genetic correlation
Dotaz
Zobrazit nápovědu
Fenylketonurie (PKU) je monogenně podmíněná dědičná metabolická choroba s autozomálně recesivní dědičností. Je způsobená mutacemi v genu pro enzym fenylalaninhydroxylázu (PAH). Gen se nachází na dlouhém raménku 12. chromozomu v oblasti 12q22-24.1. Obsahuje 13 exonů a 8 polymorfních míst využívaných pro RFLP haplotypovou analýzu. Bylo popsáno již více než 400 různých mutací PAH genu s různou mírou postižení funkce enzymu. Mutantní alely se mohou volně kombinovat a většina pacientů s PKU jsou smíšení heterozygoti pro dvě různé alely. Tyto skutečnosti podmiňují existenci kontinuálního spektra reziduálních aktivit PAH enzymu, a tím obrovskou interindividuální variabilitu metabolických fenotypů. Byla nalezena velmi dobrá korelace mezi genotypem a jeho fenotypovým projevem u většiny jedinců. PKU mutace jsou v silné vazebné nerovnováze s haplotypy a dalšími polymorfismy v PAH genu. To umožňuje studovat populační genetiku PKU a podle distribuce alel v jednotlivých populacích vysledovat původ mutací a jejich relativní stáří. Genovou analýzu pacientů s PKU v České republice provedl v roce 1997 Kozák. Detekoval u českých PKU pacientů 30 různých mutací, z nichž nejčastější byla R408W nalezená v 54,9 % vyšetřených alel. Genetické vyšetření PKU se v současnosti prakticky využívá pro prenatální diagnostiku.
Phenylketonuria (PKU) is a monogenic autosomal recessive inherited metabolic disease. It is caused by mutation in the gene encoding enzyme phenylalaninhydroxylase (PAH). The gene is located on the chromosome 12. It contains 13 exons and 8 polymorphic sites used for RFLP haplotype analysis. Over 400 different mutations in PAH gene with different degrees of PAH enzyme impairment had been defined. There is a lot of possible mutation combinations with most of patients being compound heterozygotes rather than homozygotes for one particular allele. This is the reason for excessive interindividual variability of metabolic phenotypes with continuous spectrum of mutation-related residual PAH activities. A strong correlation between PAH genotypes and its phenotypic outcome in most individuals was observed. There is a strong linkage disequilibrium among PKU mutations and haplotypes together with other PAH gene polymorphisms. This provides a useful tool for studying population genetics of PKU. We can confirm the descent of particular mutations and estimate their relative age. In the Czech PKU population, Kozák 1997 detected 30 different mutations, of which the most frequent was R408W in 54,9% of all PKU alleles. In the present, genotypic analysis is practically used mainly for prenatal diagnosis of PKU.
- MeSH
- fenotyp MeSH
- fenylalanin krev MeSH
- fenylalaninhydroxylasa metabolismus MeSH
- fenylketonurie diagnóza etiologie růst a vývoj MeSH
- geny genetika MeSH
- lidé MeSH
- lidské chromozomy, pár 12 MeSH
- mutace MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
- srovnávací studie MeSH
Moderními metodami genetického výzkumu schizofrenie jsou celogenomové asociační studie a hledání mikrodelecí/mikroduplikací DNA. Takto mohou být významné geny či polymorfizmy nalezeny, neznáme však jejich roli v patogenezi onemocnění. Proto se pozornost obrací ke genetickému vyšetřování endofenotypů schizofrenie. Endofenotyp je nejčastěji neurobiologická či neuropsychologická charakteristika asociovaná s danou nemocí, je dědičná a celoživotní a vyskytuje se také u duševně zdravých příbuzných pacienta. U schizofrenie jsou studovány zejména endofenotypy neurofyziologické, neuromotorické, neurokognitivní, neuroanatomické a neurologické. V tomto přehledovém článku jsou nejvýznamnější endofenotypy schizofrenie popsány, zmíněn je jejich biologický podklad a možné významné genetické nálezy. Problémem popisovaného výzkumu je zejména skutečnost, že schizofrenie je klinicky velmi heterogenní a výskyt endofenotypů se u jejích jednotlivých podskupin může významně lišit. Budoucnost má multicentrický mezinárodní genetický výzkum endofenotypů schizofrenie, kdy však veškeré procedury musejí být prováděny jednotně. Nalezení a vysvětlení genetického podkladu schizofrenie může sloužit její léčbě, prevenci i destigmatizaci onemocnění.
