attack (TIA) is crucial for patients with atrial fibrillation (AF). However, identifying risk factors in young patients with low-risk AF is difficult, because the incidence of TIA in such patients is very low, which would result in traditional multiple logistic regression not being able to successfully identify the risk factors in such patients. Therefore, a novel algorithm for identifying risk factors for TIA is necessary. We thus propose a novel algorithm, which combines multiple correspondence analysis and hierarchical cluster analysis and uses the Taiwan National Health Insurance Research Database, a population-based database, to determine risk factors in these patients. The results of this study can help clinicians or patients with AF in preventing TIA or stroke events as early as possible.
OBJECTIVES: The objective of this study was to assess the robustness of a novel test bolus (TB)-based computed tomographic angiography (CTA) contrast-enhancement-prediction (CEP) algorithm by retrospectively quantifying the systematic and random errors between the predicted and true enhancements. MATERIALS AND METHODS: All local institutional review boards approved this retrospective study, in which a total of 72 (3 × 24) anonymized cardiac CTA examinations were collected from 3 hospitals. All patients (46 men; median age, 62 years [range, 31-81 years]) underwent a TB scan and a cardiac CTA according to local scan and injection protocols. For each patient, a shorter TB signal and TB signals with lower temporal resolution were derived from the original TB signal. The CEP algorithm predicted the enhancement in the descending aorta (DAo) on the basis of the TB signals in the DAo, the injection protocols and kilovolt settings, as well as population-averaged blood circulation characteristics. The true enhancement was extracted with a region of interest along the DAo centerline. For each patient, the errors in timing and amplitude were calculated; differences between the hospitals were assessed using the 1-way analysis of variance (P < 0.05) and variations between the TB signals were assessed using the within-subject standard deviation. RESULTS: No significant differences were found between the 3 hospitals for any of the TB signals. With errors in the amplitude and timing of 0.3% ± 15.6% and -0.2 ± 2.0 seconds, respectively, no clinically relevant systematic errors existed. Shorter- and coarser-time-sampled TB signals introduced a within-subject standard deviation of 4.0% and 0.5 seconds, respectively. CONCLUSIONS: This TB-based CEP algorithm has no systematic errors in the timing and amplitude of predicted enhancements and is robust against coarser-time-sampled and incomplete TB scans.
- MeSH
- algoritmy * MeSH
- dospělí MeSH
- jopamidol analogy a deriváty diagnostické užití MeSH
- kontrastní látky diagnostické užití MeSH
- koronární angiografie metody MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- nemoci koronárních tepen radiografie MeSH
- počítačová rentgenová tomografie metody MeSH
- počítačové zpracování obrazu metody MeSH
- prediktivní hodnota testů MeSH
- reprodukovatelnost výsledků MeSH
- retrospektivní studie MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- vylepšení rentgenového snímku metody MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- hodnotící studie MeSH
Veřejné zdravotnictví založené na důkazech (evidence-based public health) integruje nejlepší dostupné důkazy se znalostmi a úsudky odborníků a dalších dotčených subjektů za účelem zlepšení zdraví a ochrany populace před infekčními a environmentálními riziky. Kvalitní doporučené postupy pro veřejné zdravotnictví by měly vždy stanovit a zohlednit kvalitu procesu vzniku důkazu (například design a kvalitu provedené studie), transparentnost metod a procesů použitých k získání důkazů a zohlednit, zda byla hodnocena síla podpůrných důkazů. Mezi základní nástroje získávání důkazů pro veřejné zdravotnictví patří systematické přehledy (SR), hodnocení rizik, ekonomické analýzy (studie cost-efektivity), surveillance a expertní panely či konsenzuální konference. SR představují nejvýznamnější a nejhodnotnější typy studií. Shrnují všechen dosud publikovaný výzkum, hodnotí jeho kvalitu a stanovují sílu doporučení a tím poskytují pravomoci k rozhodování odborným pracovníkům v oblasti veřejného zdraví i tvůrcům politik. Tento článek si klade za cíl popsat základní zaměření doporučených postupů ve veřejném zdravotnictví a představuje stručný návrh algoritmu pro tvorbu, adaptaci, implementaci a evaluaci na důkazech založených doporučených postupů ve veřejném zdravotnictví.