Genome-wide association studies and studies of DNA microdeletions/microduplications represent modern genetic research methods applied in schizophrenia. It is possible to find important genes and their polymorphisms by these procedures, but the findings do not clarify schizophrenia pathogenesis. That is why the genetic research into schizophrenia endophenotypes has recently been emphas ized. Endophenotype is usually a neurobiological or neuropsychological marker associated with a certain disease, heritable and life-l ong, and also occurs in healthy relatives of the patients. Neurophysiological, neuromotoric, neurocognitive, neuroanatomical and neurolo gical endophenotypes are studied in schizophrenia most frequently. In this review article, we mention the most important schizophreni a endophenotypes including their biological background, and relevant genetic findings. The problem is that schizophrenia is a cli nically heterogenous mental disorder, so the appearance of individual endophenotypes in particular subgroups may be significantly diffe rent. A multisite international genetic research into schizophrenia endophenotypes seems to be promising, but the procedures must be performed uniformly in all centers. The finding and elucidation of the genetic background of schizophrenia may help in its trea tment, prevention, and destigmatization.
- Klíčová slova
- etiopatogeneze,
- MeSH
- endofenotypy MeSH
- genetická predispozice k nemoci genetika MeSH
- genetické asociační studie MeSH
- genetika MeSH
- klinické zkoušky jako téma MeSH
- lidé MeSH
- schizofrenie etiologie genetika MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
Understanding the genetic structure of the European population is important, not only from a historical perspective, but also for the appropriate design and interpretation of genetic epidemiological studies. Previous population genetic analyses with autosomal markers in Europe either had a wide geographic but narrow genomic coverage [1, 2], or vice versa [3-6]. We therefore investigated Affymetrix GeneChip 500K genotype data from 2,514 individuals belonging to 23 different subpopulations, widely spread over Europe. Although we found only a low level of genetic differentiation between subpopulations, the existing differences were characterized by a strong continent-wide correlation between geographic and genetic distance. Furthermore, mean heterozygosity was larger, and mean linkage disequilibrium smaller, in southern as compared to northern Europe. Both parameters clearly showed a clinal distribution that provided evidence for a spatial continuity of genetic diversity in Europe. Our comprehensive genetic data are thus compatible with expectations based upon European population history, including the hypotheses of a south-north expansion and/or a larger effective population size in southern than in northern Europe. By including the widely used CEPH from Utah (CEU) samples into our analysis, we could show that these individuals represent northern and western Europeans reasonably well, thereby confirming their assumed regional ancestry.
AIMS: The aim of the study was to investigate genetic variants predicting cardiovascular events in patients with dyslipidemia and compare its relationship with common risk factors including hyperlipidemia, metabolic syndrome, history of acute myocardial infarction, thrombosis, obesity, and smoking. MATERIALS AND METHODS: Five hundred two individuals divided into six groups corresponding with the risk factors and a control group of normolypidemic patients were analyzed for the presence of eight mutations and polymorphisms (endothelial nitric oxide synthase -786T → C and G894T; lymphotoxin A C804A; angiotensin-converting enzyme [ACE] ins/del; human platelet antigen 1 a/b; beta-fibrinogen -455G → A; apolipoprotein B [ApoB] R3500Q; APOE E2/E3/E4) using the ViennaLab CVD Strip assay. RESULTS: ACE deletions are the most frequent genetic variants in risk groups of dyslipidemic patients (from 58% in cardiovascular events to 51% in smokers). We found a strong relationship between genetic variants and risk factors. G894T is significantly associated with smoking (value of odds ratio [OR] = 1.62, p = 0.04), and ACE deletions are negatively associated with cardiovascular events (OR = 0.62, p = 0.03). CONCLUSION: Significant associations between genetic variants predicting cardiovascular events and common risk factors in dyslipidemic patients were found.
- MeSH
- angiotensin konvertující enzym genetika MeSH
- dospělí MeSH
- dyslipidemie genetika MeSH
- genetická predispozice k nemoci MeSH
- genetická variace MeSH
- genotyp MeSH
- kardiovaskulární nemoci genetika MeSH
- kouření genetika MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mladý dospělý MeSH
- mutace MeSH
- polymorfismus genetický MeSH
- prediktivní hodnota testů MeSH
- rizikové faktory MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- synthasa oxidu dusnatého, typ III genetika MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mladý dospělý MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
Huntington's disease (HD) is an autosomal dominant inherited neurodegenerative disease. It has been hypothesized that changes of iron content in the brain may be involved in the pathogenesis of HD. To ascertain the hypothesis, we investigated the relationship between T2 relaxation time (T2), the number of cytosine-adenine-guanine triplet repeats (CAG) and clinical status in patients suffering from HD. 34 HD patients (mean age 50.1+/-11.8 standard deviation (SD) years) and 34 control subjects (49.6+/-13.3) were scanned using a 1.5 tesla magnetic resonance (MR) scanner and the patients underwent clinical and genetic testing. A multiple echo sequence was employed for T2 measurements. T2 from healthy volunteers matched previous studies. A T2 shortening was found in the pallidum of HD patients compared to controls (65.4+/-6.4 ms vs. 71.8+/-3.6 ms, P<0.00001). A correlation between the number of CAG and T2 was found for the left pallidum (decrease in T2, P<0.05) and an inverse correlation for the left caudate (increase in T2, P<0.05). In HD patients, alterations in iron levels may be caused by an alteration in its axonal transport. The observed T2/CAG covariations may reflect changes in levels and forms of iron: this suggests that HD patients with a higher genetic load have more ferritin-bound ("safe form") iron in the pallidum and/or more low-molecular ("toxic") iron in the caudate. An increase in "toxic" iron in the caudate may enable oxidative stress and thus underlie progression of the disease.
- MeSH
- dospělí MeSH
- expanze trinukleotidových repetic MeSH
- financování organizované MeSH
- Huntingtonova nemoc genetika parazitologie patofyziologie MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- magnetická rezonanční tomografie MeSH
- nucleus caudatus metabolismus patologie MeSH
- relaxace MeSH
- senioři MeSH
- statistika jako téma MeSH
- studie případů a kontrol MeSH
- stupeň závažnosti nemoci MeSH
- železo metabolismus MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
Etiopatogeneze Alzheimerovy choroby není dosud uspokojivě vysvětlena. Na vzniku se podílejí jak faktory genetické, tak i jiné faktory vnitřního prostředí a faktory vnějšího prostředí. V současnosti je věnován velký zájem genetice, uvažuje se o tom, že Alzheimerova choroba je polygenně podmíněná spolu s faktory vnějšího prostředí. V článku je uveden nekompletní přehled v současnosti nejsledovanějších genetických faktorů Alzheimerovy choroby. Na rozvoji této neurodegenerace se mohou podílet jak mutace, tak také řada polymorfismů. Některé polymorfismy mohou sloužit jako spouštěče neurodegenerace, jiné mohou modifikovat klinický obraz a průběh choroby. V genetice jsou důležité asociační studie, které slouží především k odhalování genetické predispozice k multífaktoriálním onemocněním, tedy genů (přesněji řečeno genotypů složených z různých alel daných genů), které zvyšují nebo snižují riziko onemocnění. Takové genotypy poznáme relativně jednoduše - vyskytují se významně častěji nebo naopak významně méně často ve skupině nemocných (případů) v porovnání se skupinou zdravých (ve smyslu netrpících danou nemocí) kontrol.
An article gives an overview of the currently most-watched genetic factors of Alzheimer´s disease. The main hypothesis is: certain genetic polymorphisms influence the development and course of the clinical picture of Alzheimer´s disease. Purpose of the study is figuring out how polymorphisms modify the clinical picture of dementia, how certain clinical features correlate with certain genetic abnormalities. Knowing the connection between genetic polymorphisms and clinical features (such as the predominant behavior disorders, activities of daily living, mood disorders) and genetic examination of polymorhisms in turn would lead to improve diagnosis and therapy of the disease. Also discovery of a new polymorphism influencing the emergence of a clinical picture AD, would mean the inventing a new biomarker AD, which would serve to early diagnosis and early initiation of therapy at a stage before the onset of dementia. In the genetics, there are important Genome-wide association studies (GWAS), which are useful first of all for identifying of genetic susceptibility for multifactorial diseases - genes (or genotypes constitued from other allelas of this genes), which increased or decreased of risk of disease. Such gebnotypes we find relatively simply - they occur significantly often or significantly scarcely ever. In the group of patients in comparison with the control group of healthy people.
- Klíčová slova
- TREM2, PLD3,
- MeSH
- Alzheimerova nemoc * diagnóza etiologie genetika MeSH
- apolipoproteiny E * analýza diagnostické užití genetika škodlivé účinky MeSH
- genetická predispozice k nemoci * MeSH
- genetické asociační studie MeSH
- interleukin-10 genetika MeSH
- lidé MeSH
- mutace genetika MeSH
- polymorfismus genetický * MeSH
- proteiny tau genetika MeSH
- receptory dopaminu D3 genetika MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