Evidence-based public health integrates the best available evidence with the knowledge and judgment of experts and other stakeholders to improve health and protect the population from infectious and environmental risks. Good public health best practices should always identify and take into account the quality of the evidence-making process (such as the design and quality of the study performed), the transparency of the methods and processes used to obtain evidence, and whether the strength of supporting evidence has been assessed. The basic tools for obtaining evidence for public health include systematic review (SR), risk assessment, economic analysis (cost-effectiveness studies), surveillance and expert panels or consensus conferences. SRs represent the most important and most valuable types of studies. They summarize all the research published so far, assess its quality and determine the strength of the recommendations, thus providing decision-making powers to public health professionals and policy makers. This article aims to describe the basic focus of practice guidelines in public health and presents a brief proposal of an algorithm for the development, adaptation, implementation and evaluation of evidence-based guidelines in the field of public health.
INTRODUCTION: The aim of the study was to assess the differences in key parameters of type 1 diabetes (T1D) control associated with treatment and monitoring modalities including newly introduced hybrid closed-loop (HCL) algorithm in children and adolescents with T1D (CwD) using the data from the population-wide pediatric diabetes registry ČENDA. METHODS: CwD younger than 19 years with T1D duration >1 year were included and divided according to the treatment modality and type of CGM used: multiple daily injection (MDI), insulin pump without (CSII) and with HCL function, intermittently scanned continuous glucose monitoring (isCGM), real-time CGM (rtCGM), and intermittent or no CGM (noCGM). HbA1c, times in glycemic ranges, and glucose risk index (GRI) were compared between the groups. RESULTS: Data of a total of 3,251 children (mean age 13.4 ± 3.8 years) were analyzed. 2,187 (67.3%) were treated with MDI, 1,064 (32.7%) with insulin pump, 585/1,064 (55%) with HCL. The HCL users achieved the highest median TIR 75.4% (IQR 6.3) and lowest GRI 29.1 (7.8), both p < 0.001 compared to other groups, followed by MDI rtCGM and CSII groups with TIR 68.8% (IQR 9.0) and 69.0% (7.5), GRI 38.8 (12.5) and 40.1 (8.5), respectively (nonsignificant to each other). These three groups did not significantly differ in their HbA1c medians (51.8 [IQR 4.5], 50.7 [4.5], and 52.7 [5.7] mmol/mol, respectively). NoCGM groups had the highest HbA1c and GRI and lowest TIR regardless of the treatment modality. CONCLUSION: This population-based study shows that the HCL technology is superior to other treatment modalities in CGM-derived parameters and should be considered as a treatment of choice in all CwD fulfilling the indication criteria.
- MeSH
- diabetes mellitus 1. typu * farmakoterapie MeSH
- dítě MeSH
- glykovaný hemoglobin MeSH
- hypoglykemika terapeutické užití MeSH
- inzulin terapeutické užití MeSH
- krevní glukóza MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- regulace glykemie MeSH
- selfmonitoring glykemie MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
Úvod: Měřící nástroje se převážně vyskytují v anglickém nebo jiném původním jazyce. Současně tyto nástroje vznikají v odlišném sociokulturním prostředí. Proto při překladu originálního nástroje do cílového jazyka je nutné postupovat podle doporučeného postupu – metodologie jazykové (lingvistické) validizace. Cíl: Předložit algoritmus jazykové validizace s aplikací na vybraný měřící nástroj. Metodika: Neexistuje standardizovaný postup, ale modifikované guidelines. Algoritmus jazykové validizace je složen z několika fází a dílčích kroků. Mezi významné fáze patří - překlady originálního nástroje do cílového jazyka; zpětné překlady do původního jazyka a pilotní testování (cognitive debriefing) na potencionálních uživatelích konkrétního měřícího nástroje. Přeložená verze musí být koncepčně shodná s originální verzí a musí být vždy testována jako nový nástroj. Koncepční shoda je jak ve významové, tak obsahové stránce originální a přeložené verze, která vychází z kulturního kontextu cílové populace. Závěr: Realizace lingvistické validizace je časově velmi náročná metoda a klade vysoké požadavky na sestavení expertního týmu. Je nutné dodržet jednotlivé kroky lingvistické validizace k zajištění konceptuální ekvivalence originální a přeložené verze.
Introduction: Measuring instruments are found predominantly in English or another native language. At the same, these instruments originate in different social and cultural environments. Therefore, in the translation of the original instrument into the target language must follow a recommended procedure - Methodology language (linguistic) validation. Aim: To present the algorithm of linguistic validation with application to the selected measuring tool. Methods: Not exist standardized procedure, but modified guidelines. Algorithm of linguistic validation consists of several phases and substeps. The significant phase include - translation of the original instrument into the target language; back translation to the original language and pilot testing (cognitive debriefing) for potential users of specific measurement tool. A translated version must be conceptually identical to the original version and must always be tested as a new instrument. Conceptual conformity both in meaning and content of the original and translated versions, which based on the cultural context of the target population. Conclusion: Realization of linguistic validation is very time-consuming method and puts high requirements on expert team. It is necessary to observe the individual steps of linguistic validation to secure conceptual equivalence of the original and translated versions.
- Publikační typ
- abstrakt z konference MeSH
INTRODUCTION: Patients with clinically node-positive bladder cancer were historically considered to have uniformly poor prognosis and were frequently treated with palliative chemotherapy (CHT) only. Although retrospective data show that long-term survival with combined treatment (surgery + CHT) is possible in one-third of these patients, consensus on a treatment algorithm is still lacking. The aim of the study is to compare the efficacy of different treatment modalities based on data from a population-based cancer registry. PATIENTS AND METHODS: The study comprises 661 patients identified from the Czech National Cancer Registry (1996-2015) with cTanyN1-3M0 bladder cancer; 195 were treated with CHT alone, 234 underwent radical cystectomy alone (RC), and 232 received a combination of RC and perioperative CHT (RC + CHT). Multivariate Cox proportional hazard regression analyses were used to evaluate the effectiveness of various treatments. RESULTS: The 5-year OS for CHT alone, RC alone, and RC + CHT were 21.7% (95% confidence interval [CI], 15.4%-28.0%), 12.1% (95% CI, 7.4%-16.7%), and 25.4% (95% CI, 18.9%-31.9%), respectively (P < .001). The median survivals were 17, 10, and 23 months, respectively. In multivariate analysis, age > 60 years (hazard ratio, 1.29; 95% CI, 1.06-1.56; P = .011) and clinical stage cT3-4 (hazard ratio, 1.39; 95% CI, 1.12-1.71; P = .002) were negative predictors of survival. When compared with CHT, RC + CHT reduced the risk of overall mortality by 21% (P = .044). CONCLUSION: Approximately one-quarter of clinically node-positive patients may achieve long-term survival with combined treatment integrating RC and perioperative CHT. The overall survival of patients is significantly improved with a multimodal approach in comparison to CHT alone.
- MeSH
- adjuvantní chemoterapie metody MeSH
- analýza přežití MeSH
- cystektomie metody MeSH
- Kaplanův-Meierův odhad MeSH
- kombinovaná terapie MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- lymfatické metastázy MeSH
- nádory močového měchýře farmakoterapie patologie chirurgie MeSH
- proporcionální rizikové modely MeSH
- registrace MeSH
- retrospektivní studie MeSH
- senioři MeSH
- staging nádorů MeSH
- výsledek terapie MeSH
- Check Tag
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- srovnávací studie MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH